EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004286 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: -
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14746 bases
Position: chr20:11024648-11039393
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020003502	IBN_N	PF03810.19	3.6e-15	1	1
ENSORLP00020003461	IBN_N	PF03810.19	2.5e-14	1	1
ENSORLP00020003398	IBN_N	PF03810.19	2.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009520	-	5186	-	ENSORLP00020003502	1105 (aa)	-	-
ENSORLT00020009684	-	5434	-	ENSORLP00020003398	1027 (aa)	-	-
ENSORLT00020009582	-	5614	-	ENSORLP00020003461	1087 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.023	ENSG00000196497	IPO4	99	45.496	Homo_sapiens
ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.921	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	79.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.882	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.911	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020004286	ipo4	100	76.937	ENSACIG00000004246	ipo4	100	77.523	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.202	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.222	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.385	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	82.222	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004286	ipo4	92	81.076	ENSATEG00000017082	ipo4	99	81.773	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004286	ipo4	84	47.779	ENSACAG00000003973	-	97	47.831	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.465	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.885	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.645	ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.921	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020004286	ipo4	100	67.801	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.537	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.321	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.598	Bos_taurus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.930	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.346	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.573	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.614	Canis_familiaris
ENSORLG00020004286	ipo4	98	45.167	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.641	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.175	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.414	Capra_hircus
ENSORLG00020004286	ipo4	98	44.663	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	45.083	Carlito_syrichta
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.337	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	45.706	Cavia_porcellus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.837	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	45.253	Cebus_capucinus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.023	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.530	Cercocebus_atys
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.152	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.522	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020004286	ipo4	90	46.083	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.226	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020004286	ipo4	92	37.148	ENSCING00000008639	-	99	37.012	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020004286	ipo4	92	37.992	ENSCSAVG00000011482	-	98	38.053	Ciona_savignyi
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.744	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.253	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.941	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.941	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.270	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020004286	ipo4	100	75.341	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	74.794	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004286	ipo4	99	75.900	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.934	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	72.544	ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.186	Danio_rerio
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.278	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.185	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.641	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.060	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020004286	ipo4	97	30.897	FBgn0042178	CG32165	97	31.132	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020004286	ipo4	97	31.152	FBgn0042177	CG32164	97	30.897	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.882	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.658	Echinops_telfairi
ENSORLG00020004286	ipo4	90	46.856	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.904	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.387	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.429	Equus_caballus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	70.524	ENSELUG00000020628	ipo4	100	72.040	Esox_lucius
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.429	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.429	Felis_catus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	41.506	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	41.873	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020004286	ipo4	89	79.675	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	84.559	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	74.108	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.816	Gadus_morhua
ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.487	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.128	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.921	ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.737	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.837	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.346	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.749	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	78.565	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.875	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	45.337	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.598	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	45.060	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020004286	ipo4	99	74.593	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004286	ipo4	100	71.113	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.113	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.429	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.799	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.972	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	45.513	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.275	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.275	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.217	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	78.401	Labrus_bergylta
ENSORLG00020004286	ipo4	100	50.089	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.089	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020004286	ipo4	79	63.520	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.802	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.434	Loxodonta_africana
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.023	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.530	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.023	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.530	Macaca_mulatta
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.930	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	45.438	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.023	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.530	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.381	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.749	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.381	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.657	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.598	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.516	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.921	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.245	Microcebus_murinus
ENSORLG00020004286	ipo4	98	43.978	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.993	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.360	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	77.177	Mola_mola
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.148	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.738	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020004286	ipo4	100	76.994	ENSMALG00000001587	ipo4	100	77.177	Monopterus_albus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.311	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.535	Mus_caroli
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.941	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	46.040	Mus_musculus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.167	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.344	Mus_pahari
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.218	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	46.344	Mus_spretus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.706	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.983	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.074	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	45.260	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.879	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.972	Nannospalax_galili
ENSORLG00020004286	ipo4	100	81.601	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.969	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.564	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.933	Ochotona_princeps
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.295	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.522	Octodon_degus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	81.601	ENSONIG00000014574	ipo4	100	81.509	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.475	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.659	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	99.026	ENSORLG00000006457	ipo4	100	99.026	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004286	ipo4	100	99.172	ENSORLG00015021856	ipo4	100	99.172	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020004286	ipo4	99	89.405	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	89.532	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.641	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.691	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020004286	ipo4	98	43.551	ENSOARG00000019188	IPO4	99	43.925	Ovis_aries
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.930	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	45.069	Pan_paniscus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.614	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.614	Panthera_pardus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.522	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.522	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.744	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.161	Pan_troglodytes
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.116	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.622	Papio_anubis
ENSORLG00020004286	ipo4	100	64.959	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	65.385	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020004286	ipo4	99	66.452	ENSPKIG00000007683	-	99	65.777	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020004286	ipo4	99	71.219	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.677	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.941	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.126	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020004286	ipo4	94	45.597	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	45.127	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.110	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	80.293	Poecilia_formosa
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.202	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.385	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.110	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	80.293	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.468	ENSPREG00000017605	ipo4	100	79.835	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.930	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	45.346	Pongo_abelii
ENSORLG00020004286	ipo4	99	45.666	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.706	Procavia_capensis
ENSORLG00020004286	ipo4	98	44.288	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.208	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020004286	ipo4	98	45.318	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.640	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.853	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	80.129	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020004286	ipo4	100	72.769	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	72.769	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.444	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.732	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.837	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	45.346	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.744	ENSRROG00000011492	IPO4	99	45.253	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.000	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	44.383	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.761	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.261	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020004286	ipo4	99	66.239	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.055	Scleropages_formosus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	63.536	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	63.168	Scleropages_formosus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.541	ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.222	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	76.217	ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.033	Seriola_dumerili
ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.025	ENSSLDG00000003869	ipo4	100	84.444	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020004286	ipo4	86	45.185	ENSSARG00000010701	IPO4	81	45.679	Sorex_araneus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.808	ENSSPAG00000008486	ipo4	100	81.267	Stegastes_partitus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.082	ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.506	Sus_scrofa
ENSORLG00020004286	ipo4	100	75.023	ENSTRUG00000012832	ipo4	100	75.023	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020004286	ipo4	99	72.518	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.335	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020004286	ipo4	99	42.673	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	42.488	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.907	ENSTTRG00000008626	IPO4	99	44.630	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.963	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.147	Ursus_americanus
ENSORLG00020004286	ipo4	96	53.261	ENSXETG00000014621	ipo4	99	45.312	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.982	ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.343	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.110	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	80.293	Xiphophorus_maculatus