EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020008933 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1197 bases
Position: chr2:6945782-6946978
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	1	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	2	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	3	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	4	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	5	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	6	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	7	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	8	9
ENSORLP00020008047	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-59	9	9
ENSORLP00020008047	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	1	3
ENSORLP00020008047	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	2	3
ENSORLP00020008047	zf-met	PF12874.7	1.8e-19	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020001849	-	1197	-	ENSORLP00020008047	398 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020008933	-	99	58.242	ENSORLG00020004313	-	62	57.923
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ENSORLG00020008933	-	63	37.500	ENSORLG00020011808	-	65	37.500
ENSORLG00020008933	-	74	54.491	ENSORLG00020007074	-	97	56.395
ENSORLG00020008933	-	99	59.494	ENSORLG00020010916	-	79	61.883
ENSORLG00020008933	-	99	48.113	ENSORLG00020000639	-	75	48.077
ENSORLG00020008933	-	65	30.317	ENSORLG00020005815	-	74	31.780
ENSORLG00020008933	-	69	38.281	ENSORLG00020004889	ZNF319	88	38.851
ENSORLG00020008933	-	69	54.067	ENSORLG00020017528	-	73	54.067
ENSORLG00020008933	-	99	40.878	ENSORLG00020007599	-	83	42.857
ENSORLG00020008933	-	99	42.697	ENSORLG00020018921	-	91	42.697
ENSORLG00020008933	-	56	49.398	ENSORLG00020016666	-	72	49.398
ENSORLG00020008933	-	69	41.379	ENSORLG00020006820	-	76	41.379
ENSORLG00020008933	-	99	58.482	ENSORLG00020007967	-	97	57.895
ENSORLG00020008933	-	89	55.307	ENSORLG00020008484	-	98	55.307
ENSORLG00020008933	-	99	42.920	ENSORLG00020010038	-	86	42.920
ENSORLG00020008933	-	65	44.828	ENSORLG00020010932	-	71	44.828
ENSORLG00020008933	-	98	57.288	ENSORLG00020009943	-	98	60.949
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ENSORLG00020008933	-	90	64.550	ENSORLG00020011075	-	89	64.550
ENSORLG00020008933	-	99	59.113	ENSORLG00020021857	-	71	59.113
ENSORLG00020008933	-	75	35.816	ENSORLG00020018791	-	88	35.811
ENSORLG00020008933	-	63	38.346	ENSORLG00020012967	scrt1b	55	38.346
ENSORLG00020008933	-	69	41.718	ENSORLG00020002817	GFI1	52	41.718
ENSORLG00020008933	-	64	46.491	ENSORLG00020005132	-	70	46.491
ENSORLG00020008933	-	69	35.606	ENSORLG00020018685	znf319b	89	35.606
ENSORLG00020008933	-	96	54.745	ENSORLG00020017164	-	97	54.745
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ENSORLG00020008933	-	99	59.712	ENSORLG00020008240	-	72	59.712
ENSORLG00020008933	-	99	49.339	ENSORLG00020015703	-	80	49.558
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ENSORLG00020008933	-	79	46.457	ENSORLG00020009139	-	98	47.403
ENSORLG00020008933	-	98	56.757	ENSORLG00020008346	-	97	57.426
ENSORLG00020008933	-	72	52.431	ENSORLG00020008424	-	90	52.431
ENSORLG00020008933	-	99	51.149	ENSORLG00020016037	-	95	49.107
ENSORLG00020008933	-	69	50.602	ENSORLG00020010950	-	97	50.602
ENSORLG00020008933	-	69	39.370	ENSORLG00020008744	-	68	37.857
ENSORLG00020008933	-	74	39.113	ENSORLG00020002128	-	99	39.113
ENSORLG00020008933	-	96	52.157	ENSORLG00020018069	-	94	50.958
ENSORLG00020008933	-	99	49.624	ENSORLG00020017850	-	95	50.189
ENSORLG00020008933	-	68	57.426	ENSORLG00020004353	-	96	57.426
ENSORLG00020008933	-	92	48.837	ENSORLG00020019227	-	84	48.837
ENSORLG00020008933	-	99	70.690	ENSORLG00020010560	-	92	71.034
ENSORLG00020008933	-	99	58.203	ENSORLG00020010171	-	99	57.669
ENSORLG00020008933	-	96	63.509	ENSORLG00020010250	-	91	63.509
ENSORLG00020008933	-	81	37.455	ENSORLG00020018495	-	64	37.455
ENSORLG00020008933	-	96	63.131	ENSORLG00020000161	-	94	63.131
ENSORLG00020008933	-	65	36.735	ENSORLG00020001758	-	56	36.735
ENSORLG00020008933	-	99	66.346	ENSORLG00020010953	-	92	65.217
ENSORLG00020008933	-	80	36.196	ENSORLG00020000009	znf710b	52	36.196
ENSORLG00020008933	-	93	58.225	ENSORLG00020011234	-	97	58.225
ENSORLG00020008933	-	67	55.078	ENSORLG00020007018	-	91	54.135
ENSORLG00020008933	-	89	61.472	ENSORLG00020010647	-	96	59.143
ENSORLG00020008933	-	83	53.617	ENSORLG00020017514	-	83	53.617
ENSORLG00020008933	-	74	41.250	ENSORLG00020017974	e4f1	50	41.250
ENSORLG00020008933	-	69	41.667	ENSORLG00020003719	GFI1B	54	41.667
ENSORLG00020008933	-	100	49.194	ENSORLG00020020419	-	92	49.194
ENSORLG00020008933	-	76	38.914	ENSORLG00020009554	-	81	38.914
ENSORLG00020008933	-	63	39.604	ENSORLG00020011478	scrt2	52	38.346
ENSORLG00020008933	-	69	38.636	ENSORLG00020006144	-	69	38.636
ENSORLG00020008933	-	99	68.327	ENSORLG00020000246	-	99	68.327
ENSORLG00020008933	-	98	73.684	ENSORLG00020010880	-	91	66.939
ENSORLG00020008933	-	75	34.800	ENSORLG00020007790	zbtb48	65	34.800
ENSORLG00020008933	-	93	52.727	ENSORLG00020000481	-	93	52.727
ENSORLG00020008933	-	99	66.111	ENSORLG00020009419	-	99	60.938
ENSORLG00020008933	-	99	64.286	ENSORLG00020004370	-	98	64.286
ENSORLG00020008933	-	99	61.569	ENSORLG00020010804	-	94	64.151
ENSORLG00020008933	-	99	58.590	ENSORLG00020010636	-	86	58.964
ENSORLG00020008933	-	69	46.018	ENSORLG00020019341	-	84	61.765
ENSORLG00020008933	-	63	43.421	ENSORLG00020001791	-	57	43.421
ENSORLG00020008933	-	93	58.947	ENSORLG00020010020	-	98	58.947
ENSORLG00020008933	-	99	66.986	ENSORLG00020009089	-	85	66.986
ENSORLG00020008933	-	100	55.072	ENSORLG00020008018	-	89	55.072
ENSORLG00020008933	-	99	44.949	ENSORLG00020009184	-	86	52.582
ENSORLG00020008933	-	83	61.000	ENSORLG00020009180	-	98	56.504
ENSORLG00020008933	-	95	43.519	ENSORLG00020001912	znf236	71	43.519
ENSORLG00020008933	-	86	35.780	ENSORLG00020018503	-	62	37.931
ENSORLG00020008933	-	86	63.281	ENSORLG00020011149	-	96	63.281
ENSORLG00020008933	-	80	46.121	ENSORLG00020009965	-	98	48.256
ENSORLG00020008933	-	97	45.000	ENSORLG00020000219	-	85	45.000
ENSORLG00020008933	-	99	60.619	ENSORLG00020008891	-	93	58.964
ENSORLG00020008933	-	67	57.500	ENSORLG00020016754	-	91	53.769
ENSORLG00020008933	-	84	39.698	ENSORLG00020009680	znf652	52	39.698
ENSORLG00020008933	-	76	30.415	ENSORLG00020010937	patz1	54	30.364
ENSORLG00020008933	-	67	43.697	ENSORLG00020001922	-	86	42.857
ENSORLG00020008933	-	99	48.469	ENSORLG00020021196	-	73	48.469
ENSORLG00020008933	-	99	56.267	ENSORLG00020006148	-	79	56.267
ENSORLG00020008933	-	91	47.436	ENSORLG00020001707	-	98	47.436
ENSORLG00020008933	-	99	50.376	ENSORLG00020017483	-	98	50.376
ENSORLG00020008933	-	65	32.218	ENSORLG00020010285	znf646	71	32.218

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020008933	-	71	59.677	ENSAPOG00000016615	-	89	59.677	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	60	52.083	ENSAPOG00000003414	-	99	52.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	80	52.727	ENSAPOG00000000601	-	68	52.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	96	45.133	ENSAPOG00000010645	-	84	45.133	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	70	50.000	ENSAPOG00000010330	-	80	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	69	45.238	ENSAPOG00000014372	-	60	45.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	83	45.385	ENSAPOG00000017148	-	71	45.385	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020008933	-	71	46.835	ENSAOCG00000007347	-	78	46.835	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020008933	-	63	47.778	ENSAPEG00000004256	-	75	47.778	Amphiprion_percula
ENSORLG00020008933	-	65	53.043	ENSATEG00000007658	-	70	47.511	Anabas_testudineus
ENSORLG00020008933	-	96	42.199	ENSAMXG00000013492	-	98	45.525	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020008933	-	70	45.714	ENSCING00000024717	-	77	45.714	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020008933	-	99	33.333	ENSCVAG00000018383	-	94	33.333	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020008933	-	69	43.460	ENSEBUG00000014768	-	65	43.460	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	66	45.082	ENSEBUG00000015472	-	50	41.350	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	81	47.000	ENSEBUG00000013874	-	66	47.000	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	76	43.529	ENSEBUG00000003418	-	92	43.529	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	57	45.882	ENSEBUG00000000436	-	69	45.882	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	68	43.307	ENSEBUG00000003232	-	54	43.307	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	67	45.238	ENSEBUG00000006666	-	84	45.238	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	68	42.021	ENSEBUG00000001308	-	64	42.021	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	68	42.520	ENSEBUG00000000422	-	63	42.520	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	87	47.222	ENSEBUG00000001569	-	81	47.222	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020008933	-	89	46.694	ENSELUG00000007694	-	87	46.694	Esox_lucius
ENSORLG00020008933	-	93	45.161	ENSELUG00000022942	-	75	45.161	Esox_lucius
ENSORLG00020008933	-	97	48.571	ENSELUG00000000281	-	74	51.880	Esox_lucius
ENSORLG00020008933	-	67	43.089	ENSGMOG00000016007	-	85	43.089	Gadus_morhua
ENSORLG00020008933	-	69	48.889	ENSGMOG00000005588	-	100	48.889	Gadus_morhua
ENSORLG00020008933	-	99	52.778	ENSGAFG00000021143	-	92	52.778	Gambusia_affinis
ENSORLG00020008933	-	81	52.174	ENSGAFG00000021139	-	99	52.174	Gambusia_affinis
ENSORLG00020008933	-	70	51.829	ENSGAGG00000010492	-	73	51.829	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020008933	-	86	41.016	ENSHBUG00000007316	-	89	41.016	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020008933	-	69	51.852	ENSHBUG00000003529	-	86	51.852	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020008933	-	78	53.052	ENSHCOG00000015355	-	89	55.455	Hippocampus_comes
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