EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020009089 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5929 bases
Position: chr13:26105752-26111680
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	1	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	2	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	3	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	4	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	5	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	6	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	7	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	8	9
ENSORLP00020008182	zf-C2H2	PF00096.26	6.8e-51	9	9
ENSORLP00020008182	zf-met	PF12874.7	7.9e-19	1	4
ENSORLP00020008182	zf-met	PF12874.7	7.9e-19	2	4
ENSORLP00020008182	zf-met	PF12874.7	7.9e-19	3	4
ENSORLP00020008182	zf-met	PF12874.7	7.9e-19	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020001619	-	1482	-	ENSORLP00020008182	493 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020009089	-	53	43.195	ENSORLG00020016116	-	53	43.195
ENSORLG00020009089	-	86	35.971	ENSORLG00020001791	-	93	35.714
ENSORLG00020009089	-	51	32.558	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	50	32.558
ENSORLG00020009089	-	50	43.195	ENSORLG00020006820	-	66	43.195
ENSORLG00020009089	-	63	52.273	ENSORLG00020009139	-	98	49.545
ENSORLG00020009089	-	55	42.222	ENSORLG00020018791	-	82	42.222
ENSORLG00020009089	-	64	40.625	ENSORLG00020002128	-	91	40.625
ENSORLG00020009089	-	86	69.512	ENSORLG00020010916	-	81	73.187
ENSORLG00020009089	-	52	31.905	ENSORLG00020005815	-	73	33.019
ENSORLG00020009089	-	89	54.128	ENSORLG00020021196	-	75	53.881
ENSORLG00020009089	-	55	34.503	ENSORLG00020010937	patz1	50	32.245
ENSORLG00020009089	-	84	67.416	ENSORLG00020004370	-	99	67.416
ENSORLG00020009089	-	53	52.105	ENSORLG00020017528	-	72	52.105
ENSORLG00020009089	-	71	38.075	ENSORLG00020006144	-	80	38.075
ENSORLG00020009089	-	52	36.771	ENSORLG00020007790	zbtb48	52	36.771
ENSORLG00020009089	-	54	39.867	ENSORLG00020018495	-	65	40.659
ENSORLG00020009089	-	61	36.667	ENSORLG00020000009	znf710b	58	35.125
ENSORLG00020009089	-	86	73.460	ENSORLG00020010880	-	91	73.460
ENSORLG00020009089	-	78	60.241	ENSORLG00020007018	-	91	60.241
ENSORLG00020009089	-	88	52.510	ENSORLG00020017483	-	97	50.980
ENSORLG00020009089	-	57	45.946	ENSORLG00020004889	ZNF319	88	45.946
ENSORLG00020009089	-	58	35.526	ENSORLG00020011478	scrt2	53	35.526
ENSORLG00020009089	-	54	48.673	ENSORLG00020019341	-	82	64.706
ENSORLG00020009089	-	55	60.317	ENSORLG00020016754	-	90	56.502
ENSORLG00020009089	-	55	36.275	ENSORLG00020018503	-	71	36.771
ENSORLG00020009089	-	87	53.465	ENSORLG00020015703	-	79	53.465
ENSORLG00020009089	-	84	56.545	ENSORLG00020016037	-	93	50.000
ENSORLG00020009089	-	92	62.332	ENSORLG00020021857	-	95	65.714
ENSORLG00020009089	-	75	75.979	ENSORLG00020011075	-	90	75.979
ENSORLG00020009089	-	54	48.739	ENSORLG00020001922	-	56	46.970
ENSORLG00020009089	-	58	45.238	ENSORLG00020003719	GFI1B	64	45.238
ENSORLG00020009089	-	53	37.762	ENSORLG00020012967	scrt1b	52	37.762
ENSORLG00020009089	-	67	39.648	ENSORLG00020009680	znf652	57	34.091
ENSORLG00020009089	-	85	49.102	ENSORLG00020000264	-	68	49.102
ENSORLG00020009089	-	85	43.564	ENSORLG00020016666	-	92	43.564
ENSORLG00020009089	-	80	61.856	ENSORLG00020010020	-	98	61.856
ENSORLG00020009089	-	87	68.889	ENSORLG00020009419	-	98	67.421
ENSORLG00020009089	-	57	50.943	ENSORLG00020010950	-	94	50.943
ENSORLG00020009089	-	85	71.362	ENSORLG00020010953	-	95	71.362
ENSORLG00020009089	-	74	51.392	ENSORLG00020008484	-	98	51.261
ENSORLG00020009089	-	55	53.472	ENSORLG00020009965	-	68	53.472
ENSORLG00020009089	-	86	51.049	ENSORLG00020010636	-	90	55.556
ENSORLG00020009089	-	96	50.000	ENSORLG00020000639	-	87	50.000
ENSORLG00020009089	-	86	59.729	ENSORLG00020007967	-	92	61.364
ENSORLG00020009089	-	61	60.104	ENSORLG00020007074	-	97	59.184
ENSORLG00020009089	-	57	47.727	ENSORLG00020001912	znf236	72	45.570
ENSORLG00020009089	-	68	56.637	ENSORLG00020017514	-	87	56.637
ENSORLG00020009089	-	53	41.406	ENSORLG00020018051	prdm5	63	41.406
ENSORLG00020009089	-	87	69.231	ENSORLG00020009943	-	99	72.358
ENSORLG00020009089	-	81	62.046	ENSORLG00020010250	-	91	62.046
ENSORLG00020009089	-	85	66.986	ENSORLG00020008933	-	99	66.986
ENSORLG00020009089	-	53	44.048	ENSORLG00020010932	-	83	44.048
ENSORLG00020009089	-	78	53.358	ENSORLG00020017164	-	93	58.369
ENSORLG00020009089	-	86	61.979	ENSORLG00020006148	-	90	61.795
ENSORLG00020009089	-	53	44.037	ENSORLG00020008787	snai2	55	44.037
ENSORLG00020009089	-	55	54.217	ENSORLG00020019227	-	51	51.190
ENSORLG00020009089	-	88	58.088	ENSORLG00020008018	-	96	58.088
ENSORLG00020009089	-	54	65.497	ENSORLG00020004353	-	96	65.497
ENSORLG00020009089	-	87	51.250	ENSORLG00020020419	-	93	51.250
ENSORLG00020009089	-	56	38.983	ENSORLG00020013114	zbtb47b	53	38.153
ENSORLG00020009089	-	81	67.677	ENSORLG00020000161	-	95	67.677
ENSORLG00020009089	-	86	56.477	ENSORLG00020008240	-	75	55.612
ENSORLG00020009089	-	62	45.860	ENSORLG00020000219	-	82	45.860
ENSORLG00020009089	-	86	60.099	ENSORLG00020008424	-	93	60.000
ENSORLG00020009089	-	56	43.243	ENSORLG00020018685	znf319b	83	43.243
ENSORLG00020009089	-	84	43.403	ENSORLG00020005132	-	92	44.958
ENSORLG00020009089	-	70	72.414	ENSORLG00020010647	-	93	61.207
ENSORLG00020009089	-	88	69.456	ENSORLG00020010171	-	91	69.456
ENSORLG00020009089	-	51	37.615	ENSORLG00020001758	-	56	37.615
ENSORLG00020009089	-	87	64.159	ENSORLG00020008891	-	97	65.182
ENSORLG00020009089	-	86	55.758	ENSORLG00020004313	-	72	55.689
ENSORLG00020009089	-	54	39.301	ENSORLG00020009554	-	76	39.301
ENSORLG00020009089	-	84	61.776	ENSORLG00020009857	-	95	67.188
ENSORLG00020009089	-	86	53.782	ENSORLG00020009184	-	98	53.782
ENSORLG00020009089	-	67	66.000	ENSORLG00020009180	-	96	63.008
ENSORLG00020009089	-	84	56.075	ENSORLG00020000246	-	99	56.075
ENSORLG00020009089	-	71	64.961	ENSORLG00020011149	-	98	64.961
ENSORLG00020009089	-	63	50.612	ENSORLG00020001707	-	95	50.612
ENSORLG00020009089	-	87	52.313	ENSORLG00020000481	-	98	52.313
ENSORLG00020009089	-	55	43.575	ENSORLG00020002817	GFI1	55	43.575
ENSORLG00020009089	-	83	52.124	ENSORLG00020018069	-	97	51.938
ENSORLG00020009089	-	89	64.015	ENSORLG00020010804	-	96	71.020
ENSORLG00020009089	-	66	39.423	ENSORLG00020010285	znf646	75	39.423
ENSORLG00020009089	-	85	61.257	ENSORLG00020008346	-	98	63.922
ENSORLG00020009089	-	80	60.574	ENSORLG00020011234	-	97	60.574
ENSORLG00020009089	-	88	46.809	ENSORLG00020007599	-	85	46.809
ENSORLG00020009089	-	85	44.196	ENSORLG00020018921	-	73	44.196
ENSORLG00020009089	-	55	40.860	ENSORLG00020008744	-	64	40.860
ENSORLG00020009089	-	86	75.893	ENSORLG00020010560	-	96	71.138
ENSORLG00020009089	-	86	54.717	ENSORLG00020017850	-	97	54.717

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020009089	-	55	52.381	ENSAPOG00000014372	-	58	52.381	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009089	-	50	53.333	ENSAPOG00000000601	-	64	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009089	-	53	55.833	ENSAPOG00000010330	-	67	55.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009089	-	54	62.295	ENSAPOG00000016615	-	89	62.295	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009089	-	80	50.000	ENSAPOG00000010645	-	87	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009089	-	58	43.902	ENSAOCG00000007347	-	78	43.902	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020009089	-	86	49.412	ENSAPEG00000004256	-	99	49.412	Amphiprion_percula
ENSORLG00020009089	-	90	55.952	ENSATEG00000007658	-	74	55.952	Anabas_testudineus
ENSORLG00020009089	-	58	46.862	ENSAMXG00000013492	-	96	48.246	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020009089	-	54	46.729	ENSCING00000024717	-	70	46.729	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020009089	-	85	44.554	ENSCVAG00000018383	-	95	43.564	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009089	-	82	44.295	ENSCVAG00000011712	-	74	44.295	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009089	-	86	54.167	ENSCVAG00000016924	-	56	53.741	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009089	-	62	47.761	FBgn0037922	CG14711	60	47.761	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020009089	-	55	48.988	ENSEBUG00000006666	-	84	48.988	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	58	48.560	ENSEBUG00000014768	-	61	48.560	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	56	46.535	ENSEBUG00000003232	-	53	44.186	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	78	49.219	ENSEBUG00000001569	-	89	49.219	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	62	45.174	ENSEBUG00000003418	-	92	45.174	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	52	48.171	ENSEBUG00000000436	-	71	48.171	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	52	46.473	ENSEBUG00000015472	-	51	46.473	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	52	45.522	ENSEBUG00000001308	-	65	45.522	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	55	45.850	ENSEBUG00000000422	-	64	45.850	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009089	-	87	46.053	ENSELUG00000022942	-	90	41.322	Esox_lucius
ENSORLG00020009089	-	59	51.417	ENSELUG00000007694	-	86	51.417	Esox_lucius
ENSORLG00020009089	-	88	45.926	ENSELUG00000000423	-	85	45.926	Esox_lucius
ENSORLG00020009089	-	86	51.007	ENSELUG00000000281	-	59	54.348	Esox_lucius
ENSORLG00020009089	-	54	43.333	ENSGMOG00000016007	-	78	43.333	Gadus_morhua
ENSORLG00020009089	-	57	51.111	ENSGMOG00000005588	-	100	51.111	Gadus_morhua
ENSORLG00020009089	-	52	50.481	ENSGAFG00000021139	-	86	50.481	Gambusia_affinis
ENSORLG00020009089	-	84	54.206	ENSGAFG00000021143	-	92	54.206	Gambusia_affinis
ENSORLG00020009089	-	53	55.689	ENSGAGG00000010492	-	72	55.689	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020009089	-	70	39.552	ENSHBUG00000007316	-	89	39.552	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020009089	-	54	48.052	ENSHBUG00000003529	-	88	48.052	Haplochromis_burtoni
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