EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006144 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4991 bases
Position: chr12:23442800-23447790
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020024646	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-34	1	5
ENSORLP00020024646	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-34	2	5
ENSORLP00020024646	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-34	3	5
ENSORLP00020024646	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-34	4	5
ENSORLP00020024646	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-34	5	5
ENSORLP00020005334	zf-C2H2	PF00096.26	7e-26	1	4
ENSORLP00020005334	zf-C2H2	PF00096.26	7e-26	2	4
ENSORLP00020005334	zf-C2H2	PF00096.26	7e-26	3	4
ENSORLP00020005334	zf-C2H2	PF00096.26	7e-26	4	4
ENSORLP00020024646	zf-met	PF12874.7	2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020006461	-	870	-	ENSORLP00020005334	289 (aa)	-	-
ENSORLT00020006437	-	3538	-	ENSORLP00020024646	538 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020006144	-	69	42.857	ENSORLG00020004370	-	84	40.526
ENSORLG00020006144	-	84	40.099	ENSORLG00020008891	-	86	43.662
ENSORLG00020006144	-	71	41.818	ENSORLG00020010932	-	81	41.818
ENSORLG00020006144	-	90	32.258	ENSORLG00020010937	patz1	60	34.659
ENSORLG00020006144	-	83	34.375	ENSORLG00020007790	zbtb48	61	35.426
ENSORLG00020006144	-	85	32.168	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	73	32.331
ENSORLG00020006144	-	84	37.245	ENSORLG00020018051	prdm5	73	37.245
ENSORLG00020006144	-	75	42.697	ENSORLG00020000161	-	84	42.308
ENSORLG00020006144	-	76	44.304	ENSORLG00020021196	-	52	42.000
ENSORLG00020006144	-	79	39.713	ENSORLG00020008346	-	96	43.169
ENSORLG00020006144	-	84	36.486	ENSORLG00020001791	-	59	36.486
ENSORLG00020006144	-	72	43.396	ENSORLG00020010950	-	94	43.529
ENSORLG00020006144	-	87	40.945	ENSORLG00020007599	-	77	40.945
ENSORLG00020006144	-	76	42.132	ENSORLG00020016666	-	75	39.524
ENSORLG00020006144	-	84	40.000	ENSORLG00020017483	-	88	45.000
ENSORLG00020006144	-	88	36.765	ENSORLG00020020419	-	84	39.316
ENSORLG00020006144	-	97	35.393	ENSORLG00020002128	-	99	33.613
ENSORLG00020006144	-	72	45.614	ENSORLG00020019341	-	81	56.410
ENSORLG00020006144	-	72	40.223	ENSORLG00020017514	-	89	39.149
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ENSORLG00020006144	-	70	45.455	ENSORLG00020011234	-	84	45.455
ENSORLG00020006144	-	77	36.036	ENSORLG00020008744	-	69	36.036
ENSORLG00020006144	-	76	48.810	ENSORLG00020019227	-	51	47.368
ENSORLG00020006144	-	87	36.058	ENSORLG00020004889	ZNF319	93	36.058
ENSORLG00020006144	-	84	34.241	ENSORLG00020004313	-	54	36.986
ENSORLG00020006144	-	79	37.008	ENSORLG00020009554	-	88	39.726
ENSORLG00020006144	-	81	37.447	ENSORLG00020010953	-	86	44.144
ENSORLG00020006144	-	78	42.384	ENSORLG00020007967	-	93	43.820
ENSORLG00020006144	-	68	35.556	ENSORLG00020000009	znf710b	63	34.328
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ENSORLG00020006144	-	83	46.809	ENSORLG00020017164	-	99	48.045
ENSORLG00020006144	-	85	33.103	ENSORLG00020008787	snai2	73	34.259
ENSORLG00020006144	-	69	38.636	ENSORLG00020008933	-	69	38.636
ENSORLG00020006144	-	81	45.556	ENSORLG00020018069	-	94	42.697
ENSORLG00020006144	-	69	42.935	ENSORLG00020010020	-	70	42.781
ENSORLG00020006144	-	86	36.792	ENSORLG00020018495	-	69	36.792
ENSORLG00020006144	-	78	40.764	ENSORLG00020008018	-	74	40.860
ENSORLG00020006144	-	69	39.106	ENSORLG00020004353	-	95	39.106
ENSORLG00020006144	-	74	40.000	ENSORLG00020007074	-	94	44.444
ENSORLG00020006144	-	69	41.089	ENSORLG00020006148	-	57	41.089
ENSORLG00020006144	-	74	40.244	ENSORLG00020007018	-	87	35.294
ENSORLG00020006144	-	100	45.055	ENSORLG00020009943	-	99	46.667
ENSORLG00020006144	-	89	47.059	ENSORLG00020004162	znf341	51	42.308
ENSORLG00020006144	-	74	41.667	ENSORLG00020001707	-	79	44.444
ENSORLG00020006144	-	84	42.786	ENSORLG00020009139	-	99	44.706
ENSORLG00020006144	-	77	37.168	ENSORLG00020001912	znf236	72	41.489
ENSORLG00020006144	-	84	37.662	ENSORLG00020017974	e4f1	57	38.667
ENSORLG00020006144	-	74	42.079	ENSORLG00020017528	-	86	42.079
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ENSORLG00020006144	-	76	39.394	ENSORLG00020000219	-	97	40.437
ENSORLG00020006144	-	84	41.026	ENSORLG00020017850	-	96	36.527
ENSORLG00020006144	-	76	41.584	ENSORLG00020010250	-	94	34.930
ENSORLG00020006144	-	61	48.235	ENSORLG00020006433	-	91	45.098
ENSORLG00020006144	-	77	41.520	ENSORLG00020010647	-	80	39.906
ENSORLG00020006144	-	85	41.398	ENSORLG00020000481	-	86	42.259
ENSORLG00020006144	-	70	38.806	ENSORLG00020008484	-	91	37.500
ENSORLG00020006144	-	92	41.584	ENSORLG00020009857	-	93	43.103
ENSORLG00020006144	-	58	34.756	ENSORLG00020001758	-	74	32.231
ENSORLG00020006144	-	79	41.558	ENSORLG00020002817	GFI1	78	41.558
ENSORLG00020006144	-	86	40.411	ENSORLG00020016037	-	93	44.444
ENSORLG00020006144	-	74	42.077	ENSORLG00020015703	-	53	42.077
ENSORLG00020006144	-	75	42.105	ENSORLG00020000246	-	93	38.342
ENSORLG00020006144	-	89	42.241	ENSORLG00020010804	-	96	46.286
ENSORLG00020006144	-	82	41.279	ENSORLG00020009965	-	81	41.958
ENSORLG00020006144	-	76	40.113	ENSORLG00020009419	-	92	47.170
ENSORLG00020006144	-	82	34.375	ENSORLG00020018685	znf319b	89	34.375
ENSORLG00020006144	-	76	37.762	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	41.727
ENSORLG00020006144	-	88	41.294	ENSORLG00020011149	-	83	41.714
ENSORLG00020006144	-	81	39.000	ENSORLG00020005132	-	78	36.559
ENSORLG00020006144	-	98	36.364	ENSORLG00020010285	znf646	70	36.364
ENSORLG00020006144	-	88	41.463	ENSORLG00020010171	-	100	41.060
ENSORLG00020006144	-	69	40.102	ENSORLG00020010916	-	73	33.978
ENSORLG00020006144	-	85	40.260	ENSORLG00020016754	-	96	44.898
ENSORLG00020006144	-	86	33.333	ENSORLG00020018503	-	72	39.252
ENSORLG00020006144	-	68	47.024	ENSORLG00020008240	-	50	47.024
ENSORLG00020006144	-	80	32.184	ENSORLG00020011808	-	58	32.184
ENSORLG00020006144	-	84	38.426	ENSORLG00020018791	-	87	38.426
ENSORLG00020006144	-	89	38.119	ENSORLG00020010038	-	67	40.756
ENSORLG00020006144	-	72	30.870	ENSORLG00020005815	-	95	30.870
ENSORLG00020006144	-	72	39.831	ENSORLG00020001922	-	83	38.621
ENSORLG00020006144	-	69	42.236	ENSORLG00020008424	-	84	45.333
ENSORLG00020006144	-	78	44.086	ENSORLG00020009180	-	90	44.079
ENSORLG00020006144	-	83	39.224	ENSORLG00020010880	-	78	46.364
ENSORLG00020006144	-	84	42.202	ENSORLG00020010560	-	98	42.373
ENSORLG00020006144	-	80	38.075	ENSORLG00020009089	-	71	38.075
ENSORLG00020006144	-	76	34.746	ENSORLG00020012967	scrt1b	51	42.500
ENSORLG00020006144	-	78	36.842	ENSORLG00020006820	-	72	37.607
ENSORLG00020006144	-	84	36.923	ENSORLG00020018921	-	74	38.994

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006144	-	80	38.071	ENSAPOG00000013493	-	89	36.047	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	80	42.941	ENSAPOG00000005187	-	59	42.941	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	73	39.837	ENSAPOG00000018492	-	69	39.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	86	36.279	ENSAPOG00000018586	-	80	36.279	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	88	37.870	ENSAPOG00000013499	-	73	38.919	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	89	49.412	ENSAPOG00000020116	-	77	49.412	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	89	42.786	ENSAPOG00000001054	-	99	42.786	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006144	-	82	38.889	ENSACIG00000023794	-	76	38.723	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006144	-	86	43.578	ENSACIG00000004041	-	90	45.685	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006144	-	90	44.318	ENSACIG00000022293	-	95	44.318	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006144	-	97	52.308	ENSACIG00000010647	-	99	52.308	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006144	-	59	44.737	ENSACIG00000007034	-	69	44.737	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006144	-	79	42.941	ENSAOCG00000013951	-	51	40.782	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	80	43.931	ENSAOCG00000018484	-	93	43.931	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	77	41.026	ENSAOCG00000012903	-	79	39.053	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	80	46.040	ENSAOCG00000022459	-	88	46.040	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	91	48.276	ENSAOCG00000015369	-	99	50.000	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	88	42.162	ENSAOCG00000013934	-	67	41.711	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	93	33.071	ENSAOCG00000019475	-	87	41.818	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	84	44.578	ENSAOCG00000020624	-	71	46.429	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	74	41.284	ENSAOCG00000010954	-	58	41.284	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	75	41.304	ENSAOCG00000013578	-	75	41.304	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006144	-	93	42.941	ENSAPEG00000012229	-	51	40.782	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	98	40.094	ENSAPEG00000013031	-	95	40.094	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	81	48.235	ENSAPEG00000008020	-	98	40.884	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	87	41.758	ENSAPEG00000011020	-	99	45.890	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	96	33.099	ENSAPEG00000005678	-	75	38.144	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	81	36.279	ENSAPEG00000018471	-	78	36.279	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	75	42.162	ENSAPEG00000012236	-	69	41.711	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	98	38.785	ENSAPEG00000009515	-	87	41.304	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	89	33.333	ENSAPEG00000016462	-	67	37.815	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	77	41.026	ENSAPEG00000018460	-	90	39.053	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006144	-	81	40.000	ENSATEG00000010560	-	98	40.000	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006144	-	74	38.614	ENSATEG00000007325	-	82	40.000	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006144	-	96	35.417	ENSATEG00000005519	-	94	48.913	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006144	-	83	38.579	ENSACLG00000017941	-	66	38.579	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020006144	-	86	34.459	ENSACLG00000006702	-	78	33.880	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020006144	-	97	37.557	ENSSMAG00000014864	-	83	46.753	Scophthalmus_maximus
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ENSORLG00020006144	-	81	43.069	ENSXMAG00000023130	-	99	43.564	Xiphophorus_maculatus