EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004313 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6003 bases
Position: chr2:9843830-9849832
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	1	6
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	2	6
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	3	6
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	4	6
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	5	6
ENSORLP00020023461	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-35	6	6
ENSORLP00020023461	zf-met	PF12874.7	6.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009484	-	1323	-	ENSORLP00020023461	440 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020004313	-	75	60.440	ENSORLG00020010804	-	96	60.440
ENSORLG00020004313	-	51	40.909	ENSORLG00020018051	prdm5	62	40.909
ENSORLG00020004313	-	58	53.600	ENSORLG00020009184	-	99	46.341
ENSORLG00020004313	-	83	62.500	ENSORLG00020008891	-	99	63.978
ENSORLG00020004313	-	53	34.746	ENSORLG00020010285	znf646	67	34.746
ENSORLG00020004313	-	62	53.704	ENSORLG00020016037	-	93	49.701
ENSORLG00020004313	-	65	37.222	ENSORLG00020000009	znf710b	66	37.222
ENSORLG00020004313	-	70	51.220	ENSORLG00020007599	-	83	51.220
ENSORLG00020004313	-	64	60.656	ENSORLG00020007967	-	98	60.656
ENSORLG00020004313	-	72	64.481	ENSORLG00020009419	-	97	67.532
ENSORLG00020004313	-	60	38.049	ENSORLG00020004889	ZNF319	91	38.049
ENSORLG00020004313	-	78	38.636	ENSORLG00020000264	-	81	38.636
ENSORLG00020004313	-	70	46.111	ENSORLG00020010038	-	93	46.111
ENSORLG00020004313	-	71	49.842	ENSORLG00020010880	-	96	49.842
ENSORLG00020004313	-	80	40.323	ENSORLG00020016666	-	95	38.679
ENSORLG00020004313	-	77	63.452	ENSORLG00020010916	-	96	63.452
ENSORLG00020004313	-	63	35.326	ENSORLG00020012229	zbtb41	53	35.326
ENSORLG00020004313	-	50	44.375	ENSORLG00020018495	-	64	44.375
ENSORLG00020004313	-	57	56.069	ENSORLG00020007074	-	98	58.599
ENSORLG00020004313	-	87	51.381	ENSORLG00020017164	-	99	55.682
ENSORLG00020004313	-	53	51.852	ENSORLG00020001912	znf236	70	51.852
ENSORLG00020004313	-	71	46.497	ENSORLG00020008424	-	95	46.497
ENSORLG00020004313	-	65	35.772	ENSORLG00020001791	-	91	35.772
ENSORLG00020004313	-	62	50.365	ENSORLG00020004370	-	94	50.365
ENSORLG00020004313	-	72	59.898	ENSORLG00020010250	-	91	59.898
ENSORLG00020004313	-	57	61.421	ENSORLG00020011075	-	82	61.421
ENSORLG00020004313	-	72	39.572	ENSORLG00020008744	-	70	39.572
ENSORLG00020004313	-	55	49.296	ENSORLG00020009139	-	98	45.294
ENSORLG00020004313	-	77	41.895	ENSORLG00020010636	-	99	41.895
ENSORLG00020004313	-	59	49.421	ENSORLG00020000161	-	93	49.421
ENSORLG00020004313	-	63	63.190	ENSORLG00020010020	-	96	63.190
ENSORLG00020004313	-	58	48.193	ENSORLG00020001707	-	87	48.193
ENSORLG00020004313	-	66	63.388	ENSORLG00020009857	-	99	63.889
ENSORLG00020004313	-	63	48.619	ENSORLG00020018069	-	97	48.619
ENSORLG00020004313	-	58	63.388	ENSORLG00020011149	-	97	59.794
ENSORLG00020004313	-	77	58.376	ENSORLG00020010171	-	97	59.873
ENSORLG00020004313	-	64	41.994	ENSORLG00020008240	-	82	38.155
ENSORLG00020004313	-	71	65.600	ENSORLG00020009180	-	99	60.500
ENSORLG00020004313	-	76	56.742	ENSORLG00020006148	-	97	56.742
ENSORLG00020004313	-	54	36.986	ENSORLG00020006144	-	84	34.241
ENSORLG00020004313	-	70	54.359	ENSORLG00020008018	-	95	54.359
ENSORLG00020004313	-	68	50.549	ENSORLG00020017483	-	97	50.549
ENSORLG00020004313	-	62	60.335	ENSORLG00020000246	-	99	63.736
ENSORLG00020004313	-	72	62.577	ENSORLG00020021857	-	82	62.577
ENSORLG00020004313	-	64	46.784	ENSORLG00020015703	-	80	46.784
ENSORLG00020004313	-	64	47.841	ENSORLG00020010953	-	96	47.902
ENSORLG00020004313	-	76	44.025	ENSORLG00020021196	-	78	47.059
ENSORLG00020004313	-	68	48.851	ENSORLG00020016754	-	89	52.761
ENSORLG00020004313	-	76	39.806	ENSORLG00020000639	-	78	31.786
ENSORLG00020004313	-	71	59.091	ENSORLG00020008346	-	100	61.871
ENSORLG00020004313	-	68	57.949	ENSORLG00020010560	-	92	67.005
ENSORLG00020004313	-	72	55.689	ENSORLG00020009089	-	86	55.758
ENSORLG00020004313	-	74	65.244	ENSORLG00020009943	-	99	65.244
ENSORLG00020004313	-	62	57.923	ENSORLG00020008933	-	99	58.242
ENSORLG00020004313	-	66	48.000	ENSORLG00020005132	-	97	48.000
ENSORLG00020004313	-	55	59.429	ENSORLG00020011234	-	87	59.429
ENSORLG00020004313	-	76	43.617	ENSORLG00020000481	-	96	45.833
ENSORLG00020004313	-	63	40.116	ENSORLG00020020419	-	94	41.624
ENSORLG00020004313	-	57	37.500	ENSORLG00020002128	-	89	37.500
ENSORLG00020004313	-	72	52.841	ENSORLG00020017850	-	97	52.841
ENSORLG00020004313	-	71	33.333	ENSORLG00020018921	-	94	33.657

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004313	-	65	45.455	ENSAPOG00000014372	-	97	45.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004313	-	59	48.305	ENSAPOG00000010645	-	84	48.305	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004313	-	50	42.748	ENSAPOG00000017148	-	54	42.748	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004313	-	50	54.430	ENSAPOG00000016615	-	85	54.430	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004313	-	52	45.455	ENSAOCG00000007347	-	83	45.455	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004313	-	62	43.333	ENSAPEG00000004256	-	96	43.333	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004313	-	70	37.778	ENSATEG00000007658	-	63	52.113	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004313	-	54	48.837	ENSAMXG00000013492	-	95	43.478	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020004313	-	73	34.173	ENSCVAG00000016924	-	74	34.641	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020004313	-	63	40.860	ENSCVAG00000018383	-	93	40.860	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020004313	-	52	44.526	ENSEBUG00000012543	-	56	44.526	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004313	-	50	45.556	ENSEBUG00000000422	-	60	45.556	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004313	-	50	48.352	ENSEBUG00000001569	-	75	48.352	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004313	-	75	45.946	ENSELUG00000000423	-	85	45.946	Esox_lucius
ENSORLG00020004313	-	73	50.769	ENSELUG00000007694	-	92	50.769	Esox_lucius
ENSORLG00020004313	-	77	47.337	ENSELUG00000000281	-	80	52.212	Esox_lucius
ENSORLG00020004313	-	70	50.276	ENSELUG00000022942	-	89	50.276	Esox_lucius
ENSORLG00020004313	-	71	44.444	ENSGAFG00000013366	-	67	44.444	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004313	-	53	48.205	ENSGAFG00000021139	-	69	48.205	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004313	-	66	48.421	ENSGAFG00000021143	-	99	48.421	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004313	-	50	47.222	ENSHBUG00000007316	-	71	47.222	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004313	-	71	48.246	ENSHCOG00000014999	-	73	48.246	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	48.322	ENSHCOG00000020976	-	73	48.322	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	73	50.754	ENSHCOG00000001256	-	92	50.754	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	48.780	ENSHCOG00000001870	-	83	48.780	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	51.351	ENSHCOG00000014994	-	60	51.351	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	41.899	ENSHCOG00000001242	-	83	41.899	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	51	52.174	ENSHCOG00000001300	-	86	52.174	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	46.099	ENSHCOG00000020924	-	80	46.099	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	53	44.000	ENSHCOG00000001793	-	79	44.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	73	50.450	ENSHCOG00000019454	-	82	36.677	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	52	45.098	ENSHCOG00000001245	-	51	45.098	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	47.788	ENSHCOG00000014781	-	93	47.788	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	78	49.718	ENSHCOG00000015355	-	86	58.824	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	62	42.435	ENSHCOG00000007358	-	86	45.024	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	49.405	ENSHCOG00000001318	-	100	44.279	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	57	49.206	ENSHCOG00000014777	-	95	47.651	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	86	50.898	ENSHCOG00000019006	-	87	46.479	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	74	46.328	ENSHCOG00000008742	-	96	46.328	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	73	52.206	ENSHCOG00000014792	-	99	52.206	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	72	44.444	ENSHCOG00000014797	-	79	44.444	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004313	-	78	33.333	ENSKMAG00000000556	-	88	33.058	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020004313	-	50	51.887	ENSMZEG00005028299	-	86	51.887	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004313	-	77	40.984	ENSMZEG00005026942	-	87	40.984	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004313	-	73	45.185	ENSMZEG00005015685	-	92	45.185	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004313	-	69	45.185	ENSNBRG00000021998	-	85	45.185	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020004313	-	57	33.641	ENSONIG00000011529	-	97	44.086	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020004313	-	55	45.355	ENSONIG00000018151	-	100	45.355	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020004313	-	56	59.218	ENSORLG00000027271	-	95	59.341	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	70	55.814	ENSORLG00000021951	-	99	56.585	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	75	58.523	ENSORLG00000027053	-	93	58.523	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	75	60.656	ENSORLG00000000247	-	99	60.656	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	67	60.773	ENSORLG00000028381	-	95	60.773	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	62	63.102	ENSORLG00000027575	-	94	63.102	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	63	48.361	ENSORLG00000025702	-	99	48.333	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	77	48.580	ENSORLG00000023744	-	98	61.749	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	75	58.523	ENSORLG00000025540	-	93	58.523	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	73	49.394	ENSORLG00000027303	-	93	49.394	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	76	60.131	ENSORLG00000029172	-	99	60.131	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	72	56.180	ENSORLG00000028456	-	97	56.180	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	75	48.864	ENSORLG00000029896	-	80	50.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	52	52.988	ENSORLG00000001796	-	99	52.988	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	71	64.516	ENSORLG00000028433	-	98	64.516	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	51	49.485	ENSORLG00000024183	-	97	49.485	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004313	-	60	63.243	ENSORLG00000000420	-	96	63.243	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020004313	-	77	43.684	ENSPREG00000016308	-	93	41.558	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020004313	-	53	37.946	ENSPNYG00000005202	-	97	44.253	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020004313	-	65	43.373	ENSSDUG00000022914	-	92	43.373	Seriola_dumerili
ENSORLG00020004313	-	71	43.243	ENSSDUG00000019911	-	72	43.243	Seriola_dumerili
ENSORLG00020004313	-	71	48.588	ENSSLDG00000001860	-	92	48.588	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020004313	-	51	40.580	ENSXMAG00000028785	-	82	40.580	Xiphophorus_maculatus