EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020004913 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3121 bases
Position: chr18:18300673-18303793
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020023845	RVT_1	PF00078.27	2.5e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020008475	-	3121	-	ENSORLP00020023845	990 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020004913	-	91	32.878	ENSORLG00020009508	-	86	32.303
ENSORLG00020004913	-	69	31.967	ENSORLG00020001879	-	91	31.687
ENSORLG00020004913	-	69	97.388	ENSORLG00020002162	-	99	97.388
ENSORLG00020004913	-	90	32.836	ENSORLG00020007707	-	86	32.432
ENSORLG00020004913	-	78	97.059	ENSORLG00020004369	-	100	97.059
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00020018358	-	100	97.593
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00020007996	-	100	97.492
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00020017275	-	100	97.091
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00020014816	-	100	97.192
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00020003054	-	100	97.492
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00020015225	-	100	97.392
ENSORLG00020004913	-	85	97.300	ENSORLG00020002609	-	100	97.300
ENSORLG00020004913	-	83	32.240	ENSORLG00020002875	-	97	32.466
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00020009527	-	100	97.492
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00020000686	-	100	97.292
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00020005358	-	99	97.593
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00020011016	-	100	97.392
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00020003643	-	100	97.593
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00020010084	-	100	97.392
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00020001429	-	100	97.192
ENSORLG00020004913	-	50	35.125	ENSORLG00020018851	-	88	34.429
ENSORLG00020004913	-	93	97.840	ENSORLG00020010495	-	100	97.840
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00020009902	-	100	97.091
ENSORLG00020004913	-	91	32.029	ENSORLG00020009614	-	95	32.220
ENSORLG00020004913	-	88	31.872	ENSORLG00020020316	-	95	31.823
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00020014382	-	100	97.192
ENSORLG00020004913	-	100	97.693	ENSORLG00020002402	-	99	97.693
ENSORLG00020004913	-	78	97.570	ENSORLG00020015867	-	100	97.570
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00020010522	-	100	97.392
ENSORLG00020004913	-	72	30.789	ENSORLG00020005057	-	100	31.048
ENSORLG00020004913	-	100	96.690	ENSORLG00020017598	-	100	96.690
ENSORLG00020004913	-	76	96.438	ENSORLG00020020442	-	100	96.438
ENSORLG00020004913	-	100	98.394	ENSORLG00020012851	-	100	98.394
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00020022082	-	99	97.292
ENSORLG00020004913	-	78	97.442	ENSORLG00020005006	-	100	97.442
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00020020415	-	100	97.292
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00020020339	-	100	97.492
ENSORLG00020004913	-	53	33.215	ENSORLG00020011847	-	97	32.737

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020004913	-	85	94.215	ENSATEG00000007887	-	99	94.215	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	100	95.382	ENSATEG00000005213	-	100	95.382	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	100	94.277	ENSATEG00000020668	-	99	94.277	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	69	93.506	ENSATEG00000004689	-	100	93.506	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	87	94.902	ENSATEG00000017712	-	100	94.902	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	100	94.478	ENSATEG00000022633	-	100	94.478	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	95	95.541	ENSATEG00000009051	-	99	95.541	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	99	94.960	ENSATEG00000009591	-	100	94.960	Anabas_testudineus
ENSORLG00020004913	-	95	76.508	ENSCSEG00000004965	-	93	76.508	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004913	-	99	75.201	ENSCSEG00000014508	-	98	75.100	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004913	-	100	75.050	ENSCSEG00000010768	-	98	74.950	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004913	-	93	76.782	ENSCSEG00000015459	-	100	76.782	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020004913	-	67	33.774	ENSLOCG00000001168	-	92	34.570	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020004913	-	100	96.389	ENSORLG00000025543	-	100	96.389	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000030097	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000026850	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000024822	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000026123	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	96	96.327	ENSORLG00000030541	-	99	96.327	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00000024333	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.289	ENSORLG00000030118	-	100	96.289	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.200	ENSORLG00000027325	-	100	96.200	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.891	ENSORLG00000027461	-	100	96.891	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000023626	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00000023624	-	100	97.292	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000029970	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000029576	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.991	ENSORLG00000021880	-	100	96.991	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000026400	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000022897	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00000024342	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	93	97.840	ENSORLG00000021832	-	100	97.840	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000024187	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00000026767	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.693	ENSORLG00000025138	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00000029439	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00000030347	-	100	97.292	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000021860	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.486	ENSORLG00000030391	-	100	96.486	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.690	ENSORLG00000029999	-	100	96.690	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.894	ENSORLG00000024793	-	100	97.894	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00000028859	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.991	ENSORLG00000025027	-	100	96.991	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.891	ENSORLG00000024897	-	100	96.891	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.894	ENSORLG00000024556	-	100	96.894	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00000024298	-	100	97.292	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000026509	-	100	97.091	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.693	ENSORLG00000026507	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.894	ENSORLG00000023209	-	100	97.894	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	67	96.125	ENSORLG00000029231	-	100	96.125	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.389	ENSORLG00000028546	-	100	96.389	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	85	97.163	ENSORLG00000030467	-	95	97.163	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000026477	-	100	97.091	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00000023036	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.392	ENSORLG00000029193	-	100	97.392	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	93	96.976	ENSORLG00000022924	-	100	96.976	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000022102	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.292	ENSORLG00000022537	-	100	97.292	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.891	ENSORLG00000027933	-	100	96.891	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000026895	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000024622	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.991	ENSORLG00000023104	-	100	96.991	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.793	ENSORLG00000025030	-	100	97.793	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000026499	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000023217	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000027942	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	95	97.260	ENSORLG00000027945	-	100	97.260	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000028713	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00000028712	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00000027738	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.492	ENSORLG00000029331	-	100	97.492	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.693	ENSORLG00000027354	-	100	97.693	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	91	97.017	ENSORLG00000026815	-	95	97.017	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	93	97.408	ENSORLG00000022934	-	100	97.408	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	96.894	ENSORLG00000027434	-	100	96.894	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.593	ENSORLG00000027439	-	100	97.593	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	70	96.857	ENSORLG00000025112	-	100	96.857	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020004913	-	100	97.192	ENSORLG00000027111	-	100	97.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020004913	-	100	97.091	ENSORLG00000030289	-	100	97.091	Oryzias_latipes
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