EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020008240 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10419 bases
Position: chr13:27503422-27513840
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	1	6
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	2	6
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	3	6
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	4	6
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	5	6
ENSORLP00020007390	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-41	6	6
ENSORLP00020007390	zf-met	PF12874.7	2.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020002980	-	3860	-	ENSORLP00020007390	448 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020008240	-	74	43.490	ENSORLG00020010636	-	93	43.490
ENSORLG00020008240	-	76	58.376	ENSORLG00020010171	-	93	58.376
ENSORLG00020008240	-	58	35.519	ENSORLG00020010937	patz1	51	30.043
ENSORLG00020008240	-	74	49.102	ENSORLG00020000264	-	70	49.102
ENSORLG00020008240	-	72	56.944	ENSORLG00020008346	-	98	57.664
ENSORLG00020008240	-	72	59.712	ENSORLG00020008933	-	99	59.712
ENSORLG00020008240	-	73	41.353	ENSORLG00020018921	-	86	41.667
ENSORLG00020008240	-	92	50.000	ENSORLG00020007599	-	98	50.000
ENSORLG00020008240	-	63	53.191	ENSORLG00020008484	-	97	53.191
ENSORLG00020008240	-	73	59.474	ENSORLG00020017850	-	97	59.474
ENSORLG00020008240	-	74	56.291	ENSORLG00020010560	-	98	58.000
ENSORLG00020008240	-	68	52.404	ENSORLG00020007074	-	91	58.278
ENSORLG00020008240	-	73	53.191	ENSORLG00020000219	-	69	53.191
ENSORLG00020008240	-	74	58.716	ENSORLG00020009943	-	99	55.729
ENSORLG00020008240	-	73	56.081	ENSORLG00020000481	-	96	54.487
ENSORLG00020008240	-	70	55.769	ENSORLG00020006148	-	79	56.589
ENSORLG00020008240	-	50	47.024	ENSORLG00020006144	-	68	47.024
ENSORLG00020008240	-	62	32.796	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	78	32.796
ENSORLG00020008240	-	56	57.639	ENSORLG00020011075	-	92	57.639
ENSORLG00020008240	-	97	49.239	ENSORLG00020010950	-	97	50.943
ENSORLG00020008240	-	72	44.220	ENSORLG00020010953	-	95	59.048
ENSORLG00020008240	-	75	56.322	ENSORLG00020000246	-	99	56.322
ENSORLG00020008240	-	73	53.901	ENSORLG00020018069	-	98	53.901
ENSORLG00020008240	-	70	63.077	ENSORLG00020008891	-	98	63.077
ENSORLG00020008240	-	68	51.190	ENSORLG00020000161	-	95	51.190
ENSORLG00020008240	-	71	39.901	ENSORLG00020012229	zbtb41	54	39.901
ENSORLG00020008240	-	50	41.951	ENSORLG00020008744	-	68	41.951
ENSORLG00020008240	-	61	30.924	ENSORLG00020005815	-	86	30.876
ENSORLG00020008240	-	71	38.053	ENSORLG00020005132	-	91	38.551
ENSORLG00020008240	-	70	52.632	ENSORLG00020017164	-	96	57.592
ENSORLG00020008240	-	72	59.574	ENSORLG00020010880	-	96	59.574
ENSORLG00020008240	-	75	60.667	ENSORLG00020010804	-	95	60.667
ENSORLG00020008240	-	73	50.490	ENSORLG00020020419	-	94	50.490
ENSORLG00020008240	-	71	59.494	ENSORLG00020009857	-	98	59.494
ENSORLG00020008240	-	90	51.181	ENSORLG00020019227	-	99	51.181
ENSORLG00020008240	-	93	39.615	ENSORLG00020021196	-	87	39.091
ENSORLG00020008240	-	50	48.571	ENSORLG00020001912	znf236	57	48.571
ENSORLG00020008240	-	73	52.439	ENSORLG00020015703	-	79	52.439
ENSORLG00020008240	-	70	49.367	ENSORLG00020002128	-	96	49.367
ENSORLG00020008240	-	64	55.789	ENSORLG00020007018	-	92	56.452
ENSORLG00020008240	-	71	46.622	ENSORLG00020016037	-	94	50.610
ENSORLG00020008240	-	73	58.757	ENSORLG00020021857	-	78	58.757
ENSORLG00020008240	-	75	55.612	ENSORLG00020009089	-	86	56.477
ENSORLG00020008240	-	72	59.551	ENSORLG00020004370	-	99	59.551
ENSORLG00020008240	-	73	56.364	ENSORLG00020008018	-	94	56.364
ENSORLG00020008240	-	73	47.644	ENSORLG00020016666	-	91	36.503
ENSORLG00020008240	-	68	57.895	ENSORLG00020010250	-	96	56.944
ENSORLG00020008240	-	55	38.462	ENSORLG00020018503	-	70	38.532
ENSORLG00020008240	-	50	33.663	ENSORLG00020010285	znf646	71	33.663
ENSORLG00020008240	-	50	49.714	ENSORLG00020009139	-	98	50.307
ENSORLG00020008240	-	71	54.922	ENSORLG00020007967	-	99	54.922
ENSORLG00020008240	-	75	59.686	ENSORLG00020010916	-	94	59.686
ENSORLG00020008240	-	50	46.875	ENSORLG00020010038	-	55	46.875
ENSORLG00020008240	-	59	59.016	ENSORLG00020011149	-	95	59.016
ENSORLG00020008240	-	65	56.970	ENSORLG00020011234	-	97	56.970
ENSORLG00020008240	-	91	46.043	ENSORLG00020000639	-	100	45.802
ENSORLG00020008240	-	90	38.636	ENSORLG00020011808	-	99	38.636
ENSORLG00020008240	-	71	54.237	ENSORLG00020017483	-	97	54.237
ENSORLG00020008240	-	50	41.520	ENSORLG00020018685	znf319b	85	41.520
ENSORLG00020008240	-	82	38.155	ENSORLG00020004313	-	64	41.994
ENSORLG00020008240	-	56	44.444	ENSORLG00020004889	ZNF319	89	44.444
ENSORLG00020008240	-	59	56.129	ENSORLG00020010647	-	94	60.494
ENSORLG00020008240	-	78	61.272	ENSORLG00020009419	-	95	60.714
ENSORLG00020008240	-	71	46.106	ENSORLG00020009184	-	94	54.404
ENSORLG00020008240	-	63	58.286	ENSORLG00020010020	-	95	58.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020008240	-	52	63.750	ENSAPOG00000016615	-	88	63.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008240	-	68	50.388	ENSAPOG00000010645	-	89	50.388	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008240	-	65	45.872	ENSAPOG00000017148	-	60	45.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008240	-	73	54.839	ENSAPEG00000004256	-	99	54.839	Amphiprion_percula
ENSORLG00020008240	-	90	56.716	ENSATEG00000007658	-	96	56.716	Anabas_testudineus
ENSORLG00020008240	-	50	53.333	ENSAMXG00000013492	-	99	46.809	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008240	-	56	55.944	ENSCVAG00000016924	-	100	51.064	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008240	-	90	36.471	ENSCVAG00000011712	-	94	39.216	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008240	-	75	50.581	ENSCVAG00000018383	-	93	50.581	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008240	-	50	51.449	ENSEBUG00000000436	-	74	51.449	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008240	-	50	46.250	ENSEBUG00000015472	-	71	46.250	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008240	-	90	46.262	ENSELUG00000022942	-	94	46.262	Esox_lucius
ENSORLG00020008240	-	74	47.600	ENSELUG00000007694	-	85	47.600	Esox_lucius
ENSORLG00020008240	-	73	42.063	ENSELUG00000000423	-	85	42.400	Esox_lucius
ENSORLG00020008240	-	90	44.937	ENSELUG00000022965	-	94	50.340	Esox_lucius
ENSORLG00020008240	-	74	56.075	ENSGAFG00000021143	-	94	56.075	Gambusia_affinis
ENSORLG00020008240	-	90	53.333	ENSGAFG00000013366	-	99	53.333	Gambusia_affinis
ENSORLG00020008240	-	73	50.259	ENSHCOG00000001245	-	87	50.259	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	51	57.447	ENSHCOG00000001300	-	75	57.447	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	75	53.988	ENSHCOG00000014781	-	89	53.988	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	88	52.066	ENSHCOG00000015003	-	98	54.464	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	75	52.356	ENSHCOG00000001256	-	88	52.356	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	86	52.096	ENSHCOG00000020924	-	79	52.096	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	90	48.592	ENSHCOG00000020976	-	100	53.191	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	60	52.910	ENSHCOG00000007681	-	95	52.910	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	90	35.556	ENSHCOG00000008133	-	91	35.556	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	88	49.550	ENSHCOG00000009103	-	99	49.550	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	73	48.447	ENSHCOG00000014792	-	79	48.447	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	88	36.881	ENSHCOG00000014797	-	98	34.339	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	89	52.632	ENSHCOG00000001242	-	99	52.632	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	76	52.601	ENSHCOG00000015355	-	89	57.407	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	92	47.305	ENSHCOG00000019006	-	98	47.305	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	91	51.786	ENSHCOG00000014994	-	86	51.786	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	75	50.000	ENSHCOG00000001238	-	89	50.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	88	53.153	ENSHCOG00000014999	-	98	53.153	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008240	-	92	49.474	ENSIPUG00000020760	-	96	48.980	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020008240	-	91	46.405	ENSKMAG00000000556	-	99	47.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020008240	-	90	53.153	ENSLBEG00000008733	-	98	53.153	Labrus_bergylta
ENSORLG00020008240	-	73	45.638	ENSMZEG00005026942	-	79	45.638	Maylandia_zebra
ENSORLG00020008240	-	51	59.459	ENSMMOG00000006322	-	82	59.459	Mola_mola
ENSORLG00020008240	-	90	56.250	ENSONIG00000011529	-	98	42.857	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020008240	-	50	46.316	ENSONIG00000018151	-	98	46.316	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020008240	-	73	54.974	ENSORLG00000013863	-	99	54.974	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	75	55.172	ENSORLG00000026684	-	99	55.172	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	100	97.778	ENSORLG00000025200	-	100	97.778	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	76	56.522	ENSORLG00000027053	-	92	56.522	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	74	57.447	ENSORLG00000028433	-	98	58.382	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	75	60.870	ENSORLG00000000247	-	98	60.870	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	73	53.571	ENSORLG00000030610	-	78	53.571	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	71	56.886	ENSORLG00000023744	-	98	56.522	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	74	53.769	ENSORLG00000001749	-	91	57.471	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	75	60.714	ENSORLG00000027974	-	93	60.714	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	74	56.354	ENSORLG00000028381	-	96	58.929	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	75	59.420	ENSORLG00000029896	-	99	60.366	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	68	65.263	ENSORLG00000023806	-	92	65.263	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	76	56.522	ENSORLG00000025540	-	92	56.522	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	72	45.646	ENSORLG00000027303	-	98	47.130	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	75	60.847	ENSORLG00000023086	-	98	60.847	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	71	47.651	ENSORLG00000025702	-	96	47.107	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	73	58.721	ENSORLG00000027575	-	94	58.721	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008240	-	73	57.143	ENSORLG00000000557	-	99	57.143	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020008240	-	92	43.662	ENSSDUG00000019911	-	98	43.662	Seriola_dumerili
ENSORLG00020008240	-	52	53.289	ENSSLDG00000001860	-	88	52.809	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020008240	-	75	41.772	ENSXCOG00000008056	-	74	41.772	Xiphophorus_couchianus