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Description
Ensembl ID
ENSORLG00020008266 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
MSI1
Alias
-
Full Name
RNA-binding protein Musashi homolog 1
Gene Type
protein_coding
Species
Oryzias_latipes_hni
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
34246 bases
Position
chr5:17649482-17683727
Accession
101154771
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSORLP00020007332RRM_1PF00076.221.8e-3412
ENSORLP00020007332RRM_1PF00076.221.8e-3422
ENSORLP00020025990RRM_1PF00076.222.6e-3412
ENSORLP00020025990RRM_1PF00076.222.6e-3422
ENSORLP00020007373RRM_1PF00076.225.9e-3412
ENSORLP00020007373RRM_1PF00076.225.9e-3422
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
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Gene Model
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSORLG00020008266MSI15935.979ENSORLG00020006043-6336.022
ENSORLG00020008266MSI15935.676ENSORLG00020007109-8932.099
ENSORLG00020008266MSI15642.529ENSORLG00020006582hnrnpa1a8441.667
ENSORLG00020008266MSI18133.588ENSORLG00020022498-8833.588
ENSORLG00020008266MSI15735.928ENSORLG00020006029-5935.928
ENSORLG00020008266MSI15444.379ENSORLG00020007776hnrnpabb9336.789
ENSORLG00020008266MSI19986.930ENSORLG00020001208-7190.909
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ENSORLG00020008266MSI16135.567ENSORLG00020007505-9331.338
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ENSORLG00020008266MSI19777.682ENSORLG00020021556msi2a9474.576
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ENSORLG00020008266MSI15444.970ENSORLG00020012133hnrnpaba8535.540
ENSORLG00020008266MSI15637.158ENSORLG00020007148hnrnpa0a5338.172
ENSORLG00020008266MSI15935.294ENSORLG00020008203-6335.602
ENSORLG00020008266MSI15237.079ENSORLG00020005859rbm24a8638.636
ENSORLG00020008266MSI15533.714ENSORLG00020022487-8133.333
ENSORLG00020008266MSI15433.918ENSORLG00020021206tardbp5535.329
ENSORLG00020008266MSI15134.356ENSORLG00020007084-7435.484
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSG00000135097MSI19986.207Homo_sapiens
ENSORLG00020008266MSI19996.370ENSAPOG00000003191MSI110098.281Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008266MSI19986.626ENSAPOG00000023458-10091.168Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008266MSI19967.680ENSAMEG00000013302MSI18392.308Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020008266MSI19396.831ENSACIG00000017754-7993.016Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020008266MSI19985.580ENSAOCG00000009031-9885.266Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008266MSI19694.444ENSAOCG00000003804MSI110098.281Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008266MSI19986.626ENSAPEG00000006857-8591.193Amphiprion_percula
ENSORLG00020008266MSI19694.444ENSAPEG00000003245MSI110098.281Amphiprion_percula
ENSORLG00020008266MSI19986.792ENSATEG00000017059MSI110086.835Anabas_testudineus
ENSORLG00020008266MSI19989.362ENSATEG00000023779-10090.085Anabas_testudineus
ENSORLG00020008266MSI19982.647ENSACAG00000002762MSI110084.254Anolis_carolinensis
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSANAG00000027151MSI110083.791Aotus_nancymaae
ENSORLG00020008266MSI18081.955ENSANAG00000027901-8882.986Aotus_nancymaae
ENSORLG00020008266MSI110090.596ENSACLG00000011230MSI110096.296Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020008266MSI19492.355ENSACLG00000000117-10092.355Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020008266MSI19988.333ENSAMXG00000038960msi17688.401Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008266MSI19987.888ENSBTAG00000009800MSI110087.888Bos_taurus
ENSORLG00020008266MSI19986.970ENSCJAG00000008578MSI110083.791Callithrix_jacchus
ENSORLG00020008266MSI19982.749ENSCAFG00000010283MSI110083.516Canis_familiaris
ENSORLG00020008266MSI19981.994ENSCAFG00020020585MSI110085.209Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020008266MSI19982.319ENSCHIG00000024304MSI110082.385Capra_hircus
ENSORLG00020008266MSI19982.263ENSTSYG00000033949MSI19585.321Carlito_syrichta
ENSORLG00020008266MSI19485.348ENSCAPG00000003919MSI17885.348Cavia_aperea
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSCPOG00000012361MSI110085.965Cavia_porcellus
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSCCAG00000035567MSI110083.791Cebus_capucinus
ENSORLG00020008266MSI19985.241ENSCATG00000030019MSI110083.791Cercocebus_atys
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSCLAG00000011329MSI110085.965Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020008266MSI17391.518ENSCSAG00000002265MSI19682.437Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020008266MSI19989.557ENSCPBG00000011349MSI110086.402Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020008266MSI19982.317ENSCANG00000040651MSI110085.366Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSCGRG00001018883Msi110083.791Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020008266MSI19982.371ENSCGRG00000002191Msi17285.410Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020008266MSI19989.881ENSCSEG00000005834-10096.571Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020008266MSI19989.590ENSCSEG00000008352-10090.000Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020008266MSI19988.274ENSCSEG00000011032MSI110088.274Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020008266MSI19991.167ENSCVAG00000009100MSI110091.714Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008266MSI16180.556ENSCVAG00000017463-8980.556Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008266MSI15265.000ENSCVAG00000017430zgc:1107969473.134Cyprinodon_variegatus
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ENSORLG00020008266MSI19989.527ENSDARG00000010710msi110092.056Danio_rerio
ENSORLG00020008266MSI19979.114ENSDNOG00000005713MSI19182.278Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020008266MSI19981.737ENSDORG00000005610Msi19484.731Dipodomys_ordii
ENSORLG00020008266MSI19979.878ENSETEG00000004756MSI110082.622Echinops_telfairi
ENSORLG00020008266MSI19987.926ENSEASG00005004736MSI19887.926Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020008266MSI19987.273ENSECAG00000017526MSI110083.791Equus_caballus
ENSORLG00020008266MSI19987.188ENSELUG00000023280-10087.188Esox_lucius
ENSORLG00020008266MSI19684.494ENSELUG00000023219MSI19285.100Esox_lucius
ENSORLG00020008266MSI19986.970ENSFCAG00000011007MSI110083.791Felis_catus
ENSORLG00020008266MSI19985.000ENSFALG00000007574MSI110088.333Ficedula_albicollis
ENSORLG00020008266MSI19982.012ENSFDAG00000019586MSI110085.061Fukomys_damarensis
ENSORLG00020008266MSI19988.040ENSFHEG00000022446MSI110091.453Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020008266MSI19994.888ENSFHEG00000003560-10098.286Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020008266MSI19986.239ENSGMOG00000001006MSI19989.971Gadus_morhua
ENSORLG00020008266MSI19980.120ENSGMOG00000017838-10085.876Gadus_morhua
ENSORLG00020008266MSI19985.115ENSGALG00000007227MSI19677.273Gallus_gallus
ENSORLG00020008266MSI19475.667ENSGAFG00000005860-10069.405Gambusia_affinis
ENSORLG00020008266MSI110092.429ENSGAFG00000021522MSI19498.165Gambusia_affinis
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ENSORLG00020008266MSI19982.698ENSGACG00000008674-10087.603Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020008266MSI19990.385ENSGAGG00000016037MSI110086.119Gopherus_agassizii
ENSORLG00020008266MSI19981.847ENSGGOG00000010328MSI110085.032Gorilla_gorilla
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ENSORLG00020008266MSI19692.442ENSHBUG00000021921MSI110096.296Haplochromis_burtoni
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ENSORLG00020008266MSI19982.012ENSHGLG00100016848MSI110085.061Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020008266MSI19991.892ENSHCOG00000012067-10086.441Hippocampus_comes
ENSORLG00020008266MSI19996.091ENSHCOG00000012019MSI110096.091Hippocampus_comes
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ENSORLG00020008266MSI19981.994ENSSTOG00000009799MSI110085.209Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020008266MSI19974.847ENSJJAG00000010643-10071.389Jaculus_jaculus
ENSORLG00020008266MSI19984.273ENSJJAG00000010463Msi110083.791Jaculus_jaculus
ENSORLG00020008266MSI19987.462ENSKMAG00000011251MSI110091.691Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020008266MSI19999.349ENSKMAG00000019877-10099.349Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020008266MSI19997.143ENSLBEG00000001375-10097.143Labrus_bergylta
ENSORLG00020008266MSI19992.581ENSLBEG00000008789MSI110091.453Labrus_bergylta
ENSORLG00020008266MSI19981.471ENSLACG00000018287MSI110082.749Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020008266MSI15174.444ENSLOCG00000008618zgc:1107967175.893Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020008266MSI19379.016ENSLAFG00000009412MSI110078.689Loxodonta_africana
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSMFAG00000001798MSI110085.965Macaca_fascicularis
ENSORLG00020008266MSI19983.041ENSMMUG00000031527MSI19685.057Macaca_mulatta
ENSORLG00020008266MSI19987.926ENSMNEG00000040034MSI19887.926Macaca_nemestrina
ENSORLG00020008266MSI19982.317ENSMLEG00000003921MSI110085.366Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020008266MSI110097.161ENSMAMG00000018426-10097.994Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020008266MSI19689.474ENSMAMG00000002279MSI110091.404Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020008266MSI19990.852ENSMZEG00005000340-10091.429Maylandia_zebra
ENSORLG00020008266MSI19692.442ENSMZEG00005026892MSI110096.296Maylandia_zebra
ENSORLG00020008266MSI17291.716ENSMGAG00000016518-10091.716Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020008266MSI17391.518ENSMAUG00000016820Msi110088.477Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020008266MSI19983.976ENSMICG00000033181MSI110083.791Microcebus_murinus
ENSORLG00020008266MSI19982.749ENSMOCG00000002286Msi110083.516Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020008266MSI19995.380ENSMMOG00000012265-9995.380Mola_mola
ENSORLG00020008266MSI19985.397ENSMMOG00000010492MSI19685.397Mola_mola
ENSORLG00020008266MSI19357.831ENSMODG00000003189-10059.036Monodelphis_domestica
ENSORLG00020008266MSI19988.889ENSMALG00000017889MSI110091.429Monopterus_albus
ENSORLG00020008266MSI19997.068ENSMALG00000001426-10097.068Monopterus_albus
ENSORLG00020008266MSI19982.749MGP_CAROLIEiJ_G0027626Msi19889.354Mus_caroli
ENSORLG00020008266MSI19985.185ENSMUSG00000054256Msi19889.354Mus_musculus
ENSORLG00020008266MSI19985.758MGP_PahariEiJ_G0024206Msi19889.695Mus_pahari
ENSORLG00020008266MSI19982.749MGP_SPRETEiJ_G0028624Msi19889.354Mus_spretus
ENSORLG00020008266MSI19981.994ENSMPUG00000003168MSI110085.209Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020008266MSI19973.512ENSMLUG00000010313MSI110076.488Myotis_lucifugus
ENSORLG00020008266MSI19982.371ENSNGAG00000014508Msi19880.055Nannospalax_galili
ENSORLG00020008266MSI19990.852ENSNBRG00000000841-10091.429Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020008266MSI18687.705ENSNBRG00000018012MSI19789.873Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020008266MSI19372.561ENSNLEG00000015636MSI110075.610Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020008266MSI19963.415ENSMEUG00000015759MSI110066.463Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020008266MSI19674.603ENSOPRG00000016879MSI110077.778Ochotona_princeps
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