EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002002 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2645 bases
Position: chr3:5163482-5166126
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001300	RVT_1	PF00078.27	1.5e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013242	-	2645	-	ENSORLP00020001300	631 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020002002	-	51	38.154	ENSORLG00020021288	-	100	38.154
ENSORLG00020002002	-	92	40.306	ENSORLG00020020421	-	77	40.306
ENSORLG00020002002	-	80	95.418	ENSORLG00020009127	-	100	95.418
ENSORLG00020002002	-	74	34.647	ENSORLG00020016480	-	60	34.647
ENSORLG00020002002	-	83	30.973	ENSORLG00020016695	-	76	30.973
ENSORLG00020002002	-	97	54.604	ENSORLG00020019030	-	75	54.604
ENSORLG00020002002	-	78	36.327	ENSORLG00020000592	-	59	36.327
ENSORLG00020002002	-	67	37.647	ENSORLG00020016924	-	100	37.647
ENSORLG00020002002	-	63	99.241	ENSORLG00020012706	-	100	99.241
ENSORLG00020002002	-	61	36.856	ENSORLG00020001433	-	52	36.856
ENSORLG00020002002	-	95	42.384	ENSORLG00020001172	-	99	42.384
ENSORLG00020002002	-	59	56.499	ENSORLG00020016252	-	100	56.499
ENSORLG00020002002	-	95	35.131	ENSORLG00020005152	-	58	35.131
ENSORLG00020002002	-	95	35.447	ENSORLG00020014275	-	59	35.447
ENSORLG00020002002	-	81	37.378	ENSORLG00020009084	-	69	37.378
ENSORLG00020002002	-	64	99.506	ENSORLG00020000154	-	100	99.506
ENSORLG00020002002	-	94	42.953	ENSORLG00020004022	-	57	42.953
ENSORLG00020002002	-	90	46.422	ENSORLG00020004971	-	66	46.422

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002002	-	55	42.450	ENSAPOG00000008925	-	97	42.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002002	-	58	38.275	ENSAOCG00000003030	-	50	38.275	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002002	-	65	34.483	ENSAPEG00000006765	-	66	34.483	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002002	-	65	44.794	ENSAPEG00000005752	-	98	44.794	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002002	-	82	47.348	ENSAPEG00000014936	-	55	47.348	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002002	-	88	42.908	ENSAPEG00000014949	-	83	42.188	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002002	-	94	36.957	ENSATEG00000019692	-	54	36.957	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002002	-	92	31.759	ENSATEG00000018698	-	54	31.759	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002002	-	83	48.960	ENSACLG00000001380	-	90	48.960	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	53	47.181	ENSACLG00000013289	-	100	47.181	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	65	33.577	ENSACLG00000020385	-	72	33.649	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	61	47.545	ENSACLG00000013847	-	89	47.545	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	86	31.319	ENSACLG00000019989	-	57	31.319	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	94	33.013	ENSACLG00000027627	-	52	33.013	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	65	32.294	ENSACLG00000005847	-	60	32.294	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	66	31.377	ENSACLG00000024556	-	53	31.377	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	88	33.504	ENSACLG00000016581	-	50	33.504	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	88	30.619	ENSACLG00000013947	-	57	30.619	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	91	30.278	ENSACLG00000014688	-	51	30.278	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	77	46.217	ENSACLG00000009861	-	99	46.217	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	90	33.500	ENSACLG00000014740	-	70	33.500	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	99	46.215	ENSACLG00000004561	-	63	46.215	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	59	87.433	ENSACLG00000007712	-	66	87.433	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002002	-	73	30.785	ENSAMXG00000042777	-	63	30.785	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	74	47.761	ENSAMXG00000038502	-	96	47.761	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	92	30.076	ENSAMXG00000041369	-	56	30.076	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	89	30.457	ENSAMXG00000039114	-	58	30.457	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	68	32.468	ENSAMXG00000043631	-	55	32.468	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	73	37.393	ENSAMXG00000043469	-	99	37.393	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	65	32.805	ENSAMXG00000038480	-	62	32.805	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	70	30.123	ENSAMXG00000033197	-	67	30.123	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	70	31.275	ENSAMXG00000041114	-	53	31.474	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	68	32.468	ENSAMXG00000030761	-	60	32.468	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	60	53.704	ENSAMXG00000031032	-	100	53.704	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	72	46.827	ENSAMXG00000039106	-	89	46.827	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	94	31.490	ENSAMXG00000033912	-	52	31.490	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	68	36.977	ENSAMXG00000040471	-	65	36.977	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	71	30.675	ENSAMXG00000041465	-	65	30.675	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002002	-	64	35.294	ENSCPBG00000001369	-	72	35.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002002	-	72	39.560	ENSCPBG00000001119	-	99	39.130	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002002	-	93	37.797	ENSCSEG00000010442	-	58	37.797	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020002002	-	95	34.365	ENSCVAG00000019870	-	82	34.365	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002002	-	56	30.141	ENSEBUG00000001810	-	93	30.141	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020002002	-	93	36.149	ENSGAGG00000022002	-	70	36.149	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	71	35.217	ENSGAGG00000002613	-	61	35.217	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	70	34.945	ENSGAGG00000013650	-	80	34.945	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	60	39.474	ENSGAGG00000011063	-	78	39.474	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	90	36.568	ENSGAGG00000007173	-	90	36.568	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	57	35.695	ENSGAGG00000007552	-	56	35.695	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002002	-	58	52.329	ENSHBUG00000009088	-	100	52.329	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002002	-	64	41.523	ENSHCOG00000019997	-	73	41.523	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002002	-	77	36.735	ENSIPUG00000003645	-	99	36.735	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002002	-	78	47.166	ENSKMAG00000007574	-	97	47.166	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002002	-	50	30.172	ENSKMAG00000010799	-	96	30.172	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002002	-	99	46.603	ENSKMAG00000013568	-	80	46.603	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002002	-	57	50.000	ENSKMAG00000003188	-	52	50.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002002	-	61	40.874	ENSLBEG00000003912	-	100	40.874	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002002	-	57	30.874	ENSLACG00000015201	-	61	30.874	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	51	36.533	ENSLACG00000017143	-	51	36.533	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	90	32.881	ENSLACG00000003991	-	65	32.881	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	51	37.654	ENSLACG00000001892	-	93	37.654	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	75	31.250	ENSLACG00000016441	-	61	31.250	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	97	34.434	ENSLACG00000002417	-	59	34.434	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	95	33.655	ENSLACG00000004818	-	58	33.655	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	58	34.204	ENSLACG00000006413	-	54	34.204	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	55	37.059	ENSLACG00000010776	-	72	37.059	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	67	35.431	ENSLACG00000002169	-	68	35.431	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	50	34.675	ENSLACG00000003900	-	100	34.675	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	87	31.418	ENSLACG00000001186	-	73	30.548	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	57	30.028	ENSLACG00000009347	-	58	30.411	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	79	30.739	ENSLACG00000006151	-	62	30.739	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	97	32.217	ENSLACG00000001833	-	52	32.217	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	90	34.694	ENSLACG00000009168	-	87	31.122	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	97	34.127	ENSLACG00000004854	-	55	34.127	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002002	-	52	36.474	ENSLOCG00000017292	-	100	36.474	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020002002	-	71	30.000	ENSMAMG00000021634	-	70	30.000	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002002	-	68	30.197	ENSMAMG00000004646	-	98	30.197	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002002	-	89	36.778	ENSMAMG00000019918	-	92	36.778	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002002	-	66	37.470	ENSMZEG00005008378	-	57	37.470	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002002	-	93	33.607	ENSMZEG00005024252	-	70	33.607	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002002	-	68	35.808	ENSMZEG00005017878	-	69	35.808	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002002	-	77	46.421	ENSMZEG00005023829	-	99	46.421	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002002	-	92	30.303	ENSMALG00000020759	-	51	30.303	Monopterus_albus
ENSORLG00020002002	-	53	52.819	ENSNBRG00000002477	-	99	52.819	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002002	-	72	45.870	ENSORLG00000027869	-	100	45.870	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	93	32.320	ENSORLG00000023550	-	50	32.320	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	64	38.235	ENSORLG00000023794	-	74	38.235	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	94	30.171	ENSORLG00000025397	-	63	30.171	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	95	35.468	ENSORLG00000028879	-	64	35.468	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	79	45.908	ENSORLG00000027231	-	95	45.908	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	50	38.245	ENSORLG00000022411	-	88	38.245	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	80	42.857	ENSORLG00000026235	-	53	42.857	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	66	46.667	ENSORLG00000027443	-	72	46.667	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	82	35.985	ENSORLG00000023615	-	57	35.985	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002002	-	66	38.889	ENSORLG00015008138	-	78	38.889	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	85	98.689	ENSORLG00015022314	-	63	98.689	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	69	38.813	ENSORLG00015017579	-	51	38.813	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	86	30.488	ENSORLG00015013109	-	94	30.488	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	94	55.518	ENSORLG00015017997	-	61	55.518	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	89	32.040	ENSORLG00015022011	-	53	32.040	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	64	46.305	ENSORLG00015009803	-	85	46.305	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	60	51.323	ENSORLG00015021822	-	100	51.323	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	89	31.518	ENSORLG00015000130	-	53	31.518	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	96	30.851	ENSORLG00015001207	-	52	30.851	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	76	33.760	ENSORLG00015000379	-	69	33.760	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	72	98.242	ENSORLG00015010510	-	74	98.242	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	95	34.163	ENSORLG00015003846	-	62	34.163	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	86	32.062	ENSORLG00015008388	-	60	32.062	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	73	31.613	ENSORLG00015022127	-	59	31.613	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002002	-	79	54.637	ENSORLG00015013369	-	65	54.637	Oryzias_latipes_hsok
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ENSORLG00020002002	-	63	35.236	ENSPSIG00000000367	-	90	35.236	Pelodiscus_sinensis
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ENSORLG00020002002	-	87	30.743	ENSPREG00000006122	-	76	30.743	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002002	-	80	31.204	ENSPREG00000006496	-	74	31.204	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002002	-	61	74.151	ENSPREG00000022349	-	83	74.151	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002002	-	73	38.771	ENSPNAG00000010299	-	91	38.771	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002002	-	88	30.806	ENSPNAG00000009767	-	64	30.806	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002002	-	79	37.897	ENSPNAG00000009058	-	99	37.897	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002002	-	81	31.979	ENSPNAG00000021509	-	56	31.979	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002002	-	61	70.052	ENSPNAG00000015949	-	100	70.052	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002002	-	68	34.820	ENSSFOG00015024061	-	75	34.820	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002002	-	67	33.333	ENSSFOG00015016168	-	97	33.333	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002002	-	63	58.396	ENSSDUG00000011043	-	51	58.396	Seriola_dumerili
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ENSORLG00020002002	-	63	40.295	ENSTRUG00000024803	-	78	40.295	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002002	-	94	30.363	ENSXMAG00000024180	-	65	30.363	Xiphophorus_maculatus
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ENSORLG00020002002	-	93	30.062	ENSXMAG00000022159	-	51	30.062	Xiphophorus_maculatus