EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020008484 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36474 bases
Position: chr2:7193296-7229769
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	1	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	2	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	3	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	4	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	5	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	6	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	7	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	8	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	9	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	10	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	11	12
ENSORLP00020007611	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-70	12	12
ENSORLP00020007611	zf-met	PF12874.7	1.8e-12	1	3
ENSORLP00020007611	zf-met	PF12874.7	1.8e-12	2	3
ENSORLP00020007611	zf-met	PF12874.7	1.8e-12	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020002594	-	1239	-	ENSORLP00020007611	412 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020008484	-	98	54.630	ENSORLG00020006148	-	67	54.630
ENSORLG00020008484	-	83	61.058	ENSORLG00020004353	-	98	61.058
ENSORLG00020008484	-	97	47.273	ENSORLG00020007599	-	74	41.404
ENSORLG00020008484	-	98	60.927	ENSORLG00020009419	-	88	70.455
ENSORLG00020008484	-	81	52.830	ENSORLG00020010950	-	97	52.830
ENSORLG00020008484	-	76	43.200	ENSORLG00020005132	-	67	43.200
ENSORLG00020008484	-	99	37.179	ENSORLG00020012229	zbtb41	50	37.179
ENSORLG00020008484	-	95	40.952	ENSORLG00020001912	znf236	76	40.602
ENSORLG00020008484	-	83	56.281	ENSORLG00020007074	-	95	54.802
ENSORLG00020008484	-	98	54.187	ENSORLG00020000246	-	94	54.187
ENSORLG00020008484	-	86	36.741	ENSORLG00020000009	znf710b	51	37.354
ENSORLG00020008484	-	83	49.231	ENSORLG00020016037	-	94	46.825
ENSORLG00020008484	-	91	37.500	ENSORLG00020006144	-	70	38.806
ENSORLG00020008484	-	85	50.000	ENSORLG00020019227	-	51	50.000
ENSORLG00020008484	-	84	46.951	ENSORLG00020016666	-	64	45.596
ENSORLG00020008484	-	80	34.483	ENSORLG00020012967	scrt1b	54	38.961
ENSORLG00020008484	-	81	40.909	ENSORLG00020008787	snai2	55	40.909
ENSORLG00020008484	-	82	40.206	ENSORLG00020006433	-	80	40.206
ENSORLG00020008484	-	97	58.252	ENSORLG00020009857	-	95	59.877
ENSORLG00020008484	-	98	51.261	ENSORLG00020009089	-	74	51.392
ENSORLG00020008484	-	67	45.299	ENSORLG00020001922	-	57	43.846
ENSORLG00020008484	-	83	38.554	ENSORLG00020002817	GFI1	52	38.554
ENSORLG00020008484	-	92	56.856	ENSORLG00020007018	-	90	56.856
ENSORLG00020008484	-	87	48.387	ENSORLG00020009139	-	99	48.387
ENSORLG00020008484	-	98	55.455	ENSORLG00020021857	-	64	51.015
ENSORLG00020008484	-	97	53.191	ENSORLG00020008240	-	63	53.191
ENSORLG00020008484	-	86	51.211	ENSORLG00020000481	-	85	50.160
ENSORLG00020008484	-	84	52.174	ENSORLG00020016754	-	94	49.587
ENSORLG00020008484	-	88	38.246	ENSORLG00020018791	-	88	36.607
ENSORLG00020008484	-	98	54.779	ENSORLG00020011234	-	91	54.779
ENSORLG00020008484	-	99	48.551	ENSORLG00020017850	-	98	47.324
ENSORLG00020008484	-	98	55.307	ENSORLG00020008933	-	89	55.307
ENSORLG00020008484	-	86	40.994	ENSORLG00020018503	-	72	40.884
ENSORLG00020008484	-	81	45.860	ENSORLG00020020419	-	74	43.713
ENSORLG00020008484	-	99	60.000	ENSORLG00020009943	-	96	57.511
ENSORLG00020008484	-	92	48.731	ENSORLG00020015703	-	63	48.731
ENSORLG00020008484	-	96	60.550	ENSORLG00020010804	-	95	61.783
ENSORLG00020008484	-	97	65.939	ENSORLG00020010560	-	100	55.523
ENSORLG00020008484	-	97	57.246	ENSORLG00020010953	-	87	54.545
ENSORLG00020008484	-	98	58.424	ENSORLG00020010020	-	93	58.424
ENSORLG00020008484	-	93	43.103	ENSORLG00020000219	-	86	43.103
ENSORLG00020008484	-	81	35.526	ENSORLG00020001758	-	55	35.526
ENSORLG00020008484	-	98	46.763	ENSORLG00020001707	-	92	46.763
ENSORLG00020008484	-	83	39.375	ENSORLG00020003719	GFI1B	59	39.375
ENSORLG00020008484	-	92	35.821	ENSORLG00020011478	scrt2	53	35.821
ENSORLG00020008484	-	94	36.577	ENSORLG00020002128	-	99	34.266
ENSORLG00020008484	-	82	41.827	ENSORLG00020018921	-	76	41.827
ENSORLG00020008484	-	98	48.521	ENSORLG00020017164	-	99	49.107
ENSORLG00020008484	-	84	30.272	ENSORLG00020004162	znf341	51	32.164
ENSORLG00020008484	-	81	45.122	ENSORLG00020019341	-	86	64.706
ENSORLG00020008484	-	97	47.619	ENSORLG00020021196	-	62	44.800
ENSORLG00020008484	-	96	67.606	ENSORLG00020010880	-	74	67.606
ENSORLG00020008484	-	88	36.364	ENSORLG00020009554	-	75	36.364
ENSORLG00020008484	-	93	31.858	ENSORLG00020010285	znf646	87	31.858
ENSORLG00020008484	-	85	36.202	ENSORLG00020018051	prdm5	78	37.826
ENSORLG00020008484	-	83	34.932	ENSORLG00020007790	zbtb48	53	34.932
ENSORLG00020008484	-	96	44.444	ENSORLG00020010038	-	73	44.444
ENSORLG00020008484	-	99	36.592	ENSORLG00020018495	-	69	36.592
ENSORLG00020008484	-	95	45.794	ENSORLG00020000639	-	56	45.455
ENSORLG00020008484	-	97	58.607	ENSORLG00020010250	-	94	55.333
ENSORLG00020008484	-	85	35.168	ENSORLG00020008744	-	67	40.367
ENSORLG00020008484	-	99	54.701	ENSORLG00020010171	-	96	56.061
ENSORLG00020008484	-	98	66.289	ENSORLG00020008891	-	82	66.289
ENSORLG00020008484	-	97	58.706	ENSORLG00020000161	-	86	58.706
ENSORLG00020008484	-	85	57.265	ENSORLG00020008424	-	86	57.265
ENSORLG00020008484	-	98	61.585	ENSORLG00020004370	-	94	61.585
ENSORLG00020008484	-	97	47.549	ENSORLG00020017528	-	88	47.549
ENSORLG00020008484	-	98	56.710	ENSORLG00020010916	-	79	55.584
ENSORLG00020008484	-	93	38.621	ENSORLG00020006820	-	78	38.621
ENSORLG00020008484	-	99	54.348	ENSORLG00020011075	-	90	55.357
ENSORLG00020008484	-	98	60.156	ENSORLG00020008346	-	98	58.883
ENSORLG00020008484	-	98	45.833	ENSORLG00020017483	-	94	47.164
ENSORLG00020008484	-	88	62.814	ENSORLG00020009180	-	89	62.814
ENSORLG00020008484	-	83	48.760	ENSORLG00020017514	-	80	48.760
ENSORLG00020008484	-	99	61.429	ENSORLG00020010636	-	84	61.429
ENSORLG00020008484	-	97	53.097	ENSORLG00020009184	-	91	52.536
ENSORLG00020008484	-	81	39.286	ENSORLG00020019789	snai1a	55	39.286
ENSORLG00020008484	-	95	57.468	ENSORLG00020011149	-	94	59.770
ENSORLG00020008484	-	81	44.578	ENSORLG00020010932	-	89	44.578
ENSORLG00020008484	-	98	55.392	ENSORLG00020008018	-	80	55.392
ENSORLG00020008484	-	83	37.283	ENSORLG00020004889	ZNF319	89	37.283
ENSORLG00020008484	-	91	46.091	ENSORLG00020018069	-	96	45.000
ENSORLG00020008484	-	96	59.298	ENSORLG00020010647	-	93	55.556
ENSORLG00020008484	-	82	51.034	ENSORLG00020009965	-	88	47.210
ENSORLG00020008484	-	82	36.047	ENSORLG00020018685	znf319b	85	34.930
ENSORLG00020008484	-	81	45.283	ENSORLG00020007339	sall4	50	45.283
ENSORLG00020008484	-	98	56.784	ENSORLG00020007967	-	94	54.412
ENSORLG00020008484	-	84	36.765	ENSORLG00020001791	-	51	36.765

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020008484	-	83	51.852	ENSAPOG00000016615	-	89	51.852	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008484	-	97	45.631	ENSAPOG00000010645	-	72	45.631	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008484	-	99	49.438	ENSAPOG00000014372	-	92	49.438	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008484	-	84	52.500	ENSAPOG00000010330	-	73	52.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008484	-	86	47.953	ENSAPOG00000000601	-	67	52.542	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008484	-	80	40.741	ENSAOCG00000007347	-	81	40.741	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008484	-	93	51.163	ENSAPEG00000004256	-	96	51.163	Amphiprion_percula
ENSORLG00020008484	-	86	50.365	ENSATEG00000007658	-	74	45.291	Anabas_testudineus
ENSORLG00020008484	-	87	43.284	ENSAMXG00000037695	-	51	43.284	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008484	-	99	40.000	ENSAMXG00000013492	-	96	42.570	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008484	-	83	45.000	ENSCING00000024717	-	75	45.000	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020008484	-	89	38.816	ENSCVAG00000011712	-	64	34.831	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008484	-	93	36.432	ENSCVAG00000018383	-	87	37.717	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008484	-	82	51.429	ENSCVAG00000016924	-	55	50.000	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008484	-	87	44.300	ENSEBUG00000001569	-	92	44.300	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	85	41.081	ENSEBUG00000001308	-	64	41.081	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	91	47.879	ENSEBUG00000000436	-	97	47.879	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	88	45.946	ENSEBUG00000003232	-	67	45.946	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	82	48.256	ENSEBUG00000006666	-	84	48.256	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	97	46.154	ENSEBUG00000015472	-	74	46.154	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	82	45.509	ENSEBUG00000000422	-	63	45.509	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	85	46.296	ENSEBUG00000013126	-	52	46.296	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	90	44.172	ENSEBUG00000012543	-	65	43.195	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	84	49.746	ENSEBUG00000013874	-	50	49.746	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	90	42.298	ENSEBUG00000014768	-	83	42.298	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	84	43.939	ENSEBUG00000003418	-	95	45.763	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	88	47.549	ENSEBUG00000004992	-	62	47.549	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008484	-	93	52.174	ENSELUG00000000281	-	83	47.674	Esox_lucius
ENSORLG00020008484	-	94	47.660	ENSELUG00000007694	-	88	42.640	Esox_lucius
ENSORLG00020008484	-	84	44.872	ENSELUG00000000423	-	51	44.872	Esox_lucius
ENSORLG00020008484	-	84	46.405	ENSELUG00000022965	-	52	46.405	Esox_lucius
ENSORLG00020008484	-	98	43.426	ENSELUG00000022942	-	69	43.426	Esox_lucius
ENSORLG00020008484	-	86	42.963	ENSGMOG00000005588	-	100	42.963	Gadus_morhua
ENSORLG00020008484	-	95	44.545	ENSGMOG00000016007	-	88	44.545	Gadus_morhua
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