EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020005385 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 59951 bases
Position: chr12:8871493-8931443
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020004537	MIF4G	PF02854.19	7.9e-25	1	1
ENSORLP00020024134	MIF4G	PF02854.19	9.7e-25	1	1
ENSORLP00020004551	MIF4G	PF02854.19	1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020007794	-	1818	-	ENSORLP00020004537	605 (aa)	-	-
ENSORLT00020007736	-	5959	-	ENSORLP00020024134	664 (aa)	-	-
ENSORLT00020007771	-	2403	-	ENSORLP00020004551	691 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.106	ENSG00000134030	CTIF	100	64.029	Homo_sapiens
ENSORLG00020005385	ctif	100	75.041	ENSAPOG00000020192	ctif	100	80.207	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020005385	ctif	87	55.331	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	54.745	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020005385	ctif	100	78.612	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.754	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020005385	ctif	100	65.726	ENSAOCG00000014275	ctif	82	91.228	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020005385	ctif	100	81.009	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.275	Amphiprion_percula
ENSORLG00020005385	ctif	100	80.502	ENSATEG00000016752	ctif	100	80.966	Anabas_testudineus
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.496	ENSACAG00000018006	CTIF	99	59.050	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.132	ENSANAG00000024925	CTIF	99	57.581	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020005385	ctif	100	78.887	ENSACLG00000005956	ctif	100	79.659	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005385	ctif	54	59.504	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.463	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.552	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	56.940	Bos_taurus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.649	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.235	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020005385	ctif	97	56.766	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	56.709	Canis_familiaris
ENSORLG00020005385	ctif	97	56.931	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	56.869	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.646	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	56.044	Capra_hircus
ENSORLG00020005385	ctif	90	56.530	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	55.950	Carlito_syrichta
ENSORLG00020005385	ctif	99	53.635	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	53.333	Cavia_aperea
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.369	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	56.735	Cavia_porcellus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.624	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	57.074	Cebus_capucinus
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.347	ENSCATG00000038134	CTIF	99	57.861	Cercocebus_atys
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.600	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	56.916	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.413	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	56.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.292	ENSCPBG00000025654	CTIF	99	58.997	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.266	ENSCANG00000030916	CTIF	100	57.074	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.612	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	59.061	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020005385	ctif	99	55.226	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.688	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020005385	ctif	100	73.455	ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.140	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020005385	ctif	100	78.143	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.143	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	65.909	ENSDARG00000090617	ctif	100	64.624	Danio_rerio
ENSORLG00020005385	ctif	71	56.098	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	55.211	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.724	ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.166	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.649	ENSEASG00005016094	CTIF	100	57.005	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.395	ENSECAG00000020473	CTIF	100	56.844	Equus_caballus
ENSORLG00020005385	ctif	90	53.147	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	52.273	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020005385	ctif	99	65.457	ENSELUG00000008733	ctif	100	65.252	Esox_lucius
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.649	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	57.005	Felis_catus
ENSORLG00020005385	ctif	97	57.143	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.689	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.698	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	56.124	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.945	ENSFHEG00000004334	ctif	100	76.945	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.903	ENSGALG00000035912	-	99	58.187	Gallus_gallus
ENSORLG00020005385	ctif	92	83.051	ENSGAFG00000011896	ctif	100	83.051	Gambusia_affinis
ENSORLG00020005385	ctif	65	55.231	ENSGAGG00000020663	CTIF	92	56.410	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.785	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	57.372	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020005385	ctif	100	79.030	ENSHBUG00000018092	ctif	100	79.801	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.945	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	57.348	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.785	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	57.188	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020005385	ctif	99	67.763	ENSHCOG00000011784	ctif	99	68.249	Hippocampus_comes
ENSORLG00020005385	ctif	99	65.778	ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.888	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.372	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	56.778	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.800	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	56.250	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020005385	ctif	100	77.630	ENSKMAG00000014651	ctif	100	78.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020005385	ctif	99	72.937	ENSLBEG00000018277	ctif	99	91.525	Labrus_bergylta
ENSORLG00020005385	ctif	99	64.568	ENSLOCG00000011697	ctif	100	64.861	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	50.000	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.379	Loxodonta_africana
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.347	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	57.861	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.347	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	57.861	Macaca_mulatta
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.347	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	57.861	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.226	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	57.674	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020005385	ctif	100	80.712	ENSMAMG00000014741	ctif	100	81.157	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020005385	ctif	91	76.406	ENSMZEG00005019767	ctif	92	77.259	Maylandia_zebra
ENSORLG00020005385	ctif	88	43.525	ENSMGAG00000001378	CTIF	63	87.500	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.533	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	57.937	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.303	ENSMICG00000010167	CTIF	100	57.372	Microcebus_murinus
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.414	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	57.861	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.122	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.122	Mola_mola
ENSORLG00020005385	ctif	99	54.708	ENSMODG00000003464	CTIF	100	54.106	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020005385	ctif	85	69.275	ENSMALG00000020553	ctif	99	87.179	Monopterus_albus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.076	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	56.542	Mus_caroli
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.942	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.406	Mus_musculus
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.194	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	58.643	Mus_pahari
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.630	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	73.856	Mus_spretus
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.913	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	56.340	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.488	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	57.005	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.937	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	58.387	Nannospalax_galili
ENSORLG00020005385	ctif	100	78.487	ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.290	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.692	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	56.270	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020005385	ctif	99	51.360	ENSMEUG00000000218	CTIF	86	85.417	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.624	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	57.074	Ochotona_princeps
ENSORLG00020005385	ctif	99	56.854	ENSODEG00000018390	CTIF	100	56.192	Octodon_degus
ENSORLG00020005385	ctif	99	77.961	ENSONIG00000007750	ctif	100	77.273	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020005385	ctif	84	50.256	ENSOANG00000001337	CTIF	99	49.670	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.853	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	57.257	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020005385	ctif	100	97.711	ENSORLG00000005786	ctif	100	97.711	Oryzias_latipes
ENSORLG00020005385	ctif	100	98.273	ENSORLG00015011872	ctif	100	98.273	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020005385	ctif	100	93.247	ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.247	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.717	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	57.166	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.369	ENSOARG00000003754	CTIF	100	56.761	Ovis_aries
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.920	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	57.372	Pan_paniscus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.303	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	56.661	Panthera_pardus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.464	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	56.778	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.920	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	57.372	Pan_troglodytes
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.226	ENSPANG00000017087	CTIF	99	57.674	Papio_anubis
ENSORLG00020005385	ctif	84	57.782	ENSPKIG00000011234	ctif	94	63.003	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.306	ENSPSIG00000006508	CTIF	99	58.306	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020005385	ctif	100	69.132	ENSPMGG00000022958	ctif	100	68.990	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.091	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	57.605	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020005385	ctif	76	55.437	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	60.241	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.164	ENSPFOG00000009243	ctif	100	76.164	Poecilia_formosa
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.446	ENSPLAG00000019171	ctif	100	76.446	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.305	ENSPMEG00000020089	ctif	100	76.305	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020005385	ctif	100	74.504	ENSPREG00000017326	ctif	100	74.504	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020005385	ctif	84	58.095	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	57.443	Pongo_abelii
ENSORLG00020005385	ctif	99	55.360	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	54.690	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.320	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	57.717	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020005385	ctif	100	79.030	ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.801	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020005385	ctif	99	67.482	ENSPNAG00000029174	ctif	100	66.809	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.253	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.699	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.920	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	57.372	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.692	ENSRROG00000006039	CTIF	100	56.571	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.742	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	57.258	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020005385	ctif	99	54.634	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	54.032	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020005385	ctif	99	65.923	ENSSFOG00015022594	ctif	100	64.950	Scleropages_formosus
ENSORLG00020005385	ctif	100	78.815	ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.630	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020005385	ctif	100	89.286	ENSSDUG00000016033	ctif	94	89.286	Seriola_dumerili
ENSORLG00020005385	ctif	100	79.616	ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.275	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020005385	ctif	99	59.416	ENSSPUG00000014734	CTIF	93	87.500	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020005385	ctif	100	76.786	ENSSPAG00000003721	ctif	100	77.110	Stegastes_partitus
ENSORLG00020005385	ctif	99	58.039	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	57.395	Sus_scrofa
ENSORLG00020005385	ctif	97	55.502	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	55.975	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020005385	ctif	56	69.767	ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.767	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020005385	ctif	99	70.376	ENSTNIG00000018763	ctif	100	70.195	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020005385	ctif	89	65.000	ENSTBEG00000002613	CTIF	89	65.000	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020005385	ctif	99	54.984	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	54.386	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020005385	ctif	85	52.799	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	52.328	Ursus_americanus
ENSORLG00020005385	ctif	99	57.488	ENSUMAG00000002735	CTIF	100	56.844	Ursus_maritimus
ENSORLG00020005385	ctif	51	61.446	ENSVPAG00000001497	-	60	61.446	Vicugna_pacos
ENSORLG00020005385	ctif	97	56.766	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	56.709	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020005385	ctif	97	44.812	ENSXETG00000026836	ctif	72	69.084	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020005385	ctif	66	68.765	ENSXCOG00000002477	ctif	98	69.388	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020005385	ctif	100	74.964	ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.671	Xiphophorus_maculatus