EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002718 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3473 bases
Position: chr22:14984604-14988076
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022425	RVT_1	PF00078.27	1.3e-43	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020012088	-	3473	-	ENSORLP00020022425	966 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSORLG00020002718	-	96	43.392	ENSORLG00020008688	-	97	43.392
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ENSORLG00020002718	-	96	43.184	ENSORLG00020018578	-	97	43.184
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ENSORLG00020002718	-	52	52.191	ENSORLG00020004992	-	98	52.191
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ENSORLG00020002718	-	98	45.732	ENSORLG00020015506	-	98	45.732
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ENSORLG00020002718	-	80	64.286	ENSORLG00020004099	-	99	64.668
ENSORLG00020002718	-	82	42.020	ENSORLG00020016049	-	99	42.020
ENSORLG00020002718	-	63	45.246	ENSORLG00020012070	-	99	45.246
ENSORLG00020002718	-	54	52.199	ENSORLG00020008589	-	97	52.199
ENSORLG00020002718	-	99	42.842	ENSORLG00020008178	-	85	42.842
ENSORLG00020002718	-	55	72.212	ENSORLG00020022028	-	98	72.212
ENSORLG00020002718	-	51	43.110	ENSORLG00020005777	-	93	43.110

Orthologs

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ENSORLG00020002718	-	58	43.907	ENSATEG00000004798	-	98	43.617	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	83	37.562	ENSATEG00000005707	-	98	37.562	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	52	53.082	ENSATEG00000015931	-	99	53.082	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	88	44.884	ENSATEG00000019512	-	99	44.884	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	88	44.884	ENSATEG00000010674	-	99	44.884	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	64	41.346	ENSATEG00000023197	-	97	41.346	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	63	48.773	ENSATEG00000002739	-	98	48.773	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	97	37.354	ENSATEG00000012907	-	96	37.354	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	53	52.745	ENSATEG00000014607	-	98	52.745	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002718	-	63	48.445	ENSATEG00000015490	-	98	48.445	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020002718	-	62	42.647	ENSACLG00000012279	-	98	42.647	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002718	-	87	47.362	ENSACLG00000009850	-	96	47.362	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002718	-	56	44.022	ENSACLG00000018945	-	93	44.022	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002718	-	57	49.186	ENSACLG00000010082	-	98	49.186	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002718	-	90	44.369	ENSACLG00000000734	-	99	44.369	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002718	-	58	52.660	ENSACLG00000000182	-	99	52.660	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020002718	-	93	46.923	ENSACLG00000015650	-	99	46.923	Astatotilapia_calliptera
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