EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020009865 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eftud2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14845 bases
Position: chr8:5110828-5125672
Accession: ZDB-GENE-040426-1569
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020026989	GTP_EFTU	PF00009.27	5.5e-45	1	1
ENSORLP00020027010	GTP_EFTU	PF00009.27	5.5e-45	1	1
ENSORLP00020008811	GTP_EFTU	PF00009.27	6.4e-38	1	1
ENSORLP00020008811	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-11	1	1
ENSORLP00020026989	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-11	1	1
ENSORLP00020027010	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-11	1	1
ENSORLP00020026989	EFG_IV	PF03764.18	1.1e-24	1	1
ENSORLP00020027010	EFG_IV	PF03764.18	1.1e-24	1	1
ENSORLP00020008811	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020000492	-	3663	-	ENSORLP00020026989	971 (aa)	-	-
ENSORLT00020000444	-	4026	-	ENSORLP00020027010	971 (aa)	-	-
ENSORLT00020000552	-	2847	-	ENSORLP00020008811	948 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020009865's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020009865's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020009865	eftud2	86	37.500	ENSORLG00020017663	eef2b	99	37.500
ENSORLG00020009865	eftud2	87	36.884	ENSORLG00020003472	-	99	36.884

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.940	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	97.940	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.667	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.718	ENSACIG00000009096	eftud2	100	93.718	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020009865	eftud2	88	92.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.118	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.837	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.837	Amphiprion_percula
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.734	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.734	Anabas_testudineus
ENSORLG00020009865	eftud2	99	88.260	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.260	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.152	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.528	ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.528	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.859	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.859	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.667	Bos_taurus
ENSORLG00020009865	eftud2	99	71.074	WBGene00001166	eftu-2	99	70.661	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.667	Canis_familiaris
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.667	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.667	Capra_hircus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	Carlito_syrichta
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.564	Cavia_aperea
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	Cavia_porcellus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.770	Cebus_capucinus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	Cercocebus_atys
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020009865	eftud2	91	80.856	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.856	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.461	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	78.439	ENSCING00000009372	-	100	78.234	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020009865	eftud2	99	78.345	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.770	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.631	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.631	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.322	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.322	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.628	ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.628	Danio_rerio
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.461	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	74.667	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020009865	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSORLG00020009865	eftud2	75	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.667	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.564	Equus_caballus
ENSORLG00020009865	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.203	ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.997	Esox_lucius
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.564	Felis_catus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.564	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.528	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.528	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	94.954	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.954	Gadus_morhua
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	Gallus_gallus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	96.910	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	96.910	Gambusia_affinis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.013	ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.770	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.425	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.425	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.461	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.461	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020009865	eftud2	100	95.576	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.650	Hippocampus_comes
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.512	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.512	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020009865	eftud2	91	92.905	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.710	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020009865	eftud2	95	93.587	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.587	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	96.807	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.807	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020009865	eftud2	95	97.192	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSORLG00020009865	eftud2	100	92.482	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.718	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	93.615	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	Loxodonta_africana
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.770	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.770	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.770	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.631	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.631	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.528	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	97.528	Maylandia_zebra
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.170	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.170	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.564	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.770	Microcebus_murinus
ENSORLG00020009865	eftud2	92	74.831	ENSMOCG00000017653	-	90	74.831	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSMOCG00000009039	-	100	91.564	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020009865	eftud2	88	98.471	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.471	Mola_mola
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.667	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020009865	eftud2	88	96.588	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.588	Monopterus_albus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.667	Mus_caroli
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.967	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.967	Mus_musculus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.667	Mus_pahari
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.667	Mus_spretus
ENSORLG00020009865	eftud2	97	91.208	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.208	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.667	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.461	Nannospalax_galili
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.425	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.425	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020009865	eftud2	97	89.692	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.692	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.963	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.963	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	83.642	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	Ochotona_princeps
ENSORLG00020009865	eftud2	94	75.466	ENSODEG00000003385	-	100	75.575	Octodon_degus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	ENSODEG00000018041	-	100	91.461	Octodon_degus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.528	ENSONIG00000000912	eftud2	100	97.528	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	99.897	ENSORLG00000003109	eftud2	100	99.897	Oryzias_latipes
ENSORLG00020009865	eftud2	100	99.897	ENSORLG00015002611	eftud2	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020009865	eftud2	100	90.329	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.329	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.667	Ovis_aries
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.770	Pan_paniscus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.667	Panthera_pardus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.667	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	Pan_troglodytes
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.770	Papio_anubis
ENSORLG00020009865	eftud2	93	89.526	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.526	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	88.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	88.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.667	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.013	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.013	Poecilia_formosa
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.013	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.013	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.013	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.013	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020009865	eftud2	100	90.535	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	Pongo_abelii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.963	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	Procavia_capensis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.770	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.449	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.449	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.425	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.425	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020009865	eftud2	100	94.336	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.336	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.864	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.667	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020009865	eftud2	97	33.897	YKL173W	SNU114	91	34.644	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020009865	eftud2	95	93.478	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.478	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020009865	eftud2	100	94.336	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.130	Scleropages_formosus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	96.601	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	96.601	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.837	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.837	Seriola_dumerili
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.940	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	97.940	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	83.848	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.848	Sorex_araneus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.358	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.837	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.837	Stegastes_partitus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.564	Sus_scrofa
ENSORLG00020009865	eftud2	83	92.413	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.413	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00020009865	eftud2	100	95.778	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.778	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.077	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.077	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020009865	eftud2	100	86.420	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	Tupaia_belangeri
ENSORLG00020009865	eftud2	91	89.671	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.671	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	90.535	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.535	Ursus_americanus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.667	Ursus_maritimus
ENSORLG00020009865	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.667	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020009865	eftud2	96	92.086	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.927	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020009865	eftud2	81	97.959	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020009865	eftud2	100	96.910	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.910	Xiphophorus_maculatus