EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020008744 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9153 bases
Position: chr23:18879475-18888627
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	1	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	2	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	3	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	4	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	5	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	6	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	7	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	8	9
ENSORLP00020026332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-61	9	9
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	1	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	2	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	3	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	4	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	5	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	6	7
ENSORLP00020026313	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-40	7	7
ENSORLP00020026332	zf-met	PF12874.7	7.5e-12	1	1
ENSORLP00020026313	zf-met	PF12874.7	1.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020002185	-	4920	-	ENSORLP00020026332	1055 (aa)	-	-
ENSORLT00020002220	-	2142	-	ENSORLP00020026313	713 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020008744	-	73	41.445	ENSORLG00020010560	-	99	41.445
ENSORLG00020008744	-	68	41.951	ENSORLG00020008240	-	50	41.951
ENSORLG00020008744	-	67	40.254	ENSORLG00020010953	-	77	40.254
ENSORLG00020008744	-	50	46.667	ENSORLG00020010950	-	96	46.667
ENSORLG00020008744	-	64	38.516	ENSORLG00020021857	-	53	38.516
ENSORLG00020008744	-	67	40.654	ENSORLG00020009184	-	96	40.654
ENSORLG00020008744	-	85	40.805	ENSORLG00020009943	-	99	39.912
ENSORLG00020008744	-	74	43.191	ENSORLG00020010636	-	87	43.191
ENSORLG00020008744	-	94	38.057	ENSORLG00020016116	-	95	38.057
ENSORLG00020008744	-	71	42.688	ENSORLG00020007967	-	93	42.347
ENSORLG00020008744	-	64	33.916	ENSORLG00020018495	-	78	31.949
ENSORLG00020008744	-	70	43.214	ENSORLG00020018069	-	94	43.214
ENSORLG00020008744	-	67	35.985	ENSORLG00020007599	-	75	36.364
ENSORLG00020008744	-	78	33.623	ENSORLG00020008018	-	92	36.675
ENSORLG00020008744	-	68	34.185	ENSORLG00020000009	znf710b	53	34.185
ENSORLG00020008744	-	67	39.437	ENSORLG00020011234	-	78	39.437
ENSORLG00020008744	-	67	39.773	ENSORLG00020002817	GFI1	55	42.331
ENSORLG00020008744	-	68	42.081	ENSORLG00020007018	-	88	42.081
ENSORLG00020008744	-	70	39.773	ENSORLG00020003719	GFI1B	85	39.773
ENSORLG00020008744	-	67	40.367	ENSORLG00020008484	-	85	35.168
ENSORLG00020008744	-	67	37.576	ENSORLG00020000246	-	86	37.576
ENSORLG00020008744	-	68	36.975	ENSORLG00020018503	-	81	34.137
ENSORLG00020008744	-	67	41.379	ENSORLG00020006148	-	62	41.379
ENSORLG00020008744	-	71	32.877	ENSORLG00020010937	patz1	57	30.802
ENSORLG00020008744	-	68	42.424	ENSORLG00020000161	-	89	42.424
ENSORLG00020008744	-	67	32.353	ENSORLG00020018685	znf319b	86	35.681
ENSORLG00020008744	-	67	44.275	ENSORLG00020000481	-	96	40.574
ENSORLG00020008744	-	61	39.796	ENSORLG00020004370	-	72	43.452
ENSORLG00020008744	-	67	39.738	ENSORLG00020009180	-	82	48.515
ENSORLG00020008744	-	70	44.898	ENSORLG00020009419	-	89	45.122
ENSORLG00020008744	-	70	36.283	ENSORLG00020016666	-	91	40.404
ENSORLG00020008744	-	67	43.028	ENSORLG00020009139	-	98	38.785
ENSORLG00020008744	-	67	39.919	ENSORLG00020001707	-	76	43.636
ENSORLG00020008744	-	73	45.411	ENSORLG00020016037	-	93	42.857
ENSORLG00020008744	-	77	42.169	ENSORLG00020000219	-	95	46.316
ENSORLG00020008744	-	67	38.605	ENSORLG00020004353	-	99	38.605
ENSORLG00020008744	-	67	43.802	ENSORLG00020007074	-	99	43.802
ENSORLG00020008744	-	78	35.075	ENSORLG00020008346	-	99	36.940
ENSORLG00020008744	-	78	44.961	ENSORLG00020017850	-	100	44.961
ENSORLG00020008744	-	67	45.390	ENSORLG00020010038	-	62	45.390
ENSORLG00020008744	-	50	40.698	ENSORLG00020010932	-	75	41.379
ENSORLG00020008744	-	64	40.860	ENSORLG00020009089	-	55	40.860
ENSORLG00020008744	-	78	37.391	ENSORLG00020005132	-	92	36.364
ENSORLG00020008744	-	66	33.846	ENSORLG00020018051	prdm5	78	33.590
ENSORLG00020008744	-	53	34.234	ENSORLG00020008787	snai2	71	34.234
ENSORLG00020008744	-	67	43.243	ENSORLG00020015703	-	52	43.243
ENSORLG00020008744	-	76	49.524	ENSORLG00020001912	znf236	78	49.524
ENSORLG00020008744	-	69	34.395	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	99	32.447
ENSORLG00020008744	-	67	43.243	ENSORLG00020010647	-	84	43.243
ENSORLG00020008744	-	75	33.333	ENSORLG00020002128	-	99	33.333
ENSORLG00020008744	-	61	35.052	ENSORLG00020003948	ZNF384	60	35.052
ENSORLG00020008744	-	69	45.946	ENSORLG00020017483	-	94	42.213
ENSORLG00020008744	-	69	38.014	ENSORLG00020010250	-	93	38.550
ENSORLG00020008744	-	67	47.085	ENSORLG00020017514	-	87	47.085
ENSORLG00020008744	-	51	40.157	ENSORLG00020019341	-	88	59.375
ENSORLG00020008744	-	68	37.864	ENSORLG00020018791	-	90	37.864
ENSORLG00020008744	-	67	40.741	ENSORLG00020017974	e4f1	58	40.741
ENSORLG00020008744	-	67	36.471	ENSORLG00020006820	-	72	45.455
ENSORLG00020008744	-	68	43.523	ENSORLG00020010880	-	82	41.818
ENSORLG00020008744	-	64	32.000	ENSORLG00020005815	-	77	33.684
ENSORLG00020008744	-	70	39.572	ENSORLG00020004313	-	72	39.572
ENSORLG00020008744	-	67	41.071	ENSORLG00020010171	-	95	35.792
ENSORLG00020008744	-	67	49.194	ENSORLG00020017164	-	98	43.243
ENSORLG00020008744	-	61	34.868	ENSORLG00020011478	scrt2	70	37.500
ENSORLG00020008744	-	77	38.506	ENSORLG00020018921	-	98	38.506
ENSORLG00020008744	-	50	40.271	ENSORLG00020011075	-	74	40.271
ENSORLG00020008744	-	67	39.130	ENSORLG00020011149	-	84	39.130
ENSORLG00020008744	-	76	39.286	ENSORLG00020020419	-	96	41.333
ENSORLG00020008744	-	69	41.825	ENSORLG00020010020	-	73	41.825
ENSORLG00020008744	-	67	36.517	ENSORLG00020009554	-	81	38.686
ENSORLG00020008744	-	61	42.373	ENSORLG00020005212	wt1b	55	46.875
ENSORLG00020008744	-	50	38.636	ENSORLG00020012967	scrt1b	58	38.636
ENSORLG00020008744	-	67	37.751	ENSORLG00020021196	-	74	37.956
ENSORLG00020008744	-	69	33.740	ENSORLG00020009680	znf652	54	34.672
ENSORLG00020008744	-	68	37.857	ENSORLG00020008933	-	69	39.370
ENSORLG00020008744	-	69	36.036	ENSORLG00020006144	-	77	36.036
ENSORLG00020008744	-	70	36.842	ENSORLG00020007790	zbtb48	63	36.842
ENSORLG00020008744	-	74	47.794	ENSORLG00020009965	-	77	47.794
ENSORLG00020008744	-	67	47.917	ENSORLG00020016754	-	91	44.186
ENSORLG00020008744	-	59	36.170	ENSORLG00020001791	-	95	36.170
ENSORLG00020008744	-	67	43.434	ENSORLG00020017528	-	89	42.708
ENSORLG00020008744	-	67	44.355	ENSORLG00020010804	-	95	44.355
ENSORLG00020008744	-	70	41.071	ENSORLG00020000264	-	52	41.071
ENSORLG00020008744	-	70	36.585	ENSORLG00020009857	-	95	40.278
ENSORLG00020008744	-	73	40.351	ENSORLG00020008891	-	97	40.351
ENSORLG00020008744	-	66	39.667	ENSORLG00020010916	-	59	39.667
ENSORLG00020008744	-	67	37.903	ENSORLG00020008424	-	90	37.903
ENSORLG00020008744	-	67	32.188	ENSORLG00020004889	ZNF319	97	34.409

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020008744	-	99	78.794	ENSAPOG00000003028	-	100	78.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008744	-	99	78.794	ENSATEG00000023044	-	100	78.916	Anabas_testudineus
ENSORLG00020008744	-	99	78.853	ENSACLG00000016841	-	97	78.853	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020008744	-	99	74.835	ENSCSEG00000004721	-	97	74.835	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020008744	-	99	75.966	ENSFHEG00000003583	-	99	75.841	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020008744	-	95	33.609	ENSKMAG00000003402	-	98	33.609	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020008744	-	99	78.019	ENSMAMG00000015670	-	97	78.019	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020008744	-	99	78.853	ENSMZEG00005001313	-	97	78.853	Maylandia_zebra
ENSORLG00020008744	-	70	32.245	ENSMMOG00000020682	-	86	34.177	Mola_mola
ENSORLG00020008744	-	98	71.646	ENSMALG00000011860	-	90	71.607	Monopterus_albus
ENSORLG00020008744	-	85	76.653	ENSNBRG00000010987	-	100	76.653	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020008744	-	69	74.644	ENSONIG00000017799	-	100	74.644	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020008744	-	100	96.561	ENSORLG00000027418	-	100	96.561	Oryzias_latipes
ENSORLG00020008744	-	100	96.840	ENSORLG00015007973	-	100	96.840	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020008744	-	100	91.782	ENSOMEG00000003451	-	94	91.782	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020008744	-	99	77.054	ENSPREG00000007135	-	97	77.054	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020008744	-	97	34.160	ENSSMAG00000002031	-	97	35.821	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020008744	-	99	78.430	ENSSMAG00000005081	-	99	78.032	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020008744	-	99	77.089	ENSSDUG00000016734	-	97	77.089	Seriola_dumerili
ENSORLG00020008744	-	99	77.183	ENSSLDG00000004485	-	97	77.183	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020008744	-	99	78.853	ENSSPAG00000003796	-	97	78.853	Stegastes_partitus
ENSORLG00020008744	-	99	73.679	ENSTRUG00000025881	-	97	73.679	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020008744	-	99	60.763	ENSXMAG00000024762	-	97	59.222	Xiphophorus_maculatus