EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002579 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11598 bases
Position: chr11:18944312-18955909
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001849	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020012327	-	2223	-	ENSORLP00020001849	375 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.505	ENSG00000105849	TWISTNB	88	44.340	Homo_sapiens
ENSORLG00020002579	twistnb	100	67.792	ENSAPOG00000011796	twistnb	100	67.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002579	twistnb	98	64.324	ENSACIG00000020400	twistnb	97	66.027	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002579	twistnb	99	67.885	ENSAOCG00000024200	twistnb	99	67.624	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002579	twistnb	99	68.146	ENSAPEG00000016750	twistnb	99	67.885	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002579	twistnb	99	67.192	ENSATEG00000017956	twistnb	99	65.617	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002579	twistnb	100	64.721	ENSACLG00000022280	twistnb	94	64.721	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002579	twistnb	53	62.562	ENSAMXG00000035868	twistnb	61	61.881	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002579	twistnb	53	56.716	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	52	61.047	Bos_taurus
ENSORLG00020002579	twistnb	51	60.209	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	52	61.236	Canis_familiaris
ENSORLG00020002579	twistnb	50	59.043	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	53	59.551	Capra_hircus
ENSORLG00020002579	twistnb	92	43.590	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	91	43.168	Cavia_porcellus
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.173	ENSCATG00000035621	TWISTNB	88	44.340	Cercocebus_atys
ENSORLG00020002579	twistnb	51	59.487	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	43.614	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.173	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	88	44.340	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.173	ENSCANG00000038759	TWISTNB	88	44.340	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020002579	twistnb	99	60.411	ENSCVAG00000014324	twistnb	99	62.051	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002579	twistnb	87	44.920	ENSDARG00000024416	twistnb	87	45.748	Danio_rerio
ENSORLG00020002579	twistnb	85	44.785	ENSDORG00000007795	Twistnb	90	43.396	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020002579	twistnb	98	53.495	ENSELUG00000000098	TWISTNB	94	51.685	Esox_lucius
ENSORLG00020002579	twistnb	73	45.907	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	58.974	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020002579	twistnb	52	57.868	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	96	42.522	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020002579	twistnb	99	61.640	ENSFHEG00000013318	twistnb	99	59.580	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020002579	twistnb	65	68.992	ENSGAFG00000018309	twistnb	99	58.201	Gambusia_affinis
ENSORLG00020002579	twistnb	67	67.194	ENSGACG00000006425	twistnb	100	67.033	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020002579	twistnb	51	56.701	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	88	44.654	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020002579	twistnb	95	65.642	ENSHBUG00000020155	twistnb	94	64.721	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002579	twistnb	95	55.087	ENSHCOG00000010590	twistnb	96	55.583	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002579	twistnb	90	47.472	ENSIPUG00000004117	twistnb	87	48.012	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002579	twistnb	88	44.242	ENSJJAG00000015887	Twistnb	55	61.236	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020002579	twistnb	100	58.947	ENSKMAG00000001591	twistnb	100	60.686	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002579	twistnb	100	64.042	ENSLBEG00000024225	twistnb	100	64.304	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002579	twistnb	87	46.246	ENSLACG00000010508	TWISTNB	83	45.425	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002579	twistnb	80	47.841	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	88	44.025	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020002579	twistnb	80	47.841	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	87	44.025	Macaca_mulatta
ENSORLG00020002579	twistnb	82	45.833	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	86	43.631	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.173	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	88	44.340	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020002579	twistnb	95	65.642	ENSMZEG00005007561	twistnb	94	64.721	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002579	twistnb	80	47.213	ENSMICG00000036489	TWISTNB	90	45.426	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002579	twistnb	79	48.495	ENSMOCG00000003458	Twistnb	90	45.955	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020002579	twistnb	99	59.021	ENSMMOG00000020085	twistnb	99	59.640	Mola_mola
ENSORLG00020002579	twistnb	78	44.482	ENSMODG00000001402	-	65	43.631	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020002579	twistnb	98	56.298	ENSMALG00000016407	twistnb	100	55.000	Monopterus_albus
ENSORLG00020002579	twistnb	53	56.436	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	90	44.089	Mus_caroli
ENSORLG00020002579	twistnb	53	55.941	ENSMUSG00000020561	Twistnb	88	45.455	Mus_musculus
ENSORLG00020002579	twistnb	53	55.941	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	90	44.409	Mus_spretus
ENSORLG00020002579	twistnb	51	58.462	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	50	60.674	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020002579	twistnb	100	64.908	ENSNBRG00000008652	twistnb	100	65.252	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002579	twistnb	88	46.131	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	88	44.340	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020002579	twistnb	90	44.767	ENSODEG00000007222	TWISTNB	91	44.410	Octodon_degus
ENSORLG00020002579	twistnb	98	97.290	ENSORLG00000004005	twistnb	88	97.290	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002579	twistnb	100	98.133	ENSORLG00015013403	twistnb	89	98.133	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002579	twistnb	52	57.360	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	88	45.223	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020002579	twistnb	50	59.043	ENSOARG00000009803	TWISTNB	53	59.551	Ovis_aries
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.505	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	88	44.479	Pan_paniscus
ENSORLG00020002579	twistnb	80	48.505	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	88	44.340	Pan_troglodytes
ENSORLG00020002579	twistnb	55	63.158	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	64.948	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002579	twistnb	95	60.434	ENSPMGG00000019023	twistnb	95	60.822	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020002579	twistnb	82	43.974	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	87	41.270	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020002579	twistnb	80	45.333	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	88	43.519	Pongo_abelii
ENSORLG00020002579	twistnb	95	65.363	ENSPNYG00000002674	twistnb	100	64.456	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020002579	twistnb	86	50.292	ENSPNAG00000011956	twistnb	85	50.949	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002579	twistnb	72	47.138	ENSSFOG00015012788	twistnb	58	64.865	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002579	twistnb	100	65.969	ENSSMAG00000012792	twistnb	100	64.921	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002579	twistnb	100	65.274	ENSSDUG00000007038	twistnb	100	65.796	Seriola_dumerili
ENSORLG00020002579	twistnb	100	67.363	ENSSPAG00000005871	twistnb	100	67.363	Stegastes_partitus
ENSORLG00020002579	twistnb	89	57.015	ENSTNIG00000017778	twistnb	90	58.013	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020002579	twistnb	51	57.216	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	53	60.112	Ursus_americanus
ENSORLG00020002579	twistnb	51	56.701	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	53	59.551	Ursus_maritimus
ENSORLG00020002579	twistnb	51	59.686	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	53	60.674	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020002579	twistnb	93	62.570	ENSXCOG00000020199	twistnb	96	57.568	Xiphophorus_couchianus