EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002243 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1248 bases
Position: chr24:14396354-14397601
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001540	RVT_1	PF00078.27	2.4e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020012851	-	1248	-	ENSORLP00020001540	415 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020002243	-	75	36.677	ENSORLG00020009746	-	91	36.677
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ENSORLG00020002243	-	57	35.950	ENSORLG00020008245	-	76	35.950
ENSORLG00020002243	-	68	30.822	ENSORLG00020022162	-	76	30.822
ENSORLG00020002243	-	91	31.169	ENSORLG00020009908	-	57	31.169
ENSORLG00020002243	-	84	31.198	ENSORLG00020012070	-	58	31.198
ENSORLG00020002243	-	79	32.143	ENSORLG00020015544	-	95	32.143
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ENSORLG00020002243	-	89	31.383	ENSORLG00020008589	-	70	31.383
ENSORLG00020002243	-	89	31.383	ENSORLG00020003779	-	56	31.383
ENSORLG00020002243	-	89	31.383	ENSORLG00020003775	-	55	31.383
ENSORLG00020002243	-	89	31.383	ENSORLG00020011031	-	54	31.383
ENSORLG00020002243	-	97	32.108	ENSORLG00020017324	-	89	32.108
ENSORLG00020002243	-	97	32.353	ENSORLG00020013078	-	87	32.353
ENSORLG00020002243	-	79	33.333	ENSORLG00020017728	-	70	33.333
ENSORLG00020002243	-	67	32.509	ENSORLG00020001541	-	77	32.000
ENSORLG00020002243	-	89	31.649	ENSORLG00020021900	-	81	31.649
ENSORLG00020002243	-	96	32.360	ENSORLG00020001944	-	89	32.360
ENSORLG00020002243	-	57	35.270	ENSORLG00020022160	-	72	35.270
ENSORLG00020002243	-	87	33.060	ENSORLG00020011898	-	64	33.060
ENSORLG00020002243	-	89	31.649	ENSORLG00020000803	-	50	31.649
ENSORLG00020002243	-	72	95.638	ENSORLG00020016658	-	91	95.638
ENSORLG00020002243	-	89	33.600	ENSORLG00020006709	-	66	33.600

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002243	-	76	31.962	ENSAPEG00000016754	-	77	31.962	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002243	-	93	51.302	ENSAPEG00000014494	-	85	51.302	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002243	-	100	58.313	ENSACLG00000023788	-	81	58.313	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	83	53.179	ENSACLG00000010907	-	88	53.179	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	58.072	ENSACLG00000019498	-	58	58.072	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	51.566	ENSACLG00000020849	-	63	51.566	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	99	33.652	ENSACLG00000016231	-	72	33.652	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	71	52.027	ENSACLG00000001254	-	99	52.027	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	57.590	ENSACLG00000016956	-	74	57.590	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	61	36.187	ENSACLG00000015445	-	67	36.187	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	55.663	ENSACLG00000017241	-	69	55.663	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	70	58.478	ENSACLG00000016290	-	93	58.478	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	51.566	ENSACLG00000003707	-	50	51.566	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	85	34.648	ENSACLG00000021422	-	89	34.648	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	52	60.748	ENSACLG00000000505	-	61	60.748	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	59.036	ENSACLG00000004427	-	51	59.036	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	59.277	ENSACLG00000010366	-	91	59.277	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	51.084	ENSACLG00000027577	-	67	51.084	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	88	59.890	ENSACLG00000008558	-	77	59.890	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	100	61.928	ENSACLG00000008551	-	75	61.928	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	81	56.250	ENSACLG00000026307	-	92	56.250	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002243	-	90	52.139	ENSACLG00000027127	-	50	52.139	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002243	-	100	57.108	ENSPNYG00000010168	-	74	57.108	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00020002243	-	96	47.236	ENSXMAG00000028454	-	91	47.236	Xiphophorus_maculatus