EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020003828 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3179 bases
Position: chr22:14109583-14112761
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020023156	RVT_1	PF00078.27	2.8e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020010275	-	3179	-	ENSORLP00020023156	769 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020003828	-	99	47.865	ENSORLG00020002198	-	79	47.865
ENSORLG00020003828	-	89	48.551	ENSORLG00020019488	-	99	48.551
ENSORLG00020003828	-	65	38.900	ENSORLG00020003864	-	96	38.506
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ENSORLG00020003828	-	59	89.183	ENSORLG00020001944	-	99	89.183
ENSORLG00020003828	-	50	47.583	ENSORLG00020001541	-	99	47.583
ENSORLG00020003828	-	73	98.230	ENSORLG00020020026	-	100	98.230
ENSORLG00020003828	-	99	45.223	ENSORLG00020021850	-	70	45.223
ENSORLG00020003828	-	70	71.429	ENSORLG00020006907	-	99	71.429
ENSORLG00020003828	-	60	53.305	ENSORLG00020003990	-	98	53.305
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ENSORLG00020003828	-	79	45.156	ENSORLG00020012070	-	99	45.156
ENSORLG00020003828	-	54	50.839	ENSORLG00020004647	-	100	50.839
ENSORLG00020003828	-	65	51.889	ENSORLG00020004992	-	98	51.889
ENSORLG00020003828	-	78	46.743	ENSORLG00020009908	-	90	46.743
ENSORLG00020003828	-	61	52.731	ENSORLG00020006573	-	99	52.731
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ENSORLG00020003828	-	99	41.931	ENSORLG00020013041	-	72	41.931
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ENSORLG00020003828	-	61	56.290	ENSORLG00020010320	-	99	56.290
ENSORLG00020003828	-	64	48.594	ENSORLG00020006220	-	95	48.594
ENSORLG00020003828	-	86	50.151	ENSORLG00020014334	-	99	50.151
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ENSORLG00020003828	-	54	51.651	ENSORLG00020009885	-	98	51.651
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ENSORLG00020003828	-	56	32.880	ENSORLG00020009835	-	95	32.880
ENSORLG00020003828	-	52	78.109	ENSORLG00020021212	-	99	78.109
ENSORLG00020003828	-	58	45.514	ENSORLG00020019768	-	89	45.514
ENSORLG00020003828	-	99	75.521	ENSORLG00020018405	-	100	75.521
ENSORLG00020003828	-	76	41.283	ENSORLG00020002120	-	93	41.118
ENSORLG00020003828	-	51	49.497	ENSORLG00020002465	-	98	49.497
ENSORLG00020003828	-	52	50.498	ENSORLG00020017728	-	84	50.498
ENSORLG00020003828	-	77	47.117	ENSORLG00020001010	-	91	47.117
ENSORLG00020003828	-	61	55.864	ENSORLG00020012080	-	99	55.864
ENSORLG00020003828	-	76	46.844	ENSORLG00020008289	-	91	46.844
ENSORLG00020003828	-	51	56.456	ENSORLG00020011261	-	96	56.456
ENSORLG00020003828	-	74	38.421	ENSORLG00020007840	-	81	38.772
ENSORLG00020003828	-	99	44.515	ENSORLG00020018578	-	80	44.515
ENSORLG00020003828	-	53	44.068	ENSORLG00020002010	-	99	44.068
ENSORLG00020003828	-	67	51.908	ENSORLG00020014098	-	98	51.908
ENSORLG00020003828	-	99	47.865	ENSORLG00020014097	-	85	47.865
ENSORLG00020003828	-	61	53.151	ENSORLG00020008115	-	99	53.151

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSORLG00020003828	-	51	56.281	ENSATEG00000004857	-	86	56.281	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	64	54.910	ENSATEG00000015931	-	98	54.910	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	66	54.386	ENSATEG00000014607	-	98	54.386	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	81	40.472	ENSATEG00000023197	-	97	40.472	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	72	42.857	ENSATEG00000004798	-	98	42.732	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	99	38.697	ENSATEG00000012907	-	79	38.697	Anabas_testudineus
ENSORLG00020003828	-	99	48.391	ENSATEG00000010674	-	89	48.391	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020003828	-	73	46.702	ENSPNYG00000010678	-	99	46.702	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00020003828	-	68	48.689	ENSPNAG00000001796	-	100	48.689	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020003828	-	68	33.645	ENSSFOG00015004172	-	90	33.645	Scleropages_formosus
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ENSORLG00020003828	-	53	37.116	ENSSPAG00000002518	-	84	37.352	Stegastes_partitus
ENSORLG00020003828	-	51	48.507	ENSXMAG00000030034	-	97	48.507	Xiphophorus_maculatus
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