EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020009535 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8219 bases
Position: chr16:17859464-17867682
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020008627	MMR_HSR1	PF01926.23	4.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020000869	-	3690	-	ENSORLP00020008627	200 (aa)	-	-
ENSORLT00020000851	-	4420	-	ENSORLP00020008643	270 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020009535	-	78	35.032	ENSORLG00020002801	rheb	85	35.032
ENSORLG00020009535	-	95	37.113	ENSORLG00020008388	rab5c	89	37.113
ENSORLG00020009535	-	80	33.129	ENSORLG00020010114	-	87	33.129
ENSORLG00020009535	-	95	36.041	ENSORLG00020000483	rab9a	97	36.041
ENSORLG00020009535	-	79	45.570	ENSORLG00020001816	rab6a	80	45.570
ENSORLG00020009535	-	87	37.778	ENSORLG00020005240	RAB29	88	37.778
ENSORLG00020009535	-	84	41.667	ENSORLG00020020811	rab25a	55	41.667
ENSORLG00020009535	-	84	47.024	ENSORLG00020020816	rab11ba	77	47.024
ENSORLG00020009535	-	86	54.971	ENSORLG00020004905	RAB15	82	54.971
ENSORLG00020009535	-	95	40.104	ENSORLG00020020922	rab5aa	89	40.104
ENSORLG00020009535	-	75	45.806	ENSORLG00020013870	-	64	45.806
ENSORLG00020009535	-	84	42.012	ENSORLG00020020277	si:dkey-34d22.5	77	42.012
ENSORLG00020009535	-	96	34.197	ENSORLG00020020961	kras	98	34.715
ENSORLG00020009535	-	69	30.435	ENSORLG00020002949	arl3	75	30.435
ENSORLG00020009535	-	98	53.061	ENSORLG00020021071	zgc:171927	90	53.061
ENSORLG00020009535	-	90	56.425	ENSORLG00020021697	-	87	56.425
ENSORLG00020009535	-	87	46.821	ENSORLG00020020844	RAB11B	79	46.821
ENSORLG00020009535	-	79	45.570	ENSORLG00020013337	rab6bb	79	44.937
ENSORLG00020009535	-	88	36.723	ENSORLG00020020220	rab23	90	36.508
ENSORLG00020009535	-	86	42.775	ENSORLG00020013895	rab42a	79	42.775
ENSORLG00020009535	-	84	37.059	ENSORLG00020012306	si:ch73-116o1.2	81	37.059
ENSORLG00020009535	-	78	30.435	ENSORLG00020006790	dnajc27	59	30.435
ENSORLG00020009535	-	85	47.929	ENSORLG00020015288	rab30	83	47.929
ENSORLG00020009535	-	61	30.303	ENSORLG00020004500	arfrp1	65	30.303
ENSORLG00020009535	-	96	33.673	ENSORLG00020019465	si:dkey-13a21.4	96	33.673
ENSORLG00020009535	-	89	53.107	ENSORLG00020018259	rab15	83	53.107
ENSORLG00020009535	-	97	36.683	ENSORLG00020018986	rab14	77	40.719
ENSORLG00020009535	-	87	49.714	ENSORLG00020005131	rab12	75	49.714
ENSORLG00020009535	-	84	48.810	ENSORLG00020021663	rab3db	76	48.810
ENSORLG00020009535	-	83	38.235	ENSORLG00020009158	rab9b	80	38.235
ENSORLG00020009535	-	79	40.000	ENSORLG00020010041	rab34a	60	40.000
ENSORLG00020009535	-	85	33.918	ENSORLG00020001721	rabl2	74	33.918
ENSORLG00020009535	-	96	34.375	ENSORLG00020008129	hras	98	34.375
ENSORLG00020009535	-	87	46.821	ENSORLG00020019393	rab11bb	81	45.143
ENSORLG00020009535	-	85	39.344	ENSORLG00020018196	rab33ba	77	39.344
ENSORLG00020009535	-	98	54.229	ENSORLG00020000892	rab1ab	98	54.229
ENSORLG00020009535	-	84	47.619	ENSORLG00020020035	rab2a	79	47.619
ENSORLG00020009535	-	79	44.937	ENSORLG00020000604	rab41	75	43.038
ENSORLG00020009535	-	85	32.402	ENSORLG00020018922	rasl11a	69	32.402
ENSORLG00020009535	-	96	42.289	ENSORLG00020013747	rab11al	93	42.289
ENSORLG00020009535	-	79	38.125	ENSORLG00020016139	rab34b	59	38.125
ENSORLG00020009535	-	86	34.659	ENSORLG00020005258	rerg	86	34.659
ENSORLG00020009535	-	95	43.229	ENSORLG00020011590	rab18b	93	43.229
ENSORLG00020009535	-	87	40.805	ENSORLG00020013719	rab25b	85	40.361
ENSORLG00020009535	-	84	31.953	ENSORLG00020011620	rras2	96	31.953
ENSORLG00020009535	-	84	46.429	ENSORLG00020015717	-	69	46.429
ENSORLG00020009535	-	94	40.306	ENSORLG00020020266	rab33a	71	40.306
ENSORLG00020009535	-	86	45.087	ENSORLG00020019269	RAB39B	81	45.087
ENSORLG00020009535	-	96	33.161	ENSORLG00020013690	zgc:55558	98	33.161
ENSORLG00020009535	-	79	43.030	ENSORLG00020010772	rab6ba	77	43.030
ENSORLG00020009535	-	91	46.154	ENSORLG00020000867	si:dkey-16l2.16	86	46.154
ENSORLG00020009535	-	89	40.426	ENSORLG00020012685	zgc:101559	80	40.426
ENSORLG00020009535	-	98	37.313	ENSORLG00020005952	rab7a	97	37.313
ENSORLG00020009535	-	90	44.809	ENSORLG00020008333	rab18a	88	44.809
ENSORLG00020009535	-	82	39.881	ENSORLG00020008512	-	83	39.881

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020009535	-	100	92.500	ENSAPOG00000001040	-	100	92.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009535	-	100	64.179	ENSACIG00000003157	-	100	64.179	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020009535	-	100	92.500	ENSAOCG00000015908	-	100	92.500	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020009535	-	100	92.500	ENSAPEG00000004121	-	100	92.500	Amphiprion_percula
ENSORLG00020009535	-	100	90.000	ENSATEG00000023662	-	100	90.000	Anabas_testudineus
ENSORLG00020009535	-	100	91.000	ENSACLG00000019643	-	100	91.000	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSCVAG00000022649	-	100	88.000	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009535	-	86	72.093	ENSDARG00000103934	megf8	99	72.093	Danio_rerio
ENSORLG00020009535	-	100	87.500	ENSGAFG00000014787	-	100	87.500	Gambusia_affinis
ENSORLG00020009535	-	100	91.000	ENSHBUG00000003728	-	100	91.000	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020009535	-	100	91.000	ENSMZEG00005015817	-	100	91.000	Maylandia_zebra
ENSORLG00020009535	-	100	91.000	ENSMMOG00000003924	-	100	91.000	Mola_mola
ENSORLG00020009535	-	100	90.500	ENSMALG00000020807	-	100	90.500	Monopterus_albus
ENSORLG00020009535	-	54	87.963	ENSOPRG00000014416	-	100	87.963	Ochotona_princeps
ENSORLG00020009535	-	100	99.500	ENSORLG00000025395	-	100	99.500	Oryzias_latipes
ENSORLG00020009535	-	100	99.000	ENSORLG00015015518	-	100	99.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020009535	-	100	85.075	ENSPKIG00000014528	-	100	85.075	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSPFOG00000014418	-	100	88.000	Poecilia_formosa
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSPLAG00000003181	-	100	88.000	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSPMEG00000022988	-	100	88.000	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSPMEG00000008020	-	100	88.000	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020009535	-	100	90.000	ENSPNYG00000004681	-	100	90.000	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020009535	-	100	88.500	ENSSFOG00015021754	rab13	100	88.500	Scleropages_formosus
ENSORLG00020009535	-	100	91.000	ENSSMAG00000016376	-	100	91.000	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020009535	-	100	65.534	ENSSMAG00000002569	-	100	65.534	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020009535	-	100	92.500	ENSSDUG00000006307	-	100	92.500	Seriola_dumerili
ENSORLG00020009535	-	100	92.500	ENSSLDG00000015823	-	100	92.500	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020009535	-	100	93.000	ENSSPAG00000022440	-	100	93.000	Stegastes_partitus
ENSORLG00020009535	-	100	89.500	ENSTNIG00000018319	-	100	89.500	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020009535	-	100	88.000	ENSXMAG00000016094	-	100	88.000	Xiphophorus_maculatus