EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004353 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27904 bases
Position: chr2:9722934-9750837
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	1	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	2	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	3	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	4	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	5	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	6	7
ENSORLP00020003545	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-42	7	7
ENSORLP00020003545	zf-met	PF12874.7	3.5e-13	1	2
ENSORLP00020003545	zf-met	PF12874.7	3.5e-13	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009437	-	651	-	ENSORLP00020003545	216 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020004353	-	99	62.927	ENSORLG00020010171	-	95	59.375
ENSORLG00020004353	-	96	44.172	ENSORLG00020018503	-	71	44.172
ENSORLG00020004353	-	95	50.246	ENSORLG00020016037	-	93	50.246
ENSORLG00020004353	-	96	60.733	ENSORLG00020006148	-	58	60.733
ENSORLG00020004353	-	95	39.106	ENSORLG00020006144	-	69	39.106
ENSORLG00020004353	-	90	49.485	ENSORLG00020010038	-	55	49.485
ENSORLG00020004353	-	95	49.231	ENSORLG00020001707	-	74	49.231
ENSORLG00020004353	-	98	43.182	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	43.182
ENSORLG00020004353	-	95	46.829	ENSORLG00020021196	-	50	48.500
ENSORLG00020004353	-	99	47.015	ENSORLG00020018051	prdm5	73	44.211
ENSORLG00020004353	-	96	66.667	ENSORLG00020011149	-	81	66.667
ENSORLG00020004353	-	90	44.318	ENSORLG00020016666	-	63	44.318
ENSORLG00020004353	-	96	65.537	ENSORLG00020008346	-	87	63.507
ENSORLG00020004353	-	93	44.186	ENSORLG00020012967	scrt1b	55	44.186
ENSORLG00020004353	-	96	41.667	ENSORLG00020000009	znf710b	52	41.667
ENSORLG00020004353	-	96	65.482	ENSORLG00020010647	-	91	65.482
ENSORLG00020004353	-	96	64.593	ENSORLG00020011234	-	72	64.593
ENSORLG00020004353	-	96	64.467	ENSORLG00020008424	-	84	64.467
ENSORLG00020004353	-	96	57.426	ENSORLG00020008933	-	68	57.426
ENSORLG00020004353	-	99	38.605	ENSORLG00020008744	-	67	38.605
ENSORLG00020004353	-	96	55.556	ENSORLG00020017514	-	90	55.556
ENSORLG00020004353	-	96	54.950	ENSORLG00020009184	-	81	54.950
ENSORLG00020004353	-	95	36.054	ENSORLG00020001758	-	55	36.054
ENSORLG00020004353	-	97	40.704	ENSORLG00020018791	-	89	40.704
ENSORLG00020004353	-	91	40.909	ENSORLG00020006820	-	71	40.909
ENSORLG00020004353	-	98	67.778	ENSORLG00020010020	-	69	67.778
ENSORLG00020004353	-	96	62.019	ENSORLG00020000246	-	91	63.107
ENSORLG00020004353	-	95	33.613	ENSORLG00020007790	zbtb48	54	33.613
ENSORLG00020004353	-	95	56.923	ENSORLG00020000481	-	90	54.187
ENSORLG00020004353	-	99	64.368	ENSORLG00020010804	-	98	62.981
ENSORLG00020004353	-	96	58.421	ENSORLG00020007018	-	78	58.421
ENSORLG00020004353	-	96	67.241	ENSORLG00020004370	-	85	67.241
ENSORLG00020004353	-	96	65.497	ENSORLG00020010636	-	73	65.497
ENSORLG00020004353	-	96	62.209	ENSORLG00020008018	-	73	61.494
ENSORLG00020004353	-	96	49.758	ENSORLG00020017528	-	72	49.758
ENSORLG00020004353	-	91	42.857	ENSORLG00020001922	-	64	41.667
ENSORLG00020004353	-	98	43.810	ENSORLG00020000219	-	73	43.810
ENSORLG00020004353	-	90	40.404	ENSORLG00020009554	-	79	40.404
ENSORLG00020004353	-	96	65.497	ENSORLG00020009089	-	54	65.497
ENSORLG00020004353	-	96	62.019	ENSORLG00020010250	-	88	59.794
ENSORLG00020004353	-	95	52.764	ENSORLG00020018069	-	89	52.451
ENSORLG00020004353	-	96	56.311	ENSORLG00020017850	-	94	52.913
ENSORLG00020004353	-	98	65.803	ENSORLG00020010880	-	79	66.000
ENSORLG00020004353	-	94	53.797	ENSORLG00020016754	-	89	51.807
ENSORLG00020004353	-	93	46.957	ENSORLG00020019341	-	86	60.606
ENSORLG00020004353	-	99	34.507	ENSORLG00020001791	-	52	34.507
ENSORLG00020004353	-	97	50.242	ENSORLG00020009139	-	93	50.242
ENSORLG00020004353	-	96	69.799	ENSORLG00020009857	-	94	65.700
ENSORLG00020004353	-	95	53.202	ENSORLG00020017483	-	93	53.202
ENSORLG00020004353	-	98	41.053	ENSORLG00020010285	znf646	67	41.053
ENSORLG00020004353	-	96	63.507	ENSORLG00020009180	-	90	62.827
ENSORLG00020004353	-	96	59.677	ENSORLG00020007967	-	87	59.677
ENSORLG00020004353	-	95	46.154	ENSORLG00020005132	-	78	46.154
ENSORLG00020004353	-	98	53.672	ENSORLG00020007074	-	94	55.063
ENSORLG00020004353	-	92	47.059	ENSORLG00020004162	znf341	55	47.059
ENSORLG00020004353	-	96	66.341	ENSORLG00020010916	-	57	66.341
ENSORLG00020004353	-	96	48.276	ENSORLG00020020419	-	80	48.276
ENSORLG00020004353	-	96	68.627	ENSORLG00020010560	-	98	61.538
ENSORLG00020004353	-	96	56.571	ENSORLG00020017164	-	94	56.863
ENSORLG00020004353	-	96	66.346	ENSORLG00020008891	-	86	66.346
ENSORLG00020004353	-	99	46.500	ENSORLG00020007599	-	64	46.500
ENSORLG00020004353	-	97	40.141	ENSORLG00020003719	GFI1B	57	40.141
ENSORLG00020004353	-	94	44.318	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	55	44.318
ENSORLG00020004353	-	99	64.423	ENSORLG00020011075	-	78	64.423
ENSORLG00020004353	-	96	63.636	ENSORLG00020000161	-	77	63.636
ENSORLG00020004353	-	99	44.444	ENSORLG00020018495	-	63	44.444
ENSORLG00020004353	-	97	42.754	ENSORLG00020008787	snai2	53	42.754
ENSORLG00020004353	-	95	46.193	ENSORLG00020010950	-	94	49.020
ENSORLG00020004353	-	99	59.906	ENSORLG00020010953	-	78	59.906
ENSORLG00020004353	-	92	44.660	ENSORLG00020006433	-	79	44.660
ENSORLG00020004353	-	95	43.000	ENSORLG00020018921	-	79	43.000
ENSORLG00020004353	-	99	41.935	ENSORLG00020010932	-	75	41.935
ENSORLG00020004353	-	94	41.441	ENSORLG00020002817	GFI1	50	41.441
ENSORLG00020004353	-	98	40.909	ENSORLG00020018685	znf319b	81	40.909
ENSORLG00020004353	-	98	61.058	ENSORLG00020008484	-	83	61.058
ENSORLG00020004353	-	99	50.877	ENSORLG00020001912	znf236	72	50.877
ENSORLG00020004353	-	96	68.508	ENSORLG00020009419	-	94	62.069
ENSORLG00020004353	-	96	48.731	ENSORLG00020009965	-	72	48.731
ENSORLG00020004353	-	98	67.150	ENSORLG00020009943	-	99	67.150
ENSORLG00020004353	-	97	43.590	ENSORLG00020002128	-	90	43.590
ENSORLG00020004353	-	95	50.990	ENSORLG00020015703	-	51	50.990
ENSORLG00020004353	-	96	63.054	ENSORLG00020021857	-	55	63.054

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004353	-	91	45.000	ENSAPOG00000010645	-	54	45.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	95	52.632	ENSAPOG00000010330	-	72	52.632	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	96	55.696	ENSAPOG00000016615	-	83	55.696	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	95	47.727	ENSAPOG00000014372	-	60	47.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	88	48.765	ENSAPOG00000000601	-	66	48.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	96	54.930	ENSAPOG00000003414	-	97	54.930	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004353	-	99	44.304	ENSAOCG00000007347	-	76	44.304	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004353	-	96	48.913	ENSAPEG00000004256	-	65	48.913	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004353	-	94	56.780	ENSATEG00000007658	-	68	49.268	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004353	-	99	47.826	ENSAMXG00000013492	-	97	42.995	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020004353	-	92	47.788	ENSCING00000024717	-	88	47.788	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020004353	-	98	50.000	ENSCVAG00000018383	-	77	50.000	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020004353	-	90	48.101	ENSEBUG00000013126	-	53	48.101	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	93	48.454	ENSEBUG00000003418	-	95	48.454	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	94	52.632	ENSEBUG00000014768	-	72	52.632	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	99	48.454	ENSEBUG00000000422	-	64	48.454	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	96	54.124	ENSEBUG00000006666	-	86	54.124	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	90	53.390	ENSEBUG00000013874	-	50	53.390	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	95	54.622	ENSEBUG00000015472	-	64	54.622	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	90	46.739	ENSEBUG00000001308	-	64	46.739	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	91	49.689	ENSEBUG00000000436	-	68	49.689	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	90	50.515	ENSEBUG00000001569	-	75	50.515	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	91	49.708	ENSEBUG00000003232	-	54	49.708	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020004353	-	95	53.077	ENSELUG00000000281	-	55	53.077	Esox_lucius
ENSORLG00020004353	-	97	53.659	ENSELUG00000007694	-	81	53.659	Esox_lucius
ENSORLG00020004353	-	99	49.432	ENSELUG00000022942	-	59	49.432	Esox_lucius
ENSORLG00020004353	-	94	40.984	ENSGMOG00000016007	-	78	40.984	Gadus_morhua
ENSORLG00020004353	-	92	49.254	ENSGMOG00000005588	-	100	49.254	Gadus_morhua
ENSORLG00020004353	-	94	52.679	ENSGAFG00000021143	-	56	52.679	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004353	-	99	41.667	ENSGAFG00000013366	-	54	41.667	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004353	-	95	50.267	ENSGAFG00000021139	-	89	50.267	Gambusia_affinis
ENSORLG00020004353	-	92	47.904	ENSGAGG00000010492	-	73	47.904	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020004353	-	99	39.062	ENSHBUG00000007316	-	69	42.593	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004353	-	90	48.718	ENSHBUG00000003529	-	78	48.718	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004353	-	95	48.454	ENSHCOG00000001318	-	94	44.444	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	51.562	ENSHCOG00000007681	-	83	51.562	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	50.000	ENSHCOG00000014777	-	70	50.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	98	44.737	ENSHCOG00000020976	-	54	44.737	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	51.087	ENSHCOG00000001245	-	67	51.087	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	97	51.136	ENSHCOG00000001242	-	61	51.136	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	48.889	ENSHCOG00000001793	-	71	48.087	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	56.842	ENSHCOG00000015355	-	88	54.128	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	95	49.718	ENSHCOG00000008133	-	55	49.718	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004353	-	97	47.953	ENSHCOG00000014797	-	54	47.953	Hippocampus_comes
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ENSORLG00020004353	-	95	54.348	ENSSLDG00000001860	-	77	52.195	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020004353	-	97	41.791	ENSSLDG00000018033	-	65	41.791	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020004353	-	98	46.269	ENSXCOG00000009674	-	97	46.269	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020004353	-	90	46.893	ENSXMAG00000028785	-	74	46.893	Xiphophorus_maculatus