EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006422 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2661 bases
Position: chr10:18946646-18949306
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020024813	RVT_1	PF00078.27	4.8e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020006009	-	2661	-	ENSORLP00020024813	746 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020006422	-	69	43.561	ENSORLG00020006907	-	95	43.561
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ENSORLG00020006422	-	93	98.847	ENSORLG00020007946	-	98	98.847
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ENSORLG00020006422	-	57	34.023	ENSORLG00020009835	-	93	34.023
ENSORLG00020006422	-	64	33.745	ENSORLG00020011014	-	98	33.745
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ENSORLG00020006422	-	59	47.059	ENSORLG00020016660	-	97	47.404
ENSORLG00020006422	-	51	54.545	ENSORLG00020020066	-	98	52.913
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ENSORLG00020006422	-	95	44.173	ENSORLG00020005060	-	82	44.354
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ENSORLG00020006422	-	66	54.400	ENSORLG00020006316	-	98	53.131
ENSORLG00020006422	-	98	96.453	ENSORLG00020010964	-	76	96.453
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ENSORLG00020006422	-	98	41.532	ENSORLG00020013041	-	69	41.532
ENSORLG00020006422	-	77	45.656	ENSORLG00020006111	-	91	45.656
ENSORLG00020006422	-	76	45.611	ENSORLG00020021237	-	91	45.611
ENSORLG00020006422	-	63	55.462	ENSORLG00020008115	-	99	55.462
ENSORLG00020006422	-	50	52.406	ENSORLG00020002465	-	99	50.873
ENSORLG00020006422	-	98	47.147	ENSORLG00020005659	-	99	47.147

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006422	-	92	38.307	ENSATEG00000005707	-	85	38.571	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006422	-	55	36.451	ENSATEG00000014055	-	69	36.451	Anabas_testudineus
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