EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002482 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22962 bases
Position: chr15:6113746-6136707
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001775	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.7e-29	1	2
ENSORLP00020001775	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.7e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020012456	-	5430	-	ENSORLP00020001775	832 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020002482's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020002482's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.761	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.325	Homo_sapiens
ENSORLG00020002482	papolg	100	87.425	ENSAPOG00000004798	papolg	100	87.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.415	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	70.455	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020002482	papolg	89	81.486	ENSACIG00000010546	papolg	99	79.416	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002482	papolg	100	88.024	ENSAOCG00000010254	papolg	100	87.784	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002482	papolg	100	87.784	ENSAPEG00000006944	papolg	100	87.545	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002482	papolg	100	88.862	ENSATEG00000009007	papolg	100	88.623	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002482	papolg	87	65.147	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.793	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020002482	papolg	71	60.065	ENSACAG00000015048	-	100	59.350	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.321	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	70.360	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.731	ENSACLG00000015592	papolg	100	86.550	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002482	papolg	99	76.892	ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.431	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.745	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	69.987	Bos_taurus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.628	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.628	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020002482	papolg	96	69.974	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.424	Canis_familiaris
ENSORLG00020002482	papolg	98	71.020	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	70.455	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.479	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	69.721	Capra_hircus
ENSORLG00020002482	papolg	99	69.894	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	70.133	Carlito_syrichta
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.385	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.120	Cavia_porcellus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.761	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.761	Cebus_capucinus
ENSORLG00020002482	papolg	81	80.603	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	80.603	Cercocebus_atys
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.784	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.948	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.722	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	70.722	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020002482	papolg	79	68.601	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.806	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020002482	papolg	59	64.503	ENSCING00000024664	-	92	64.503	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020002482	papolg	58	64.742	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.742	Ciona_savignyi
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.604	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	70.588	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020002482	papolg	87	70.811	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	70.461	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020002482	papolg	87	70.811	ENSCGRG00000005552	-	99	70.461	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020002482	papolg	89	84.324	ENSCSEG00000000771	papolg	99	83.514	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020002482	papolg	100	84.481	ENSCVAG00000016602	papolg	96	94.675	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002482	papolg	99	77.394	ENSDARG00000012141	papolg	100	76.596	Danio_rerio
ENSORLG00020002482	papolg	99	68.037	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	67.995	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020002482	papolg	52	85.151	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.151	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020002482	papolg	89	57.902	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	56.785	Echinops_telfairi
ENSORLG00020002482	papolg	56	58.442	ENSEBUG00000005042	-	79	58.442	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020002482	papolg	54	72.798	ENSEBUG00000004020	papolg	91	72.798	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.252	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	70.292	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.252	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	70.187	Equus_caballus
ENSORLG00020002482	papolg	89	63.284	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.968	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020002482	papolg	89	77.856	ENSELUG00000014497	papolg	99	77.228	Esox_lucius
ENSORLG00020002482	papolg	98	70.784	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.987	Felis_catus
ENSORLG00020002482	papolg	88	59.254	ENSFALG00000011079	PAPOLG	71	71.324	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.767	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	70.249	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020002482	papolg	63	82.463	ENSFHEG00000019080	papolg	97	81.955	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020002482	papolg	89	77.193	ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.350	Gadus_morhua
ENSORLG00020002482	papolg	87	61.702	ENSGALG00000007853	PAPOLG	99	62.500	Gallus_gallus
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.967	ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.395	Gambusia_affinis
ENSORLG00020002482	papolg	89	87.450	ENSGACG00000002718	papolg	100	87.316	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.643	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	70.628	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.731	ENSHBUG00000004882	papolg	100	86.557	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002482	papolg	88	71.084	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	71.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020002482	papolg	89	71.182	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	71.126	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020002482	papolg	100	84.311	ENSHCOG00000006782	papolg	100	83.952	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002482	papolg	99	77.586	ENSIPUG00000021642	papolg	100	77.285	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.557	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.557	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020002482	papolg	52	85.383	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.383	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.902	ENSKMAG00000016439	papolg	100	85.544	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002482	papolg	100	83.162	ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.047	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002482	papolg	96	64.314	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.048	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002482	papolg	99	76.247	ENSLOCG00000016130	papolg	100	75.889	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.424	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	86.571	Loxodonta_africana
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.360	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	70.761	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.360	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	70.761	Macaca_mulatta
ENSORLG00020002482	papolg	89	63.347	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	63.612	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.201	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	70.588	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020002482	papolg	100	88.144	ENSMAMG00000010667	papolg	100	87.923	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.731	ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.550	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002482	papolg	87	63.315	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	62.517	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020002482	papolg	88	71.505	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	71.506	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020002482	papolg	99	70.213	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	70.336	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002482	papolg	89	71.049	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.784	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020002482	papolg	99	88.456	ENSMMOG00000008020	papolg	99	86.980	Mola_mola
ENSORLG00020002482	papolg	87	69.867	ENSMODG00000002160	PAPOLG	98	69.292	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020002482	papolg	100	87.186	ENSMALG00000007012	papolg	100	86.946	Monopterus_albus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.993	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.981	Mus_caroli
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.861	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.981	Mus_musculus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.464	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.336	Mus_pahari
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.596	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.981	Mus_spretus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.385	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	70.159	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020002482	papolg	97	71.156	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	70.845	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.596	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	70.252	Nannospalax_galili
ENSORLG00020002482	papolg	89	76.954	ENSNBRG00000011943	papolg	99	77.748	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002482	papolg	52	84.884	ENSNLEG00000009507	-	100	84.884	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020002482	papolg	56	66.769	ENSMEUG00000013605	-	67	67.619	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020002482	papolg	99	70.120	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	69.761	Ochotona_princeps
ENSORLG00020002482	papolg	50	83.213	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.213	Octodon_degus
ENSORLG00020002482	papolg	89	81.292	ENSONIG00000002985	papolg	100	81.023	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020002482	papolg	95	69.396	ENSOANG00000012403	PAPOLG	98	69.583	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.252	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	70.159	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020002482	papolg	100	99.520	ENSORLG00000001577	papolg	100	99.520	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002482	papolg	100	99.520	ENSORLG00015008836	papolg	100	99.520	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002482	papolg	100	94.743	ENSOMEG00000001406	papolg	100	94.265	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002482	papolg	51	58.957	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	58.957	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020002482	papolg	99	70.346	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	69.588	Ovis_aries
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.777	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	70.761	Pan_paniscus
ENSORLG00020002482	papolg	98	71.049	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	70.385	Panthera_pardus
ENSORLG00020002482	papolg	98	70.916	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.252	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.777	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	70.761	Pan_troglodytes
ENSORLG00020002482	papolg	89	67.067	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	67.467	Papio_anubis
ENSORLG00020002482	papolg	99	75.265	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.879	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002482	papolg	95	76.034	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.641	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002482	papolg	94	67.377	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.578	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020002482	papolg	87	71.448	ENSPEMG00000008960	-	99	71.042	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020002482	papolg	88	52.202	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.857	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020002482	papolg	60	64.343	ENSPMAG00000004864	-	99	64.343	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020002482	papolg	89	69.412	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.150	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.630	ENSPFOG00000012909	papolg	100	85.495	Poecilia_formosa
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.259	ENSPLAG00000018445	papolg	100	85.124	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.412	ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.613	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020002482	papolg	100	84.977	ENSPREG00000010358	papolg	100	84.806	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.360	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	70.227	Pongo_abelii
ENSORLG00020002482	papolg	87	64.238	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.464	Procavia_capensis
ENSORLG00020002482	papolg	89	64.181	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	64.400	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020002482	papolg	79	80.935	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.273	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020002482	papolg	100	85.731	ENSPNYG00000006729	papolg	100	86.550	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020002482	papolg	99	78.117	ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.719	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.861	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	70.518	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020002482	papolg	89	66.043	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	65.246	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.604	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	69.774	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020002482	papolg	89	70.494	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.895	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020002482	papolg	83	69.583	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.306	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020002482	papolg	89	73.850	ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.184	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002482	papolg	89	66.129	ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.067	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002482	papolg	68	93.706	ENSSMAG00000015598	papolg	100	82.143	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002482	papolg	100	88.144	ENSSDUG00000000912	papolg	100	87.784	Seriola_dumerili
ENSORLG00020002482	papolg	100	88.024	ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.665	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020002482	papolg	87	68.097	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	67.156	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020002482	papolg	100	86.082	ENSSPAG00000009004	papolg	100	85.848	Stegastes_partitus
ENSORLG00020002482	papolg	99	70.503	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.159	Sus_scrofa
ENSORLG00020002482	papolg	64	71.992	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	71.992	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020002482	papolg	89	82.038	ENSTRUG00000006410	papolg	99	81.696	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002482	papolg	89	78.429	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.896	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020002482	papolg	88	64.305	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	64.219	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020002482	papolg	96	66.401	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	66.799	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020002482	papolg	97	69.774	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.509	Ursus_americanus
ENSORLG00020002482	papolg	95	70.620	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	70.777	Ursus_maritimus
ENSORLG00020002482	papolg	88	66.533	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.312	Vicugna_pacos
ENSORLG00020002482	papolg	96	70.385	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	70.557	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020002482	papolg	89	67.277	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.754	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020002482	papolg	60	95.409	ENSXCOG00000006611	papolg	73	95.409	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020002482	papolg	67	92.829	ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.829	Xiphophorus_maculatus