EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010019 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3334 bases
Position: chr10:2111261-2114594
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027180	RVT_1	PF00078.27	2.3e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020000025	-	3334	-	ENSORLP00020027180	798 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010019	-	80	38.285	ENSORLG00020002198	-	67	38.285
ENSORLG00020010019	-	80	38.744	ENSORLG00020015506	-	67	38.744
ENSORLG00020010019	-	82	40.087	ENSORLG00020008688	-	70	40.029
ENSORLG00020010019	-	66	30.961	ENSORLG00020016931	-	77	30.961
ENSORLG00020010019	-	60	39.425	ENSORLG00020003828	-	63	39.425
ENSORLG00020010019	-	80	38.591	ENSORLG00020019255	-	67	38.591
ENSORLG00020010019	-	70	38.814	ENSORLG00020007092	-	73	38.814
ENSORLG00020010019	-	80	38.744	ENSORLG00020010964	-	67	38.744
ENSORLG00020010019	-	81	36.377	ENSORLG00020021850	-	60	36.377
ENSORLG00020010019	-	52	42.482	ENSORLG00020007946	-	59	42.280
ENSORLG00020010019	-	57	41.087	ENSORLG00020006422	-	61	41.087
ENSORLG00020010019	-	96	70.351	ENSORLG00020013041	-	72	70.351
ENSORLG00020010019	-	56	39.159	ENSORLG00020005659	-	61	39.159
ENSORLG00020010019	-	80	38.744	ENSORLG00020015822	-	67	38.744
ENSORLG00020010019	-	82	40.087	ENSORLG00020004158	-	67	40.262
ENSORLG00020010019	-	76	38.746	ENSORLG00020014097	-	68	38.746
ENSORLG00020010019	-	50	40.000	ENSORLG00020021212	-	93	41.039
ENSORLG00020010019	-	86	37.213	ENSORLG00020000004	-	63	37.322
ENSORLG00020010019	-	84	37.139	ENSORLG00020008178	-	58	38.132
ENSORLG00020010019	-	76	38.585	ENSORLG00020017660	-	68	38.585
ENSORLG00020010019	-	76	38.240	ENSORLG00020012549	-	68	38.240
ENSORLG00020010019	-	76	37.785	ENSORLG00020007840	-	88	37.742
ENSORLG00020010019	-	62	59.046	ENSORLG00020003864	-	94	59.046
ENSORLG00020010019	-	68	37.123	ENSORLG00020001972	-	67	37.123
ENSORLG00020010019	-	81	37.821	ENSORLG00020002718	-	68	37.821
ENSORLG00020010019	-	60	38.716	ENSORLG00020006907	-	89	38.716
ENSORLG00020010019	-	74	38.978	ENSORLG00020005060	-	70	38.978
ENSORLG00020010019	-	50	42.998	ENSORLG00020018691	-	59	42.892
ENSORLG00020010019	-	61	39.960	ENSORLG00020016659	-	62	39.960
ENSORLG00020010019	-	60	38.509	ENSORLG00020018405	-	63	38.509
ENSORLG00020010019	-	63	73.190	ENSORLG00020016049	-	63	73.190
ENSORLG00020010019	-	80	38.744	ENSORLG00020007799	-	85	38.744
ENSORLG00020010019	-	82	39.884	ENSORLG00020018578	-	70	39.884
ENSORLG00020010019	-	60	39.130	ENSORLG00020004099	-	63	39.130
ENSORLG00020010019	-	74	38.978	ENSORLG00020019417	-	68	38.978
ENSORLG00020010019	-	61	40.154	ENSORLG00020002120	-	79	40.154
ENSORLG00020010019	-	95	55.253	ENSORLG00020010431	-	78	55.772
ENSORLG00020010019	-	60	39.959	ENSORLG00020004554	-	63	39.959
ENSORLG00020010019	-	80	38.532	ENSORLG00020008961	-	67	38.591
ENSORLG00020010019	-	84	37.139	ENSORLG00020021297	-	58	38.132

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010019	-	61	49.799	ENSAOCG00000011105	-	62	50.402	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010019	-	56	43.043	ENSATEG00000007276	-	85	43.043	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.918	ENSATEG00000007647	-	93	40.918	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.918	ENSATEG00000010400	-	63	40.918	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	39.920	ENSATEG00000009980	-	79	39.920	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.120	ENSATEG00000019513	-	63	40.120	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.239	ENSATEG00000013493	-	60	40.239	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.918	ENSATEG00000016515	-	79	40.918	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	40.918	ENSATEG00000015818	-	63	40.918	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	60	39.243	ENSATEG00000007199	-	64	39.243	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010019	-	68	41.239	ENSACLG00000008391	-	65	41.239	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	61	41.292	ENSACLG00000002614	-	71	41.292	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	61	41.992	ENSACLG00000027996	-	64	41.992	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	68	41.270	ENSACLG00000021287	-	65	41.270	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	68	41.270	ENSACLG00000023885	-	65	41.270	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	68	41.270	ENSACLG00000004826	-	65	41.270	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	50	44.526	ENSACLG00000011058	-	85	44.526	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	61	41.326	ENSACLG00000020864	-	64	41.326	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	68	41.446	ENSACLG00000002468	-	65	41.446	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	84	39.199	ENSACLG00000004144	-	92	39.199	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	60	42.209	ENSACLG00000005642	-	87	42.209	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010019	-	78	39.130	ENSAMXG00000040632	-	69	39.130	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	78	38.820	ENSAMXG00000036981	-	76	38.820	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	78	38.629	ENSAMXG00000040782	-	69	38.629	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	66	38.645	ENSAMXG00000034383	-	72	38.645	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	94	56.258	ENSAMXG00000037852	-	72	56.258	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	78	38.820	ENSAMXG00000029285	-	69	38.820	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020010019	-	56	43.368	ENSCSEG00000013023	-	61	43.277	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010019	-	67	42.179	ENSCSEG00000014137	-	66	42.179	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020010019	-	55	65.471	ENSKMAG00000014228	-	63	65.179	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010019	-	57	43.376	ENSKMAG00000001967	-	61	43.902	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010019	-	57	43.376	ENSKMAG00000010396	-	61	43.902	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010019	-	57	43.376	ENSKMAG00000000948	-	61	43.902	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020010019	-	54	38.514	ENSLACG00000022383	-	100	38.514	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020010019	-	50	41.769	ENSLACG00000011269	-	58	41.769	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020010019	-	50	41.769	ENSLACG00000022513	-	58	41.769	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020010019	-	85	41.341	ENSMAMG00000017899	-	69	41.341	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.620	ENSMAMG00000007233	-	69	41.620	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	66	48.529	ENSMAMG00000011664	-	61	48.529	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.620	ENSMAMG00000022385	-	69	41.620	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.620	ENSMAMG00000021861	-	69	41.620	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	51	42.991	ENSMAMG00000002569	-	84	42.991	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	75	41.456	ENSMAMG00000009163	-	68	41.456	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.341	ENSMAMG00000019681	-	69	41.341	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	50	56.161	ENSMAMG00000010110	-	72	58.442	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.341	ENSMAMG00000021485	-	75	41.341	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	85	41.480	ENSMAMG00000020611	-	84	41.480	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020010019	-	51	43.230	ENSMALG00000019734	-	57	43.230	Monopterus_albus
ENSORLG00020010019	-	70	56.370	ENSORLG00000023083	-	72	56.370	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	86	57.637	ENSORLG00000027491	-	72	57.637	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.029	ENSORLG00000023458	-	70	40.029	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	71	58.406	ENSORLG00000021796	-	67	58.406	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	74	39.520	ENSORLG00000025731	-	84	39.520	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.320	ENSORLG00000025672	-	82	40.320	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.087	ENSORLG00000023600	-	70	40.029	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	80	72.798	ENSORLG00000028906	-	70	72.798	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.175	ENSORLG00000028760	-	76	40.407	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	57	42.308	ENSORLG00000023890	-	78	42.451	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.175	ENSORLG00000030094	-	70	40.175	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.233	ENSORLG00000029568	-	70	40.175	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.233	ENSORLG00000023734	-	70	40.175	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	61	40.698	ENSORLG00000024832	-	61	40.698	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.233	ENSORLG00000026300	-	70	40.175	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	83	39.943	ENSORLG00000025177	-	70	39.943	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	81	39.971	ENSORLG00000023906	-	69	39.971	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.087	ENSORLG00000026621	-	70	40.029	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	95	55.123	ENSORLG00000030164	-	72	55.642	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	83	40.058	ENSORLG00000026646	-	70	40.058	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	39.738	ENSORLG00000023377	-	70	39.738	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.525	ENSORLG00000027049	-	70	40.466	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.348	ENSORLG00000027014	-	70	40.407	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	81	40.176	ENSORLG00000029298	-	91	40.176	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	74	39.394	ENSORLG00000022547	-	68	39.394	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	86	40.719	ENSORLG00000023053	-	58	40.598	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	64	40.596	ENSORLG00000024521	-	65	40.596	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	97	55.058	ENSORLG00000022274	-	96	55.314	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	83	39.769	ENSORLG00000027481	-	70	39.769	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	81	40.029	ENSORLG00000027976	-	69	40.117	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	75	59.437	ENSORLG00000021915	-	84	59.437	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	74	38.782	ENSORLG00000024420	-	68	38.782	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.407	ENSORLG00000024429	-	90	40.175	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	39.942	ENSORLG00000022484	-	70	39.971	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	70	35.567	ENSORLG00000029533	-	86	35.567	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.146	ENSORLG00000025092	-	69	40.146	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	82	40.320	ENSORLG00000025444	-	70	40.320	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	96	69.961	ENSORLG00000030043	-	72	69.961	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	74	39.617	ENSORLG00000027999	-	68	39.617	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	74	39.457	ENSORLG00000027997	-	68	39.457	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	86	40.576	ENSORLG00000024154	-	56	40.456	Oryzias_latipes
ENSORLG00020010019	-	71	58.752	ENSORLG00015012293	-	67	58.752	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020010019	-	75	59.603	ENSORLG00015018975	-	69	59.768	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020010019	-	56	73.154	ENSORLG00015011143	-	87	73.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020010019	-	57	92.920	ENSORLG00015022021	-	88	92.920	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020010019	-	56	73.154	ENSORLG00015022603	-	60	73.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020010019	-	69	63.571	ENSOMEG00000021672	-	66	63.571	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020010019	-	95	59.922	ENSOMEG00000003257	-	72	60.026	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020010019	-	59	56.289	ENSOMEG00000013776	-	90	58.784	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020010019	-	81	40.828	ENSOMEG00000020877	-	68	40.828	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020010019	-	58	53.277	ENSPKIG00000003654	-	98	53.797	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020010019	-	55	61.573	ENSPKIG00000009042	-	61	61.573	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020010019	-	81	43.551	ENSPMEG00000002401	-	74	43.551	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020010019	-	52	47.482	ENSPREG00000012441	-	96	47.482	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020010019	-	76	42.105	ENSSMAG00000017424	-	77	42.105	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020010019	-	50	66.334	ENSXMAG00000028039	-	57	66.334	Xiphophorus_maculatus