EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004449 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: -
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13205 bases
Position: chr1:27174849-27188053
Accession: 101173124
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020003656	RRM_1	PF00076.22	3.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020009260	-	3160	XM_023959938	ENSORLP00020003656	927 (aa)	XP_023815706	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	81	78.205	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	73	78.344	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	82	77.215	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	74	77.070	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	82	77.215	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	74	77.070	Amphiprion_percula
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	80	76.129	ENSACLG00000019359	-	68	76.129	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	63	76.129	ENSHBUG00000019347	-	54	76.129	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	52	31.683	ENSHCOG00000015325	-	67	31.353	Hippocampus_comes
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	78	79.851	ENSKMAG00000019855	si:dkey-93h22.8	73	74.522	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	80	75.641	ENSLBEG00000024075	-	57	41.247	Labrus_bergylta
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	80	78.205	ENSMAMG00000011169	-	71	77.707	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	80	76.129	ENSMZEG00005008228	-	71	76.129	Maylandia_zebra
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	70	75.641	ENSMALG00000005052	-	69	75.159	Monopterus_albus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	93.319	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	93.750	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	94.181	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	94.181	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	74.547	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	74.121	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	84	80.916	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	81	76.712	Poecilia_formosa
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	70	34.483	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	68	33.952	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	64	76.282	ENSPNYG00000002682	-	56	76.129	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	65	58.750	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	78	58.974	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	81	78.947	ENSSMAG00000005915	si:dkey-93h22.8	58	71.975	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	80	76.282	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	71	75.796	Seriola_dumerili
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	87	76.282	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	80	75.796	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	76	74.359	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	75	73.885	Stegastes_partitus
ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	70	35.752	ENSXMAG00000000243	si:dkey-93h22.8	69	35.629	Xiphophorus_maculatus