EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002044 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpusd4
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase D4
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3967 bases
Position: chr5:5389428-5393394
Accession: ZDB-GENE-040801-238
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022006	PseudoU_synth_2	PF00849.22	4.9e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013182	-	1331	-	ENSORLP00020022006	398 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.398	ENSG00000165526	RPUSD4	88	48.961	Homo_sapiens
ENSORLG00020002044	rpusd4	97	68.974	ENSAPOG00000011024	rpusd4	92	72.253	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002044	rpusd4	92	47.568	ENSAMEG00000000127	-	89	48.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020002044	rpusd4	55	57.843	ENSAMEG00000005953	-	93	57.843	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	67.385	ENSACIG00000003533	rpusd4	96	67.178	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002044	rpusd4	96	67.784	ENSAOCG00000015409	rpusd4	90	70.994	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002044	rpusd4	96	67.784	ENSAPEG00000018935	rpusd4	90	70.994	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002044	rpusd4	88	69.341	ENSATEG00000008059	rpusd4	87	69.341	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002044	rpusd4	70	50.355	ENSAPLG00000013250	RPUSD4	96	50.530	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	50.000	ENSACAG00000000189	RPUSD4	89	50.000	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	47.774	ENSANAG00000024050	RPUSD4	89	47.774	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	67.416	ENSACLG00000020996	rpusd4	92	67.416	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	58.507	ENSAMXG00000031479	rpusd4	94	58.507	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002044	rpusd4	86	48.127	ENSBTAG00000020900	RPUSD4	91	47.472	Bos_taurus
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	48.204	ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	48.204	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	52.649	ENSCAFG00000010488	RPUSD4	87	50.450	Canis_familiaris
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	52.649	ENSCAFG00020010621	RPUSD4	87	50.450	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	49.231	ENSCHIG00000009975	RPUSD4	87	48.246	Capra_hircus
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	51.385	ENSTSYG00000008456	RPUSD4	85	51.385	Carlito_syrichta
ENSORLG00020002044	rpusd4	60	51.250	ENSCAPG00000006040	RPUSD4	91	51.250	Cavia_aperea
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	50.440	ENSCPOG00000014971	RPUSD4	87	50.440	Cavia_porcellus
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	49.231	ENSCCAG00000027838	RPUSD4	86	49.231	Cebus_capucinus
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.327	ENSCATG00000041570	RPUSD4	80	50.327	Cercocebus_atys
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	49.014	ENSCLAG00000016553	RPUSD4	92	49.014	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	48.494	ENSCSAG00000002274	RPUSD4	87	48.494	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020002044	rpusd4	69	49.821	ENSCHOG00000010249	RPUSD4	97	49.821	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020002044	rpusd4	72	53.287	ENSCPBG00000011175	RPUSD4	99	53.287	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002044	rpusd4	68	39.068	ENSCSAVG00000000872	-	54	39.068	Ciona_savignyi
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	50.492	ENSCANG00000039684	RPUSD4	80	50.492	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	49.702	ENSCGRG00001024141	Rpusd4	92	48.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	49.702	ENSCGRG00000014415	Rpusd4	92	48.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	68.493	ENSCVAG00000008761	rpusd4	93	68.493	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	67.945	ENSCVAG00000000392	rpusd4	98	69.364	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	86	53.623	ENSDARG00000012674	rpusd4	94	53.623	Danio_rerio
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	48.547	ENSDNOG00000020026	RPUSD4	90	48.547	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	48.860	ENSDORG00000016717	Rpusd4	88	46.746	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020002044	rpusd4	92	47.849	ENSETEG00000013953	RPUSD4	96	47.849	Echinops_telfairi
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	53.741	ENSEASG00005022982	RPUSD4	89	49.558	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	54.082	ENSECAG00000000557	RPUSD4	77	54.082	Equus_caballus
ENSORLG00020002044	rpusd4	55	60.870	ENSEEUG00000014036	RPUSD4	58	60.870	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020002044	rpusd4	88	57.618	ENSELUG00000008075	rpusd4	94	57.618	Esox_lucius
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	52.318	ENSFCAG00000029789	RPUSD4	87	49.850	Felis_catus
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	45.481	ENSFALG00000005171	RPUSD4	98	45.481	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	49.701	ENSFDAG00000014307	RPUSD4	88	49.701	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	70.083	ENSFHEG00000004329	rpusd4	94	70.083	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	60.436	ENSGMOG00000017726	rpusd4	99	59.517	Gadus_morhua
ENSORLG00020002044	rpusd4	71	51.228	ENSGALG00000024326	RPUSD4	80	51.399	Gallus_gallus
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	66.120	ENSGAFG00000021559	rpusd4	94	66.120	Gambusia_affinis
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	69.670	ENSGACG00000001657	rpusd4	98	72.242	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	87	48.424	ENSGAGG00000000132	RPUSD4	95	48.424	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.096	ENSGGOG00000016494	RPUSD4	88	48.665	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	67.416	ENSHBUG00000022838	rpusd4	92	67.416	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	50.613	ENSHGLG00000002285	RPUSD4	85	50.613	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	50.613	ENSHGLG00100006385	RPUSD4	85	50.613	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020002044	rpusd4	88	65.714	ENSHCOG00000006612	rpusd4	90	65.714	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	55.000	ENSIPUG00000023879	rusd4	87	55.000	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	51.852	ENSSTOG00000025280	RPUSD4	88	51.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	80	52.012	ENSJJAG00000018673	Rpusd4	86	52.012	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	70.083	ENSKMAG00000021805	rpusd4	94	70.083	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002044	rpusd4	84	71.091	ENSLBEG00000020394	rpusd4	93	70.920	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	53.560	ENSLACG00000011028	RPUSD4	89	50.700	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	45.970	ENSLOCG00000003124	rpusd4	88	45.970	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.547	ENSLAFG00000005211	RPUSD4	99	42.517	Loxodonta_africana
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.654	ENSMFAG00000039513	RPUSD4	80	50.654	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.000	ENSMMUG00000007933	RPUSD4	80	50.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.654	ENSMNEG00000027414	RPUSD4	80	50.654	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.980	ENSMLEG00000042461	RPUSD4	80	50.980	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	68.120	ENSMAMG00000023839	rpusd4	94	68.120	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	67.416	ENSMZEG00005011999	rpusd4	92	67.416	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002044	rpusd4	71	49.117	ENSMGAG00000000840	RPUSD4	88	49.301	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	50.000	ENSMAUG00000010280	Rpusd4	87	50.000	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	50.599	ENSMICG00000015979	RPUSD4	90	53.135	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002044	rpusd4	84	47.788	ENSMOCG00000000661	Rpusd4	89	47.788	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020002044	rpusd4	78	70.833	ENSMMOG00000021731	rpusd4	93	70.833	Mola_mola
ENSORLG00020002044	rpusd4	77	49.359	ENSMODG00000004521	RPUSD4	79	49.359	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	72.277	ENSMALG00000005839	rpusd4	99	68.196	Monopterus_albus
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	52.381	MGP_CAROLIEiJ_G0031954	Rpusd4	77	52.381	Mus_caroli
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	51.803	ENSMUSG00000032044	Rpusd4	80	51.803	Mus_musculus
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	52.560	MGP_PahariEiJ_G0014819	Rpusd4	76	52.560	Mus_pahari
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	48.295	MGP_SPRETEiJ_G0033078	Rpusd4	92	48.295	Mus_spretus
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.850	ENSMPUG00000006608	RPUSD4	87	49.850	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020002044	rpusd4	64	50.980	ENSMLUG00000029348	-	98	50.980	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	52.492	ENSMLUG00000017328	-	78	52.492	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020002044	rpusd4	86	49.859	ENSNGAG00000020847	Rpusd4	93	49.859	Nannospalax_galili
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	69.277	ENSNBRG00000005207	rpusd4	96	69.277	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	48.665	ENSNLEG00000007465	RPUSD4	88	48.665	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	52.131	ENSMEUG00000004370	RPUSD4	81	52.131	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	48.747	ENSODEG00000004577	RPUSD4	93	48.747	Octodon_degus
ENSORLG00020002044	rpusd4	89	68.272	ENSONIG00000018879	rpusd4	90	70.393	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	48.485	ENSOANG00000007247	RPUSD4	93	48.485	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	52.980	ENSOCUG00000017039	RPUSD4	80	52.961	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020002044	rpusd4	95	96.817	ENSORLG00000002750	rpusd4	98	95.722	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002044	rpusd4	100	96.992	ENSORLG00015020034	rpusd4	100	96.992	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002044	rpusd4	100	80.149	ENSOMEG00000004861	rpusd4	100	79.404	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	52.459	ENSOGAG00000008922	RPUSD4	79	52.459	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020002044	rpusd4	81	49.231	ENSOARG00000012238	RPUSD4	87	48.246	Ovis_aries
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.249	ENSPPAG00000042883	RPUSD4	82	48.817	Pan_paniscus
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.850	ENSPPRG00000003081	RPUSD4	87	49.850	Panthera_pardus
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.850	ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	52.318	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.398	ENSPTRG00000004454	RPUSD4	88	48.961	Pan_troglodytes
ENSORLG00020002044	rpusd4	76	50.654	ENSPANG00000015040	RPUSD4	80	50.654	Papio_anubis
ENSORLG00020002044	rpusd4	86	53.736	ENSPKIG00000023986	rpusd4	89	53.736	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	53.061	ENSPSIG00000014268	RPUSD4	92	53.061	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	64.157	ENSPMGG00000002806	rpusd4	92	62.727	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020002044	rpusd4	73	44.558	ENSPEMG00000000278	Rpusd4	75	44.558	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020002044	rpusd4	75	40.122	ENSPMAG00000008183	rpusd4	95	40.122	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020002044	rpusd4	74	52.365	ENSPCIG00000010212	RPUSD4	80	52.365	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	66.125	ENSPFOG00000019030	rpusd4	97	66.125	Poecilia_formosa
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	67.030	ENSPLAG00000016848	rpusd4	94	67.030	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020002044	rpusd4	90	65.668	ENSPMEG00000017534	rpusd4	94	65.668	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020002044	rpusd4	85	66.763	ENSPREG00000005689	rpusd4	89	66.763	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002044	rpusd4	83	48.071	ENSPPYG00000004043	RPUSD4	88	48.071	Pongo_abelii
ENSORLG00020002044	rpusd4	68	52.459	ENSPCAG00000000753	RPUSD4	72	52.459	Procavia_capensis
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ENSORLG00020002044	rpusd4	88	67.598	ENSXMAG00000023351	rpusd4	91	67.787	Xiphophorus_maculatus