EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020008454 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: celf4
Alias: -
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 102509 bases
Position: chr5:17076644-17179152
Accession: 101170176
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020007586	RRM_1	PF00076.22	4.4e-53	1	3
ENSORLP00020007586	RRM_1	PF00076.22	4.4e-53	2	3
ENSORLP00020007586	RRM_1	PF00076.22	4.4e-53	3	3
ENSORLP00020007565	RRM_1	PF00076.22	3.1e-34	1	2
ENSORLP00020007565	RRM_1	PF00076.22	3.1e-34	2	2
ENSORLP00020026132	RRM_1	PF00076.22	2e-30	1	3
ENSORLP00020026132	RRM_1	PF00076.22	2e-30	2	3
ENSORLP00020026132	RRM_1	PF00076.22	2e-30	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020002672	-	2663	-	ENSORLP00020007565	525 (aa)	-	-
ENSORLT00020002664	-	1278	-	ENSORLP00020026132	425 (aa)	-	-
ENSORLT00020002633	-	2249	-	ENSORLP00020007586	524 (aa)	XP_011473443	UPI0005CC4BDB

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020008454	celf4	50	45.679	ENSORLG00020019326	elavl1a	89	45.679
ENSORLG00020008454	celf4	58	41.975	ENSORLG00020016040	ELAVL2	84	41.975
ENSORLG00020008454	celf4	73	32.222	ENSORLG00020013161	tia1l	53	34.568
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.019	ENSORLG00020021262	si:dkey-205h23.2	98	95.238
ENSORLG00020008454	celf4	60	30.556	ENSORLG00020021193	pabpc1l	58	34.884
ENSORLG00020008454	celf4	96	37.282	ENSORLG00020015261	-	96	41.575
ENSORLG00020008454	celf4	62	32.099	ENSORLG00020016803	rbms2a	52	32.099
ENSORLG00020008454	celf4	61	40.260	ENSORLG00020022674	RBMS3	76	40.789
ENSORLG00020008454	celf4	58	31.818	ENSORLG00020021205	tia1	94	34.177
ENSORLG00020008454	celf4	92	66.132	ENSORLG00020008839	celf3b	100	65.927
ENSORLG00020008454	celf4	58	41.860	ENSORLG00020004570	elavl3	85	41.860
ENSORLG00020008454	celf4	58	47.436	ENSORLG00020012447	-	87	46.914
ENSORLG00020008454	celf4	92	69.355	ENSORLG00020003560	celf5a	91	65.079
ENSORLG00020008454	celf4	78	64.234	ENSORLG00020006562	-	100	45.736
ENSORLG00020008454	celf4	92	66.667	ENSORLG00020007978	celf3a	100	65.784
ENSORLG00020008454	celf4	55	40.741	ENSORLG00020014277	elavl4	73	40.741

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020008454	celf4	100	75.277	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.619	ENSAPOG00000002964	celf4	100	99.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008454	celf4	89	75.052	ENSAMEG00000017059	CELF4	99	75.464	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020008454	celf4	100	80.769	ENSACIG00000018097	celf4	100	80.769	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.619	ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008454	celf4	56	61.333	ENSAOCG00000019919	-	80	61.333	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008454	celf4	100	84.009	ENSAPEG00000002940	celf4	99	82.543	Amphiprion_percula
ENSORLG00020008454	celf4	100	84.009	ENSATEG00000023731	celf4	100	84.009	Anabas_testudineus
ENSORLG00020008454	celf4	88	76.253	ENSAPLG00000007830	-	100	76.253	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020008454	celf4	53	76.518	ENSACAG00000012428	CELF4	92	78.879	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSANAG00000029499	CELF4	99	75.368	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.429	ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020008454	celf4	100	93.905	ENSAMXG00000007935	celf4	100	94.095	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008454	celf4	86	92.683	ENSBTAG00000004940	CELF4	99	92.683	Bos_taurus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.251	ENSCJAG00000021135	CELF4	99	75.514	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020008454	celf4	86	92.683	ENSCHIG00000007169	CELF4	99	92.683	Capra_hircus
ENSORLG00020008454	celf4	94	71.496	ENSTSYG00000000816	CELF4	85	74.584	Carlito_syrichta
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.616	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	74.908	Cavia_porcellus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSCCAG00000028373	CELF4	99	75.368	Cebus_capucinus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.251	ENSCATG00000045293	CELF4	99	75.514	Cercocebus_atys
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.860	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	79.151	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020008454	celf4	90	78.372	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	81.170	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020008454	celf4	93	75.127	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	76.142	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSCANG00000036735	CELF4	99	75.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020008454	celf4	78	70.673	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	73.529	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.238	ENSCSEG00000007074	celf4	99	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020008454	celf4	100	83.015	ENSCVAG00000017617	celf4	99	83.015	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008454	celf4	100	95.038	ENSDARG00000070045	celf4	100	96.535	Danio_rerio
ENSORLG00020008454	celf4	90	76.296	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	79.259	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.860	ENSDORG00000007169	Celf4	99	79.151	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020008454	celf4	84	77.241	ENSETEG00000007432	-	73	77.241	Echinops_telfairi
ENSORLG00020008454	celf4	100	74.633	ENSEASG00005016534	CELF4	99	77.778	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.251	ENSECAG00000008810	CELF4	79	96.552	Equus_caballus
ENSORLG00020008454	celf4	89	75.000	ENSEEUG00000003763	CELF4	86	81.696	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.311	ENSFCAG00000045234	CELF4	99	77.941	Felis_catus
ENSORLG00020008454	celf4	90	79.389	ENSFALG00000009188	CELF4	98	81.425	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020008454	celf4	100	74.170	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	74.354	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020008454	celf4	100	97.669	ENSFHEG00000003431	celf4	99	97.669	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020008454	celf4	100	93.478	ENSGMOG00000008703	celf4	91	93.478	Gadus_morhua
ENSORLG00020008454	celf4	79	92.683	ENSGMOG00000011747	-	75	92.683	Gadus_morhua
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.046	ENSGAFG00000021515	celf4	99	98.361	Gambusia_affinis
ENSORLG00020008454	celf4	100	91.651	ENSGACG00000008752	celf4	100	91.445	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020008454	celf4	68	87.372	ENSGAGG00000023014	-	98	88.737	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020008454	celf4	71	85.185	ENSGAGG00000017672	-	86	90.217	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSGGOG00000013920	CELF4	99	75.368	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.618	ENSHBUG00000021618	celf4	100	99.618	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020008454	celf4	100	74.845	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	75.464	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.306	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	78.598	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020008454	celf4	100	81.064	ENSHCOG00000012195	celf4	99	80.266	Hippocampus_comes
ENSORLG00020008454	celf4	100	84.190	ENSIPUG00000010810	celf4	83	92.431	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.122	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	78.413	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020008454	celf4	100	98.667	ENSKMAG00000019602	celf4	100	98.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020008454	celf4	100	83.369	ENSLBEG00000000940	celf4	99	83.369	Labrus_bergylta
ENSORLG00020008454	celf4	93	80.397	ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.819	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.113	Loxodonta_africana
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSMFAG00000042983	CELF4	99	75.368	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020008454	celf4	100	75.277	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	75.052	Macaca_mulatta
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.311	ENSMNEG00000033449	CELF4	99	77.941	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020008454	celf4	92	74.187	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	74.390	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020008454	celf4	100	84.009	ENSMAMG00000018573	celf4	99	82.543	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020008454	celf4	100	82.151	ENSMZEG00005026879	celf4	99	82.151	Maylandia_zebra
ENSORLG00020008454	celf4	79	50.737	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	63.037	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.251	ENSMICG00000006984	CELF4	99	75.514	Microcebus_murinus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.491	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	78.782	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020008454	celf4	100	82.942	ENSMMOG00000012281	celf4	100	82.942	Mola_mola
ENSORLG00020008454	celf4	78	70.757	ENSMODG00000000306	CELF4	91	71.018	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.619	ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	Monopterus_albus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.675	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	99	78.967	Mus_caroli
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.903	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	80.337	Mus_musculus
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.675	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	99	78.967	Mus_pahari
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.675	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	99	78.967	Mus_spretus
ENSORLG00020008454	celf4	94	70.794	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	72.642	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020008454	celf4	90	76.585	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	79.512	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020008454	celf4	100	78.967	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	79.151	Nannospalax_galili
ENSORLG00020008454	celf4	100	82.151	ENSNBRG00000018194	celf4	99	82.151	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020008454	celf4	78	70.466	ENSMEUG00000007202	-	92	92.593	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020008454	celf4	83	80.696	ENSOPRG00000014415	CELF4	89	86.555	Ochotona_princeps
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.860	ENSODEG00000018464	CELF4	99	79.151	Octodon_degus
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.809	ENSONIG00000019463	celf4	100	99.809	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020008454	celf4	88	78.224	ENSOCUG00000024790	CELF4	81	78.647	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020008454	celf4	100	100.000	ENSORLG00000008913	celf4	100	100.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008454	celf4	100	100.000	ENSORLG00015004115	celf4	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020008454	celf4	100	99.810	ENSOMEG00000002391	celf4	100	99.810	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020008454	celf4	94	78.824	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	81.412	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020008454	celf4	68	80.573	ENSOARG00000005276	CELF4	100	80.573	Ovis_aries
ENSORLG00020008454	celf4	92	77.439	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	77.642	Pan_paniscus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSPPRG00000007683	CELF4	99	75.368	Panthera_pardus
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSPTRG00000009982	CELF4	99	75.368	Pan_troglodytes
ENSORLG00020008454	celf4	100	73.101	ENSPANG00000006365	CELF4	99	75.368	Papio_anubis
ENSORLG00020008454	celf4	100	87.097	ENSPKIG00000017421	celf4	100	87.666	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020008454	celf4	90	79.389	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	81.425	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020008454	celf4	100	77.675	ENSPEMG00000019299	Celf4	99	78.967	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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