EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010038 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12502 bases
Position: chr19:169725-182226
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	1	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	2	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	3	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	4	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	5	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	6	7
ENSORLP00020027192	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-39	7	7
ENSORLP00020027192	zf-met	PF12874.7	2.3e-16	1	2
ENSORLP00020027192	zf-met	PF12874.7	2.3e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020000004	-	3992	-	ENSORLP00020027192	414 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010038	-	65	37.255	ENSORLG00020011478	scrt2	53	37.255
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ENSORLG00020010038	-	58	36.015	ENSORLG00020018791	-	88	37.768
ENSORLG00020010038	-	96	48.372	ENSORLG00020010916	-	85	48.372
ENSORLG00020010038	-	58	51.327	ENSORLG00020019341	-	79	67.647
ENSORLG00020010038	-	68	47.059	ENSORLG00020016666	-	84	47.059
ENSORLG00020010038	-	60	43.382	ENSORLG00020018503	-	76	43.382
ENSORLG00020010038	-	55	50.926	ENSORLG00020010647	-	77	50.926
ENSORLG00020010038	-	63	46.635	ENSORLG00020011075	-	86	45.614
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ENSORLG00020010038	-	89	47.236	ENSORLG00020016037	-	94	50.459
ENSORLG00020010038	-	93	46.111	ENSORLG00020004313	-	70	46.111
ENSORLG00020010038	-	76	35.417	ENSORLG00020010285	znf646	76	35.417
ENSORLG00020010038	-	73	42.537	ENSORLG00020008787	snai2	74	42.537
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ENSORLG00020010038	-	63	47.577	ENSORLG00020008346	-	89	48.707
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ENSORLG00020010038	-	80	41.250	ENSORLG00020003719	GFI1B	91	41.250
ENSORLG00020010038	-	55	38.983	ENSORLG00020007790	zbtb48	54	38.494
ENSORLG00020010038	-	55	50.000	ENSORLG00020004370	-	82	50.000
ENSORLG00020010038	-	71	45.455	ENSORLG00020018069	-	99	46.853
ENSORLG00020010038	-	65	41.699	ENSORLG00020007599	-	89	41.699
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ENSORLG00020010038	-	89	48.018	ENSORLG00020010560	-	98	47.826
ENSORLG00020010038	-	62	45.390	ENSORLG00020008744	-	67	45.390
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ENSORLG00020010038	-	55	46.875	ENSORLG00020008240	-	50	46.875
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ENSORLG00020010038	-	72	42.683	ENSORLG00020010950	-	97	49.541
ENSORLG00020010038	-	56	40.909	ENSORLG00020002128	-	89	40.909
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ENSORLG00020010038	-	85	46.256	ENSORLG00020017850	-	99	46.256
ENSORLG00020010038	-	61	40.000	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	40.000
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ENSORLG00020010038	-	58	42.857	ENSORLG00020006820	-	69	42.857
ENSORLG00020010038	-	58	50.435	ENSORLG00020017514	-	90	50.435
ENSORLG00020010038	-	55	44.444	ENSORLG00020006433	-	79	42.857
ENSORLG00020010038	-	73	44.444	ENSORLG00020008484	-	96	44.444
ENSORLG00020010038	-	97	48.592	ENSORLG00020009180	-	99	48.592
ENSORLG00020010038	-	62	50.661	ENSORLG00020009184	-	88	48.325
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ENSORLG00020010038	-	85	36.957	ENSORLG00020007967	-	99	43.644
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ENSORLG00020010038	-	58	47.120	ENSORLG00020017528	-	71	47.120
ENSORLG00020010038	-	83	50.867	ENSORLG00020015703	-	79	50.867
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ENSORLG00020010038	-	93	52.113	ENSORLG00020009419	-	95	52.113
ENSORLG00020010038	-	71	42.541	ENSORLG00020018921	-	93	45.070
ENSORLG00020010038	-	55	51.744	ENSORLG00020007074	-	98	51.744
ENSORLG00020010038	-	58	47.598	ENSORLG00020008424	-	85	47.598
ENSORLG00020010038	-	95	44.493	ENSORLG00020008018	-	96	44.493
ENSORLG00020010038	-	55	49.569	ENSORLG00020011149	-	90	49.569
ENSORLG00020010038	-	93	45.455	ENSORLG00020010171	-	99	45.133
ENSORLG00020010038	-	61	38.636	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	59	38.636
ENSORLG00020010038	-	83	46.256	ENSORLG00020009943	-	99	49.519
ENSORLG00020010038	-	56	47.664	ENSORLG00020002817	GFI1	50	47.664
ENSORLG00020010038	-	78	49.333	ENSORLG00020017164	-	99	48.018
ENSORLG00020010038	-	94	45.783	ENSORLG00020000219	-	84	45.783
ENSORLG00020010038	-	56	47.321	ENSORLG00020005132	-	79	47.321
ENSORLG00020010038	-	94	51.754	ENSORLG00020009965	-	99	51.754

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020010038	-	72	44.550	ENSAPOG00000013982	-	89	44.550	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	55	47.273	ENSAPOG00000010200	-	81	47.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	88	56.561	ENSAPOG00000021959	-	86	56.561	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	93	54.206	ENSAPOG00000019061	-	89	47.674	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	93	58.150	ENSAPOG00000021383	-	91	58.150	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	75	49.339	ENSAPOG00000021991	-	93	51.339	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	57	54.386	ENSAPOG00000005195	-	88	52.586	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020010038	-	55	42.654	ENSACIG00000017653	-	93	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	90	58.772	ENSACIG00000011541	-	90	58.772	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	71	49.425	ENSACIG00000006755	-	71	49.425	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	76	37.209	ENSACIG00000019804	-	90	37.209	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	58	49.198	ENSACIG00000008448	-	68	49.198	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	56	43.568	ENSACIG00000019815	-	93	43.568	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	58	36.194	ENSACIG00000017683	-	75	35.683	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	56	40.086	ENSACIG00000001369	-	85	40.086	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020010038	-	68	49.339	ENSAOCG00000010471	-	77	49.339	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	92	50.877	ENSAOCG00000016905	-	77	50.877	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	91	55.455	ENSAOCG00000017602	-	94	55.455	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	86	44.125	ENSAOCG00000002430	-	97	44.063	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	88	47.115	ENSAOCG00000002795	-	92	51.351	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	89	47.967	ENSAOCG00000007134	-	90	47.967	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	89	40.317	ENSAOCG00000012813	-	96	40.317	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	91	58.590	ENSAOCG00000017595	-	93	58.590	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020010038	-	57	50.220	ENSAPEG00000013097	-	72	50.220	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	88	56.818	ENSAPEG00000013044	-	92	56.818	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	94	49.780	ENSAPEG00000015337	-	98	50.000	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	91	55.455	ENSAPEG00000012470	-	94	55.455	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	91	58.590	ENSAPEG00000012443	-	93	58.590	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	55	36.800	ENSAPEG00000019106	-	53	37.445	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	72	50.877	ENSAPEG00000001546	-	82	50.877	Amphiprion_percula
ENSORLG00020010038	-	82	36.207	ENSATEG00000008674	-	77	36.207	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010038	-	56	36.782	ENSATEG00000013871	-	57	37.885	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010038	-	76	43.396	ENSATEG00000019378	-	77	39.841	Anabas_testudineus
ENSORLG00020010038	-	91	50.877	ENSACLG00000027424	-	96	50.877	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010038	-	68	38.174	ENSACLG00000019167	-	95	38.174	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010038	-	59	48.990	ENSACLG00000013935	-	81	48.990	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010038	-	88	43.874	ENSACLG00000020393	-	94	53.275	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010038	-	91	58.333	ENSACLG00000020610	-	93	58.333	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020010038	-	58	36.667	ENSACLG00000000102	-	57	37.949	Astatotilapia_calliptera
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