EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001972 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3236 bases
Position: chr9:8362478-8365713
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001278	RVT_1	PF00078.27	1.4e-42	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020013282	-	3236	-	ENSORLP00020001278	830 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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Orthologs

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ENSORLG00020001972	-	73	50.900	ENSATEG00000002739	-	98	50.900	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	61	52.381	ENSATEG00000004857	-	97	52.381	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	99	48.749	ENSATEG00000019512	-	97	48.749	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	73	50.974	ENSATEG00000015490	-	98	51.227	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	96	37.781	ENSATEG00000005707	-	97	37.905	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	99	48.749	ENSATEG00000010674	-	97	48.749	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	99	38.573	ENSATEG00000012907	-	84	38.694	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	62	54.352	ENSATEG00000014607	-	99	54.352	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	64	36.726	ENSATEG00000014055	-	77	36.726	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	76	39.968	ENSATEG00000023197	-	99	40.126	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001972	-	66	42.259	ENSATEG00000004798	-	96	42.259	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020001972	-	53	53.812	ENSACLG00000004998	-	99	53.812	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001972	-	99	42.137	ENSACLG00000000393	-	91	42.137	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001972	-	96	42.341	ENSACLG00000000395	-	91	42.341	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001972	-	55	56.182	ENSACLG00000012447	-	99	56.399	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001972	-	99	42.377	ENSACLG00000025119	-	91	42.377	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001972	-	85	40.896	ENSACLG00000013844	-	92	40.896	Astatotilapia_calliptera
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