EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002010 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1289 bases
Position: chr5:5571208-5572496
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020021972	RVT_1	PF00078.27	2.9e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013232	-	1289	-	ENSORLP00020021972	412 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020002010	-	99	67.470	ENSORLG00020021613	-	62	67.470
ENSORLG00020002010	-	86	51.831	ENSORLG00020018183	-	87	50.923
ENSORLG00020002010	-	81	34.911	ENSORLG00020019816	-	62	34.024
ENSORLG00020002010	-	78	51.807	ENSORLG00020019768	-	64	51.807
ENSORLG00020002010	-	75	53.398	ENSORLG00020007610	-	97	53.398
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020008589	-	71	51.187
ENSORLG00020002010	-	75	48.718	ENSORLG00020001944	-	68	48.718
ENSORLG00020002010	-	75	52.597	ENSORLG00020021067	-	83	51.506
ENSORLG00020002010	-	100	48.219	ENSORLG00020007092	-	52	48.219
ENSORLG00020002010	-	64	48.669	ENSORLG00020021212	-	63	49.606
ENSORLG00020002010	-	100	48.694	ENSORLG00020016342	-	56	48.694
ENSORLG00020002010	-	83	30.882	ENSORLG00020013935	-	69	30.882
ENSORLG00020002010	-	99	46.005	ENSORLG00020018405	-	53	46.005
ENSORLG00020002010	-	80	47.112	ENSORLG00020014641	-	69	46.201
ENSORLG00020002010	-	79	51.682	ENSORLG00020019862	-	69	51.682
ENSORLG00020002010	-	85	57.627	ENSORLG00020020284	-	70	57.627
ENSORLG00020002010	-	94	44.898	ENSORLG00020022028	-	72	44.898
ENSORLG00020002010	-	100	48.219	ENSORLG00020012251	-	56	48.219
ENSORLG00020002010	-	59	64.050	ENSORLG00020017794	-	62	64.050
ENSORLG00020002010	-	79	51.988	ENSORLG00020010320	-	69	51.988
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ENSORLG00020002010	-	99	44.068	ENSORLG00020003828	-	53	44.068
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ENSORLG00020002010	-	89	51.491	ENSORLG00020015750	-	79	51.491
ENSORLG00020002010	-	87	46.927	ENSORLG00020021677	-	72	46.927
ENSORLG00020002010	-	84	37.283	ENSORLG00020011014	-	70	37.283
ENSORLG00020002010	-	92	45.119	ENSORLG00020011254	-	81	45.119
ENSORLG00020002010	-	82	34.211	ENSORLG00020009687	-	59	33.918
ENSORLG00020002010	-	80	51.964	ENSORLG00020015544	-	93	51.964
ENSORLG00020002010	-	62	49.804	ENSORLG00020011261	-	62	49.804
ENSORLG00020002010	-	78	34.769	ENSORLG00020001304	-	81	34.769
ENSORLG00020002010	-	99	67.153	ENSORLG00020012070	-	67	67.554
ENSORLG00020002010	-	74	51.299	ENSORLG00020008855	-	67	51.299
ENSORLG00020002010	-	80	52.568	ENSORLG00020003990	-	69	52.568
ENSORLG00020002010	-	86	52.394	ENSORLG00020020066	-	90	51.451
ENSORLG00020002010	-	80	44.411	ENSORLG00020005292	-	93	44.411
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ENSORLG00020002010	-	99	45.763	ENSORLG00020004099	-	53	45.763
ENSORLG00020002010	-	86	51.268	ENSORLG00020003812	-	97	50.396
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020009885	-	88	51.187
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020008289	-	63	48.931
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ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020001010	-	63	48.931
ENSORLG00020002010	-	79	51.524	ENSORLG00020019142	-	69	51.524
ENSORLG00020002010	-	100	48.456	ENSORLG00020003779	-	62	48.456
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020003775	-	61	48.931
ENSORLG00020002010	-	59	70.370	ENSORLG00020001541	-	62	70.370
ENSORLG00020002010	-	65	37.546	ENSORLG00020009835	-	58	37.546
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ENSORLG00020002010	-	86	51.831	ENSORLG00020011734	-	74	50.923
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ENSORLG00020002010	-	71	45.890	ENSORLG00020016243	-	75	45.890
ENSORLG00020002010	-	79	52.294	ENSORLG00020013078	-	69	52.294
ENSORLG00020002010	-	99	48.175	ENSORLG00020019488	-	59	48.175
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ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020004992	-	74	51.187
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ENSORLG00020002010	-	81	34.911	ENSORLG00020017929	-	67	34.024
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ENSORLG00020002010	-	73	52.333	ENSORLG00020022160	-	97	51.235
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ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020000803	-	56	48.931
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ENSORLG00020002010	-	68	34.643	ENSORLG00020002243	-	65	34.643
ENSORLG00020002010	-	57	52.479	ENSORLG00020017918	-	56	52.479
ENSORLG00020002010	-	94	48.843	ENSORLG00020001799	-	82	48.843
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ENSORLG00020002010	-	58	49.580	ENSORLG00020015554	-	61	49.580
ENSORLG00020002010	-	72	46.512	ENSORLG00020015149	-	92	46.512
ENSORLG00020002010	-	87	49.444	ENSORLG00020004647	-	86	49.444
ENSORLG00020002010	-	80	46.526	ENSORLG00020022231	-	83	46.526
ENSORLG00020002010	-	86	51.549	ENSORLG00020013014	-	85	50.660
ENSORLG00020002010	-	50	41.262	ENSORLG00020016267	-	72	41.262
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020021900	-	82	51.187
ENSORLG00020002010	-	63	36.293	ENSORLG00020001021	-	63	35.907
ENSORLG00020002010	-	81	50.595	ENSORLG00020018011	-	90	50.595
ENSORLG00020002010	-	69	95.423	ENSORLG00020003864	-	53	95.423
ENSORLG00020002010	-	79	50.765	ENSORLG00020012080	-	69	50.765
ENSORLG00020002010	-	100	49.526	ENSORLG00020008999	-	56	49.526
ENSORLG00020002010	-	99	40.146	ENSORLG00020015429	-	63	40.146
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020021860	-	56	48.931
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020001344	-	93	51.187
ENSORLG00020002010	-	99	48.418	ENSORLG00020006422	-	54	48.418
ENSORLG00020002010	-	82	34.795	ENSORLG00020011701	-	80	34.795
ENSORLG00020002010	-	78	47.500	ENSORLG00020006907	-	59	47.500
ENSORLG00020002010	-	64	46.591	ENSORLG00020013020	-	77	46.591
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020014062	-	56	48.931
ENSORLG00020002010	-	99	66.667	ENSORLG00020016049	-	51	66.667
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020004056	-	85	51.187
ENSORLG00020002010	-	100	98.786	ENSORLG00020019399	-	74	98.786
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020021237	-	65	48.931
ENSORLG00020002010	-	66	56.250	ENSORLG00020008245	-	93	54.730
ENSORLG00020002010	-	58	40.586	ENSORLG00020011841	-	65	40.586
ENSORLG00020002010	-	79	51.952	ENSORLG00020012664	-	64	51.952
ENSORLG00020002010	-	85	34.188	ENSORLG00020009946	-	62	33.333
ENSORLG00020002010	-	80	45.482	ENSORLG00020008083	-	70	45.482
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020015125	-	60	48.931
ENSORLG00020002010	-	62	45.736	ENSORLG00020005670	-	95	45.349
ENSORLG00020002010	-	86	51.549	ENSORLG00020002465	-	93	50.660
ENSORLG00020002010	-	80	51.775	ENSORLG00020019476	-	62	51.775
ENSORLG00020002010	-	86	51.831	ENSORLG00020017390	-	71	50.923
ENSORLG00020002010	-	99	43.099	ENSORLG00020020026	-	72	43.099
ENSORLG00020002010	-	74	68.317	ENSORLG00020003888	-	66	68.317
ENSORLG00020002010	-	100	48.694	ENSORLG00020012063	-	56	48.694
ENSORLG00020002010	-	86	51.831	ENSORLG00020009639	-	83	50.923
ENSORLG00020002010	-	50	39.904	ENSORLG00020017052	-	58	39.423
ENSORLG00020002010	-	99	45.366	ENSORLG00020004554	-	53	45.366
ENSORLG00020002010	-	100	48.931	ENSORLG00020011031	-	61	48.931
ENSORLG00020002010	-	100	48.694	ENSORLG00020009908	-	62	48.694
ENSORLG00020002010	-	99	48.309	ENSORLG00020018691	-	59	48.309
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020010414	-	79	51.187
ENSORLG00020002010	-	80	52.870	ENSORLG00020010410	-	69	52.870
ENSORLG00020002010	-	86	52.113	ENSORLG00020009707	-	74	51.187

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002010	-	100	52.899	ENSAOCG00000011105	-	52	52.885	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002010	-	83	56.725	ENSAPEG00000019125	-	75	56.725	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002010	-	79	56.575	ENSAPEG00000006031	-	80	56.575	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002010	-	80	52.711	ENSAPEG00000000917	-	89	52.711	Amphiprion_percula
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ENSORLG00020002010	-	100	49.528	ENSPNAG00000014173	-	80	49.528	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002010	-	99	45.933	ENSPNAG00000002193	-	73	45.933	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002010	-	96	48.655	ENSPNAG00000009566	-	75	49.132	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002010	-	100	48.815	ENSSMAG00000014467	-	74	48.815	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	60	51.004	ENSSMAG00000020841	-	60	51.004	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	100	49.524	ENSSMAG00000016680	-	89	49.524	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	100	48.578	ENSSMAG00000017424	-	50	48.578	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	100	49.524	ENSSMAG00000020789	-	76	49.524	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	93	50.909	ENSSMAG00000017564	-	90	50.909	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002010	-	58	72.574	ENSSDUG00000021566	-	64	72.574	Seriola_dumerili
ENSORLG00020002010	-	100	69.903	ENSSDUG00000012909	-	66	69.903	Seriola_dumerili
ENSORLG00020002010	-	88	40.000	ENSSPUG00000004689	-	67	39.669	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020002010	-	58	63.025	ENSSPAG00000005749	-	76	62.083	Stegastes_partitus
ENSORLG00020002010	-	50	46.154	ENSSPAG00000005778	-	58	46.154	Stegastes_partitus
ENSORLG00020002010	-	100	51.196	ENSTRUG00000024564	-	93	51.196	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002010	-	54	49.099	ENSTRUG00000020404	-	85	48.598	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002010	-	80	52.212	ENSTRUG00000024195	-	74	52.212	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002010	-	64	51.636	ENSTRUG00000022494	-	59	51.636	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002010	-	100	67.233	ENSXMAG00000028039	-	59	67.233	Xiphophorus_maculatus