EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020003398 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1151 bases
Position: chr7:2790750-2791900
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020002637	RVT_1	PF00078.27	2.7e-20	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020010972	-	1151	-	ENSORLP00020002637	333 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSORLG00020003398	-	84	48.029	ENSORLG00020016243	-	73	48.029
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ENSORLG00020003398	-	93	51.118	ENSORLG00020008589	-	58	51.118
ENSORLG00020003398	-	91	30.990	ENSORLG00020019816	-	57	30.990
ENSORLG00020003398	-	91	31.429	ENSORLG00020017929	-	62	31.429
ENSORLG00020003398	-	73	84.426	ENSORLG00020004647	-	59	84.426
ENSORLG00020003398	-	68	50.000	ENSORLG00020013014	-	51	50.000
ENSORLG00020003398	-	93	51.438	ENSORLG00020008115	-	65	51.438

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020003398	-	50	45.783	ENSACIG00000019567	-	78	45.783	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020003398	-	100	46.407	ENSAOCG00000004576	-	90	46.547	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020003398	-	100	45.808	ENSAPEG00000024502	-	89	45.946	Amphiprion_percula
ENSORLG00020003398	-	99	52.410	ENSATEG00000015931	-	65	52.410	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	98	52.147	ENSATEG00000004857	-	70	52.147	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	96	42.857	ENSATEG00000014055	-	55	42.857	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	99	42.900	ENSATEG00000004798	-	58	42.900	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	99	52.108	ENSATEG00000014607	-	64	52.108	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	99	43.202	ENSATEG00000019241	-	93	43.202	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	99	52.108	ENSATEG00000002739	-	54	52.108	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003398	-	99	52.410	ENSATEG00000015490	-	54	52.410	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020003398	-	100	45.946	ENSACLG00000027135	-	96	45.946	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	77	50.781	ENSACLG00000000907	-	67	50.781	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	99	48.788	ENSACLG00000026769	-	75	48.788	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020003398	-	100	48.048	ENSACLG00000005212	-	50	48.048	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020003398	-	86	47.917	ENSACLG00000006327	-	55	47.917	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020003398	-	99	62.310	ENSACLG00000020926	-	87	61.747	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	75	50.602	ENSACLG00000002725	-	67	50.602	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	100	48.348	ENSACLG00000025562	-	75	48.348	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	97	50.769	ENSACLG00000005570	-	50	50.769	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	100	48.048	ENSACLG00000019420	-	66	48.048	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	100	59.760	ENSACLG00000014642	-	55	59.760	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	99	58.735	ENSACLG00000002680	-	81	58.735	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003398	-	100	48.048	ENSACLG00000024400	-	64	48.048	Astatotilapia_calliptera
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