EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020007018 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 53538 bases
Position: chr21:12461496-12515033
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	1	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	2	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	3	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	4	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	5	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	6	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	7	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	8	9
ENSORLP00020006189	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-61	9	9
ENSORLP00020006189	zf-met	PF12874.7	2.7e-10	1	2
ENSORLP00020006189	zf-met	PF12874.7	2.7e-10	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020005009	-	1152	-	ENSORLP00020006189	383 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020007018	-	87	60.690	ENSORLG00020011075	-	90	60.690
ENSORLG00020007018	-	82	57.143	ENSORLG00020010250	-	94	54.817
ENSORLG00020007018	-	80	44.444	ENSORLG00020018844	wt1	54	42.742
ENSORLG00020007018	-	91	78.723	ENSORLG00020007074	-	95	81.657
ENSORLG00020007018	-	84	51.176	ENSORLG00020000264	-	54	51.176
ENSORLG00020007018	-	81	51.974	ENSORLG00020020419	-	84	52.740
ENSORLG00020007018	-	85	37.970	ENSORLG00020002128	-	99	38.380
ENSORLG00020007018	-	78	45.133	ENSORLG00020018921	-	76	45.133
ENSORLG00020007018	-	90	56.446	ENSORLG00020017164	-	99	52.000
ENSORLG00020007018	-	79	57.762	ENSORLG00020017850	-	95	57.762
ENSORLG00020007018	-	87	59.140	ENSORLG00020010020	-	98	59.140
ENSORLG00020007018	-	79	37.984	ENSORLG00020011478	scrt2	50	37.984
ENSORLG00020007018	-	89	55.556	ENSORLG00020008018	-	83	56.803
ENSORLG00020007018	-	80	38.760	ENSORLG00020012967	scrt1b	54	38.760
ENSORLG00020007018	-	78	44.828	ENSORLG00020018503	-	69	46.753
ENSORLG00020007018	-	79	38.043	ENSORLG00020020094	-	58	38.636
ENSORLG00020007018	-	77	60.731	ENSORLG00020010647	-	84	60.731
ENSORLG00020007018	-	84	50.000	ENSORLG00020002700	znf367	50	48.649
ENSORLG00020007018	-	87	35.294	ENSORLG00020006144	-	74	40.244
ENSORLG00020007018	-	71	38.971	ENSORLG00020001791	-	51	38.971
ENSORLG00020007018	-	80	49.741	ENSORLG00020016666	-	66	49.741
ENSORLG00020007018	-	81	38.514	ENSORLG00020004889	ZNF319	88	38.514
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ENSORLG00020007018	-	92	60.000	ENSORLG00020009943	-	92	59.494
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ENSORLG00020007018	-	91	62.543	ENSORLG00020009419	-	88	61.017
ENSORLG00020007018	-	78	37.037	ENSORLG00020005815	-	73	37.037
ENSORLG00020007018	-	91	57.143	ENSORLG00020011234	-	96	57.143
ENSORLG00020007018	-	94	45.659	ENSORLG00020007599	-	64	48.466
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ENSORLG00020007018	-	81	61.000	ENSORLG00020009180	-	94	59.016
ENSORLG00020007018	-	88	58.750	ENSORLG00020009184	-	87	58.750
ENSORLG00020007018	-	76	35.000	ENSORLG00020015911	-	74	35.000
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ENSORLG00020007018	-	91	60.294	ENSORLG00020008346	-	87	61.034
ENSORLG00020007018	-	90	56.856	ENSORLG00020008484	-	92	56.856
ENSORLG00020007018	-	80	59.797	ENSORLG00020011149	-	91	57.194
ENSORLG00020007018	-	92	53.793	ENSORLG00020017483	-	87	53.793
ENSORLG00020007018	-	93	55.063	ENSORLG00020016754	-	92	53.812
ENSORLG00020007018	-	91	59.596	ENSORLG00020010560	-	98	59.200
ENSORLG00020007018	-	77	59.797	ENSORLG00020010916	-	56	59.797
ENSORLG00020007018	-	79	57.895	ENSORLG00020010636	-	75	57.895
ENSORLG00020007018	-	87	35.764	ENSORLG00020000009	znf710b	51	35.764
ENSORLG00020007018	-	92	52.482	ENSORLG00020007967	-	91	57.353
ENSORLG00020007018	-	80	31.959	ENSORLG00020002653	-	62	31.959
ENSORLG00020007018	-	79	33.721	ENSORLG00020002684	-	78	33.721
ENSORLG00020007018	-	79	50.000	ENSORLG00020005132	-	71	50.847
ENSORLG00020007018	-	83	42.470	ENSORLG00020018495	-	64	42.470
ENSORLG00020007018	-	71	60.944	ENSORLG00020008424	-	90	59.592
ENSORLG00020007018	-	80	57.192	ENSORLG00020018069	-	89	51.678
ENSORLG00020007018	-	84	45.732	ENSORLG00020006820	-	68	45.732
ENSORLG00020007018	-	91	54.135	ENSORLG00020008933	-	67	55.078
ENSORLG00020007018	-	88	44.125	ENSORLG00020021857	-	67	43.864
ENSORLG00020007018	-	82	57.895	ENSORLG00020000246	-	88	57.895
ENSORLG00020007018	-	79	46.429	ENSORLG00020010932	-	68	46.429
ENSORLG00020007018	-	82	48.571	ENSORLG00020001912	znf236	74	45.794
ENSORLG00020007018	-	80	43.452	ENSORLG00020003719	GFI1B	61	43.452
ENSORLG00020007018	-	79	34.826	ENSORLG00020010937	patz1	53	34.025
ENSORLG00020007018	-	87	43.452	ENSORLG00020001602	gfi1ab	64	43.452
ENSORLG00020007018	-	92	56.452	ENSORLG00020008240	-	64	55.789
ENSORLG00020007018	-	91	62.927	ENSORLG00020010880	-	80	62.927
ENSORLG00020007018	-	79	40.299	ENSORLG00020008787	snai2	53	40.299
ENSORLG00020007018	-	82	50.403	ENSORLG00020016037	-	99	50.403
ENSORLG00020007018	-	84	44.172	ENSORLG00020002817	GFI1	50	44.937
ENSORLG00020007018	-	77	44.444	ENSORLG00020006433	-	75	44.444
ENSORLG00020007018	-	78	45.133	ENSORLG00020019341	-	81	61.290
ENSORLG00020007018	-	91	63.793	ENSORLG00020010804	-	94	63.763
ENSORLG00020007018	-	82	48.485	ENSORLG00020009139	-	98	49.091
ENSORLG00020007018	-	90	52.071	ENSORLG00020006148	-	70	45.673
ENSORLG00020007018	-	77	36.735	ENSORLG00020001758	-	55	36.735
ENSORLG00020007018	-	79	36.039	ENSORLG00020007790	zbtb48	52	36.039
ENSORLG00020007018	-	77	49.339	ENSORLG00020010038	-	55	49.339
ENSORLG00020007018	-	78	40.357	ENSORLG00020018791	-	81	40.357
ENSORLG00020007018	-	73	52.632	ENSORLG00020017514	-	90	52.632
ENSORLG00020007018	-	88	60.444	ENSORLG00020010171	-	98	54.857
ENSORLG00020007018	-	75	54.091	ENSORLG00020001707	-	83	54.091
ENSORLG00020007018	-	89	61.111	ENSORLG00020000161	-	88	61.111
ENSORLG00020007018	-	78	51.429	ENSORLG00020010950	-	94	51.429
ENSORLG00020007018	-	86	59.783	ENSORLG00020010953	-	87	58.120
ENSORLG00020007018	-	86	57.692	ENSORLG00020015703	-	51	57.692
ENSORLG00020007018	-	82	41.525	ENSORLG00020010285	znf646	87	41.525
ENSORLG00020007018	-	89	55.823	ENSORLG00020008891	-	82	58.955
ENSORLG00020007018	-	78	39.568	ENSORLG00020018051	prdm5	75	39.568
ENSORLG00020007018	-	77	54.327	ENSORLG00020017528	-	74	54.327
ENSORLG00020007018	-	81	36.000	ENSORLG00020018685	znf319b	85	36.000
ENSORLG00020007018	-	85	49.635	ENSORLG00020000219	-	69	49.635
ENSORLG00020007018	-	88	42.081	ENSORLG00020008744	-	68	42.081
ENSORLG00020007018	-	91	60.241	ENSORLG00020009089	-	78	60.241
ENSORLG00020007018	-	82	39.827	ENSORLG00020009554	-	76	39.827
ENSORLG00020007018	-	90	46.667	ENSORLG00020001922	-	62	45.455
ENSORLG00020007018	-	79	30.380	ENSORLG00020004162	znf341	60	30.380

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020007018	-	78	57.851	ENSAPOG00000010330	-	82	57.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	79	51.042	ENSAPOG00000010645	-	58	45.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	80	52.381	ENSAPOG00000000601	-	66	52.071	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	81	52.941	ENSAPOG00000014372	-	61	53.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	81	60.000	ENSAPOG00000016615	-	94	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	78	59.155	ENSAPOG00000003414	-	97	59.155	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007018	-	78	45.570	ENSAOCG00000007347	-	59	43.902	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020007018	-	78	51.852	ENSAPEG00000004256	-	74	51.852	Amphiprion_percula
ENSORLG00020007018	-	79	56.489	ENSATEG00000007658	-	71	47.964	Anabas_testudineus
ENSORLG00020007018	-	91	42.271	ENSAMXG00000013492	-	97	47.525	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020007018	-	77	44.628	ENSCING00000024717	-	76	44.628	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020007018	-	84	43.403	ENSCVAG00000018383	-	76	44.083	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020007018	-	78	46.552	ENSEBUG00000003418	-	96	46.552	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	90	52.439	ENSEBUG00000015472	-	69	52.439	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	81	48.201	ENSEBUG00000014768	-	68	48.201	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	78	48.201	ENSEBUG00000001569	-	75	48.201	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	79	48.780	ENSEBUG00000000436	-	75	48.780	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	81	45.395	ENSEBUG00000003232	-	53	45.395	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	83	45.200	ENSEBUG00000004992	-	53	48.472	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	79	48.223	ENSEBUG00000013874	-	51	48.223	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	81	50.519	ENSEBUG00000006666	-	91	50.519	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	80	44.221	ENSEBUG00000001308	-	64	44.221	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	83	47.561	ENSEBUG00000000422	-	63	47.561	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020007018	-	88	46.818	ENSELUG00000022942	-	64	48.458	Esox_lucius
ENSORLG00020007018	-	77	53.633	ENSELUG00000007694	-	76	53.633	Esox_lucius
ENSORLG00020007018	-	78	57.377	ENSELUG00000000281	-	62	57.377	Esox_lucius
ENSORLG00020007018	-	78	51.111	ENSGMOG00000005588	-	100	51.111	Gadus_morhua
ENSORLG00020007018	-	84	43.750	ENSGMOG00000016007	-	86	45.283	Gadus_morhua
ENSORLG00020007018	-	91	55.172	ENSGAFG00000021143	-	60	55.172	Gambusia_affinis
ENSORLG00020007018	-	82	50.000	ENSGAFG00000021139	-	86	50.000	Gambusia_affinis
ENSORLG00020007018	-	78	57.485	ENSGAGG00000010492	-	73	56.805	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020007018	-	87	40.613	ENSHBUG00000007316	-	69	42.857	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020007018	-	77	51.163	ENSHBUG00000003529	-	82	51.163	Haplochromis_burtoni
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ENSORLG00020007018	-	85	50.532	ENSSLDG00000001860	-	85	50.289	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020007018	-	78	61.905	ENSXCOG00000009674	-	81	61.905	Xiphophorus_couchianus
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ENSORLG00020007018	-	77	50.610	ENSXMAG00000028785	-	73	50.610	Xiphophorus_maculatus