EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020007271 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1e
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2738 bases
Position: chr1:11687576-11690313
Accession: ZDB-GENE-050522-251
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020006384	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	7.2e-114	1	1
ENSORLP00020006420	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	6.8e-93	1	2
ENSORLP00020006420	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	6.8e-93	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020004634	-	1065	-	ENSORLP00020006420	354 (aa)	-	-
ENSORLT00020004684	-	1149	-	ENSORLP00020006384	382 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020007271's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020007271's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSG00000137054	POLR1E	90	45.407	Homo_sapiens
ENSORLG00020007271	polr1e	99	64.767	ENSAPOG00000012452	polr1e	96	61.126	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	52.874	ENSAMEG00000010193	POLR1E	90	40.092	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020007271	polr1e	99	71.507	ENSACIG00000009884	polr1e	99	71.507	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.394	ENSAOCG00000005665	polr1e	93	68.394	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.912	ENSAPEG00000020581	polr1e	93	68.912	Amphiprion_percula
ENSORLG00020007271	polr1e	99	71.318	ENSATEG00000020609	polr1e	93	71.318	Anabas_testudineus
ENSORLG00020007271	polr1e	86	38.303	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.303	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020007271	polr1e	97	45.312	ENSANAG00000038046	POLR1E	94	42.025	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020007271	polr1e	99	72.021	ENSACLG00000013685	polr1e	92	72.021	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020007271	polr1e	99	53.906	ENSAMXG00000018181	polr1e	95	52.685	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	45.876	ENSBTAG00000012243	POLR1E	92	45.876	Bos_taurus
ENSORLG00020007271	polr1e	96	43.896	ENSCJAG00000010512	POLR1E	84	47.647	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.588	ENSCAFG00000002377	POLR1E	92	44.588	Canis_familiaris
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.330	ENSCAFG00020017851	POLR1E	92	44.330	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020007271	polr1e	99	45.269	ENSCHIG00000019479	POLR1E	92	45.269	Capra_hircus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.359	ENSTSYG00000002075	POLR1E	92	44.359	Carlito_syrichta
ENSORLG00020007271	polr1e	76	41.522	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	43.299	Cavia_aperea
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.020	ENSCPOG00000009965	POLR1E	92	44.444	Cavia_porcellus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	39.840	ENSCCAG00000029460	POLR1E	93	39.840	Cebus_capucinus
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSCATG00000031732	POLR1E	92	51.087	Cercocebus_atys
ENSORLG00020007271	polr1e	84	46.201	ENSCLAG00000012701	POLR1E	86	46.201	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020007271	polr1e	96	44.882	ENSCSAG00000010782	POLR1E	90	44.882	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020007271	polr1e	97	37.958	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	35.533	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020007271	polr1e	99	46.770	ENSCPBG00000006923	POLR1E	93	46.770	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.932	ENSCANG00000036112	POLR1E	92	52.174	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.268	ENSCGRG00001006197	Polr1e	89	42.268	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020007271	polr1e	99	41.753	ENSCGRG00000006430	Polr1e	89	41.753	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020007271	polr1e	99	64.062	ENSCSEG00000005121	polr1e	96	62.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.992	ENSCVAG00000019759	polr1e	93	68.992	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020007271	polr1e	96	54.960	ENSDARG00000006434	polr1e	95	53.690	Danio_rerio
ENSORLG00020007271	polr1e	97	38.051	ENSDNOG00000010257	POLR1E	94	34.763	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020007271	polr1e	88	41.908	ENSETEG00000018204	POLR1E	96	42.120	Echinops_telfairi
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.152	ENSEASG00005000675	POLR1E	92	43.152	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.152	ENSECAG00000014669	POLR1E	92	43.152	Equus_caballus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	37.500	ENSEEUG00000011928	POLR1E	82	38.918	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	61.719	ENSELUG00000008150	polr1e	94	59.949	Esox_lucius
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.928	ENSFCAG00000013081	POLR1E	92	43.928	Felis_catus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.711	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	41.058	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.020	ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	42.184	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.217	ENSFHEG00000009801	polr1e	93	68.217	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	49.606	ENSGMOG00000003336	POLR1E	94	49.606	Gadus_morhua
ENSORLG00020007271	polr1e	98	44.819	ENSGALG00000005395	POLR1E	95	42.785	Gallus_gallus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	67.959	ENSGAFG00000004850	polr1e	93	67.959	Gambusia_affinis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	64.194	ENSGACG00000016087	polr1e	93	64.194	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.895	ENSGAGG00000001659	POLR1E	97	42.513	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSGGOG00000001882	POLR1E	88	49.474	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020007271	polr1e	99	72.021	ENSHBUG00000002559	polr1e	92	72.021	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020007271	polr1e	99	45.103	ENSHGLG00000002036	POLR1E	92	45.103	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020007271	polr1e	99	45.361	ENSHGLG00100012784	POLR1E	92	45.361	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020007271	polr1e	99	63.377	ENSHCOG00000002774	polr1e	93	63.636	Hippocampus_comes
ENSORLG00020007271	polr1e	99	54.805	ENSIPUG00000003019	polr1e	95	54.103	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020007271	polr1e	98	42.969	ENSSTOG00000009810	POLR1E	93	41.582	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.669	ENSJJAG00000020731	Polr1e	88	43.669	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	70.725	ENSKMAG00000000046	polr1e	93	70.725	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.217	ENSLBEG00000003104	polr1e	92	68.394	Labrus_bergylta
ENSORLG00020007271	polr1e	92	46.978	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.978	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020007271	polr1e	99	50.513	ENSLOCG00000012859	polr1e	93	49.873	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020007271	polr1e	95	48.958	ENSLAFG00000012831	POLR1E	93	41.117	Loxodonta_africana
ENSORLG00020007271	polr1e	97	45.170	ENSMFAG00000045465	POLR1E	92	51.087	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSMMUG00000017892	POLR1E	92	51.087	Macaca_mulatta
ENSORLG00020007271	polr1e	99	38.462	ENSMNEG00000040283	POLR1E	92	40.659	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSMLEG00000031135	POLR1E	92	51.087	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.571	ENSMAMG00000001260	polr1e	92	68.571	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	71.762	ENSMZEG00005021536	polr1e	92	71.762	Maylandia_zebra
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.894	ENSMAUG00000021044	Polr1e	88	42.894	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.330	ENSMICG00000003673	POLR1E	92	44.330	Microcebus_murinus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	41.237	ENSMOCG00000012920	Polr1e	89	41.237	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.992	ENSMMOG00000007391	polr1e	95	68.992	Mola_mola
ENSORLG00020007271	polr1e	95	45.238	ENSMODG00000002884	POLR1E	90	45.238	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.171	ENSMALG00000002665	polr1e	92	69.171	Monopterus_albus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	49.425	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	95	41.237	Mus_caroli
ENSORLG00020007271	polr1e	99	50.575	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	39.646	Mus_musculus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	51.724	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	95	43.557	Mus_pahari
ENSORLG00020007271	polr1e	99	50.575	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	95	41.902	Mus_spretus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	50.000	ENSMPUG00000006040	POLR1E	81	50.000	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.845	ENSMLUG00000012688	POLR1E	90	42.893	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.557	ENSNGAG00000002520	Polr1e	88	43.557	Nannospalax_galili
ENSORLG00020007271	polr1e	99	72.021	ENSNBRG00000016822	polr1e	92	72.021	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.932	ENSNLEG00000003616	POLR1E	92	51.087	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020007271	polr1e	80	48.000	ENSMEUG00000015372	-	77	49.302	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020007271	polr1e	92	39.835	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	39.835	Ochotona_princeps
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.845	ENSODEG00000014565	POLR1E	89	44.845	Octodon_degus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	71.503	ENSONIG00000008921	polr1e	92	71.503	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.119	ENSOCUG00000024773	POLR1E	94	40.759	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020007271	polr1e	100	94.602	ENSORLG00000005143	polr1e	94	94.602	Oryzias_latipes
ENSORLG00020007271	polr1e	100	94.859	ENSORLG00015000137	polr1e	94	94.859	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020007271	polr1e	100	85.347	ENSOMEG00000013264	polr1e	92	85.347	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.590	ENSOGAG00000012981	POLR1E	90	43.590	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020007271	polr1e	99	45.524	ENSOARG00000011465	POLR1E	88	45.524	Ovis_aries
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSPPAG00000034566	POLR1E	92	51.087	Pan_paniscus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.330	ENSPPRG00000005649	POLR1E	92	44.330	Panthera_pardus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.072	ENSPTIG00000009774	POLR1E	92	44.072	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSPTRG00000020944	POLR1E	92	51.087	Pan_troglodytes
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSPANG00000025563	POLR1E	92	51.087	Papio_anubis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	56.848	ENSPKIG00000003562	polr1e	94	55.330	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.935	ENSPSIG00000003274	POLR1E	92	43.257	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	62.169	ENSPMGG00000024169	polr1e	95	60.892	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	38.158	ENSPEMG00000022300	-	89	37.260	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020007271	polr1e	99	42.377	ENSPEMG00000019151	-	88	42.377	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020007271	polr1e	98	44.872	ENSPCIG00000014798	POLR1E	92	44.872	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	65.860	ENSPFOG00000019627	polr1e	93	65.860	Poecilia_formosa
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.171	ENSPLAG00000022679	polr1e	93	69.171	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020007271	polr1e	92	70.474	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	70.474	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.394	ENSPREG00000009470	polr1e	93	68.394	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.144	ENSPPYG00000019061	POLR1E	90	45.144	Pongo_abelii
ENSORLG00020007271	polr1e	53	42.180	ENSPCAG00000004891	POLR1E	68	42.180	Procavia_capensis
ENSORLG00020007271	polr1e	98	43.669	ENSPCOG00000027448	POLR1E	91	43.669	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.330	ENSPVAG00000007940	POLR1E	81	44.330	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	72.021	ENSPNYG00000001032	polr1e	92	72.021	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020007271	polr1e	100	52.551	ENSPNAG00000006987	polr1e	94	52.551	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020007271	polr1e	99	41.085	ENSRNOG00000012664	Polr1e	90	39.340	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.407	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSRROG00000031986	POLR1E	92	51.087	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020007271	polr1e	96	45.407	ENSSBOG00000021415	POLR1E	90	45.407	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020007271	polr1e	88	45.690	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	45.690	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020007271	polr1e	99	55.155	ENSSFOG00015002293	polr1e	93	55.155	Scleropages_formosus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.792	ENSSMAG00000011672	polr1e	86	69.610	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.948	ENSSDUG00000022279	polr1e	92	69.948	Seriola_dumerili
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.948	ENSSLDG00000024918	polr1e	92	69.948	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020007271	polr1e	60	37.931	ENSSARG00000009810	-	58	38.627	Sorex_araneus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.615	ENSSPUG00000009499	POLR1E	92	44.615	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	70.130	ENSSPAG00000021240	polr1e	93	70.130	Stegastes_partitus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.757	ENSSSCG00000005347	POLR1E	92	44.757	Sus_scrofa
ENSORLG00020007271	polr1e	100	46.535	ENSTGUG00000007169	POLR1E	97	38.161	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020007271	polr1e	99	63.918	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	64.116	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020007271	polr1e	98	65.625	ENSTNIG00000017812	polr1e	92	65.625	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.669	ENSTBEG00000013786	POLR1E	82	43.669	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.478	ENSTTRG00000008294	POLR1E	82	43.478	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.845	ENSUAMG00000012474	POLR1E	91	46.567	Ursus_americanus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.845	ENSUMAG00000011496	POLR1E	92	44.845	Ursus_maritimus
ENSORLG00020007271	polr1e	83	41.896	ENSVPAG00000009048	POLR1E	77	41.896	Vicugna_pacos
ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.330	ENSVVUG00000019954	POLR1E	92	44.330	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020007271	polr1e	98	42.416	ENSXETG00000006533	polr1e	94	41.206	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020007271	polr1e	100	67.454	ENSXCOG00000013706	polr1e	95	67.454	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.251	ENSXMAG00000012484	polr1e	93	69.251	Xiphophorus_maculatus