EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004153 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: apobec2a
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme%2C catalytic polypeptide-like 2a
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6741 bases
Position: chr5:20031061-20037801
Accession: ZDB-GENE-050306-15
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020023369	APOBEC_N	PF08210.11	3e-47	1	1
ENSORLP00020023369	APOBEC_C	PF05240.14	7.8e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009731	-	3961	-	ENSORLP00020023369	237 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	58.515	ENSORLG00020006164	APOBEC2	84	58.515
ENSORLG00020004153	apobec2a	70	32.749	ENSORLG00020006547	aicda	86	32.749

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.333	ENSG00000124701	APOBEC2	95	53.302	Homo_sapiens
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.348	ENSAPOG00000019390	apobec2b	84	54.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004153	apobec2a	89	48.673	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	89	48.673	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020004153	apobec2a	78	76.344	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	76.344	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.783	ENSACIG00000002472	APOBEC2	99	54.959	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.783	ENSAOCG00000023355	apobec2b	84	54.783	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	72.131	ENSAOCG00000003291	apobec2a	99	72.131	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	71.721	ENSAPEG00000003630	apobec2a	99	71.721	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	55.217	ENSAPEG00000004591	apobec2b	84	55.217	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004153	apobec2a	95	56.444	ENSATEG00000023043	APOBEC2	83	56.140	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	69.048	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	80.571	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004153	apobec2a	78	55.319	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	83	55.319	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	52.604	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	54.749	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.333	ENSANAG00000026993	APOBEC2	95	53.302	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020004153	apobec2a	88	57.895	ENSACLG00000007634	APOBEC2	84	55.022	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020004153	apobec2a	73	73.563	ENSACLG00000026736	-	97	73.563	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020004153	apobec2a	94	58.667	ENSAMXG00000015966	apobec2b	79	58.667	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020004153	apobec2a	88	64.815	ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	63.333	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.632	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	68	52.113	Bos_taurus
ENSORLG00020004153	apobec2a	87	53.555	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	95	53.521	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.381	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	97	51.376	Canis_familiaris
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.857	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	97	51.835	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.632	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	95	52.113	Capra_hircus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	54.922	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	98	50.901	Carlito_syrichta
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	53.368	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	97	49.550	Cavia_aperea
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	53.368	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	97	49.550	Cavia_porcellus
ENSORLG00020004153	apobec2a	87	53.081	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	95	53.052	Cebus_capucinus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSCATG00000010691	APOBEC2	99	51.316	Cercocebus_atys
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	53.886	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	99	49.333	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	95	53.052	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020004153	apobec2a	73	55.866	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	99	55.866	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020004153	apobec2a	77	56.452	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	99	52.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.995	ENSCANG00000035072	APOBEC2	95	53.521	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	94	51.754	ENSCGRG00001014983	Apobec2	99	51.754	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020004153	apobec2a	94	51.754	ENSCGRG00000007835	Apobec2	99	51.754	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020004153	apobec2a	80	57.672	ENSCSEG00000000690	-	91	49.383	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	69.323	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	69.323	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	55.895	ENSCVAG00000012342	apobec2b	85	55.895	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	59.363	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	59.766	Danio_rerio
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	59.307	ENSDARG00000113992	apobec2b	86	57.983	Danio_rerio
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	35.533	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	97	34.685	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.250	ENSDORG00000006447	Apobec2	97	52.466	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	55.440	ENSETEG00000000624	APOBEC2	99	50.439	Echinops_telfairi
ENSORLG00020004153	apobec2a	67	57.143	ENSEASG00005002937	APOBEC2	84	57.143	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	54.922	ENSECAG00000006576	APOBEC2	86	55.208	Equus_caballus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	54.167	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	86	54.167	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020004153	apobec2a	98	63.445	ENSELUG00000003736	apobec2a	83	64.979	Esox_lucius
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	55.959	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	97	52.294	Felis_catus
ENSORLG00020004153	apobec2a	78	46.032	ENSFALG00000003910	APOBEC2	99	42.273	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020004153	apobec2a	89	52.778	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	97	51.835	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	54.237	ENSFHEG00000005492	apobec2b	99	55.274	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	57.143	ENSGMOG00000006819	apobec2b	99	52.227	Gadus_morhua
ENSORLG00020004153	apobec2a	74	74.857	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	74.857	Gadus_morhua
ENSORLG00020004153	apobec2a	78	55.556	ENSGALG00000003226	APOBEC2	85	55.556	Gallus_gallus
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	57.269	ENSGAFG00000007634	apobec2b	73	57.269	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	79.787	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	79.787	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	83	60.714	ENSGACG00000009663	apobec2b	99	54.183	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	77	56.452	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	52.055	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.333	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	92	53.302	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.585	ENSHBUG00000005993	apobec2b	84	55.459	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	66.802	ENSHBUG00000015890	apobec2a	99	66.802	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.381	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	97	51.802	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.381	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	97	51.802	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	64.198	ENSHCOG00000020319	apobec2a	99	64.198	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004153	apobec2a	88	58.852	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	78	58.852	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004153	apobec2a	88	64.623	ENSIPUG00000017355	apobec2a	67	60.593	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	91	61.751	ENSIPUG00000013784	Apobec2	80	61.751	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.857	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	97	52.294	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.110	ENSJJAG00000009733	Apobec2	94	52.857	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	52.402	ENSKMAG00000020631	apobec2b	86	52.402	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020004153	apobec2a	94	56.195	ENSLBEG00000009422	-	79	56.195	Labrus_bergylta
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	72.653	ENSLBEG00000025214	apobec2a	100	72.653	Labrus_bergylta
ENSORLG00020004153	apobec2a	90	54.930	ENSLACG00000015985	APOBEC2	93	54.930	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020004153	apobec2a	83	64.975	ENSLOCG00000012415	apobec2b	85	58.298	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	87	53.555	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	99	51.584	Loxodonta_africana
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	95	53.052	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	95	53.052	Macaca_mulatta
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	95	53.052	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	95	53.052	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	56.277	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	76	59.048	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	66.935	ENSMAMG00000023685	apobec2a	97	66.935	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020004153	apobec2a	88	57.895	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	77	57.895	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004153	apobec2a	93	71.041	ENSMZEG00005005240	-	88	78.235	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004153	apobec2a	78	55.556	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	54.749	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020004153	apobec2a	94	51.316	ENSMAUG00000011016	Apobec2	99	51.316	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020004153	apobec2a	91	50.901	ENSMICG00000043339	APOBEC2	99	50.901	Microcebus_murinus
ENSORLG00020004153	apobec2a	84	55.172	ENSMOCG00000001904	Apobec2	94	53.810	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020004153	apobec2a	93	57.466	ENSMMOG00000008681	apobec2b	82	57.466	Mola_mola
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	51.628	ENSMODG00000013090	APOBEC2	97	51.628	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	68.016	ENSMALG00000020523	apobec2a	100	68.421	Monopterus_albus
ENSORLG00020004153	apobec2a	95	53.333	ENSMALG00000013779	APOBEC2	85	54.585	Monopterus_albus
ENSORLG00020004153	apobec2a	84	54.680	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	94	53.333	Mus_caroli
ENSORLG00020004153	apobec2a	84	54.680	ENSMUSG00000040694	Apobec2	94	53.333	Mus_musculus
ENSORLG00020004153	apobec2a	84	54.680	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	53.333	Mus_pahari
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.857	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	99	50.216	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	50.476	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	91	50.476	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	54.067	ENSNGAG00000013717	Apobec2	94	53.810	Nannospalax_galili
ENSORLG00020004153	apobec2a	80	78.947	ENSNBRG00000021776	apobec2a	99	66.802	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	54.148	ENSNBRG00000018806	apobec2b	77	53.782	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.333	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	53.302	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.558	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	97	52.558	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	55.440	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	96	51.131	Ochotona_princeps
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	54.922	ENSODEG00000016183	APOBEC2	99	50.220	Octodon_degus
ENSORLG00020004153	apobec2a	93	56.306	ENSONIG00000012289	apobec2b	87	54.622	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	69.231	ENSONIG00000004644	-	99	69.231	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020004153	apobec2a	70	54.762	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	53.333	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	55.959	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	97	51.802	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	58.079	ENSORLG00000022372	APOBEC2	84	58.079	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	99.578	ENSORLG00000010752	apobec2a	100	99.578	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	99.578	ENSORLG00015021781	apobec2a	100	99.578	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020004153	apobec2a	96	58.515	ENSORLG00015022089	-	84	58.515	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020004153	apobec2a	99	57.806	ENSOMEG00000015449	APOBEC2	99	56.735	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020004153	apobec2a	100	92.887	ENSOMEG00000001311	apobec2a	100	92.887	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020004153	apobec2a	91	51.351	ENSOGAG00000002632	APOBEC2	99	51.351	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.632	ENSOARG00000000820	APOBEC2	95	52.113	Ovis_aries
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.477	ENSPPAG00000035598	APOBEC2	92	53.302	Pan_paniscus
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	55.959	ENSPPRG00000008530	APOBEC2	97	52.294	Panthera_pardus
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ENSORLG00020004153	apobec2a	84	54.680	ENSRNOG00000012303	Apobec2	94	53.333	Rattus_norvegicus
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ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.995	ENSRROG00000030082	APOBEC2	95	53.521	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020004153	apobec2a	87	53.081	ENSSBOG00000028496	APOBEC2	95	53.302	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020004153	apobec2a	79	54.922	ENSSHAG00000017771	APOBEC2	97	51.389	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020004153	apobec2a	74	57.062	ENSSFOG00015005437	-	74	57.062	Scleropages_formosus
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ENSORLG00020004153	apobec2a	100	69.880	ENSSMAG00000001011	apobec2a	74	69.880	Scophthalmus_maximus
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ENSORLG00020004153	apobec2a	74	51.934	ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.934	Sphenodon_punctatus
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ENSORLG00020004153	apobec2a	86	51.905	ENSSSCG00000036018	APOBEC2	94	51.905	Sus_scrofa
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ENSORLG00020004153	apobec2a	86	52.857	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	97	52.294	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020004153	apobec2a	86	46.119	ENSXETG00000008007	apobec2	93	46.119	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.310	ENSXCOG00000007398	apobec2b	90	55.983	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020004153	apobec2a	97	54.741	ENSXMAG00000008134	apobec2b	81	56.696	Xiphophorus_maculatus