EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004099 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2337 bases
Position: chr4:19904293-19906629
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020023337	RVT_1	PF00078.27	1e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009817	-	2337	-	ENSORLP00020023337	769 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020004099	-	67	49.427	ENSORLG00020006316	-	98	49.427
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ENSORLG00020004099	-	61	57.569	ENSORLG00020013078	-	99	57.569
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ENSORLG00020004099	-	92	44.847	ENSORLG00020021860	-	95	44.847
ENSORLG00020004099	-	51	47.990	ENSORLG00020002465	-	98	47.990
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ENSORLG00020004099	-	61	51.050	ENSORLG00020010410	-	99	51.050
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Orthologs

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ENSORLG00020004099	-	99	47.165	ENSATEG00000010674	-	90	46.968	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004099	-	81	39.557	ENSATEG00000023197	-	97	39.557	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004099	-	80	48.947	ENSATEG00000002739	-	99	48.947	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004099	-	95	37.116	ENSATEG00000005707	-	89	37.116	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004099	-	80	49.109	ENSATEG00000015490	-	99	49.109	Anabas_testudineus
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