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Description
Ensembl ID
ENSORLG00020006164 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
APOBEC2
Alias
-
Full Name
apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type
protein_coding
Species
Oryzias_latipes_hni
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
3251 bases
Position
chr7:13072245-13075495
Accession
605
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSORLP00020024656APOBEC_NPF08210.113.7e-4411
ENSORLP00020024656APOBEC_CPF05240.146.7e-2611
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSORLT00020006409APOBEC2-201801-ENSORLP00020024656266 (aa)--
Gene Model
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSORLG00020006164APOBEC28458.515ENSORLG00020004153apobec2a9658.515
ENSORLG00020006164APOBEC26230.588ENSORLG00020006547aicda8730.588
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSG00000124701APOBEC28559.686Homo_sapiens
ENSORLG00020006164APOBEC210079.851ENSAPOG00000019390apobec2b10081.343Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006164APOBEC26356.897ENSAMEG00000004467APOBEC26956.897Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020006164APOBEC210079.478ENSACIG00000002472APOBEC210074.436Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006164APOBEC27157.292ENSACIG00000016370apobec2a7656.410Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006164APOBEC210052.963ENSAOCG00000003291apobec2a10052.963Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006164APOBEC210080.224ENSAOCG00000023355apobec2b10081.716Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006164APOBEC29952.788ENSAPEG00000003630apobec2a9952.788Amphiprion_percula
ENSORLG00020006164APOBEC210079.851ENSAPEG00000004591apobec2b10080.970Amphiprion_percula
ENSORLG00020006164APOBEC210051.119ENSATEG00000000956apobec2a9861.143Anabas_testudineus
ENSORLG00020006164APOBEC210079.554ENSATEG00000023043APOBEC210082.528Anabas_testudineus
ENSORLG00020006164APOBEC28551.948ENSAPLG00000002895APOBEC29951.948Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020006164APOBEC28047.945ENSACAG00000016506APOBEC29455.114Anolis_carolinensis
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSANAG00000026993APOBEC28559.686Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006164APOBEC210079.478ENSACLG00000007634APOBEC210079.478Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020006164APOBEC26560.465ENSACLG00000026736-9760.465Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020006164APOBEC27856.338ENSAMXG00000042992apobec2a10050.883Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020006164APOBEC28261.333ENSAMXG00000015966apobec2b9657.993Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSBTAG00000005974APOBEC27351.739Bos_taurus
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSCJAG00000004063APOBEC28559.686Callithrix_jacchus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSCAFG00000001575APOBEC28558.115Canis_familiaris
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSCAFG00020008306APOBEC28558.115Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020006164APOBEC26957.068ENSCHIG00000026348APOBEC29853.425Capra_hircus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.639ENSTSYG00000008206APOBEC29653.881Carlito_syrichta
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSCAPG00000015084APOBEC28457.592Cavia_aperea
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSCPOG00000036103APOBEC28457.592Cavia_porcellus
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSCCAG00000033987APOBEC28559.686Cebus_capucinus
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSCATG00000010691APOBEC28560.209Cercocebus_atys
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSCLAG00000013817APOBEC28458.115Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSCSAG00000011177APOBEC28560.209Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020006164APOBEC26359.195ENSCHOG00000008930APOBEC29759.195Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020006164APOBEC26857.297ENSCPBG00000017469APOBEC29654.028Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSCANG00000035072APOBEC28560.209Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSCGRG00001014983Apobec28558.115Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSCGRG00000007835Apobec28558.115Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020006164APOBEC27177.660ENSCSEG00000000690-10063.603Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020006164APOBEC29155.159ENSCSEG00000020201apobec2a9456.667Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020006164APOBEC210078.947ENSCVAG00000012342apobec2b10078.947Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020006164APOBEC28461.404ENSDARG00000113992apobec2b9557.088Danio_rerio
ENSORLG00020006164APOBEC29853.409ENSDARG00000018881apobec2a9452.727Danio_rerio
ENSORLG00020006164APOBEC26941.538ENSDNOG00000033914APOBEC29840.435Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSDORG00000006447Apobec28357.592Dipodomys_ordii
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSETEG00000000624APOBEC28358.115Echinops_telfairi
ENSORLG00020006164APOBEC25859.119ENSEASG00005002937APOBEC28359.119Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.639ENSECAG00000006576APOBEC28558.639Equus_caballus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSEEUG00000006046APOBEC28558.115Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020006164APOBEC27062.434ENSELUG00000003736apobec2a7360.386Esox_lucius
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSFCAG00000004108APOBEC29853.182Felis_catus
ENSORLG00020006164APOBEC26847.872ENSFALG00000003910APOBEC29844.248Ficedula_albicollis
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSFDAG00000006015APOBEC28557.592Fukomys_damarensis
ENSORLG00020006164APOBEC28083.491ENSFHEG00000005492apobec2b10071.805Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020006164APOBEC27773.430ENSGMOG00000006819apobec2b10063.060Gadus_morhua
ENSORLG00020006164APOBEC26563.068ENSGMOG00000007028apobec2a10063.068Gadus_morhua
ENSORLG00020006164APOBEC26956.614ENSGALG00000003226APOBEC29851.613Gallus_gallus
ENSORLG00020006164APOBEC210082.331ENSGAFG00000007634apobec2b8782.331Gambusia_affinis
ENSORLG00020006164APOBEC27062.234ENSGACG00000011671apobec2a10062.234Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020006164APOBEC210074.436ENSGACG00000009663apobec2b9981.614Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020006164APOBEC26857.297ENSGAGG00000010347APOBEC28457.527Gopherus_agassizii
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSGGOG00000001099APOBEC28359.686Gorilla_gorilla
ENSORLG00020006164APOBEC210077.985ENSHBUG00000005993apobec2b10077.985Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020006164APOBEC28556.780ENSHBUG00000015890apobec2a9556.780Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSHGLG00000017169APOBEC29852.232Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSHGLG00100019442APOBEC29852.232Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020006164APOBEC210075.373ENSHCOG00000002712APOBEC210075.373Hippocampus_comes
ENSORLG00020006164APOBEC28952.521ENSHCOG00000020319apobec2a8159.596Hippocampus_comes
ENSORLG00020006164APOBEC27756.621ENSIPUG00000017355apobec2a6554.585Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020006164APOBEC210057.455ENSIPUG00000013784Apobec210057.664Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSSTOG00000023643APOBEC29855.455Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.068ENSJJAG00000009733Apobec28557.068Jaculus_jaculus
ENSORLG00020006164APOBEC29980.755ENSKMAG00000020631apobec2b9980.755Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020006164APOBEC27981.517ENSLBEG00000009422-10072.438Labrus_bergylta
ENSORLG00020006164APOBEC28456.710ENSLBEG00000025214apobec2a9656.710Labrus_bergylta
ENSORLG00020006164APOBEC28456.332ENSLACG00000015985APOBEC29656.332Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020006164APOBEC27261.735ENSLOCG00000012415apobec2b8258.079Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSLAFG00000016563APOBEC29854.545Loxodonta_africana
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSMFAG00000044645APOBEC28560.209Macaca_fascicularis
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSMMUG00000021171APOBEC28560.209Macaca_mulatta
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSMNEG00000045497APOBEC28560.209Macaca_nemestrina
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSMLEG00000028328APOBEC28560.209Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020006164APOBEC210076.364ENSMAMG00000007926APOBEC210078.309Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020006164APOBEC210052.963ENSMAMG00000023685apobec2a8261.137Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020006164APOBEC28357.826ENSMZEG00005005240-9857.826Maylandia_zebra
ENSORLG00020006164APOBEC210079.478ENSMZEG00005027159APOBEC210079.478Maylandia_zebra
ENSORLG00020006164APOBEC28351.101ENSMGAG00000010173APOBEC29851.101Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020006164APOBEC26958.639ENSMAUG00000011016Apobec28558.639Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020006164APOBEC27754.091ENSMICG00000043339APOBEC29854.091Microcebus_murinus
ENSORLG00020006164APOBEC26959.162ENSMOCG00000001904Apobec29854.545Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020006164APOBEC210076.692ENSMMOG00000008681apobec2b10076.692Mola_mola
ENSORLG00020006164APOBEC26956.842ENSMODG00000013090APOBEC28656.842Monodelphis_domestica
ENSORLG00020006164APOBEC28651.440ENSMALG00000020523apobec2a8557.416Monopterus_albus
ENSORLG00020006164APOBEC210074.436ENSMALG00000013779APOBEC210074.627Monopterus_albus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115MGP_CAROLIEiJ_G0021727Apobec29853.636Mus_caroli
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSMUSG00000040694Apobec29853.636Mus_musculus
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115MGP_PahariEiJ_G0020716Apobec29853.636Mus_pahari
ENSORLG00020006164APOBEC26958.639ENSMPUG00000013691APOBEC28258.639Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSMLUG00000011327APOBEC28358.115Myotis_lucifugus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSNGAG00000013717Apobec28557.592Nannospalax_galili
ENSORLG00020006164APOBEC27063.492ENSNBRG00000021776apobec2a8958.036Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020006164APOBEC210078.358ENSNBRG00000018806apobec2b8977.612Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSNLEG00000005057APOBEC28559.686Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020006164APOBEC26956.842ENSMEUG00000011623APOBEC28656.842Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020006164APOBEC26959.162ENSOPRG00000014808APOBEC29854.260Ochotona_princeps
ENSORLG00020006164APOBEC26958.115ENSODEG00000016183APOBEC29753.846Octodon_degus
ENSORLG00020006164APOBEC27961.215ENSONIG00000004644-9557.627Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020006164APOBEC210079.478ENSONIG00000012289apobec2b10079.478Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020006164APOBEC25957.407ENSOANG00000000824APOBEC29953.591Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020006164APOBEC27755.869ENSOCUG00000028008APOBEC29854.260Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020006164APOBEC210099.624ENSORLG00000022372APOBEC210099.624Oryzias_latipes
ENSORLG00020006164APOBEC28458.515ENSORLG00000010752apobec2a9658.515Oryzias_latipes
ENSORLG00020006164APOBEC210099.248ENSORLG00015022089-10099.248Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020006164APOBEC28458.515ENSORLG00015021781apobec2a9658.515Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020006164APOBEC28557.328ENSOMEG00000001311apobec2a9757.328Oryzias_melastigma
ENSORLG00020006164APOBEC210092.481ENSOMEG00000015449APOBEC210092.481Oryzias_melastigma
ENSORLG00020006164APOBEC27754.545ENSOGAG00000002632APOBEC29854.545Otolemur_garnettii
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSOARG00000000820APOBEC29853.881Ovis_aries
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSPPAG00000035598APOBEC28359.686Pan_paniscus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSPPRG00000008530APOBEC29853.182Panthera_pardus
ENSORLG00020006164APOBEC26957.592ENSPTIG00000011084APOBEC28557.592Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020006164APOBEC26959.686ENSPTRG00000029679APOBEC28359.686Pan_troglodytes
ENSORLG00020006164APOBEC26960.209ENSPANG00000007121APOBEC28560.209Papio_anubis
ENSORLG00020006164APOBEC29255.422ENSPKIG00000005395apobec2a8760.731Paramormyrops_kingsleyae
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