EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020009054 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12767 bases
Position: chr16:18077689-18090455
Accession: 101159943
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020008116	PRP3	PF08572.10	9.4e-77	1	1
ENSORLP00020026503	PRP3	PF08572.10	9.4e-77	1	1
ENSORLP00020008095	PRP3	PF08572.10	1e-76	1	1
ENSORLP00020008080	PRP3	PF08572.10	1.2e-69	1	1
ENSORLP00020008116	PWI	PF01480.17	3.9e-12	1	1
ENSORLP00020026503	PWI	PF01480.17	3.9e-12	1	1
ENSORLP00020008080	PWI	PF01480.17	4.3e-12	1	1
ENSORLP00020008095	PWI	PF01480.17	4.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020001738	-	3042	-	ENSORLP00020026503	656 (aa)	-	-
ENSORLT00020001764	-	2953	XM_011485324	ENSORLP00020008095	692 (aa)	XP_011483626	-
ENSORLT00020001716	-	3427	-	ENSORLP00020008116	656 (aa)	-	-
ENSORLT00020001793	-	2085	-	ENSORLP00020008080	694 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSG00000117360	PRPF3	100	72.650	Homo_sapiens
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.246	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	87.249	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.897	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	72.792	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.064	ENSACIG00000007876	prpf3	100	85.349	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.530	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	86.819	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.963	ENSATEG00000023583	prpf3	100	87.393	Anabas_testudineus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	73.219	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.219	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.624	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	72.650	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.265	ENSACLG00000020127	prpf3	100	85.694	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020009054	prpf3	100	80.112	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.112	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	72.650	Bos_taurus
ENSORLG00020009054	prpf3	81	39.261	WBGene00010844	prp-3	96	36.524	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	72.650	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	72.650	Canis_familiaris
ENSORLG00020009054	prpf3	85	71.908	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.438	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	72.650	Capra_hircus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.937	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	72.792	Carlito_syrichta
ENSORLG00020009054	prpf3	93	62.232	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	62.923	Cavia_aperea
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.795	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	72.650	Cavia_porcellus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	72.650	Cebus_capucinus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	59.065	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	59.915	Cercocebus_atys
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.897	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	72.792	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020009054	prpf3	76	80.292	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	81.387	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020009054	prpf3	99	72.222	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	73.077	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020009054	prpf3	60	58.852	ENSCING00000003312	-	99	58.852	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020009054	prpf3	82	51.042	ENSCSAVG00000008720	-	96	51.042	Ciona_savignyi
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.184	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	72.080	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	72.650	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	72.650	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020009054	prpf3	100	84.136	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	84.136	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.351	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	86.782	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	79.943	ENSDARG00000086425	prpf3	100	79.943	Danio_rerio
ENSORLG00020009054	prpf3	99	66.049	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	66.762	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020009054	prpf3	93	71.626	ENSDORG00000008664	Prpf3	99	72.699	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020009054	prpf3	80	53.229	FBgn0036915	Prp3	99	53.559	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.041	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	71.937	Echinops_telfairi
ENSORLG00020009054	prpf3	100	61.364	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	61.898	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	72.507	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	72.650	Equus_caballus
ENSORLG00020009054	prpf3	84	71.655	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	72.460	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	74.148	ENSELUG00000013624	prpf3	100	74.468	Esox_lucius
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	72.650	Felis_catus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.897	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	72.792	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.043	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	86.475	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	81.508	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	81.508	Gadus_morhua
ENSORLG00020009054	prpf3	99	73.362	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	73.362	Gallus_gallus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.612	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	86.043	Gambusia_affinis
ENSORLG00020009054	prpf3	100	84.615	ENSGACG00000011792	prpf3	100	85.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	72.222	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	74.776	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020009054	prpf3	86	75.811	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	76.833	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.551	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	85.980	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020009054	prpf3	99	52.068	ENSHGLG00000016033	-	96	65.455	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	72.507	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	72.507	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020009054	prpf3	90	65.455	ENSHGLG00100008951	-	96	65.455	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020009054	prpf3	100	81.571	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	82.429	Hippocampus_comes
ENSORLG00020009054	prpf3	100	79.630	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	79.772	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	72.650	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.980	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	86.695	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.895	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	87.749	Labrus_bergylta
ENSORLG00020009054	prpf3	98	68.300	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	68.760	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	72.650	Loxodonta_africana
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	72.650	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020009054	prpf3	95	72.568	ENSMMUG00000016301	PRPF3	97	73.089	Macaca_mulatta
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	72.650	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020009054	prpf3	86	75.811	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	76.833	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020009054	prpf3	98	49.353	ENSMLEG00000041065	-	97	48.921	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.895	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	86.895	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	86.913	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	87.340	Maylandia_zebra
ENSORLG00020009054	prpf3	99	73.362	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	73.362	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	72.650	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	74.510	Microcebus_murinus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	72.650	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020009054	prpf3	100	78.843	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	79.408	Mola_mola
ENSORLG00020009054	prpf3	99	72.262	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	73.115	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020009054	prpf3	100	83.714	ENSMALG00000007257	prpf3	100	83.714	Monopterus_albus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.795	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	72.650	Mus_caroli
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.795	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	72.650	Mus_musculus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.879	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	72.740	Mus_pahari
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.795	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	72.650	Mus_spretus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	70.228	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	71.225	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.795	ENSMLUG00000004646	-	100	72.688	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	72.650	Nannospalax_galili
ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.935	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	86.357	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020009054	prpf3	95	72.611	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.089	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020009054	prpf3	71	76.812	ENSMEUG00000008733	PRPF3	77	77.778	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	72.650	Ochotona_princeps
ENSORLG00020009054	prpf3	99	54.468	ENSODEG00000014412	-	100	55.177	Octodon_degus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	72.080	ENSODEG00000011363	-	100	72.934	Octodon_degus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	87.055	ENSONIG00000006394	prpf3	100	87.482	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	55.319	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.319	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	72.650	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020009054	prpf3	100	99.855	ENSORLG00000010330	prpf3	100	99.855	Oryzias_latipes
ENSORLG00020009054	prpf3	100	99.566	ENSORLG00015015016	prpf3	100	99.566	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020009054	prpf3	100	96.254	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	96.254	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020009054	prpf3	99	68.234	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.132	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.650	Ovis_aries
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	72.507	Pan_paniscus
ENSORLG00020009054	prpf3	98	56.041	ENSPPAG00000043769	-	99	55.959	Pan_paniscus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	72.650	Panthera_pardus
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	72.650	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	72.650	Pan_troglodytes
ENSORLG00020009054	prpf3	98	55.167	ENSPTRG00000047819	-	99	55.087	Pan_troglodytes
ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.612	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	72.507	Papio_anubis
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ENSORLG00020009054	prpf3	99	72.404	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	72.831	Pelodiscus_sinensis
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ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.612	ENSXMAG00000016347	prpf3	100	86.331	Xiphophorus_maculatus