EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020002955 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3003 bases
Position: chr5:5029290-5032292
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020002215	RVT_1	PF00078.27	1.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020011692	-	3003	-	ENSORLP00020002215	774 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020002955	-	50	32.828	ENSORLG00020008083	-	83	32.828
ENSORLG00020002955	-	57	71.171	ENSORLG00020019816	-	84	71.171
ENSORLG00020002955	-	52	71.535	ENSORLG00020017929	-	83	71.535
ENSORLG00020002955	-	51	34.171	ENSORLG00020006805	-	83	34.171
ENSORLG00020002955	-	62	30.556	ENSORLG00020002120	-	74	31.781
ENSORLG00020002955	-	54	34.491	ENSORLG00020012070	-	85	31.540
ENSORLG00020002955	-	57	39.002	ENSORLG00020009687	-	78	39.002
ENSORLG00020002955	-	55	31.840	ENSORLG00020009946	-	76	31.840
ENSORLG00020002955	-	76	30.066	ENSORLG00020000803	-	79	30.066
ENSORLG00020002955	-	52	31.000	ENSORLG00020011415	-	64	31.000
ENSORLG00020002955	-	50	34.085	ENSORLG00020018183	-	92	34.085
ENSORLG00020002955	-	50	32.741	ENSORLG00020019862	-	83	32.741
ENSORLG00020002955	-	54	34.107	ENSORLG00020011898	-	75	34.107
ENSORLG00020002955	-	56	31.522	ENSORLG00020019476	-	82	32.444
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020004992	-	82	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020014098	-	78	33.492
ENSORLG00020002955	-	85	30.861	ENSORLG00020011465	-	83	30.861
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020018053	-	83	33.492
ENSORLG00020002955	-	51	34.336	ENSORLG00020003990	-	83	34.336
ENSORLG00020002955	-	53	32.227	ENSORLG00020020284	-	84	32.227
ENSORLG00020002955	-	53	33.803	ENSORLG00020022349	-	77	33.803
ENSORLG00020002955	-	52	33.415	ENSORLG00020013014	-	91	33.415
ENSORLG00020002955	-	51	34.171	ENSORLG00020018736	-	95	34.171
ENSORLG00020002955	-	73	30.324	ENSORLG00020021613	-	85	30.324
ENSORLG00020002955	-	53	33.178	ENSORLG00020021677	-	84	33.178
ENSORLG00020002955	-	97	34.605	ENSORLG00020003695	-	80	34.605
ENSORLG00020002955	-	50	32.161	ENSORLG00020010320	-	83	32.161
ENSORLG00020002955	-	54	33.793	ENSORLG00020006907	-	81	32.972
ENSORLG00020002955	-	51	33.668	ENSORLG00020006573	-	83	33.668
ENSORLG00020002955	-	51	33.747	ENSORLG00020022231	-	98	33.747
ENSORLG00020002955	-	61	31.667	ENSORLG00020006709	-	84	31.667
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020017390	-	79	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020008589	-	78	33.492
ENSORLG00020002955	-	50	32.663	ENSORLG00020012080	-	83	32.663
ENSORLG00020002955	-	56	32.088	ENSORLG00020019768	-	85	33.034
ENSORLG00020002955	-	51	34.171	ENSORLG00020010410	-	83	34.171
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020010414	-	87	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	33.649	ENSORLG00020006316	-	78	33.649
ENSORLG00020002955	-	50	32.658	ENSORLG00020019142	-	83	32.911
ENSORLG00020002955	-	50	32.995	ENSORLG00020013078	-	83	32.995
ENSORLG00020002955	-	50	32.225	ENSORLG00020004647	-	93	32.992
ENSORLG00020002955	-	75	69.468	ENSORLG00020013338	-	71	69.468
ENSORLG00020002955	-	50	34.177	ENSORLG00020008115	-	82	34.177
ENSORLG00020002955	-	51	35.411	ENSORLG00020014641	-	83	35.411
ENSORLG00020002955	-	53	35.049	ENSORLG00020019661	-	76	35.049
ENSORLG00020002955	-	50	36.548	ENSORLG00020006220	-	74	36.548
ENSORLG00020002955	-	53	33.254	ENSORLG00020009639	-	92	33.254
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020015063	-	82	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020009707	-	82	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020021900	-	91	33.492
ENSORLG00020002955	-	53	34.038	ENSORLG00020022028	-	77	34.038
ENSORLG00020002955	-	53	33.577	ENSORLG00020011014	-	83	33.577
ENSORLG00020002955	-	56	32.018	ENSORLG00020012664	-	85	32.960
ENSORLG00020002955	-	53	33.254	ENSORLG00020011734	-	82	33.254
ENSORLG00020002955	-	53	33.492	ENSORLG00020002173	-	92	33.492
ENSORLG00020002955	-	52	33.659	ENSORLG00020004056	-	92	33.659
ENSORLG00020002955	-	50	33.835	ENSORLG00020009885	-	92	33.835
ENSORLG00020002955	-	53	34.112	ENSORLG00020020026	-	74	34.112
ENSORLG00020002955	-	54	33.487	ENSORLG00020015750	-	91	33.487

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020002955	-	77	72.727	ENSACLG00000006988	-	87	72.727	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	81	31.308	ENSACLG00000004427	-	78	31.308	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	53	71.602	ENSACLG00000004613	-	99	71.602	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	63	32.323	ENSACLG00000017241	-	80	32.323	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	58	33.190	ENSACLG00000016956	-	80	33.190	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	72	30.756	ENSACLG00000020009	-	95	30.756	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	52	34.568	ENSACLG00000023788	-	78	34.568	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	82	75.472	ENSACLG00000009813	-	74	75.472	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	51	77.078	ENSACLG00000021422	-	100	77.078	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	51	35.088	ENSACLG00000026433	-	88	35.088	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	81	31.988	ENSACLG00000021942	-	92	32.457	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	56	31.180	ENSACLG00000005509	-	98	31.403	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	64	72.177	ENSACLG00000016231	-	85	72.177	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020002955	-	54	31.175	ENSAMXG00000035582	-	81	31.175	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002955	-	88	40.529	ENSAMXG00000029265	-	73	40.529	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020002955	-	56	30.345	ENSCPBG00000001489	-	77	30.345	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002955	-	55	30.000	ENSCPBG00000010408	-	85	30.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002955	-	54	30.952	ENSCPBG00000022715	-	92	30.952	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020002955	-	54	31.517	ENSGAGG00000010190	-	97	31.517	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	56	30.892	ENSGAGG00000002004	-	94	30.892	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	52	32.512	ENSGAGG00000022089	-	96	32.512	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	61	30.021	ENSGAGG00000018246	-	84	30.021	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	56	30.365	ENSGAGG00000021953	-	79	30.365	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	54	30.806	ENSGAGG00000021454	-	97	30.806	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	59	30.568	ENSGAGG00000017706	-	95	30.568	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	61	30.444	ENSGAGG00000011204	-	83	30.444	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	56	30.892	ENSGAGG00000006259	-	92	30.892	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	56	31.081	ENSGAGG00000014895	-	87	31.081	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020002955	-	54	54.415	ENSKMAG00000020993	-	99	54.415	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002955	-	54	32.075	ENSKMAG00000012711	-	50	32.075	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002955	-	69	31.066	ENSKMAG00000004644	-	79	31.066	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020002955	-	50	35.476	ENSLBEG00000008627	-	66	35.476	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002955	-	86	30.479	ENSLBEG00000015802	-	93	30.479	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002955	-	51	37.940	ENSLBEG00000007826	-	100	37.940	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002955	-	70	30.055	ENSLBEG00000018374	-	80	30.055	Labrus_bergylta
ENSORLG00020002955	-	50	59.585	ENSMALG00000009397	-	97	59.585	Monopterus_albus
ENSORLG00020002955	-	72	30.427	ENSMALG00000020948	-	79	30.427	Monopterus_albus
ENSORLG00020002955	-	69	30.684	ENSONIG00000021263	-	71	30.684	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020002955	-	62	58.471	ENSORLG00000025054	-	84	58.471	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	53	35.049	ENSORLG00000025899	-	76	35.049	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	99	56.516	ENSORLG00000023054	-	70	56.516	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	90	30.154	ENSORLG00000026858	-	83	30.154	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	73	31.424	ENSORLG00000030445	-	83	31.424	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	68	31.589	ENSORLG00000022703	-	82	31.589	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	100	69.121	ENSORLG00000024201	-	71	69.121	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	100	68.863	ENSORLG00000025129	-	71	68.863	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	95	31.085	ENSORLG00000030276	-	78	31.085	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	86	31.213	ENSORLG00000024888	-	87	31.213	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	75	68.793	ENSORLG00000024294	-	99	68.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	53	35.049	ENSORLG00000026969	-	76	35.049	Oryzias_latipes
ENSORLG00020002955	-	81	56.051	ENSORLG00015005330	-	98	56.051	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002955	-	51	35.443	ENSORLG00015013285	-	78	35.443	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002955	-	73	68.440	ENSORLG00015020629	-	87	68.440	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020002955	-	53	31.707	ENSOMEG00000008180	-	73	31.707	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002955	-	70	30.824	ENSOMEG00000012000	-	99	30.824	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002955	-	55	48.578	ENSOMEG00000001970	-	83	48.578	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002955	-	100	70.785	ENSOMEG00000015999	-	71	70.785	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002955	-	100	54.744	ENSOMEG00000007525	-	83	54.744	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020002955	-	59	31.739	ENSPNYG00000010168	-	80	31.739	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020002955	-	75	30.691	ENSXMAG00000024044	-	84	30.691	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020002955	-	75	30.718	ENSXMAG00000026064	-	81	30.718	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020002955	-	88	30.372	ENSXMAG00000023391	-	69	30.372	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020002955	-	84	30.677	ENSXMAG00000023609	-	79	30.677	Xiphophorus_maculatus