EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020003464 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo3
Alias: -
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11306 bases
Position: chr23:22401670-22412975
Accession: 101165123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020022921	Xpo1	PF08389.12	5.5e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020010883	-	2795	-	ENSORLP00020022921	923 (aa)	XP_023807927	UPI0009DA023E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSG00000064419	TNPO3	100	85.000	Homo_sapiens
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	95.341	ENSAPOG00000018347	tnpo3	100	95.341	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	81.723	ENSAMEG00000005135	TNPO3	98	81.723	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020003464	tnpo3	96	91.874	ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.265	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	95.233	ENSAOCG00000008264	tnpo3	100	95.233	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020003464	tnpo3	96	95.243	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	95.243	Amphiprion_percula
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.691	ENSATEG00000003197	tnpo3	100	94.691	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003464	tnpo3	72	81.475	ENSAPLG00000005946	TNPO3	91	81.475	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020003464	tnpo3	82	84.474	ENSACAG00000013470	TNPO3	95	84.474	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSANAG00000037940	TNPO3	100	85.278	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.583	ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.583	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	91.658	ENSAMXG00000016236	tnpo3	100	91.658	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	85.049	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	85.049	Bos_taurus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSCJAG00000018085	TNPO3	100	85.278	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSCAFG00000001543	TNPO3	100	84.832	Canis_familiaris
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSCAFG00020022462	TNPO3	99	84.432	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSCHIG00000011721	TNPO3	100	84.940	Capra_hircus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSTSYG00000002989	TNPO3	100	85.278	Carlito_syrichta
ENSORLG00020003464	tnpo3	72	86.022	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	86.022	Cavia_aperea
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.507	ENSCPOG00000039784	TNPO3	100	84.507	Cavia_porcellus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	85.278	Cebus_capucinus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	85.000	Cercocebus_atys
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	83.711	ENSCLAG00000016298	TNPO3	100	83.711	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSCSAG00000009966	TNPO3	100	84.832	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	60.568	ENSCHOG00000011547	TNPO3	99	60.568	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020003464	tnpo3	93	83.897	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	83.897	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	48.475	ENSCING00000005042	-	99	48.475	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	47.231	ENSCSAVG00000008623	-	96	53.047	Ciona_savignyi
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	85.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	100	84.940	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	100	84.940	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	92.091	ENSCSEG00000005952	tnpo3	100	92.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	93.174	ENSCVAG00000020285	tnpo3	100	93.174	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	90.574	ENSDARG00000045680	tnpo3	100	90.574	Danio_rerio
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSDNOG00000002556	TNPO3	100	84.724	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020003464	tnpo3	62	83.420	ENSDORG00000002433	Tnpo3	95	83.420	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	43.089	FBgn0031456	Tnpo-SR	99	43.089	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020003464	tnpo3	94	84.106	ENSETEG00000002101	TNPO3	90	84.106	Echinops_telfairi
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	70.652	ENSEBUG00000016931	tnpo3	99	70.652	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSEASG00005008677	TNPO3	100	84.724	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	84.724	Equus_caballus
ENSORLG00020003464	tnpo3	64	31.174	ENSEEUG00000011681	IPO13	77	31.174	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	79.468	ENSEEUG00000005178	TNPO3	98	79.468	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	92.818	ENSELUG00000012153	tnpo3	99	92.818	Esox_lucius
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSFCAG00000018186	TNPO3	100	85.000	Felis_catus
ENSORLG00020003464	tnpo3	96	80.045	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	80.045	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.216	ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.216	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	93.261	ENSFHEG00000012859	tnpo3	99	93.261	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	91.766	ENSGMOG00000007324	tnpo3	100	91.766	Gadus_morhua
ENSORLG00020003464	tnpo3	61	83.392	ENSGALG00000039420	TNPO3	99	83.392	Gallus_gallus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.366	ENSGACG00000000699	tnpo3	100	94.366	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	93	83.781	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	83.781	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	85.000	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.583	ENSHBUG00000008351	tnpo3	100	94.583	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSHGLG00000004463	TNPO3	100	84.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSHGLG00100005509	TNPO3	100	84.724	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	91.441	ENSHCOG00000007221	tnpo3	100	91.441	Hippocampus_comes
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	90.033	ENSIPUG00000014979	TNPO3	99	90.033	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSSTOG00000004885	TNPO3	100	84.724	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	78.817	ENSJJAG00000013530	Tnpo3	100	78.817	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.258	ENSKMAG00000010497	tnpo3	100	94.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020003464	tnpo3	96	89.241	ENSLBEG00000011988	-	99	89.241	Labrus_bergylta
ENSORLG00020003464	tnpo3	96	91.619	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	91.619	Labrus_bergylta
ENSORLG00020003464	tnpo3	87	85.870	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	85.870	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	90.574	ENSLOCG00000015556	tnpo3	100	90.574	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.142	ENSLAFG00000002738	TNPO3	100	84.142	Loxodonta_africana
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMFAG00000032385	TNPO3	100	85.000	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMMUG00000004311	TNPO3	100	85.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	85.000	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	85.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.800	ENSMAMG00000021096	tnpo3	100	94.800	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.583	ENSMZEG00005015084	tnpo3	100	94.583	Maylandia_zebra
ENSORLG00020003464	tnpo3	78	80.552	ENSMGAG00000002839	TNPO3	99	80.552	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMAUG00000013463	Tnpo3	100	84.832	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020003464	tnpo3	70	33.077	ENSMICG00000011003	IPO13	79	33.136	Microcebus_murinus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMICG00000000140	TNPO3	100	85.000	Microcebus_murinus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	100	84.940	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.150	ENSMMOG00000005887	tnpo3	100	94.150	Mola_mola
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	85.374	ENSMODG00000014700	TNPO3	100	85.374	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.366	ENSMALG00000006675	tnpo3	100	94.366	Monopterus_albus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	100	84.724	Mus_caroli
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	100	84.724	Mus_musculus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	100	84.724	Mus_pahari
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.615	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	100	84.615	Mus_spretus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSMPUG00000006021	TNPO3	100	84.832	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	76.706	ENSMLUG00000000947	TNPO3	100	76.706	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	100	84.724	Nannospalax_galili
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	93.066	ENSNBRG00000019001	tnpo3	100	94.589	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	81.714	ENSNLEG00000012491	TNPO3	100	85.000	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020003464	tnpo3	52	30.288	ENSMEUG00000002835	IPO13	61	30.288	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	66.213	ENSMEUG00000002445	TNPO3	98	66.213	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020003464	tnpo3	91	85.326	ENSOPRG00000006163	TNPO3	90	85.326	Ochotona_princeps
ENSORLG00020003464	tnpo3	98	84.479	ENSODEG00000012826	TNPO3	100	84.479	Octodon_degus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	94.800	ENSONIG00000007604	tnpo3	100	94.800	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020003464	tnpo3	95	81.759	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	81.759	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	81.723	ENSOCUG00000010105	TNPO3	99	81.723	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	100.000	ENSORLG00000029369	tnpo3	100	100.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	99.892	ENSORLG00015002610	tnpo3	100	99.892	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	98.483	ENSOMEG00000021006	tnpo3	100	98.483	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.724	ENSOGAG00000015340	TNPO3	100	84.724	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.940	ENSOARG00000004026	TNPO3	100	84.940	Ovis_aries
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	85.000	Pan_paniscus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.000	Panthera_pardus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSPTIG00000016167	TNPO3	100	85.000	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	85.000	Pan_troglodytes
ENSORLG00020003464	tnpo3	98	84.641	ENSPANG00000022226	TNPO3	100	85.000	Papio_anubis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	87.757	ENSPKIG00000023234	tnpo3	100	87.757	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	83.909	ENSPKIG00000008628	-	100	83.909	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020003464	tnpo3	62	87.148	ENSPMGG00000009763	tnpo3	99	87.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSPEMG00000000422	Tnpo3	100	84.832	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020003464	tnpo3	95	72.480	ENSPMAG00000008621	tnpo3	100	72.480	Petromyzon_marinus
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ENSORLG00020003464	tnpo3	100	92.849	ENSPFOG00000013592	tnpo3	99	92.849	Poecilia_formosa
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ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.832	ENSVVUG00000011004	TNPO3	100	84.688	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020003464	tnpo3	99	76.706	ENSXETG00000015009	tnpo3	99	76.706	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020003464	tnpo3	100	92.741	ENSXMAG00000013062	tnpo3	100	92.741	Xiphophorus_maculatus