EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020005006 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2349 bases
Position: chr20:10346499-10348847
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020004229	RVT_1	PF00078.27	7e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020008317	-	2349	-	ENSORLP00020004229	782 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020007996	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020017275	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020014816	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020003054	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	98.082	ENSORLG00020015225	-	78	98.082
ENSORLG00020005006	-	100	97.954	ENSORLG00020002609	-	92	97.954
ENSORLG00020005006	-	97	97.098	ENSORLG00020020442	-	100	97.098
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00020000686	-	78	97.826
ENSORLG00020005006	-	67	33.808	ENSORLG00020011847	-	97	33.274
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00020011016	-	78	97.826
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00020022082	-	78	97.826
ENSORLG00020005006	-	100	98.082	ENSORLG00020020415	-	78	98.082
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00020020339	-	78	97.826
ENSORLG00020005006	-	100	98.210	ENSORLG00020003643	-	78	98.210
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020010084	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	97.442	ENSORLG00020004913	-	78	97.442
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020009902	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	97.570	ENSORLG00020004369	-	100	97.570
ENSORLG00020005006	-	98	31.758	ENSORLG00020009614	-	81	31.646
ENSORLG00020005006	-	100	98.210	ENSORLG00020018358	-	78	98.210
ENSORLG00020005006	-	100	97.570	ENSORLG00020001429	-	78	97.570
ENSORLG00020005006	-	100	98.210	ENSORLG00020010495	-	84	98.210
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00020009527	-	78	97.698
ENSORLG00020005006	-	100	98.210	ENSORLG00020005358	-	78	98.210
ENSORLG00020005006	-	94	32.345	ENSORLG00020009508	-	71	31.953
ENSORLG00020005006	-	100	98.338	ENSORLG00020012851	-	79	98.338
ENSORLG00020005006	-	100	97.954	ENSORLG00020014382	-	78	97.954
ENSORLG00020005006	-	100	98.338	ENSORLG00020002402	-	78	98.338
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00020010522	-	78	97.826
ENSORLG00020005006	-	100	97.059	ENSORLG00020017598	-	78	97.059
ENSORLG00020005006	-	88	31.978	ENSORLG00020002875	-	82	31.903
ENSORLG00020005006	-	64	35.577	ENSORLG00020018851	-	88	35.203
ENSORLG00020005006	-	100	98.082	ENSORLG00020015867	-	100	98.082
ENSORLG00020005006	-	89	32.514	ENSORLG00020001879	-	80	33.489
ENSORLG00020005006	-	61	97.046	ENSORLG00020002162	-	68	97.046
ENSORLG00020005006	-	94	31.559	ENSORLG00020020316	-	81	31.179
ENSORLG00020005006	-	93	32.503	ENSORLG00020007707	-	70	31.771

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020005006	-	73	31.605	ENSAPEG00000009254	-	99	31.438	Amphiprion_percula
ENSORLG00020005006	-	100	92.583	ENSATEG00000011048	-	100	92.583	Anabas_testudineus
ENSORLG00020005006	-	97	95.664	ENSATEG00000006562	-	92	95.664	Anabas_testudineus
ENSORLG00020005006	-	89	32.455	ENSACLG00000017252	-	91	32.089	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005006	-	60	35.343	ENSACLG00000000577	-	97	34.578	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005006	-	86	32.429	ENSACLG00000013208	-	81	33.068	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005006	-	100	77.366	ENSCSEG00000017238	-	92	77.366	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020005006	-	60	81.144	ENSCSEG00000000334	-	100	81.144	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020005006	-	80	78.617	ENSCSEG00000016291	-	96	78.964	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020005006	-	82	78.125	ENSCSEG00000008847	-	99	78.125	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020005006	-	62	34.809	ENSELUG00000023077	-	87	34.809	Esox_lucius
ENSORLG00020005006	-	99	46.456	ENSLACG00000011569	-	91	45.908	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020005006	-	67	30.000	ENSLACG00000006699	-	88	31.198	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020005006	-	81	39.336	ENSLOCG00000016955	-	94	40.407	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020005006	-	58	40.351	ENSLOCG00000008864	-	98	40.351	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020005006	-	51	36.275	ENSMALG00000007492	-	99	36.275	Monopterus_albus
ENSORLG00020005006	-	98	98.177	ENSORLG00000028921	-	100	98.177	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	98	98.307	ENSORLG00000030153	-	100	98.307	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	98	98.047	ENSORLG00000028330	-	100	98.047	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	97.826	ENSORLG00000028876	-	98	97.826	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	97.442	ENSORLG00000024673	-	100	97.442	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	97	96.053	ENSORLG00000028786	-	100	96.053	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	98	97.005	ENSORLG00000026947	-	100	97.005	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	93	32.592	ENSORLG00000023376	-	85	32.105	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	60	98.517	ENSORLG00000022572	-	100	98.517	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	97.570	ENSORLG00000024563	-	92	97.570	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	59	36.590	ENSORLG00000015190	-	98	36.192	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	60	98.305	ENSORLG00000024322	-	100	98.305	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	60	96.822	ENSORLG00000027624	-	100	96.822	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	97.187	ENSORLG00000024229	-	100	97.187	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	97.698	ENSORLG00000025758	-	100	97.698	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	100	98.031	ENSORLG00000025843	-	100	98.031	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	64	36.207	ENSORLG00000028845	-	88	35.645	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	84	32.562	ENSORLG00000030430	-	72	32.122	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	93	97.796	ENSORLG00000023326	-	99	97.796	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005006	-	91	98.025	ENSORLG00015006293	-	100	98.025	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	100	98.210	ENSORLG00015018638	-	92	98.210	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	53	95.884	ENSORLG00015020118	-	100	95.884	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	60	98.729	ENSORLG00015012247	-	100	98.729	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	60	98.093	ENSORLG00015021074	-	100	98.093	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	60	98.517	ENSORLG00015015659	-	100	98.517	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	60	98.305	ENSORLG00015010665	-	100	98.305	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	100	97.315	ENSORLG00015008272	-	92	97.315	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	60	31.463	ENSORLG00015011564	-	98	31.864	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	59	32.218	ENSORLG00015014615	-	86	31.789	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	76	30.853	ENSORLG00015009448	-	83	30.781	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	97	98.026	ENSORLG00015010878	-	100	98.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	97	98.289	ENSORLG00015005006	-	100	98.289	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	52	98.280	ENSORLG00015012611	-	100	98.280	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	100	98.338	ENSORLG00015005235	-	99	98.338	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	99	98.069	ENSORLG00015004990	-	100	98.069	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005006	-	98	79.637	ENSOMEG00000010125	-	91	78.729	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005006	-	100	79.592	ENSOMEG00000008315	-	92	78.699	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005006	-	97	79.659	ENSOMEG00000004401	-	92	78.740	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005006	-	98	79.324	ENSOMEG00000004553	-	99	78.544	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005006	-	100	79.464	ENSOMEG00000004044	-	89	78.571	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005006	-	79	30.934	ENSPKIG00000009130	-	86	30.168	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020005006	-	56	33.186	ENSPKIG00000021701	-	94	33.186	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020005006	-	93	32.275	ENSPREG00000017352	-	70	31.915	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020005006	-	58	36.111	ENSSMAG00000002801	-	97	36.111	Scophthalmus_maximus