EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006036 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl9
Alias: -
Full Name: ribosomal protein L9
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5123 bases
Position: chr1:12081243-12086365
Accession: 111947653
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020005226	Ribosomal_L6	PF00347.23	4.9e-32	1	2
ENSORLP00020005226	Ribosomal_L6	PF00347.23	4.9e-32	2	2
ENSORLP00020005237	Ribosomal_L6	PF00347.23	9.6e-32	1	2
ENSORLP00020005237	Ribosomal_L6	PF00347.23	9.6e-32	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020006630	-	2305	-	ENSORLP00020005237	193 (aa)	XP_023812321	UPI0002A47B98
ENSORLT00020006650	-	1913	-	ENSORLP00020005226	232 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSG00000163682	RPL9	100	90.265	Homo_sapiens
ENSORLG00020006036	rpl9	100	93.782	ENSAPOG00000007833	rpl9	99	94.845	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	85.789	ENSAMEG00000003187	RPL9	100	86.979	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020006036	rpl9	98	71.053	ENSAMEG00000003670	-	100	72.917	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020006036	rpl9	98	62.105	ENSAMEG00000005164	-	100	63.542	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020006036	rpl9	98	92.632	ENSACIG00000010516	rpl9	100	95.312	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006036	rpl9	100	92.228	ENSAOCG00000013751	rpl9	100	93.750	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006036	rpl9	100	92.228	ENSAPEG00000019426	rpl9	100	93.750	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006036	rpl9	99	92.708	ENSATEG00000019735	rpl9	100	94.792	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006036	rpl9	90	88.439	ENSAPLG00000011712	RPL9	99	89.714	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020006036	rpl9	97	86.096	ENSACAG00000007317	RPL9	100	85.938	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020006036	rpl9	95	71.196	ENSANAG00000028192	-	98	72.581	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	84	81.481	ENSANAG00000036273	-	90	81.481	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	98	80.000	ENSANAG00000023940	-	100	81.250	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSANAG00000027218	RPL9	100	87.500	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	84	72.393	ENSANAG00000024659	-	99	72.393	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	83	83.750	ENSANAG00000025368	-	90	83.544	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006036	rpl9	98	93.651	ENSACLG00000015446	rpl9	81	93.810	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020006036	rpl9	98	88.889	ENSAMXG00000041237	rpl9	99	90.052	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	85.789	ENSBTAG00000030281	-	100	86.979	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.737	ENSBTAG00000024608	-	100	85.938	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	58	86.486	ENSBTAG00000047946	-	100	88.496	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.211	ENSBTAG00000048225	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.211	ENSBTAG00000045566	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSBTAG00000014518	RPL9	100	87.500	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.211	ENSBTAG00000045678	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	59.474	WBGene00004420	rpl-9	98	60.638	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020006036	rpl9	87	83.832	ENSCJAG00000022754	-	92	83.832	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCJAG00000000723	RPL9	100	87.500	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	77.895	ENSCAFG00000015886	-	100	78.646	Canis_familiaris
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCAFG00000016008	RPL9	100	87.500	Canis_familiaris
ENSORLG00020006036	rpl9	98	77.368	ENSCAFG00000000653	-	100	78.125	Canis_familiaris
ENSORLG00020006036	rpl9	98	77.368	ENSCAFG00020002963	-	100	78.125	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020006036	rpl9	84	80.368	ENSCAFG00020013873	-	91	80.368	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCAFG00020002170	RPL9	100	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020006036	rpl9	98	83.158	ENSCHIG00000009159	-	100	84.375	Capra_hircus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	85.263	ENSCHIG00000010457	-	100	86.458	Capra_hircus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCHIG00000011416	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	85.789	ENSCHIG00000011028	-	100	86.979	Capra_hircus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	72.487	ENSCHIG00000008212	-	90	71.859	Capra_hircus
ENSORLG00020006036	rpl9	97	74.332	ENSTSYG00000025699	-	97	75.401	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006036	rpl9	97	74.866	ENSTSYG00000035529	-	99	72.892	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006036	rpl9	97	88.235	ENSTSYG00000033916	-	100	88.021	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006036	rpl9	97	81.283	ENSTSYG00000036944	-	97	83.422	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006036	rpl9	97	74.332	ENSTSYG00000027256	-	99	72.289	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006036	rpl9	97	88.235	ENSCPOG00000004543	RPL9	100	88.542	Cavia_porcellus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	83.158	ENSCCAG00000014967	-	100	83.854	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006036	rpl9	90	83.237	ENSCCAG00000019506	-	98	83.237	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	70.000	ENSCCAG00000019338	-	100	71.354	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	73.684	ENSCCAG00000000333	RPL9	100	75.000	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.211	ENSCCAG00000018472	-	100	85.417	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCATG00000031890	RPL9	100	87.500	Cercocebus_atys
ENSORLG00020006036	rpl9	83	76.875	ENSCATG00000031517	-	100	76.364	Cercocebus_atys
ENSORLG00020006036	rpl9	98	72.632	ENSCATG00000034300	-	100	73.958	Cercocebus_atys
ENSORLG00020006036	rpl9	97	75.401	ENSCATG00000034132	-	96	76.289	Cercocebus_atys
ENSORLG00020006036	rpl9	98	79.894	ENSCATG00000035764	-	100	82.011	Cercocebus_atys
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ENSORLG00020006036	rpl9	97	68.449	ENSCLAG00000000776	-	100	69.271	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020006036	rpl9	82	74.214	ENSCLAG00000009325	-	96	74.214	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020006036	rpl9	97	88.235	ENSCLAG00000001418	-	100	88.542	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020006036	rpl9	83	73.016	ENSCSAG00000016932	RPL9	98	73.016	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCPBG00000013796	RPL9	100	87.500	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020006036	rpl9	99	66.146	ENSCING00000009310	-	99	68.063	Ciona_intestinalis
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	74.211	ENSCANG00000029652	-	100	75.521	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.737	ENSCANG00000004781	-	100	85.938	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	82.105	ENSCANG00000008940	-	100	83.333	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSCANG00000020360	-	100	87.500	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	74.211	ENSCGRG00001000697	-	99	73.869	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020006036	rpl9	98	71.579	ENSCGRG00001000691	-	100	72.917	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	71.579	ENSCGRG00000013050	-	100	72.917	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020006036	rpl9	87	70.659	ENSCGRG00000018121	-	100	70.659	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020006036	rpl9	99	90.052	ENSCSEG00000004845	rpl9	99	93.158	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020006036	rpl9	98	95.238	ENSCVAG00000007241	rpl9	100	97.396	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020006036	rpl9	100	90.674	ENSDARG00000037350	rpl9	99	93.194	Danio_rerio
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.737	ENSDNOG00000045361	-	97	85.567	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSDNOG00000007411	-	99	85.930	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	66	59.375	ENSDNOG00000032325	-	91	59.375	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	96	68.649	ENSDNOG00000012581	-	99	67.337	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	97	58.730	ENSDNOG00000035065	-	100	63.006	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	89	58.621	ENSDNOG00000004245	-	99	55.208	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	58.974	ENSDORG00000028406	-	100	60.406	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSDORG00000001088	-	100	87.500	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020006036	rpl9	100	62.051	ENSDORG00000026634	-	100	62.887	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020006036	rpl9	99	61.979	FBgn0015756	RpL9	100	63.021	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020006036	rpl9	96	61.828	ENSETEG00000007167	-	100	61.458	Echinops_telfairi
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.293	ENSETEG00000019049	-	100	85.492	Echinops_telfairi
ENSORLG00020006036	rpl9	96	62.366	ENSETEG00000019917	-	96	64.674	Echinops_telfairi
ENSORLG00020006036	rpl9	99	53.125	ENSETEG00000002415	-	99	53.125	Echinops_telfairi
ENSORLG00020006036	rpl9	94	56.044	ENSETEG00000009761	-	99	56.044	Echinops_telfairi
ENSORLG00020006036	rpl9	99	64.062	ENSEBUG00000007378	rpl9	100	64.062	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSEASG00005008233	RPL9	100	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020006036	rpl9	56	70.370	ENSECAG00000029016	-	95	72.222	Equus_caballus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSECAG00000016489	RPL9	100	87.500	Equus_caballus
ENSORLG00020006036	rpl9	65	75.200	ENSEEUG00000000368	-	100	75.200	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020006036	rpl9	81	87.261	ENSEEUG00000004394	RPL9	100	87.261	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	88.360	ENSELUG00000007202	rpl9	99	90.052	Esox_lucius
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSFCAG00000012284	RPL9	100	87.500	Felis_catus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.842	ENSFALG00000009256	RPL9	100	88.021	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020006036	rpl9	97	88.235	ENSFDAG00000013998	-	100	88.542	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020006036	rpl9	97	69.519	ENSFDAG00000020084	-	100	70.312	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020006036	rpl9	97	59.162	ENSFDAG00000015251	-	100	59.694	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020006036	rpl9	100	94.301	ENSFHEG00000008785	rpl9	100	96.354	Fundulus_heteroclitus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSGALG00000000150	RPL9	100	87.500	Gallus_gallus
ENSORLG00020006036	rpl9	100	93.782	ENSGAFG00000020607	rpl9	100	94.792	Gambusia_affinis
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	88.947	ENSHCOG00000002401	rpl9	100	90.104	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006036	rpl9	99	89.583	ENSIPUG00000003557	rpl9	99	92.670	Ictalurus_punctatus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	83.684	ENSMMUG00000010691	-	100	84.896	Macaca_mulatta
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ENSORLG00020006036	rpl9	83	78.125	ENSMNEG00000033519	-	100	77.576	Macaca_nemestrina
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ENSORLG00020006036	rpl9	100	66.839	ENSMLEG00000040897	-	92	68.229	Mandrillus_leucophaeus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	93.651	ENSMZEG00005023706	rpl9	96	87.907	Maylandia_zebra
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.842	ENSMGAG00000012293	RPL9	100	88.021	Meleagris_gallopavo
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.842	ENSMAUG00000001435	-	100	88.021	Mesocricetus_auratus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	92.593	ENSMMOG00000007326	rpl9	100	94.271	Mola_mola
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	93.158	ENSMALG00000006219	rpl9	100	95.312	Monopterus_albus
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ENSORLG00020006036	rpl9	97	87.701	MGP_PahariEiJ_G0017029	-	100	88.021	Mus_pahari
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ENSORLG00020006036	rpl9	60	83.478	MGP_SPRETEiJ_G0015311	-	97	83.478	Mus_spretus
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	93.651	ENSNBRG00000016133	rpl9	100	95.833	Neolamprologus_brichardi
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ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.737	ENSMEUG00000006034	-	100	85.938	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020006036	rpl9	98	84.211	ENSMEUG00000016722	-	100	85.417	Notamacropus_eugenii
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ENSORLG00020006036	rpl9	56	80.556	ENSUAMG00000002425	-	100	81.416	Ursus_americanus
ENSORLG00020006036	rpl9	84	75.309	ENSUAMG00000014494	-	97	75.309	Ursus_americanus
ENSORLG00020006036	rpl9	84	68.712	ENSUAMG00000025283	-	89	68.712	Ursus_americanus
ENSORLG00020006036	rpl9	84	72.840	ENSUMAG00000011460	-	97	74.691	Ursus_maritimus
ENSORLG00020006036	rpl9	99	69.231	ENSUMAG00000008731	-	99	69.231	Ursus_maritimus
ENSORLG00020006036	rpl9	97	87.701	ENSUMAG00000000865	RPL9	100	87.500	Ursus_maritimus
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.842	ENSVPAG00000002023	-	100	88.021	Vicugna_pacos
ENSORLG00020006036	rpl9	98	86.316	ENSVPAG00000009904	-	100	87.500	Vicugna_pacos
ENSORLG00020006036	rpl9	93	72.222	ENSVVUG00000016821	-	98	72.778	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020006036	rpl9	98	78.049	ENSVVUG00000014677	RPL9	100	79.227	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020006036	rpl9	97	84.492	ENSXETG00000012856	rpl9	100	84.896	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020006036	rpl9	100	92.228	ENSXCOG00000013726	rpl9	100	94.271	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020006036	rpl9	100	93.782	ENSXMAG00000009586	rpl9	100	94.271	Xiphophorus_maculatus