EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020006830 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: trmu
Alias: -
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8100 bases
Position: chr23:358518-366617
Accession: ZDB-GENE-050522-540
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020005979	tRNA_Me_trans	PF03054.16	5.5e-135	1	1
ENSORLP00020025055	tRNA_Me_trans	PF03054.16	2.5e-112	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020005394	-	1230	-	ENSORLP00020025055	409 (aa)	-	-
ENSORLT00020005358	-	3295	-	ENSORLP00020005979	414 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.642	ENSG00000100416	TRMU	99	70.270	Homo_sapiens
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.212	ENSAPOG00000014458	trmu	99	82.212	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020006830	trmu	97	69.825	ENSAMEG00000003319	TRMU	96	69.825	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020006830	trmu	99	81.490	ENSACIG00000002101	trmu	100	81.490	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.816	ENSAOCG00000013155	trmu	99	83.816	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.333	ENSAPEG00000013350	trmu	99	83.333	Amphiprion_percula
ENSORLG00020006830	trmu	99	80.825	ENSATEG00000007814	trmu	100	80.825	Anabas_testudineus
ENSORLG00020006830	trmu	92	70.185	ENSAPLG00000016380	TRMU	97	70.185	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020006830	trmu	97	70.398	ENSACAG00000007720	TRMU	96	70.398	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.642	ENSANAG00000038053	TRMU	96	68.642	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.293	ENSACLG00000005395	trmu	99	83.293	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020006830	trmu	99	73.415	ENSAMXG00000005282	trmu	99	73.415	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020006830	trmu	99	68.460	ENSBTAG00000005595	TRMU	98	68.460	Bos_taurus
ENSORLG00020006830	trmu	92	39.276	WBGene00007114	mttu-1	98	39.276	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.993	ENSCJAG00000000198	TRMU	97	66.993	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.889	ENSCAFG00000000779	TRMU	95	68.889	Canis_familiaris
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.889	ENSCAFG00020009184	TRMU	95	68.889	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.642	ENSCHIG00000017074	TRMU	97	68.642	Capra_hircus
ENSORLG00020006830	trmu	96	69.925	ENSTSYG00000003853	TRMU	95	69.925	Carlito_syrichta
ENSORLG00020006830	trmu	94	65.356	ENSCAPG00000013034	TRMU	96	65.356	Cavia_aperea
ENSORLG00020006830	trmu	97	69.479	ENSCPOG00000020780	TRMU	96	69.479	Cavia_porcellus
ENSORLG00020006830	trmu	99	67.718	ENSCCAG00000021641	TRMU	98	67.718	Cebus_capucinus
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.241	ENSCATG00000032800	TRMU	96	67.241	Cercocebus_atys
ENSORLG00020006830	trmu	97	69.479	ENSCLAG00000017269	TRMU	96	69.479	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.734	ENSCSAG00000005279	TRMU	96	67.734	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020006830	trmu	90	69.086	ENSCPBG00000011621	TRMU	93	69.086	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020006830	trmu	94	48.454	ENSCING00000019371	-	95	48.454	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020006830	trmu	99	67.233	ENSCANG00000041645	TRMU	98	67.233	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.344	ENSCGRG00001001739	Trmu	97	66.344	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020006830	trmu	99	60.775	ENSCGRG00000002781	Trmu	97	60.775	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020006830	trmu	99	76.829	ENSCSEG00000012382	trmu	99	76.829	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020006830	trmu	99	81.928	ENSCVAG00000001366	trmu	99	81.928	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020006830	trmu	99	70.913	ENSDARG00000043734	trmu	100	70.913	Danio_rerio
ENSORLG00020006830	trmu	64	57.463	ENSDNOG00000047245	-	94	57.463	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020006830	trmu	99	69.363	ENSDORG00000007455	Trmu	99	69.363	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020006830	trmu	93	43.782	FBgn0040337	CG3021	95	43.782	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020006830	trmu	93	55.499	ENSEBUG00000007454	trmu	100	54.179	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020006830	trmu	98	70.123	ENSEASG00005021725	TRMU	96	70.123	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020006830	trmu	98	70.123	ENSECAG00000000467	TRMU	96	70.123	Equus_caballus
ENSORLG00020006830	trmu	69	52.448	ENSEEUG00000000074	-	68	52.448	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020006830	trmu	99	76.570	ENSELUG00000009464	trmu	99	77.989	Esox_lucius
ENSORLG00020006830	trmu	96	70.175	ENSFCAG00000006533	TRMU	95	70.175	Felis_catus
ENSORLG00020006830	trmu	92	69.509	ENSFALG00000010035	TRMU	98	69.509	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020006830	trmu	91	67.196	ENSFDAG00000017472	TRMU	96	67.196	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.651	ENSFHEG00000003162	trmu	98	83.651	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020006830	trmu	97	71.499	ENSGMOG00000001323	trmu	100	71.499	Gadus_morhua
ENSORLG00020006830	trmu	97	69.756	ENSGALG00000031922	TRMU	97	69.756	Gallus_gallus
ENSORLG00020006830	trmu	98	84.236	ENSGAFG00000013331	trmu	97	84.236	Gambusia_affinis
ENSORLG00020006830	trmu	99	79.621	ENSGACG00000019024	trmu	99	79.621	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.395	ENSGGOG00000000203	TRMU	96	68.395	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.293	ENSHBUG00000023421	trmu	99	83.293	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020006830	trmu	97	68.159	ENSHGLG00000009278	TRMU	95	68.159	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020006830	trmu	97	68.159	ENSHGLG00100018863	TRMU	95	68.159	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020006830	trmu	100	78.554	ENSHCOG00000013459	trmu	100	78.554	Hippocampus_comes
ENSORLG00020006830	trmu	96	75.940	ENSIPUG00000009785	trmu	98	75.940	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020006830	trmu	99	68.949	ENSSTOG00000010993	TRMU	96	68.949	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020006830	trmu	97	68.905	ENSJJAG00000000667	Trmu	96	68.905	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020006830	trmu	99	81.687	ENSKMAG00000008516	trmu	99	81.687	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020006830	trmu	99	80.241	ENSLBEG00000018831	trmu	99	80.241	Labrus_bergylta
ENSORLG00020006830	trmu	97	72.208	ENSLACG00000013713	TRMU	96	72.208	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020006830	trmu	97	77.057	ENSLOCG00000016066	trmu	96	77.057	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020006830	trmu	95	62.564	ENSLAFG00000005129	TRMU	95	62.404	Loxodonta_africana
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.980	ENSMFAG00000039767	TRMU	96	67.980	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.980	ENSMMUG00000000807	TRMU	96	67.980	Macaca_mulatta
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.980	ENSMNEG00000028164	TRMU	96	67.980	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.488	ENSMLEG00000033884	TRMU	96	67.488	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020006830	trmu	99	80.387	ENSMAMG00000004717	trmu	99	80.387	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.293	ENSMZEG00005015797	trmu	99	83.293	Maylandia_zebra
ENSORLG00020006830	trmu	79	67.568	ENSMGAG00000007550	TRMU	97	67.568	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020006830	trmu	96	67.419	ENSMAUG00000022282	Trmu	96	67.419	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020006830	trmu	95	69.114	ENSMICG00000029046	TRMU	96	69.114	Microcebus_murinus
ENSORLG00020006830	trmu	97	67.742	ENSMOCG00000014641	Trmu	97	67.742	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020006830	trmu	99	78.554	ENSMMOG00000007229	trmu	99	78.554	Mola_mola
ENSORLG00020006830	trmu	96	66.332	ENSMODG00000007433	TRMU	93	66.332	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020006830	trmu	99	79.277	ENSMALG00000007721	trmu	99	79.277	Monopterus_albus
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.344	MGP_CAROLIEiJ_G0020134	Trmu	98	66.344	Mus_caroli
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.344	ENSMUSG00000022386	Trmu	98	66.344	Mus_musculus
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.102	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	98	66.102	Mus_pahari
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.344	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	98	66.344	Mus_spretus
ENSORLG00020006830	trmu	98	69.136	ENSMPUG00000002523	TRMU	96	69.136	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020006830	trmu	99	67.874	ENSNGAG00000005132	Trmu	99	67.874	Nannospalax_galili
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.809	ENSNBRG00000022690	trmu	99	82.963	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.395	ENSNLEG00000015773	TRMU	96	68.395	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020006830	trmu	79	56.881	ENSMEUG00000000216	TRMU	99	56.881	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020006830	trmu	97	68.734	ENSODEG00000014745	TRMU	97	68.395	Octodon_degus
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.535	ENSONIG00000009821	trmu	99	83.535	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020006830	trmu	93	63.918	ENSOANG00000001891	TRMU	98	63.918	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020006830	trmu	91	68.351	ENSOCUG00000003664	TRMU	94	67.259	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020006830	trmu	100	99.517	ENSORLG00000019015	trmu	100	99.517	Oryzias_latipes
ENSORLG00020006830	trmu	100	100.000	ENSORLG00015003907	trmu	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020006830	trmu	55	92.140	ENSOMEG00000015541	trmu	83	92.140	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.160	ENSOGAG00000008096	TRMU	97	67.160	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020006830	trmu	92	66.579	ENSOARG00000019475	TRMU	93	66.579	Ovis_aries
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.395	ENSPPAG00000033944	TRMU	96	68.395	Pan_paniscus
ENSORLG00020006830	trmu	96	70.175	ENSPPRG00000004197	TRMU	95	70.175	Panthera_pardus
ENSORLG00020006830	trmu	67	69.314	ENSPTIG00000014122	TRMU	97	70.833	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.395	ENSPTRG00000014510	TRMU	96	68.395	Pan_troglodytes
ENSORLG00020006830	trmu	95	68.861	ENSPANG00000023074	TRMU	97	65.753	Papio_anubis
ENSORLG00020006830	trmu	99	72.639	ENSPKIG00000002849	trmu	99	72.639	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020006830	trmu	88	70.055	ENSPSIG00000013020	TRMU	95	70.055	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020006830	trmu	99	79.805	ENSPMGG00000004083	trmu	99	79.805	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020006830	trmu	96	67.419	ENSPEMG00000014007	Trmu	96	67.419	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020006830	trmu	95	65.394	ENSPCIG00000009923	TRMU	93	65.239	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020006830	trmu	97	79.250	ENSPFOG00000008197	trmu	89	79.250	Poecilia_formosa
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.927	ENSPLAG00000008414	trmu	99	82.927	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.171	ENSPMEG00000004326	trmu	99	83.171	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.651	ENSPREG00000007980	trmu	99	82.651	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.395	ENSPPYG00000011949	TRMU	96	68.395	Pongo_abelii
ENSORLG00020006830	trmu	91	62.334	ENSPCAG00000013462	TRMU	97	62.334	Procavia_capensis
ENSORLG00020006830	trmu	97	67.830	ENSPCOG00000016539	TRMU	96	67.830	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020006830	trmu	97	63.342	ENSPVAG00000013202	TRMU	96	63.342	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.809	ENSPNYG00000005629	trmu	99	82.809	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020006830	trmu	97	76.060	ENSPNAG00000006339	trmu	94	76.060	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020006830	trmu	99	66.344	ENSRNOG00000016465	Trmu	98	66.344	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020006830	trmu	98	66.995	ENSRBIG00000038973	TRMU	96	66.995	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020006830	trmu	98	67.241	ENSRROG00000004267	TRMU	96	67.241	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020006830	trmu	93	33.333	YDL033C	SLM3	93	33.333	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00020006830	trmu	98	68.317	ENSSBOG00000030184	TRMU	96	68.317	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSORLG00020006830	trmu	99	82.169	ENSSMAG00000019450	trmu	99	82.169	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.614	ENSSDUG00000011913	trmu	99	83.614	Seriola_dumerili
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.373	ENSSLDG00000011684	trmu	99	83.373	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020006830	trmu	99	59.506	ENSSPUG00000017123	TRMU	97	59.012	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020006830	trmu	99	82.082	ENSSPAG00000021875	trmu	99	82.082	Stegastes_partitus
ENSORLG00020006830	trmu	99	67.482	ENSSSCG00000000007	TRMU	98	66.828	Sus_scrofa
ENSORLG00020006830	trmu	90	71.582	ENSTGUG00000003663	-	100	71.582	Taeniopygia_guttata
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ENSORLG00020006830	trmu	89	42.547	ENSTBEG00000011276	-	95	42.547	Tupaia_belangeri
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ENSORLG00020006830	trmu	98	68.148	ENSVVUG00000024963	TRMU	96	68.148	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020006830	trmu	97	71.960	ENSXETG00000023304	trmu	95	71.960	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020006830	trmu	99	80.861	ENSXCOG00000015105	trmu	99	80.861	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020006830	trmu	99	83.373	ENSXMAG00000006697	trmu	99	83.373	Xiphophorus_maculatus