EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002128 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 91118 bases
Position: chr18:576322-667439
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	1	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	2	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	3	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	4	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	5	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	6	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	7	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	8	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	9	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	10	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	11	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	12	19
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ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	14	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	15	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	16	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	17	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	18	19
ENSORLP00020022043	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-139	19	19
ENSORLP00020022043	zf-met	PF12874.7	4.7e-07	1	2
ENSORLP00020022043	zf-met	PF12874.7	4.7e-07	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013044	-	4938	-	ENSORLP00020022043	1645 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020002128	-	95	34.932	ENSORLG00020003948	ZNF384	69	34.932
ENSORLG00020002128	-	99	33.613	ENSORLG00020006144	-	97	35.393
ENSORLG00020002128	-	99	43.564	ENSORLG00020010804	-	93	41.885
ENSORLG00020002128	-	88	40.606	ENSORLG00020006820	-	80	40.606
ENSORLG00020002128	-	96	49.367	ENSORLG00020008240	-	70	49.367
ENSORLG00020002128	-	92	41.624	ENSORLG00020015703	-	60	41.624
ENSORLG00020002128	-	99	30.408	ENSORLG00020004889	ZNF319	98	32.508
ENSORLG00020002128	-	99	34.266	ENSORLG00020008484	-	94	36.577
ENSORLG00020002128	-	99	36.792	ENSORLG00020018503	-	79	36.792
ENSORLG00020002128	-	83	38.889	ENSORLG00020012967	scrt1b	85	38.889
ENSORLG00020002128	-	96	43.200	ENSORLG00020000481	-	89	43.200
ENSORLG00020002128	-	92	44.706	ENSORLG00020000161	-	95	44.706
ENSORLG00020002128	-	93	41.176	ENSORLG00020000009	znf710b	56	41.176
ENSORLG00020002128	-	94	40.659	ENSORLG00020018921	-	87	38.255
ENSORLG00020002128	-	99	31.830	ENSORLG00020010950	-	100	44.144
ENSORLG00020002128	-	99	38.024	ENSORLG00020009943	-	99	40.000
ENSORLG00020002128	-	99	41.579	ENSORLG00020020419	-	96	41.579
ENSORLG00020002128	-	90	37.143	ENSORLG00020011478	scrt2	82	37.143
ENSORLG00020002128	-	100	40.530	ENSORLG00020009139	-	98	41.294
ENSORLG00020002128	-	92	40.909	ENSORLG00020011149	-	87	38.983
ENSORLG00020002128	-	99	40.437	ENSORLG00020011075	-	92	40.437
ENSORLG00020002128	-	79	43.363	ENSORLG00020019341	-	91	51.429
ENSORLG00020002128	-	93	36.242	ENSORLG00020018051	prdm5	80	36.877
ENSORLG00020002128	-	95	39.759	ENSORLG00020009419	-	99	47.368
ENSORLG00020002128	-	94	38.559	ENSORLG00020010953	-	96	38.559
ENSORLG00020002128	-	89	37.500	ENSORLG00020004313	-	57	37.500
ENSORLG00020002128	-	89	40.909	ENSORLG00020010038	-	56	40.909
ENSORLG00020002128	-	96	41.538	ENSORLG00020001707	-	97	41.538
ENSORLG00020002128	-	99	33.333	ENSORLG00020008744	-	75	33.333
ENSORLG00020002128	-	89	39.785	ENSORLG00020006148	-	60	39.785
ENSORLG00020002128	-	99	35.664	ENSORLG00020001912	znf236	74	36.735
ENSORLG00020002128	-	98	39.456	ENSORLG00020016037	-	97	38.938
ENSORLG00020002128	-	99	38.095	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	98	38.095
ENSORLG00020002128	-	86	38.554	ENSORLG00020020094	-	54	33.010
ENSORLG00020002128	-	95	42.697	ENSORLG00020010880	-	98	42.697
ENSORLG00020002128	-	84	42.515	ENSORLG00020002817	GFI1	60	42.515
ENSORLG00020002128	-	94	39.286	ENSORLG00020008346	-	99	37.945
ENSORLG00020002128	-	93	42.759	ENSORLG00020017528	-	87	42.759
ENSORLG00020002128	-	99	44.118	ENSORLG00020009184	-	94	44.118
ENSORLG00020002128	-	99	32.544	ENSORLG00020010937	patz1	67	32.121
ENSORLG00020002128	-	71	47.778	ENSORLG00020010932	-	81	47.778
ENSORLG00020002128	-	98	36.842	ENSORLG00020009680	znf652	57	36.842
ENSORLG00020002128	-	92	40.462	ENSORLG00020010636	-	90	40.462
ENSORLG00020002128	-	99	44.966	ENSORLG00020017164	-	99	44.966
ENSORLG00020002128	-	90	42.553	ENSORLG00020007074	-	99	42.553
ENSORLG00020002128	-	74	42.105	ENSORLG00020019789	snai1a	55	42.105
ENSORLG00020002128	-	94	36.905	ENSORLG00020018791	-	89	36.905
ENSORLG00020002128	-	99	39.560	ENSORLG00020010171	-	99	40.385
ENSORLG00020002128	-	80	36.283	ENSORLG00020001758	-	76	36.190
ENSORLG00020002128	-	99	33.984	ENSORLG00020018685	znf319b	86	33.984
ENSORLG00020002128	-	87	50.000	ENSORLG00020020570	sall1a	56	50.000
ENSORLG00020002128	-	95	45.745	ENSORLG00020010560	-	99	39.925
ENSORLG00020002128	-	90	40.000	ENSORLG00020017514	-	99	40.000
ENSORLG00020002128	-	95	40.230	ENSORLG00020000246	-	99	40.230
ENSORLG00020002128	-	73	44.211	ENSORLG00020006433	-	82	44.211
ENSORLG00020002128	-	99	41.489	ENSORLG00020007599	-	75	36.789
ENSORLG00020002128	-	74	41.414	ENSORLG00020008812	hic1	51	40.000
ENSORLG00020002128	-	94	38.224	ENSORLG00020021857	-	57	38.224
ENSORLG00020002128	-	99	38.380	ENSORLG00020007018	-	85	37.970
ENSORLG00020002128	-	99	37.143	ENSORLG00020009180	-	94	37.143
ENSORLG00020002128	-	96	35.227	ENSORLG00020018495	-	73	32.776
ENSORLG00020002128	-	94	39.615	ENSORLG00020010916	-	68	39.615
ENSORLG00020002128	-	93	41.304	ENSORLG00020008787	snai2	83	41.304
ENSORLG00020002128	-	93	42.222	ENSORLG00020016666	-	75	42.222
ENSORLG00020002128	-	98	36.126	ENSORLG00020009554	-	89	36.126
ENSORLG00020002128	-	91	40.625	ENSORLG00020009089	-	64	40.625
ENSORLG00020002128	-	93	44.286	ENSORLG00020004370	-	96	44.286
ENSORLG00020002128	-	93	34.685	ENSORLG00020005815	-	86	34.247
ENSORLG00020002128	-	99	45.263	ENSORLG00020000219	-	93	39.735
ENSORLG00020002128	-	96	40.000	ENSORLG00020009965	-	92	38.550
ENSORLG00020002128	-	93	30.942	ENSORLG00020014595	PRDM15	58	32.639
ENSORLG00020002128	-	99	43.396	ENSORLG00020005132	-	78	40.094
ENSORLG00020002128	-	74	43.678	ENSORLG00020000639	-	50	43.678
ENSORLG00020002128	-	96	39.048	ENSORLG00020021196	-	65	39.048
ENSORLG00020002128	-	99	38.889	ENSORLG00020008891	-	99	46.774
ENSORLG00020002128	-	92	42.105	ENSORLG00020017974	e4f1	75	42.105
ENSORLG00020002128	-	89	47.518	ENSORLG00020016754	-	98	44.785
ENSORLG00020002128	-	99	37.662	ENSORLG00020008018	-	76	38.305
ENSORLG00020002128	-	93	40.394	ENSORLG00020010647	-	93	39.583
ENSORLG00020002128	-	99	40.000	ENSORLG00020017483	-	99	40.000
ENSORLG00020002128	-	88	42.138	ENSORLG00020008424	-	96	42.138
ENSORLG00020002128	-	94	36.226	ENSORLG00020011234	-	90	36.226
ENSORLG00020002128	-	99	40.777	ENSORLG00020009857	-	97	40.777
ENSORLG00020002128	-	99	32.231	ENSORLG00020004162	znf341	54	32.231
ENSORLG00020002128	-	89	41.935	ENSORLG00020003719	GFI1B	60	41.935
ENSORLG00020002128	-	95	38.989	ENSORLG00020010250	-	94	35.826
ENSORLG00020002128	-	96	36.316	ENSORLG00020007790	zbtb48	69	36.316
ENSORLG00020002128	-	88	40.602	ENSORLG00020001791	-	67	40.909
ENSORLG00020002128	-	93	38.095	ENSORLG00020001395	-	50	38.095
ENSORLG00020002128	-	93	40.152	ENSORLG00020010020	-	89	40.152
ENSORLG00020002128	-	99	44.048	ENSORLG00020018069	-	99	44.048
ENSORLG00020002128	-	99	43.651	ENSORLG00020017850	-	98	42.636
ENSORLG00020002128	-	79	50.000	ENSORLG00020019227	-	90	50.000
ENSORLG00020002128	-	96	43.357	ENSORLG00020007967	-	96	45.977
ENSORLG00020002128	-	90	43.590	ENSORLG00020004353	-	97	43.590
ENSORLG00020002128	-	81	44.167	ENSORLG00020001922	-	83	44.615
ENSORLG00020002128	-	99	39.113	ENSORLG00020008933	-	74	39.113

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002128	-	93	51.724	ENSAPOG00000001054	-	80	51.724	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	34.204	ENSAPOG00000018586	-	88	33.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	32.426	ENSAPOG00000013499	-	76	39.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	35.254	ENSAPOG00000013493	-	86	33.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	32.046	ENSAPOG00000018492	-	72	35.294	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	41.758	ENSAPOG00000020116	-	95	41.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	90	37.745	ENSAPOG00000005187	-	64	38.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002128	-	99	34.775	ENSACIG00000022293	-	98	38.816	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002128	-	96	36.585	ENSACIG00000023794	-	84	36.199	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002128	-	77	45.455	ENSACIG00000007034	-	99	45.455	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002128	-	99	41.313	ENSACIG00000004041	-	99	39.852	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002128	-	99	41.304	ENSACIG00000010647	-	99	41.520	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002128	-	99	39.643	ENSAOCG00000013934	-	90	39.643	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	35.588	ENSAOCG00000012903	-	78	32.970	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	40.611	ENSAOCG00000013578	-	81	40.611	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	90	38.916	ENSAOCG00000013951	-	81	38.916	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	93	34.286	ENSAOCG00000010954	-	73	33.452	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	44.218	ENSAOCG00000015369	-	98	44.186	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	41.053	ENSAOCG00000022459	-	98	41.053	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	36.019	ENSAOCG00000020624	-	80	35.938	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002128	-	99	32.751	ENSAOCG00000019475	-	99	39.437	Amphiprion_ocellaris
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ENSORLG00020002128	-	99	34.565	ENSAPEG00000018471	-	88	33.929	Amphiprion_percula
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ENSORLG00020002128	-	99	38.857	ENSPNAG00000010752	-	98	39.759	Pygocentrus_nattereri
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