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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020003058 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srrt
Alias: -
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9115 bases
Position: chr14:14208547-14217661
Accession: 101166978
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020002304	ARS2	PF04959.13	4.5e-87	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020011545	-	2877	XM_020708930	ENSORLP00020002304	870 (aa)	XP_020564589	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.891	ENSG00000087087	SRRT	98	88.710	Homo_sapiens
ENSORLG00020003058	srrt	95	80.710	ENSAPOG00000002304	srrt	98	87.123	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020003058	srrt	96	63.200	ENSAMEG00000014506	SRRT	96	65.132	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020003058	srrt	85	91.176	ENSACIG00000015795	srrt	94	91.702	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020003058	srrt	93	55.042	ENSAOCG00000009189	-	96	56.829	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020003058	srrt	84	92.341	ENSAOCG00000009693	srrt	98	87.558	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020003058	srrt	83	92.123	ENSAPEG00000003646	srrt	97	92.128	Amphiprion_percula
ENSORLG00020003058	srrt	93	55.042	ENSAPEG00000020016	-	96	56.829	Amphiprion_percula
ENSORLG00020003058	srrt	53	62.245	ENSATEG00000003652	-	89	63.786	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003058	srrt	95	84.468	ENSATEG00000014425	srrt	98	85.781	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.784	ENSACAG00000001014	SRRT	98	66.053	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSANAG00000031718	SRRT	96	64.902	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020003058	srrt	95	84.468	ENSACLG00000013156	srrt	94	87.179	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003058	srrt	53	64.979	ENSACLG00000009423	-	96	55.822	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003058	srrt	51	79.911	ENSAMXG00000016671	srrt	95	72.005	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.333	ENSBTAG00000001134	SRRT	96	64.483	Bos_taurus
ENSORLG00020003058	srrt	65	44.794	WBGene00017085	E01A2.2	85	43.552	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSCJAG00000014917	SRRT	96	65.665	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020003058	srrt	96	63.908	ENSCAFG00000023538	SRRT	96	65.353	Canis_familiaris
ENSORLG00020003058	srrt	98	63.375	ENSCAFG00020013358	SRRT	99	63.227	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.810	ENSCHIG00000010495	SRRT	96	64.828	Capra_hircus
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.785	Carlito_syrichta
ENSORLG00020003058	srrt	95	64.497	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	65.842	Cavia_aperea
ENSORLG00020003058	srrt	96	63.605	ENSCPOG00000001739	SRRT	96	65.438	Cavia_porcellus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSCCAG00000015877	SRRT	96	65.589	Cebus_capucinus
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSCATG00000036306	SRRT	97	64.794	Cercocebus_atys
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.548	ENSCLAG00000007568	SRRT	94	67.611	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSCSAG00000017996	SRRT	96	65.513	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020003058	srrt	51	74.815	ENSCHOG00000007815	SRRT	64	74.265	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020003058	srrt	69	74.123	ENSCPBG00000011553	SRRT	81	72.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020003058	srrt	100	42.437	ENSCING00000003506	-	86	44.659	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020003058	srrt	100	42.556	ENSCSAVG00000008394	-	81	55.714	Ciona_savignyi
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSCANG00000034556	SRRT	96	65.625	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020003058	srrt	96	63.531	ENSCGRG00001001594	Srrt	96	65.052	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020003058	srrt	96	59.096	ENSCGRG00000007292	Srrt	95	67.339	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020003058	srrt	52	63.907	ENSCSEG00000005233	-	96	53.783	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020003058	srrt	98	72.811	ENSCSEG00000017878	srrt	98	75.691	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020003058	srrt	95	84.487	ENSCVAG00000019848	srrt	98	85.215	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020003058	srrt	96	74.765	ENSDARG00000017762	srrt	98	74.087	Danio_rerio
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSDNOG00000003851	SRRT	96	65.012	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.005	ENSDORG00000005584	Srrt	95	68.571	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020003058	srrt	89	53.348	FBgn0033062	Ars2	79	53.863	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020003058	srrt	74	71.429	ENSETEG00000016175	SRRT	82	73.548	Echinops_telfairi
ENSORLG00020003058	srrt	61	62.690	ENSEBUG00000008517	-	76	62.690	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSEASG00005016956	SRRT	96	65.242	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSECAG00000012292	SRRT	96	65.057	Equus_caballus
ENSORLG00020003058	srrt	80	77.083	ENSEEUG00000009117	SRRT	81	71.875	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020003058	srrt	93	59.102	ENSELUG00000021216	-	96	59.587	Esox_lucius
ENSORLG00020003058	srrt	96	73.533	ENSELUG00000006651	srrt	96	71.868	Esox_lucius
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.162	ENSFCAG00000006855	SRRT	96	64.828	Felis_catus
ENSORLG00020003058	srrt	52	70.354	ENSFDAG00000021347	SRRT	96	64.118	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020003058	srrt	53	58.144	ENSFHEG00000004105	-	96	57.851	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020003058	srrt	76	88.095	ENSFHEG00000002756	srrt	93	88.645	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020003058	srrt	73	66.063	ENSGMOG00000018694	-	94	51.990	Gadus_morhua
ENSORLG00020003058	srrt	96	73.955	ENSGMOG00000018619	srrt	98	73.923	Gadus_morhua
ENSORLG00020003058	srrt	52	63.557	ENSGAFG00000020383	-	96	55.282	Gambusia_affinis
ENSORLG00020003058	srrt	95	83.990	ENSGAFG00000005423	srrt	98	84.732	Gambusia_affinis
ENSORLG00020003058	srrt	93	52.582	ENSGACG00000001100	-	96	55.336	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020003058	srrt	96	82.000	ENSGACG00000020387	srrt	98	81.524	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSGGOG00000001508	SRRT	96	65.581	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020003058	srrt	52	91.429	ENSHBUG00000002942	srrt	94	86.713	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.079	ENSHGLG00000008344	Srrt	92	68.815	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020003058	srrt	96	65.192	ENSHGLG00100018857	Srrt	92	69.538	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020003058	srrt	98	81.097	ENSHCOG00000005403	srrt	98	80.863	Hippocampus_comes
ENSORLG00020003058	srrt	93	54.121	ENSHCOG00000008904	-	95	54.038	Hippocampus_comes
ENSORLG00020003058	srrt	93	71.463	ENSIPUG00000021150	srrt	98	71.642	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.111	ENSSTOG00000013776	SRRT	96	65.661	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.520	ENSJJAG00000010446	Srrt	92	69.392	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020003058	srrt	52	64.509	ENSKMAG00000008468	-	96	55.645	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020003058	srrt	53	89.530	ENSKMAG00000013599	srrt	98	83.778	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020003058	srrt	98	78.522	ENSLBEG00000016308	srrt	98	78.472	Labrus_bergylta
ENSORLG00020003058	srrt	95	54.748	ENSLACG00000001089	SRRT	98	56.946	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020003058	srrt	57	82.278	ENSLOCG00000013658	srrt	100	58.222	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSLAFG00000007725	SRRT	96	65.081	Loxodonta_africana
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSMFAG00000033745	SRRT	99	64.753	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020003058	srrt	96	62.984	ENSMMUG00000021255	SRRT	96	65.513	Macaca_mulatta
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSMNEG00000041864	SRRT	97	64.753	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSMLEG00000029479	SRRT	98	64.753	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020003058	srrt	95	83.134	ENSMAMG00000014311	srrt	98	85.781	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020003058	srrt	52	66.094	ENSMAMG00000010681	-	96	56.744	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020003058	srrt	53	65.190	ENSMZEG00005028002	-	96	55.822	Maylandia_zebra
ENSORLG00020003058	srrt	52	91.648	ENSMZEG00005016135	srrt	94	87.063	Maylandia_zebra
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.548	ENSMAUG00000011386	Srrt	95	68.008	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSMICG00000009471	SRRT	98	64.531	Microcebus_murinus
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSMOCG00000001971	Srrt	95	67.265	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020003058	srrt	95	79.760	ENSMMOG00000016399	srrt	98	79.790	Mola_mola
ENSORLG00020003058	srrt	83	54.642	ENSMMOG00000011137	-	88	54.737	Mola_mola
ENSORLG00020003058	srrt	52	69.872	ENSMODG00000004862	SRRT	92	69.342	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020003058	srrt	90	79.245	ENSMALG00000018604	srrt	99	77.738	Monopterus_albus
ENSORLG00020003058	srrt	54	51.915	ENSMALG00000005567	-	87	53.664	Monopterus_albus
ENSORLG00020003058	srrt	96	65.340	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	99	71.642	Mus_caroli
ENSORLG00020003058	srrt	96	65.340	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	71.642	Mus_musculus
ENSORLG00020003058	srrt	96	65.340	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	99	71.642	Mus_pahari
ENSORLG00020003058	srrt	96	65.340	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	99	71.642	Mus_spretus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.468	ENSMPUG00000015839	SRRT	96	65.057	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.548	ENSMLUG00000009975	SRRT	96	64.679	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.774	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	64.753	Nannospalax_galili
ENSORLG00020003058	srrt	52	90.529	ENSNBRG00000019100	srrt	98	84.400	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020003058	srrt	95	57.692	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	59.229	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020003058	srrt	96	54.386	ENSMEUG00000011941	SRRT	96	53.882	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020003058	srrt	61	75.000	ENSOPRG00000002502	-	67	79.545	Ochotona_princeps
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.637	ENSODEG00000016856	SRRT	94	68.303	Octodon_degus
ENSORLG00020003058	srrt	93	55.148	ENSONIG00000016080	-	94	56.725	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020003058	srrt	52	91.429	ENSONIG00000004242	srrt	98	83.655	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020003058	srrt	100	99.540	ENSORLG00000008120	srrt	100	99.540	Oryzias_latipes
ENSORLG00020003058	srrt	100	99.425	ENSORLG00015008062	srrt	100	99.425	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020003058	srrt	93	56.916	ENSOMEG00000006963	-	96	57.429	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020003058	srrt	100	96.101	ENSOMEG00000003155	srrt	100	96.101	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	ENSOGAG00000017242	SRRT	96	65.589	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020003058	srrt	52	73.593	ENSOARG00000015645	SRRT	96	64.821	Ovis_aries
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSPPAG00000041090	SRRT	96	65.509	Pan_paniscus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.144	ENSPPRG00000009557	SRRT	96	64.815	Panthera_pardus
ENSORLG00020003058	srrt	96	64.277	ENSPTIG00000014355	SRRT	96	64.943	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	ENSPTRG00000019511	SRRT	99	62.864	Pan_troglodytes
ENSORLG00020003058	srrt	94	68.193	ENSPKIG00000022212	-	98	68.208	Paramormyrops_kingsleyae
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