EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020005670 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1005 bases
Position: chr21:14617823-14618827
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020024319	RVT_1	PF00078.27	1.4e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020007238	-	1005	-	ENSORLP00020024319	260 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSORLG00020005670	-	90	49.791	ENSORLG00020021067	-	60	49.791
ENSORLG00020005670	-	95	47.638	ENSORLG00020012080	-	54	48.031
ENSORLG00020005670	-	80	52.153	ENSORLG00020018147	-	91	52.153
ENSORLG00020005670	-	78	42.273	ENSORLG00020001541	-	54	42.273
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ENSORLG00020005670	-	78	36.098	ENSORLG00020009746	-	58	36.098
ENSORLG00020005670	-	95	47.287	ENSORLG00020015544	-	73	47.287
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ENSORLG00020005670	-	95	47.287	ENSORLG00020013014	-	58	47.287
ENSORLG00020005670	-	95	46.538	ENSORLG00020016660	-	57	46.538
ENSORLG00020005670	-	63	37.952	ENSORLG00020001640	-	82	37.952
ENSORLG00020005670	-	94	53.571	ENSORLG00020016243	-	66	53.571
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ENSORLG00020005670	-	58	39.735	ENSORLG00020002943	-	69	39.735
ENSORLG00020005670	-	95	48.062	ENSORLG00020006805	-	54	48.062
ENSORLG00020005670	-	95	46.415	ENSORLG00020006220	-	50	46.415
ENSORLG00020005670	-	95	44.961	ENSORLG00020003888	-	56	44.961
ENSORLG00020005670	-	95	48.062	ENSORLG00020004056	-	58	48.062
ENSORLG00020005670	-	95	48.062	ENSORLG00020002173	-	56	48.062
ENSORLG00020005670	-	95	43.023	ENSORLG00020008855	-	56	43.023

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020005670	-	76	46.231	ENSAPOG00000023528	-	79	46.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020005670	-	76	34.314	ENSACIG00000019567	-	88	34.314	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020005670	-	53	37.681	ENSACIG00000011711	-	63	37.681	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020005670	-	71	48.958	ENSAOCG00000004576	-	52	48.958	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020005670	-	64	37.714	ENSAOCG00000022972	-	91	37.714	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020005670	-	62	48.750	ENSAPEG00000007794	-	78	48.750	Amphiprion_percula
ENSORLG00020005670	-	75	47.343	ENSAPEG00000024502	-	56	47.343	Amphiprion_percula
ENSORLG00020005670	-	88	44.397	ENSATEG00000002253	-	69	44.397	Anabas_testudineus
ENSORLG00020005670	-	95	47.410	ENSATEG00000014313	-	72	47.410	Anabas_testudineus
ENSORLG00020005670	-	95	44.314	ENSACLG00000013944	-	58	44.314	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	76	43.689	ENSACLG00000020926	-	54	43.689	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	90	45.455	ENSACLG00000024568	-	57	45.455	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	95	45.490	ENSACLG00000000230	-	54	45.490	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	74	43.000	ENSACLG00000001865	-	55	43.000	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	95	43.922	ENSACLG00000025525	-	63	43.922	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	88	47.679	ENSACLG00000022966	-	71	46.332	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	95	50.980	ENSACLG00000014537	-	54	50.980	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	95	43.922	ENSACLG00000017093	-	58	43.922	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	92	45.833	ENSACLG00000025009	-	51	45.833	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	62	39.645	ENSACLG00000003344	-	54	39.645	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	80	50.239	ENSACLG00000019110	-	51	50.239	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	95	44.706	ENSACLG00000015324	-	66	44.706	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	95	50.584	ENSACLG00000004998	-	57	50.584	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	67	46.703	ENSACLG00000022741	-	50	46.703	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	75	45.771	ENSACLG00000005593	-	53	45.771	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	95	44.314	ENSACLG00000001556	-	54	44.314	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	80	48.848	ENSACLG00000003937	-	54	48.848	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	61	45.342	ENSACLG00000015452	-	85	45.342	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	95	43.137	ENSACLG00000024587	-	67	43.137	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	95	44.706	ENSACLG00000020388	-	70	44.706	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	95	44.314	ENSACLG00000025562	-	58	44.314	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020005670	-	72	43.077	ENSACLG00000008024	-	52	43.077	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020005670	-	82	57.273	ENSPNYG00000023857	-	64	57.273	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020005670	-	72	43.147	ENSPNAG00000003449	-	59	43.147	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020005670	-	60	51.266	ENSPNAG00000024994	-	98	51.266	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020005670	-	68	41.711	ENSPNAG00000013203	-	70	43.147	Pygocentrus_nattereri
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ENSORLG00020005670	-	95	44.314	ENSSDUG00000000707	-	80	44.314	Seriola_dumerili
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ENSORLG00020005670	-	52	36.691	ENSXCOG00000003154	-	95	36.842	Xiphophorus_couchianus
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ENSORLG00020005670	-	88	51.667	ENSXMAG00000029256	-	58	51.667	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020005670	-	94	64.940	ENSXMAG00000019451	-	69	64.940	Xiphophorus_maculatus