EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006820 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4207 bases
Position: chr23:20093997-20098203
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020025077	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-20	1	4
ENSORLP00020025077	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-20	2	4
ENSORLP00020025077	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-20	3	4
ENSORLP00020025077	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-20	4	4
ENSORLP00020025077	zf-met	PF12874.7	1.1e-10	1	2
ENSORLP00020025077	zf-met	PF12874.7	1.1e-10	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020005342	-	738	-	ENSORLP00020025077	245 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020006820's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020006820's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020006820	-	77	44.068	ENSORLG00020010647	-	82	44.068
ENSORLG00020006820	-	70	34.579	ENSORLG00020001758	-	55	35.165
ENSORLG00020006820	-	72	38.824	ENSORLG00020007790	zbtb48	55	38.824
ENSORLG00020006820	-	78	40.441	ENSORLG00020021196	-	60	40.441
ENSORLG00020006820	-	66	42.515	ENSORLG00020011234	-	74	42.515
ENSORLG00020006820	-	66	45.283	ENSORLG00020017528	-	94	45.283
ENSORLG00020006820	-	64	44.853	ENSORLG00020008424	-	84	44.853
ENSORLG00020006820	-	76	47.761	ENSORLG00020010804	-	94	46.721
ENSORLG00020006820	-	78	45.963	ENSORLG00020009139	-	98	45.732
ENSORLG00020006820	-	66	43.195	ENSORLG00020009089	-	50	43.195
ENSORLG00020006820	-	66	48.592	ENSORLG00020001707	-	74	48.592
ENSORLG00020006820	-	66	44.937	ENSORLG00020010636	-	73	44.937
ENSORLG00020006820	-	72	44.203	ENSORLG00020000219	-	69	44.203
ENSORLG00020006820	-	72	45.455	ENSORLG00020008744	-	67	36.471
ENSORLG00020006820	-	66	43.704	ENSORLG00020018921	-	76	43.704
ENSORLG00020006820	-	68	45.732	ENSORLG00020007018	-	84	45.732
ENSORLG00020006820	-	67	47.414	ENSORLG00020008018	-	71	47.414
ENSORLG00020006820	-	77	35.556	ENSORLG00020008787	snai2	69	35.556
ENSORLG00020006820	-	77	42.759	ENSORLG00020010020	-	80	42.759
ENSORLG00020006820	-	86	41.765	ENSORLG00020011075	-	79	42.657
ENSORLG00020006820	-	74	40.146	ENSORLG00020000246	-	86	40.146
ENSORLG00020006820	-	76	42.958	ENSORLG00020010950	-	96	40.594
ENSORLG00020006820	-	72	36.697	ENSORLG00020000009	znf710b	51	36.697
ENSORLG00020006820	-	78	48.951	ENSORLG00020017483	-	92	48.951
ENSORLG00020006820	-	73	42.683	ENSORLG00020005815	-	80	42.683
ENSORLG00020006820	-	65	37.589	ENSORLG00020018503	-	69	36.875
ENSORLG00020006820	-	73	49.254	ENSORLG00020016037	-	94	49.254
ENSORLG00020006820	-	76	49.645	ENSORLG00020016754	-	92	42.857
ENSORLG00020006820	-	76	39.552	ENSORLG00020011149	-	91	39.552
ENSORLG00020006820	-	62	45.985	ENSORLG00020010880	-	74	45.985
ENSORLG00020006820	-	62	38.596	ENSORLG00020019789	snai1a	55	38.596
ENSORLG00020006820	-	74	45.985	ENSORLG00020009943	-	90	45.985
ENSORLG00020006820	-	57	40.171	ENSORLG00020001922	-	59	40.000
ENSORLG00020006820	-	76	45.732	ENSORLG00020009184	-	87	45.732
ENSORLG00020006820	-	66	47.826	ENSORLG00020017514	-	90	47.826
ENSORLG00020006820	-	70	43.195	ENSORLG00020007074	-	94	43.919
ENSORLG00020006820	-	69	45.087	ENSORLG00020007599	-	72	45.087
ENSORLG00020006820	-	64	39.375	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	39.375
ENSORLG00020006820	-	77	47.872	ENSORLG00020010250	-	90	47.253
ENSORLG00020006820	-	63	42.857	ENSORLG00020010932	-	68	42.857
ENSORLG00020006820	-	67	50.000	ENSORLG00020000481	-	81	50.862
ENSORLG00020006820	-	65	42.963	ENSORLG00020018685	znf319b	89	41.611
ENSORLG00020006820	-	82	44.706	ENSORLG00020001912	znf236	59	44.706
ENSORLG00020006820	-	56	42.105	ENSORLG00020001791	-	51	42.105
ENSORLG00020006820	-	77	45.255	ENSORLG00020010560	-	98	43.885
ENSORLG00020006820	-	68	38.816	ENSORLG00020018495	-	65	38.816
ENSORLG00020006820	-	78	44.526	ENSORLG00020009857	-	90	46.316
ENSORLG00020006820	-	62	38.636	ENSORLG00020012967	scrt1b	50	38.636
ENSORLG00020006820	-	70	43.796	ENSORLG00020010171	-	92	44.915
ENSORLG00020006820	-	80	46.324	ENSORLG00020009180	-	88	46.324
ENSORLG00020006820	-	71	48.438	ENSORLG00020000161	-	82	48.438
ENSORLG00020006820	-	81	46.835	ENSORLG00020018069	-	89	48.951
ENSORLG00020006820	-	78	46.479	ENSORLG00020009419	-	88	45.985
ENSORLG00020006820	-	81	50.694	ENSORLG00020017164	-	99	48.175
ENSORLG00020006820	-	69	41.593	ENSORLG00020010285	znf646	57	41.593
ENSORLG00020006820	-	73	46.154	ENSORLG00020020419	-	78	46.154
ENSORLG00020006820	-	69	42.857	ENSORLG00020010038	-	58	42.857
ENSORLG00020006820	-	67	43.066	ENSORLG00020010916	-	62	41.071
ENSORLG00020006820	-	65	42.177	ENSORLG00020018791	-	80	42.177
ENSORLG00020006820	-	66	45.312	ENSORLG00020005132	-	72	45.312
ENSORLG00020006820	-	69	40.000	ENSORLG00020019341	-	86	47.917
ENSORLG00020006820	-	76	43.103	ENSORLG00020008346	-	91	44.000
ENSORLG00020006820	-	75	41.772	ENSORLG00020009965	-	79	41.279
ENSORLG00020006820	-	66	37.195	ENSORLG00020009554	-	76	37.195
ENSORLG00020006820	-	76	38.060	ENSORLG00020010953	-	87	38.060
ENSORLG00020006820	-	73	45.185	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	45.185
ENSORLG00020006820	-	69	42.767	ENSORLG00020016666	-	70	42.767
ENSORLG00020006820	-	76	41.379	ENSORLG00020008933	-	69	41.379
ENSORLG00020006820	-	71	48.466	ENSORLG00020017850	-	95	47.239
ENSORLG00020006820	-	72	41.727	ENSORLG00020007967	-	85	41.727
ENSORLG00020006820	-	78	38.621	ENSORLG00020008484	-	93	38.621
ENSORLG00020006820	-	71	40.909	ENSORLG00020004353	-	91	40.909
ENSORLG00020006820	-	81	40.141	ENSORLG00020008891	-	86	45.455
ENSORLG00020006820	-	66	44.118	ENSORLG00020004370	-	74	44.118
ENSORLG00020006820	-	66	42.254	ENSORLG00020006148	-	50	42.254
ENSORLG00020006820	-	72	37.607	ENSORLG00020006144	-	78	36.842
ENSORLG00020006820	-	80	40.606	ENSORLG00020002128	-	88	40.606
ENSORLG00020006820	-	66	46.341	ENSORLG00020015703	-	52	46.341
ENSORLG00020006820	-	65	42.754	ENSORLG00020002817	GFI1	50	42.754
ENSORLG00020006820	-	65	40.714	ENSORLG00020018051	prdm5	80	38.125

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006820	-	61	42.667	ENSCVAG00000023371	-	58	42.667	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020006820	-	66	46.341	ENSEBUG00000012314	-	59	46.341	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006820	-	72	46.951	ENSEBUG00000010204	-	68	46.951	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006820	-	66	45.324	ENSEBUG00000014042	-	51	45.324	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006820	-	65	49.635	ENSGAFG00000014563	-	52	49.635	Gambusia_affinis
ENSORLG00020006820	-	64	49.390	ENSHBUG00000009941	-	71	49.390	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020006820	-	64	52.174	ENSKMAG00000019180	-	58	52.174	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020006820	-	63	48.624	ENSLOCG00000018285	-	100	48.624	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020006820	-	68	44.118	ENSMMOG00000011435	-	73	44.118	Mola_mola
ENSORLG00020006820	-	58	48.611	ENSORLG00000028457	-	80	46.296	Oryzias_latipes
ENSORLG00020006820	-	75	46.429	ENSPMEG00000022852	-	63	46.429	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020006820	-	76	45.714	ENSPREG00000016593	-	53	45.714	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020006820	-	75	44.304	ENSPREG00000004746	-	50	44.304	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020006820	-	65	59.649	ENSPNYG00000006306	-	94	59.649	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020006820	-	64	49.390	ENSPNYG00000011973	-	78	49.390	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020006820	-	69	44.444	ENSPNAG00000015513	si:dkey-210j14.3	87	44.444	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020006820	-	65	47.297	ENSXCOG00000010950	si:dkey-210j14.3	57	47.297	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020006820	-	62	46.809	ENSXMAG00000022137	-	82	46.809	Xiphophorus_maculatus