EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020003361 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17648 bases
Position: chr3:23028209-23045856
Accession: ZDB-GENE-030131-2621
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020002602	Urb2	PF10441.9	2.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020011031	-	9743	-	ENSORLP00020002602	1617 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.608	ENSG00000135763	URB2	100	56.322	Homo_sapiens
ENSORLG00020003361	urb2	91	61.803	ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.738	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.462	ENSAMEG00000009206	URB2	100	35.437	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020003361	urb2	100	63.394	ENSAOCG00000019961	urb2	100	63.631	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020003361	urb2	100	63.335	ENSAPEG00000005263	urb2	100	63.572	Amphiprion_percula
ENSORLG00020003361	urb2	100	61.193	ENSATEG00000020930	urb2	100	60.757	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003361	urb2	97	35.864	ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.802	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020003361	urb2	99	36.697	ENSACAG00000001285	URB2	99	36.517	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.119	ENSANAG00000033963	URB2	99	35.076	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020003361	urb2	91	61.187	ENSACLG00000009254	urb2	100	61.187	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003361	urb2	99	40.524	ENSAMXG00000003474	urb2	99	40.328	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.058	ENSBTAG00000010180	URB2	100	35.058	Bos_taurus
ENSORLG00020003361	urb2	95	57.343	ENSCJAG00000010968	URB2	99	57.343	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.246	ENSCAFG00000012118	URB2	99	34.428	Canis_familiaris
ENSORLG00020003361	urb2	93	33.006	ENSCAFG00020027217	URB2	98	33.268	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.237	ENSCHIG00000014513	URB2	100	35.130	Capra_hircus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.124	ENSTSYG00000006924	URB2	100	35.117	Carlito_syrichta
ENSORLG00020003361	urb2	57	43.143	ENSCPOG00000020777	-	99	43.143	Cavia_porcellus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.362	ENSCCAG00000023932	URB2	99	35.319	Cebus_capucinus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.468	ENSCATG00000043366	URB2	99	34.629	Cercocebus_atys
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.922	ENSCLAG00000006268	URB2	99	36.104	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.428	ENSCSAG00000010599	URB2	99	34.590	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020003361	urb2	69	41.987	ENSCHOG00000010163	URB2	70	41.987	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.411	ENSCPBG00000006191	URB2	99	37.411	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.460	ENSCANG00000023711	URB2	99	34.650	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.867	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	34.790	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.867	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	34.790	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020003361	urb2	100	52.764	ENSCSEG00000000299	urb2	100	52.584	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020003361	urb2	100	61.829	ENSCVAG00000011011	urb2	100	61.829	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020003361	urb2	100	43.075	ENSDARG00000003217	urb2	100	67.308	Danio_rerio
ENSORLG00020003361	urb2	97	32.859	ENSDNOG00000043064	URB2	99	32.900	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.435	ENSDORG00000014975	Urb2	99	34.392	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020003361	urb2	95	38.028	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.028	Echinops_telfairi
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.814	ENSEASG00005012060	URB2	100	35.637	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020003361	urb2	93	57.931	ENSECAG00000012338	URB2	100	57.931	Equus_caballus
ENSORLG00020003361	urb2	92	55.245	ENSEEUG00000002669	URB2	92	55.245	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020003361	urb2	100	48.002	ENSELUG00000014647	urb2	100	48.123	Esox_lucius
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.240	ENSFCAG00000007662	URB2	99	35.451	Felis_catus
ENSORLG00020003361	urb2	99	36.937	ENSFALG00000003385	URB2	99	36.703	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.905	ENSFDAG00000021079	URB2	99	35.905	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.097	ENSFHEG00000010357	urb2	100	60.158	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020003361	urb2	99	49.697	ENSGMOG00000012459	urb2	100	50.000	Gadus_morhua
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.455	ENSGALG00000011101	URB2	99	37.216	Gallus_gallus
ENSORLG00020003361	urb2	100	59.187	ENSGACG00000016179	urb2	100	59.005	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.851	ENSGAGG00000021879	URB2	99	37.851	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.688	ENSGGOG00000025643	URB2	99	34.688	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020003361	urb2	100	62.001	ENSHBUG00000018469	urb2	100	62.001	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020003361	urb2	97	34.321	ENSHGLG00000016561	URB2	99	34.630	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.880	ENSHGLG00100001838	URB2	99	35.099	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020003361	urb2	100	41.152	ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.088	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.537	ENSSTOG00000025323	URB2	99	35.576	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.394	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	35.394	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020003361	urb2	100	63.373	ENSKMAG00000020129	urb2	100	63.478	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.929	ENSLACG00000002038	URB2	99	37.937	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020003361	urb2	99	42.271	ENSLOCG00000015462	urb2	99	42.382	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.280	ENSLAFG00000012484	URB2	100	35.280	Loxodonta_africana
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.489	ENSMFAG00000039905	URB2	99	34.650	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.529	ENSMMUG00000009509	URB2	99	34.690	Macaca_mulatta
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.468	ENSMNEG00000038762	URB2	99	34.629	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.529	ENSMLEG00000043252	URB2	99	34.690	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020003361	urb2	100	59.067	ENSMAMG00000020365	urb2	100	59.386	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020003361	urb2	100	61.942	ENSMZEG00005011027	urb2	100	61.942	Maylandia_zebra
ENSORLG00020003361	urb2	93	35.728	ENSMGAG00000012073	URB2	98	35.492	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020003361	urb2	95	57.343	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	57.343	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020003361	urb2	100	34.997	ENSMICG00000033302	URB2	100	35.219	Microcebus_murinus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.772	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.772	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020003361	urb2	100	61.529	ENSMALG00000006529	urb2	100	61.470	Monopterus_albus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.518	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	34.678	Mus_musculus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.494	ENSMPUG00000012438	URB2	99	35.641	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.523	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	35.494	Nannospalax_galili
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.606	ENSNLEG00000014450	URB2	99	34.767	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020003361	urb2	90	45.045	ENSMEUG00000016434	URB2	92	45.045	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020003361	urb2	87	78.571	ENSOPRG00000009906	URB2	86	78.571	Ochotona_princeps
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.641	ENSODEG00000005593	URB2	99	35.445	Octodon_degus
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.414	ENSONIG00000017078	urb2	100	60.597	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.451	ENSOANG00000013732	URB2	99	34.817	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.823	ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.983	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020003361	urb2	100	97.959	ENSORLG00000010915	urb2	100	97.959	Oryzias_latipes
ENSORLG00020003361	urb2	100	97.835	ENSORLG00015001534	urb2	100	97.835	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020003361	urb2	100	84.084	ENSOMEG00000010076	urb2	100	84.331	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.209	ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.127	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.012	ENSOARG00000003102	URB2	100	35.133	Ovis_aries
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.751	ENSPPAG00000040629	URB2	99	34.751	Pan_paniscus
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.280	ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.398	Panthera_pardus
ENSORLG00020003361	urb2	96	75.000	ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.751	ENSPTRG00000002092	URB2	99	34.751	Pan_troglodytes
ENSORLG00020003361	urb2	99	33.435	ENSPANG00000002245	URB2	99	33.597	Papio_anubis
ENSORLG00020003361	urb2	99	43.073	ENSPKIG00000005787	urb2	99	42.987	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.121	ENSPSIG00000002690	URB2	99	37.053	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020003361	urb2	96	33.333	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.459	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.805	ENSPCIG00000030071	URB2	99	35.745	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.220	ENSPFOG00000014330	urb2	100	60.220	Poecilia_formosa
ENSORLG00020003361	urb2	100	59.927	ENSPLAG00000014654	urb2	100	59.866	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.403	ENSPMEG00000012356	urb2	100	60.403	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.414	ENSPREG00000010268	urb2	100	60.475	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020003361	urb2	100	34.326	ENSPPYG00000000123	URB2	100	34.487	Pongo_abelii
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.458	ENSPCOG00000023537	URB2	100	35.480	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020003361	urb2	99	33.555	ENSPVAG00000002108	URB2	99	33.475	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020003361	urb2	91	60.836	ENSPNYG00000016840	urb2	100	61.097	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020003361	urb2	99	42.424	ENSPNAG00000013684	urb2	99	42.441	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.537	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	34.712	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.894	ENSRBIG00000037937	URB2	99	35.055	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.954	ENSRROG00000039854	URB2	99	35.115	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.058	ENSSBOG00000023055	URB2	99	35.015	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.258	ENSSHAG00000014735	URB2	99	35.198	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020003361	urb2	97	44.479	ENSSFOG00015015432	urb2	98	44.072	Scleropages_formosus
ENSORLG00020003361	urb2	91	60.168	ENSSMAG00000004984	urb2	100	59.974	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020003361	urb2	100	63.072	ENSSDUG00000000902	urb2	100	63.189	Seriola_dumerili
ENSORLG00020003361	urb2	99	37.126	ENSSPUG00000018549	URB2	99	37.388	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020003361	urb2	100	63.863	ENSSPAG00000013632	urb2	100	63.803	Stegastes_partitus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.615	ENSSSCG00000010186	URB2	100	35.615	Sus_scrofa
ENSORLG00020003361	urb2	99	36.594	ENSTGUG00000009990	URB2	99	36.534	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020003361	urb2	100	53.650	ENSTRUG00000008173	urb2	100	53.531	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020003361	urb2	95	55.378	ENSTNIG00000017689	urb2	98	55.378	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020003361	urb2	95	78.571	ENSTTRG00000014864	URB2	95	78.571	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.523	ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.498	Ursus_americanus
ENSORLG00020003361	urb2	100	35.423	ENSUMAG00000004728	URB2	100	35.394	Ursus_maritimus
ENSORLG00020003361	urb2	53	58.333	ENSVPAG00000001750	-	51	58.333	Vicugna_pacos
ENSORLG00020003361	urb2	99	34.693	ENSVVUG00000006747	URB2	99	34.936	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020003361	urb2	99	35.088	ENSXETG00000023331	urb2	99	35.027	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020003361	urb2	100	60.110	ENSXMAG00000015059	urb2	100	60.049	Xiphophorus_maculatus