EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002280 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo11
Alias: -
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 130823 bases
Position: chr9:8093287-8224109
Accession: ZDB-GENE-040711-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022119	IBN_N	PF03810.19	5.1e-19	1	1
ENSORLP00020001524	IBN_N	PF03810.19	5.5e-19	1	1
ENSORLP00020001497	IBN_N	PF03810.19	5.6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020012888	-	5181	-	ENSORLP00020001524	943 (aa)	-	-
ENSORLT00020012856	-	5277	-	ENSORLP00020022119	975 (aa)	-	-
ENSORLT00020012923	-	2814	-	ENSORLP00020001497	937 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSG00000086200	IPO11	100	90.123	Homo_sapiens
ENSORLG00020002280	ipo11	100	95.692	ENSAPOG00000009256	ipo11	100	95.692	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.009	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	83.009	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020002280	ipo11	92	94.763	ENSACIG00000003345	ipo11	98	94.789	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	92.083	ENSAOCG00000000164	ipo11	100	92.083	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002280	ipo11	100	92.092	ENSAPEG00000005496	ipo11	100	92.092	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002280	ipo11	95	95.770	ENSATEG00000016853	ipo11	99	95.770	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	78.803	ENSAPLG00000009338	IPO11	100	78.803	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020002280	ipo11	100	81.744	ENSACAG00000008472	IPO11	99	81.744	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSANAG00000027877	IPO11	99	83.077	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020002280	ipo11	100	88.753	ENSACLG00000014997	ipo11	100	88.753	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.845	ENSAMXG00000005993	ipo11	100	82.845	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002280	ipo11	91	83.159	ENSBTAG00000018616	IPO11	99	83.159	Bos_taurus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	83.077	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	ENSCAFG00000007240	IPO11	100	83.487	Canis_familiaris
ENSORLG00020002280	ipo11	75	83.357	ENSCAFG00020022776	-	99	83.357	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.667	ENSCHIG00000013218	IPO11	100	82.667	Capra_hircus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	81.333	ENSCPOG00000009412	IPO11	100	81.333	Cavia_porcellus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.282	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	83.282	Cebus_capucinus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSCATG00000040159	IPO11	100	83.179	Cercocebus_atys
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSCLAG00000003889	IPO11	100	83.179	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020002280	ipo11	58	83.057	ENSCSAG00000016001	IPO11	96	83.057	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020002280	ipo11	76	81.573	ENSCHOG00000002780	IPO11	77	81.898	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020002280	ipo11	100	84.410	ENSCPBG00000026824	IPO11	100	88.953	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002280	ipo11	99	34.077	ENSCING00000006626	-	99	34.112	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020002280	ipo11	99	34.306	ENSCSAVG00000003664	-	99	34.306	Ciona_savignyi
ENSORLG00020002280	ipo11	100	77.778	ENSCANG00000042405	IPO11	99	82.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.872	ENSCGRG00001012206	Ipo11	100	82.872	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.872	ENSCGRG00000003026	-	100	82.872	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020002280	ipo11	100	94.051	ENSCSEG00000017257	ipo11	100	94.051	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	93.949	ENSCVAG00000011995	ipo11	100	93.949	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	90.872	ENSDARG00000054224	ipo11	99	92.336	Danio_rerio
ENSORLG00020002280	ipo11	100	79.897	ENSDORG00000002721	Ipo11	100	79.897	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020002280	ipo11	98	35.882	FBgn0284254	Impbeta11	94	35.840	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020002280	ipo11	99	60.391	ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020002280	ipo11	54	80.859	ENSEASG00005006951	-	98	80.859	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.974	ENSECAG00000014185	IPO11	98	82.974	Equus_caballus
ENSORLG00020002280	ipo11	92	82.921	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	82.921	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	91.897	ENSELUG00000002842	ipo11	100	91.897	Esox_lucius
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	ENSFCAG00000003236	IPO11	100	83.487	Felis_catus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.487	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.462	ENSFDAG00000016117	IPO11	100	82.462	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	81.590	ENSFHEG00000017985	ipo11	100	81.590	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	90.256	ENSGMOG00000007727	ipo11	100	90.256	Gadus_morhua
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.564	ENSGALG00000014740	IPO11	100	82.564	Gallus_gallus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	93.436	ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.702	Gambusia_affinis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	92.308	ENSGACG00000006939	ipo11	100	92.308	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020002280	ipo11	85	87.791	ENSGAGG00000008880	IPO11	97	87.791	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSGGOG00000003240	IPO11	100	83.179	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020002280	ipo11	100	94.872	ENSHBUG00000004364	ipo11	100	94.872	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.974	ENSHGLG00000002375	IPO11	100	82.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.974	ENSHGLG00100011662	IPO11	100	82.974	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020002280	ipo11	100	89.308	ENSHCOG00000013529	ipo11	100	89.308	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002280	ipo11	99	72.690	ENSIPUG00000019077	clc4f	100	72.690	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSSTOG00000006070	IPO11	100	83.179	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.051	ENSJJAG00000007223	Ipo11	100	82.051	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020002280	ipo11	99	93.519	ENSKMAG00000013674	ipo11	100	93.519	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	94.667	ENSLBEG00000003126	ipo11	100	94.667	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002280	ipo11	100	87.363	ENSLOCG00000007848	ipo11	100	90.337	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.667	ENSLAFG00000003115	IPO11	100	83.180	Loxodonta_africana
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSMFAG00000035631	IPO11	98	83.179	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSMMUG00000001233	IPO11	100	90.123	Macaca_mulatta
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.282	ENSMNEG00000032061	IPO11	98	83.282	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSMLEG00000014468	IPO11	100	83.077	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	95.282	ENSMAMG00000020889	ipo11	100	95.282	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	94.974	ENSMZEG00005006586	ipo11	100	94.974	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002280	ipo11	100	72.421	ENSMGAG00000004204	IPO11	100	72.421	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020002280	ipo11	100	73.706	ENSMAUG00000020293	Ipo11	100	73.706	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	81.231	ENSMICG00000036842	-	100	81.231	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSMICG00000016463	-	100	83.077	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.051	ENSMOCG00000000236	Ipo11	100	82.051	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020002280	ipo11	100	91.752	ENSMMOG00000001391	ipo11	100	91.752	Mola_mola
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.564	ENSMODG00000019612	IPO11	100	82.564	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020002280	ipo11	100	94.564	ENSMALG00000017198	ipo11	100	94.564	Monopterus_albus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.154	MGP_CAROLIEiJ_G0018871	Ipo11	100	82.154	Mus_caroli
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.359	ENSMUSG00000042590	Ipo11	100	82.359	Mus_musculus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	81.333	MGP_PahariEiJ_G0015943	Ipo11	100	81.333	Mus_pahari
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.359	MGP_SPRETEiJ_G0019750	Ipo11	100	82.359	Mus_spretus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	80.308	ENSMPUG00000007026	IPO11	100	80.308	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.872	ENSMLUG00000011760	IPO11	99	82.872	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.359	ENSNGAG00000007024	Ipo11	100	82.359	Nannospalax_galili
ENSORLG00020002280	ipo11	94	90.078	ENSNBRG00000013831	ipo11	100	90.078	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.974	ENSNLEG00000003072	IPO11	100	82.974	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020002280	ipo11	74	81.884	ENSMEUG00000003783	-	74	81.884	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSODEG00000017269	IPO11	100	83.179	Octodon_degus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	95.179	ENSONIG00000015147	ipo11	100	95.179	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020002280	ipo11	87	82.619	ENSOANG00000012524	IPO11	91	82.619	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	99.590	ENSORLG00000004267	ipo11	100	99.729	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002280	ipo11	100	99.590	ENSORLG00015010565	ipo11	100	99.729	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002280	ipo11	100	98.564	ENSOMEG00000021765	ipo11	100	98.564	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSOGAG00000000533	IPO11	99	83.179	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.667	ENSOARG00000006763	IPO11	99	82.667	Ovis_aries
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.077	ENSPPAG00000042249	IPO11	100	83.077	Pan_paniscus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	ENSPPRG00000000856	IPO11	99	83.487	Panthera_pardus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.487	ENSPTIG00000015280	IPO11	100	83.487	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSPTRG00000016915	IPO11	100	83.179	Pan_troglodytes
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.179	ENSPANG00000013348	IPO11	100	83.179	Papio_anubis
ENSORLG00020002280	ipo11	100	89.333	ENSPKIG00000016964	ipo11	100	89.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002280	ipo11	100	83.709	ENSPSIG00000002959	IPO11	100	83.709	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020002280	ipo11	90	86.818	ENSPMGG00000013232	ipo11	95	86.818	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.256	ENSPEMG00000018393	Ipo11	100	82.256	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020002280	ipo11	100	82.051	ENSPCIG00000023292	IPO11	100	82.576	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020002280	ipo11	74	95.763	ENSPFOG00000019348	ipo11	98	94.224	Poecilia_formosa
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