EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1265 bases
Position: chr12:27420352-27421616
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022095	RVT_1	PF00078.27	4.9e-19	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020012921	-	1265	-	ENSORLP00020022095	314 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSORLG00020002204	-	100	98.408	ENSORLG00020019504	-	87	98.408
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ENSORLG00020002204	-	100	97.452	ENSORLG00020019862	-	67	97.452
ENSORLG00020002204	-	96	54.575	ENSORLG00020003990	-	64	54.575
ENSORLG00020002204	-	98	97.078	ENSORLG00020004482	-	99	97.078
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ENSORLG00020002204	-	99	55.128	ENSORLG00020011898	-	55	55.128
ENSORLG00020002204	-	99	55.449	ENSORLG00020022028	-	58	55.449
ENSORLG00020002204	-	100	96.497	ENSORLG00020012080	-	67	96.497
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ENSORLG00020002204	-	71	50.667	ENSORLG00020004647	-	54	50.667
ENSORLG00020002204	-	100	97.134	ENSORLG00020019142	-	67	97.134
ENSORLG00020002204	-	94	47.475	ENSORLG00020011841	-	81	47.475
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ENSORLG00020002204	-	99	55.769	ENSORLG00020022349	-	58	55.769
ENSORLG00020002204	-	99	46.688	ENSORLG00020019399	-	57	46.541
ENSORLG00020002204	-	98	54.167	ENSORLG00020006573	-	65	54.167
ENSORLG00020002204	-	99	55.449	ENSORLG00020020026	-	55	55.449
ENSORLG00020002204	-	71	53.982	ENSORLG00020013014	-	50	53.982
ENSORLG00020002204	-	98	54.487	ENSORLG00020006316	-	58	54.487
ENSORLG00020002204	-	98	54.167	ENSORLG00020008589	-	58	54.167
ENSORLG00020002204	-	92	54.483	ENSORLG00020001622	-	96	54.483
ENSORLG00020002204	-	99	44.795	ENSORLG00020001541	-	81	44.795
ENSORLG00020002204	-	58	52.151	ENSORLG00020015544	-	52	52.151
ENSORLG00020002204	-	98	41.720	ENSORLG00020003888	-	68	41.720
ENSORLG00020002204	-	61	52.083	ENSORLG00020015149	-	60	52.083
ENSORLG00020002204	-	98	30.128	ENSORLG00020011014	-	63	30.128
ENSORLG00020002204	-	100	96.815	ENSORLG00020010320	-	67	96.815
ENSORLG00020002204	-	74	55.508	ENSORLG00020009639	-	52	55.508
ENSORLG00020002204	-	100	95.541	ENSORLG00020013078	-	67	95.541
ENSORLG00020002204	-	98	54.167	ENSORLG00020008115	-	65	54.167
ENSORLG00020002204	-	99	49.038	ENSORLG00020016788	-	79	49.038
ENSORLG00020002204	-	98	47.419	ENSORLG00020017052	-	87	47.419
ENSORLG00020002204	-	97	54.516	ENSORLG00020017390	-	58	54.516

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002204	-	99	47.452	ENSAOCG00000004576	-	85	47.452	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002204	-	99	46.815	ENSAPEG00000024502	-	85	46.815	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002204	-	98	53.074	ENSATEG00000014607	-	60	53.074	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002204	-	98	41.883	ENSATEG00000004798	-	54	41.883	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002204	-	98	41.883	ENSATEG00000019241	-	87	41.883	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002204	-	96	52.475	ENSATEG00000004857	-	65	52.475	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002204	-	98	52.751	ENSATEG00000015490	-	50	52.751	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002204	-	98	52.427	ENSATEG00000002739	-	50	52.427	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020002204	-	98	52.427	ENSATEG00000015931	-	61	52.427	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020002204	-	99	61.022	ENSACLG00000017363	-	71	61.022	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002204	-	99	60.703	ENSACLG00000006202	-	84	60.703	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002204	-	99	61.022	ENSACLG00000010080	-	71	61.022	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002204	-	75	49.789	ENSACLG00000000907	-	62	49.789	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002204	-	99	50.794	ENSACLG00000024568	-	74	50.794	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002204	-	68	45.205	ENSACLG00000013521	-	54	45.205	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002204	-	95	50.831	ENSACLG00000015659	-	51	50.831	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002204	-	99	44.872	ENSACLG00000017402	-	67	44.872	Astatotilapia_calliptera
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