EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006148 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1963 bases
Position: chr2:8487745-8489707
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	1	6
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	2	6
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	3	6
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	4	6
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	5	6
ENSORLP00020005339	zf-C2H2	PF00096.26	2.7e-34	6	6
ENSORLP00020005339	zf-met	PF12874.7	1.3e-09	1	2
ENSORLP00020005339	zf-met	PF12874.7	1.3e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020006459	-	1422	-	ENSORLP00020005339	473 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020006148	-	89	50.382	ENSORLG00020008018	-	97	50.566
ENSORLG00020006148	-	70	45.673	ENSORLG00020007018	-	90	52.071
ENSORLG00020006148	-	74	37.220	ENSORLG00020012229	zbtb41	54	37.220
ENSORLG00020006148	-	96	59.624	ENSORLG00020010250	-	97	53.942
ENSORLG00020006148	-	74	50.661	ENSORLG00020018069	-	97	50.000
ENSORLG00020006148	-	97	63.918	ENSORLG00020021857	-	92	63.711
ENSORLG00020006148	-	78	55.474	ENSORLG00020016754	-	89	55.233
ENSORLG00020006148	-	56	52.511	ENSORLG00020017514	-	80	52.511
ENSORLG00020006148	-	79	57.923	ENSORLG00020009857	-	95	64.878
ENSORLG00020006148	-	84	48.276	ENSORLG00020017483	-	96	44.106
ENSORLG00020006148	-	51	33.333	ENSORLG00020010285	znf646	71	33.333
ENSORLG00020006148	-	85	45.050	ENSORLG00020010636	-	91	58.559
ENSORLG00020006148	-	86	38.859	ENSORLG00020009184	-	99	45.000
ENSORLG00020006148	-	56	54.688	ENSORLG00020007074	-	95	54.118
ENSORLG00020006148	-	98	60.664	ENSORLG00020008891	-	98	59.829
ENSORLG00020006148	-	57	50.000	ENSORLG00020009139	-	98	47.150
ENSORLG00020006148	-	54	43.709	ENSORLG00020002817	GFI1	50	43.709
ENSORLG00020006148	-	79	69.340	ENSORLG00020010560	-	97	62.500
ENSORLG00020006148	-	89	43.836	ENSORLG00020018921	-	94	43.836
ENSORLG00020006148	-	79	44.344	ENSORLG00020007599	-	84	44.344
ENSORLG00020006148	-	55	45.033	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	45.033
ENSORLG00020006148	-	72	60.997	ENSORLG00020010020	-	99	60.997
ENSORLG00020006148	-	97	39.678	ENSORLG00020017850	-	98	45.211
ENSORLG00020006148	-	93	66.990	ENSORLG00020010880	-	95	66.990
ENSORLG00020006148	-	65	58.798	ENSORLG00020011149	-	96	58.798
ENSORLG00020006148	-	62	34.884	ENSORLG00020018051	prdm5	73	36.032
ENSORLG00020006148	-	92	51.835	ENSORLG00020007967	-	97	54.460
ENSORLG00020006148	-	55	53.425	ENSORLG00020009965	-	94	42.857
ENSORLG00020006148	-	55	41.546	ENSORLG00020018495	-	64	44.099
ENSORLG00020006148	-	75	60.680	ENSORLG00020000161	-	95	60.680
ENSORLG00020006148	-	56	48.673	ENSORLG00020019341	-	74	78.125
ENSORLG00020006148	-	97	56.742	ENSORLG00020004313	-	76	56.742
ENSORLG00020006148	-	79	56.589	ENSORLG00020008240	-	70	55.769
ENSORLG00020006148	-	57	41.089	ENSORLG00020006144	-	69	41.089
ENSORLG00020006148	-	56	39.796	ENSORLG00020009554	-	77	39.796
ENSORLG00020006148	-	50	42.254	ENSORLG00020006820	-	66	42.254
ENSORLG00020006148	-	59	43.455	ENSORLG00020018685	znf319b	85	43.455
ENSORLG00020006148	-	67	54.630	ENSORLG00020008484	-	98	54.630
ENSORLG00020006148	-	55	48.958	ENSORLG00020001912	znf236	62	48.958
ENSORLG00020006148	-	77	62.983	ENSORLG00020004370	-	98	63.057
ENSORLG00020006148	-	56	37.778	ENSORLG00020000009	znf710b	56	37.778
ENSORLG00020006148	-	79	52.174	ENSORLG00020015703	-	98	52.174
ENSORLG00020006148	-	78	48.750	ENSORLG00020000264	-	68	48.750
ENSORLG00020006148	-	92	59.278	ENSORLG00020009419	-	99	59.278
ENSORLG00020006148	-	58	36.154	ENSORLG00020018503	-	69	37.981
ENSORLG00020006148	-	77	52.083	ENSORLG00020016037	-	94	47.059
ENSORLG00020006148	-	79	56.267	ENSORLG00020008933	-	99	56.267
ENSORLG00020006148	-	90	61.795	ENSORLG00020009089	-	86	61.979
ENSORLG00020006148	-	58	60.733	ENSORLG00020004353	-	96	60.733
ENSORLG00020006148	-	80	47.468	ENSORLG00020021196	-	72	47.468
ENSORLG00020006148	-	82	39.827	ENSORLG00020020419	-	94	39.827
ENSORLG00020006148	-	76	50.838	ENSORLG00020017164	-	98	52.406
ENSORLG00020006148	-	90	61.667	ENSORLG00020010171	-	96	61.667
ENSORLG00020006148	-	97	53.962	ENSORLG00020010916	-	96	53.962
ENSORLG00020006148	-	50	52.174	ENSORLG00020001707	-	75	52.174
ENSORLG00020006148	-	60	39.785	ENSORLG00020002128	-	89	39.785
ENSORLG00020006148	-	69	58.092	ENSORLG00020011075	-	90	58.092
ENSORLG00020006148	-	58	42.982	ENSORLG00020010950	-	94	47.222
ENSORLG00020006148	-	84	59.563	ENSORLG00020008346	-	93	59.716
ENSORLG00020006148	-	65	56.425	ENSORLG00020010647	-	91	55.082
ENSORLG00020006148	-	72	58.309	ENSORLG00020011234	-	97	58.309
ENSORLG00020006148	-	81	60.714	ENSORLG00020010953	-	85	62.439
ENSORLG00020006148	-	92	56.175	ENSORLG00020008424	-	97	56.497
ENSORLG00020006148	-	61	37.500	ENSORLG00020004889	ZNF319	88	37.500
ENSORLG00020006148	-	62	41.379	ENSORLG00020008744	-	67	41.379
ENSORLG00020006148	-	61	61.702	ENSORLG00020009180	-	96	56.757
ENSORLG00020006148	-	92	67.526	ENSORLG00020009943	-	97	77.778
ENSORLG00020006148	-	55	42.162	ENSORLG00020018791	-	81	42.162
ENSORLG00020006148	-	79	50.962	ENSORLG00020019227	-	73	50.962
ENSORLG00020006148	-	98	50.000	ENSORLG00020000639	-	82	50.000
ENSORLG00020006148	-	81	55.844	ENSORLG00020000246	-	99	55.844
ENSORLG00020006148	-	50	35.950	ENSORLG00020007790	zbtb48	52	35.950
ENSORLG00020006148	-	85	53.488	ENSORLG00020000481	-	83	53.488
ENSORLG00020006148	-	96	59.722	ENSORLG00020010804	-	95	59.722

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006148	-	74	46.591	ENSAPOG00000010645	-	84	46.591	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006148	-	52	55.000	ENSAPOG00000016615	-	86	55.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006148	-	55	54.000	ENSAPOG00000010330	-	70	54.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006148	-	59	51.266	ENSAPOG00000000601	-	68	51.266	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006148	-	52	49.315	ENSAOCG00000007347	-	84	49.315	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006148	-	93	55.882	ENSATEG00000007658	-	74	55.882	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006148	-	55	52.427	ENSAMXG00000013492	-	96	47.143	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020006148	-	77	50.000	ENSCVAG00000018383	-	95	49.505	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020006148	-	59	51.240	FBgn0037922	CG14711	62	51.240	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020006148	-	54	46.753	ENSEBUG00000012543	-	68	46.753	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	55	45.778	ENSEBUG00000003418	-	95	45.778	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	59	48.585	ENSEBUG00000014768	-	82	48.585	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	68	49.206	ENSEBUG00000003232	-	72	49.206	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	54	44.000	ENSEBUG00000000422	-	72	44.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	57	51.042	ENSEBUG00000013874	-	72	51.042	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	57	50.388	ENSEBUG00000004992	-	59	50.388	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	55	49.524	ENSEBUG00000001569	-	88	49.524	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006148	-	95	47.727	ENSELUG00000000281	-	76	47.727	Esox_lucius
ENSORLG00020006148	-	84	45.946	ENSELUG00000007694	-	75	45.946	Esox_lucius
ENSORLG00020006148	-	96	35.915	ENSELUG00000022942	-	86	49.533	Esox_lucius
ENSORLG00020006148	-	53	41.593	ENSGMOG00000016007	-	85	40.351	Gadus_morhua
ENSORLG00020006148	-	75	49.138	ENSGAFG00000021143	-	89	49.138	Gambusia_affinis
ENSORLG00020006148	-	55	48.585	ENSGAFG00000021139	-	86	48.585	Gambusia_affinis
ENSORLG00020006148	-	56	54.167	ENSGAGG00000010492	-	72	54.167	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020006148	-	56	38.868	ENSHBUG00000007316	-	67	40.462	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020006148	-	68	46.448	ENSHCOG00000001318	-	93	46.448	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	93	47.273	ENSHCOG00000001870	-	82	47.273	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	80	49.143	ENSHCOG00000019006	-	50	49.143	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	85	47.273	ENSHCOG00000020924	-	85	47.273	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	93	46.729	ENSHCOG00000001256	-	99	46.729	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	55	49.462	ENSHCOG00000008133	-	55	49.462	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	54	45.540	ENSHCOG00000008742	-	76	45.540	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	90	45.833	ENSHCOG00000014781	-	93	45.833	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	63	46.696	ENSHCOG00000007681	-	84	46.696	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	55	50.000	ENSHCOG00000014777	-	76	50.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	93	50.588	ENSHCOG00000019454	-	86	50.588	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	84	40.455	ENSHCOG00000001245	-	90	40.455	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	86	45.411	ENSHCOG00000001242	-	64	45.411	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	58	50.450	ENSHCOG00000001793	-	70	50.450	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	65	48.148	ENSHCOG00000015355	-	94	48.148	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	86	51.163	ENSHCOG00000007464	-	79	51.163	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	55	45.946	ENSHCOG00000014797	-	54	45.946	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	93	52.899	ENSHCOG00000014792	-	99	52.899	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	53	50.472	ENSHCOG00000007358	-	74	50.472	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006148	-	95	42.442	ENSKMAG00000000556	-	81	42.442	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020006148	-	51	48.571	ENSLBEG00000022059	-	76	42.478	Labrus_bergylta
ENSORLG00020006148	-	59	53.247	ENSLBEG00000011588	-	97	53.247	Labrus_bergylta
ENSORLG00020006148	-	56	51.376	ENSMZEG00005028299	-	91	51.376	Maylandia_zebra
ENSORLG00020006148	-	58	56.863	ENSMMOG00000006322	-	68	56.863	Mola_mola
ENSORLG00020006148	-	58	52.000	ENSONIG00000011529	-	98	39.303	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020006148	-	59	43.868	ENSONIG00000018151	-	98	43.868	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020006148	-	93	53.061	ENSORLG00000030610	-	81	52.477	Oryzias_latipes
ENSORLG00020006148	-	86	55.319	ENSORLG00000028433	-	94	60.000	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020006148	-	87	48.148	ENSPREG00000002615	-	87	48.148	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020006148	-	71	44.231	ENSPREG00000016308	-	90	40.845	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020006148	-	62	42.035	ENSPNYG00000005202	-	93	46.500	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020006148	-	94	53.571	ENSSDUG00000019911	-	82	47.115	Seriola_dumerili
ENSORLG00020006148	-	55	49.057	ENSXMAG00000028785	-	74	49.057	Xiphophorus_maculatus