EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002857 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: -
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 426 bases
Position: chr24:118402-118827
Accession: ZDB-GENE-081110-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020002119	PTH2	PF01981.16	1.3e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020011859	-	357	-	ENSORLP00020002119	118 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020002857's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020002857's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSG00000184924	PTRHD1	83	57.265	Homo_sapiens
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	92	80.342	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.410	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	82.051	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	92	80.342	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	92	80.342	Amphiprion_percula
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSATEG00000019199	ptrhd1	92	80.342	Anabas_testudineus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSANAG00000019089	PTRHD1	83	57.265	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	ENSACLG00000000814	ptrhd1	92	82.906	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	73.276	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	73.276	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	60.684	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	83	60.684	Bos_taurus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	97	48.246	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	44.444	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	56.410	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	83	56.410	Canis_familiaris
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	59.829	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	83	59.829	Capra_hircus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	83	56.410	Carlito_syrichta
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	83	56.410	Cavia_porcellus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	83	57.265	Cebus_capucinus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.897	ENSCATG00000033690	PTRHD1	83	56.897	Cercocebus_atys
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	80	57.265	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	83	57.265	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	44.828	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	84	44.828	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	55.556	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	82	55.556	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.621	ENSCING00000019647	-	97	58.621	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCANG00000034444	PTRHD1	83	57.265	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	55	57.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	83	57.265	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	92	81.197	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	92	81.197	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	76.068	ENSDARG00000016122	ptrhd1	92	76.068	Danio_rerio
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	77	56.410	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	55.556	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	83	55.556	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	58.974	FBgn0038446	CG14903	97	58.974	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	45.690	ENSETEG00000009379	-	85	45.690	Echinops_telfairi
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	60.345	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	40.678	ENSEASG00005001302	-	82	40.678	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSECAG00000017730	PTRHD1	83	57.265	Equus_caballus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	40.678	ENSECAG00000005314	-	79	40.678	Equus_caballus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	60.684	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	83	60.684	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	75.214	ENSELUG00000003837	ptrhd1	92	75.214	Esox_lucius
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	83	56.410	Felis_catus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.974	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	83	58.974	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	92	80.342	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.034	ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.034	Gallus_gallus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	92	81.197	Gambusia_affinis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSGACG00000006743	ptrhd1	91	81.197	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	91	57.265	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	92	56.410	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	92	82.051	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.974	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	83	58.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSHGLG00100004341	-	85	57.265	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	83	58.120	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	91	81.197	Hippocampus_comes
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	73.504	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	73.504	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	83	57.265	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	84	56.410	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	96	80.531	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	80.531	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	92	81.197	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002857	ptrhd1	88	70.192	ENSLACG00000018052	PTRHD1	92	65.812	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	75.000	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	90	75.000	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	83	58.120	Loxodonta_africana
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	83	56.410	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	83	56.410	Macaca_mulatta
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	83	56.410	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	55.172	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	83	55.172	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	77.778	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	92	77.778	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	92	82.906	Maylandia_zebra
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	83	58.120	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.974	ENSMICG00000001578	PTRHD1	83	58.974	Microcebus_murinus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	55.556	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	55.556	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	79.487	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	92	79.487	Mola_mola
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSMODG00000015895	PTRHD1	85	58.120	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	78.632	ENSMALG00000003471	ptrhd1	92	78.632	Monopterus_albus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	83	56.410	Mus_caroli
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	56.410	Mus_musculus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	83	56.410	Mus_spretus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	83	58.120	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	83	57.265	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	83	58.120	Nannospalax_galili
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	92	82.906	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	57.265	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	83	57.265	Ochotona_princeps
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSODEG00000007805	PTRHD1	80	56.410	Octodon_degus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	ENSONIG00000015722	ptrhd1	85	82.051	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	83	58.120	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	100	99.153	ENSORLG00000028768	ptrhd1	100	99.153	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	99.145	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	99.145	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002857	ptrhd1	100	94.915	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	92	94.915	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	54.701	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	83	54.701	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	59.829	ENSOARG00000018052	PTRHD1	83	59.829	Ovis_aries
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	83	57.265	Pan_paniscus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	83	56.410	Panthera_pardus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	83	56.410	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	83	57.265	Pan_troglodytes
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSPANG00000006781	PTRHD1	83	58.120	Papio_anubis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	70.940	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	79	70.940	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	78.632	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	92	78.632	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	88	68.269	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	92	64.957	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.974	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	58.974	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	79.487	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	82	79.487	Poecilia_formosa
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	79.487	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	79.487	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	92	80.342	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	80.342	ENSPREG00000017624	ptrhd1	92	80.342	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	83	57.265	Pongo_abelii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	83	58.120	Procavia_capensis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	83	58.120	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.974	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	83	58.974	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	92	82.906	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	75.214	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	75.214	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	83	57.265	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	83	57.265	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSRROG00000029627	PTRHD1	83	57.265	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	83	58.120	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	57.265	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	76.068	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	76.068	Scleropages_formosus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	79.487	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	91	79.487	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	78	82.051	Seriola_dumerili
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	92	82.051	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	87	58.120	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.906	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	82.906	Stegastes_partitus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	83	47.959	ENSSSCG00000040441	-	78	47.959	Sus_scrofa
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	59.829	ENSTGUG00000015169	-	85	59.829	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	77.778	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	92	77.778	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	78.632	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	78.632	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	54.701	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	83	54.701	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	83	57.265	Ursus_americanus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	58.120	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	83	58.120	Vicugna_pacos
ENSORLG00020002857	ptrhd1	87	65.049	ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.069	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	92	81.197	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	81.197	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	92	81.197	Xiphophorus_maculatus