EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020010250 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41385 bases
Position: chr2:5302349-5343733
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	1	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	2	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	3	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	4	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	5	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	6	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	7	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	8	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	9	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	10	14
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ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	13	14
ENSORLP00020009341	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-77	14	14
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	1	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	2	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	3	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	4	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	5	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	6	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	7	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	8	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	9	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	10	11
ENSORLP00020027332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-62	11	11
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	1	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	2	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	3	10
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ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	5	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	6	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	7	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	8	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	9	10
ENSORLP00020009333	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-55	10	10
ENSORLP00020009341	zf-met	PF12874.7	1.2e-24	1	4
ENSORLP00020009341	zf-met	PF12874.7	1.2e-24	2	4
ENSORLP00020009341	zf-met	PF12874.7	1.2e-24	3	4
ENSORLP00020009341	zf-met	PF12874.7	1.2e-24	4	4
ENSORLP00020027332	zf-met	PF12874.7	2.2e-20	1	4
ENSORLP00020027332	zf-met	PF12874.7	2.2e-20	2	4
ENSORLP00020027332	zf-met	PF12874.7	2.2e-20	3	4
ENSORLP00020027332	zf-met	PF12874.7	2.2e-20	4	4
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	1	6
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	2	6
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	3	6
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	4	6
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	5	6
ENSORLP00020009333	zf-met	PF12874.7	4.7e-18	6	6
ENSORLP00020009341	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.9e-28	1	1
ENSORLP00020027332	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.1e-25	1	2
ENSORLP00020027332	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.1e-25	2	2
ENSORLP00020009333	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	5.2e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020015700	-	1416	-	ENSORLP00020027332	471 (aa)	-	-
ENSORLT00020015685	-	1122	-	ENSORLP00020009333	373 (aa)	-	-
ENSORLT00020015695	-	1632	-	ENSORLP00020009341	543 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020010250	-	87	44.444	ENSORLG00020000009	znf710b	51	44.444
ENSORLG00020010250	-	91	37.405	ENSORLG00020001758	-	60	37.405
ENSORLG00020010250	-	96	43.697	ENSORLG00020008787	snai2	85	43.697
ENSORLG00020010250	-	92	45.304	ENSORLG00020016666	-	84	45.503
ENSORLG00020010250	-	92	37.415	ENSORLG00020012967	scrt1b	81	38.136
ENSORLG00020010250	-	97	48.256	ENSORLG00020021196	-	70	48.996
ENSORLG00020010250	-	80	37.209	ENSORLG00020020094	-	59	39.024
ENSORLG00020010250	-	91	48.214	ENSORLG00020000639	-	70	48.113
ENSORLG00020010250	-	93	45.745	ENSORLG00020000219	-	86	48.630
ENSORLG00020010250	-	93	41.284	ENSORLG00020019789	snai1a	78	41.284
ENSORLG00020010250	-	86	57.377	ENSORLG00020019227	-	87	52.632
ENSORLG00020010250	-	95	55.263	ENSORLG00020000481	-	96	48.305
ENSORLG00020010250	-	95	48.221	ENSORLG00020018069	-	97	52.720
ENSORLG00020010250	-	91	62.046	ENSORLG00020009089	-	81	62.046
ENSORLG00020010250	-	94	68.394	ENSORLG00020010880	-	96	68.394
ENSORLG00020010250	-	83	42.857	ENSORLG00020018503	-	81	35.733
ENSORLG00020010250	-	88	65.200	ENSORLG00020010020	-	98	65.200
ENSORLG00020010250	-	91	59.184	ENSORLG00020008018	-	93	56.250
ENSORLG00020010250	-	99	50.575	ENSORLG00020017164	-	100	53.659
ENSORLG00020010250	-	90	62.313	ENSORLG00020011234	-	97	62.313
ENSORLG00020010250	-	90	66.879	ENSORLG00020004370	-	92	66.879
ENSORLG00020010250	-	94	42.276	ENSORLG00020005132	-	94	48.319
ENSORLG00020010250	-	90	62.963	ENSORLG00020010636	-	82	62.455
ENSORLG00020010250	-	76	51.786	ENSORLG00020004162	znf341	58	51.786
ENSORLG00020010250	-	94	58.537	ENSORLG00020007074	-	98	59.259
ENSORLG00020010250	-	89	62.054	ENSORLG00020010647	-	94	65.254
ENSORLG00020010250	-	95	50.000	ENSORLG00020017850	-	97	51.429
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ENSORLG00020010250	-	91	66.807	ENSORLG00020010953	-	97	66.807
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ENSORLG00020010250	-	95	61.674	ENSORLG00020009857	-	97	63.133
ENSORLG00020010250	-	87	38.983	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	98	41.176
ENSORLG00020010250	-	88	38.545	ENSORLG00020018051	prdm5	87	35.616
ENSORLG00020010250	-	96	41.439	ENSORLG00020020419	-	95	46.965
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ENSORLG00020010250	-	87	45.361	ENSORLG00020006433	-	79	46.000
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ENSORLG00020010250	-	88	59.794	ENSORLG00020004353	-	96	62.019
ENSORLG00020010250	-	91	56.849	ENSORLG00020021857	-	80	54.464
ENSORLG00020010250	-	86	40.351	ENSORLG00020017974	e4f1	52	38.922
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ENSORLG00020010250	-	86	42.759	ENSORLG00020002817	GFI1	76	46.250
ENSORLG00020010250	-	84	44.444	ENSORLG00020010932	-	75	44.048
ENSORLG00020010250	-	89	31.579	ENSORLG00020010937	patz1	56	32.000
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ENSORLG00020010250	-	97	61.765	ENSORLG00020008346	-	99	64.138
ENSORLG00020010250	-	86	39.827	ENSORLG00020001395	-	52	39.827
ENSORLG00020010250	-	90	47.253	ENSORLG00020006820	-	77	47.872
ENSORLG00020010250	-	94	41.711	ENSORLG00020018921	-	87	43.089
ENSORLG00020010250	-	99	60.952	ENSORLG00020009943	-	99	61.238
ENSORLG00020010250	-	94	55.333	ENSORLG00020008484	-	97	58.607
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ENSORLG00020010250	-	91	48.366	ENSORLG00020009965	-	89	47.660
ENSORLG00020010250	-	90	67.513	ENSORLG00020000161	-	93	67.513
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ENSORLG00020010250	-	94	53.333	ENSORLG00020019341	-	89	65.625
ENSORLG00020010250	-	99	36.066	ENSORLG00020004889	ZNF319	87	40.190
ENSORLG00020010250	-	84	45.205	ENSORLG00020011478	scrt2	54	43.421
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ENSORLG00020010250	-	93	30.698	ENSORLG00020005815	-	73	39.062
ENSORLG00020010250	-	93	58.683	ENSORLG00020011075	-	93	59.662
ENSORLG00020010250	-	87	49.432	ENSORLG00020010038	-	56	49.541
ENSORLG00020010250	-	97	56.277	ENSORLG00020010171	-	99	59.220
ENSORLG00020010250	-	94	34.930	ENSORLG00020006144	-	76	41.584
ENSORLG00020010250	-	97	53.942	ENSORLG00020006148	-	96	59.624
ENSORLG00020010250	-	91	52.655	ENSORLG00020015703	-	74	52.655
ENSORLG00020010250	-	92	60.518	ENSORLG00020000246	-	95	59.811
ENSORLG00020010250	-	90	33.333	ENSORLG00020012229	zbtb41	50	37.162
ENSORLG00020010250	-	86	37.888	ENSORLG00020018685	znf319b	85	37.677
ENSORLG00020010250	-	87	60.797	ENSORLG00020010916	-	86	50.000
ENSORLG00020010250	-	90	72.398	ENSORLG00020010560	-	100	67.133
ENSORLG00020010250	-	87	39.886	ENSORLG00020018495	-	79	40.369
ENSORLG00020010250	-	94	53.546	ENSORLG00020008424	-	95	61.009
ENSORLG00020010250	-	97	60.699	ENSORLG00020008891	-	96	61.905
ENSORLG00020010250	-	99	62.388	ENSORLG00020011149	-	96	63.467
ENSORLG00020010250	-	96	56.944	ENSORLG00020008240	-	68	57.895
ENSORLG00020010250	-	99	45.506	ENSORLG00020000264	-	66	46.626
ENSORLG00020010250	-	85	46.154	ENSORLG00020001922	-	74	46.617
ENSORLG00020010250	-	95	42.466	ENSORLG00020001912	znf236	75	46.535
ENSORLG00020010250	-	98	43.711	ENSORLG00020009139	-	98	48.148

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSORLG00020010250	-	95	47.405	ENSXMAG00000028065	-	96	48.649	Xiphophorus_maculatus